Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32408 LG9 18017724 18024287 Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 18017967 intron_variant
A/G 18017977 intron_variant
C/T 18017996 intron_variant
T/C 18018505 intron_variant
T/A 18018710 intron_variant
A/G 18019293 intron_variant
T/C 18019295 intron_variant
T/A 18019301 intron_variant
C/A 18019314 intron_variant
T/C 18019317 intron_variant
A/T 18019355 intron_variant
T/C 18019362 intron_variant
G/A 18019364 intron_variant
T/C 18019365 intron_variant
C/T 18019430 intron_variant
G/A 18019439 intron_variant
C/A 18019527 intron_variant
A/T 18019750 intron_variant
G/A 18019754 intron_variant
G/A,T 18020167 intron_variant
C/T 18020206 intron_variant
C/T 18020234 intron_variant
C/G,* 18020276 intron_variant
T/A 18020278 intron_variant
T/C 18020285 intron_variant
G/T 18020550 intron_variant
A/G 18020559 intron_variant
A/T 18020968 intron_variant
C/T 18021022 intron_variant
T/C 18021149 intron_variant
C/A 18021154 intron_variant
G/C 18021240 intron_variant
T/A 18021258 intron_variant
G/T 18021266 intron_variant
C/G 18021269 intron_variant
A/C 18021272 intron_variant
T/A 18021280 intron_variant
C/G 18021820 intron_variant
T/A 18021889 missense_variant p.Lys349Ile
A/T 18022078 missense_variant p.Leu316His
T/A 18022144 missense_variant p.Asn294Ile
T/A 18022150 missense_variant p.Asn292Ile
T/A 18022314 missense_variant p.Glu237Asp
G/T 18023054 intron_variant
T/A 18023064 intron_variant
T/A 18023395 intron_variant
A/G 18023400 intron_variant
C/A 18023406 intron_variant
A/T 18023422 intron_variant
C/T 18023589 intron_variant
G/A 18023598 intron_variant
G/A 18023619 intron_variant
C/A 18023623 intron_variant
T/A 18023631 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32408.1
MDVQVINAEGSGHQSKADNGDAEPSDSEVNNTEKYGTHAEDRISEPYVGMEFDTVDVAKAFYNEYARHMGFSSKVGPYGHSKIDGENYREFVCGREGLRKGLNESCNAMIRIELKSQNKWVVTKLVKEHTHSLFSSSKSHNNHPSKHFSSVGRTMPETYQGVGLVPSGVMYVSMDGNRVSNQNTRGMKNIHTTAAERSHPESLTARYSNLCKEAIRYAEEGAVTVETYNAAISGIREGGKKVANVKRSVAKVSPPNNQAGGIAYDDRKTPTPTSDTTPLLWPRQDEITRRFNLNDAGGPVQSVADLNLPRMAPVSLHRDDGLSENMVVLPCLKSMTWIMENKNSTPGNKVAVINLKLQDYSRVPSTESEVKFHLSRVTLEPMLKSMAYISEQLSTPANKVAVINLKLQDTETTSGESEVKFQVSRDTLGAMLRSMAYIREQLSHAEIVYIGGEKGL*


CDS Sequence:
>Vu_32408.1
ATGGATGTTCAAGTGATAAATGCGGAAGGAAGTGGTCATCAGTCAAAGGCAGATAACGGGGATGCAGAACCAAGTGACAGTGAAGTTAATAATACTGAAAAGTATGGAACTCATGCGGAGGACCGGATTTCTGAACCATATGTGGGTATGGAATTCGACACTGTAGATGTTGCTAAGGCATTTTATAATGAATATGCTAGACACATGGGTTTTAGCTCTAAAGTTGGCCCATATGGTCACTCTAAAATTGATGGGGAAAATTATAGGGAGTTTGTATGTGGTAGGGAAGGTTTAAGAAAAGGACTAAATGAAAGTTGCAATGCAATGATTAGGATCGAGCTAAAGAGTCAAAATAAATGGGTGGTAACAAAATTAGTGAAGGAGCATACTCATTCCCTGTTCAGTTCCAGTAAGTCACACAATAATCACCCAAGTAAGCATTTTTCTAGTGTTGGAAGGACAATGCCGGAAACTTATCAAGGAGTGGGTCTTGTTCCTAGTGGTGTTATGTATGTATCTATGGATGGGAATCGTGTTTCGAATCAGAATACTCGTGGGATGAAGAATATTCATACCACTGCTGCTGAACGAAGTCACCCAGAATCTTTGACAGCAAGATATAGCAATCTATGCAAGGAAGCCATCAGGTACGCTGAGGAAGGGGCAGTAACTGTGGAAACATATAATGCTGCAATAAGTGGTATTAGAGAAGGTGGAAAGAAGGTTGCTAATGTGAAAAGAAGTGTTGCCAAAGTATCTCCTCCTAACAATCAGGCCGGTGGGATTGCATATGATGACAGGAAAACTCCCACTCCAACTTCAGATACAACTCCTCTTTTATGGCCGCGGCAAGATGAGATAACGAGGAGGTTTAATCTTAATGATGCTGGTGGTCCTGTTCAATCAGTTGCTGATCTAAACTTGCCACGGATGGCCCCAGTCTCTCTTCATCGTGATGATGGCCTATCTGAAAACATGGTAGTTCTTCCATGCCTAAAATCAATGACATGGATAATGGAGAACAAAAACTCAACTCCTGGGAATAAAGTAGCTGTTATCAATCTTAAGTTGCAAGACTATAGCAGGGTTCCATCCACAGAATCTGAGGTTAAGTTTCATCTTTCTAGAGTTACTTTGGAACCAATGTTGAAGTCTATGGCTTACATCAGTGAACAGCTCTCAACACCAGCTAATAAGGTTGCAGTAATAAATCTCAAGCTTCAAGATACTGAGACAACCTCTGGTGAGTCAGAAGTAAAGTTTCAGGTGTCCCGGGATACATTGGGTGCTATGCTACGATCAATGGCCTATATCCGTGAGCAGCTTTCTCATGCCGAGATTGTGTATATAGGAGGAGAGAAGGGTTTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_32408::LG9:18024287-18026287(-)
ACATTGCATTTTATTCATATATCTCACATGTTGTTTGAATCTCAATGGGAGAAGGAACGACTAAAAAAAGGGTTTCATGGTAATATGCACAATTTTAAGAGTTGTTTCTTGCTTTCTTCATAATTTATTTCTTCCTTAAAAAGTTCTTCTGCTCCAAATTGTAAGATTACAGACGACTCATTCTACCATTTCAGAAGCAAATTATTGCCATAGTAATTGTGCATGGACGAAGGGAAGAGGTTGGAGCGGTGCACGAAGCTGCAAACTAGGGTTTGGGGCTTAGAGGAAGGGGAAGAGATGGCAGAGCCAAGAGTTTGTGAGGAAGAAGACGCGGAGAAGGAGAGACATCGGCGTAACGCACTTTTTCTATGGGAGGAGGAGAGAGGAGGTTTGATGAGGGAGGGAGGGAGAAAATAACTTGATCTTCCTAACGTCGTTGGCAATGGAAGATAAAAGGAAGTGGAGGTGGCGGTGATTGTGGAGAGAGAGAGAGTTTCTAAGTGTACAGCGTGACACACGGTTACCCAATTCAGCCTAATTTTAACGGTGTTAATTTTGGAGGACGAAAAATTATAGTTTTCTTAAGGACAAGGATCAAAATATACCAAAGTTTGAAAGAGACTAAAACTAAAATCGCTTGATAGTTGAGAGACTAAAAACATATTTAACCCAAAAATTTATAAGAAAAGTTTTGAAAAAAAAAGTGTAAAATGAAGAAAAAGTGGTAGATTTATGGGGATTCTTTTGAAATCACTAATATACCCTTATATAATATTTTGTTTTCCTTATTTTTTTAGTTGTAAATGTAAGAAATAAATAAATGCAATAGCAATTTTAGGAAAAAAATTATTTTCACTTTTTCAATTAATTTTTCAAACAAAAGATCTTTATATTTTAAAGGATACACTAAGTAATTTTGACATTATACTAAATACAATTATTTAACATTCATTAATTCCATTAAATCAATCCTATATCTCAATAAATTTCCTACATAAATTTATTATCTTTCTATTAAACCAAATCACTCACTTTTCATTCGATTAATTTCCTGATTATTACTAATCAATATTCACTTTTTAATTTTTAACTAAATAGTTAGGGATTTGTTAGTTCTTCTTGGAAAAAGAAAAATAAATAAATATAAATCAATTTTAAAAAAAGGATAGAAGAAGCGTGATGATGCAAAGCGTAAGTAGCCCACTGACATAGATAATGCACTTGGCAAATCCAACCGCATACAGCACAAGTTGAGCTCAGATCCCACTTTGATAAAAAGGAAAACAGTTCGGTCTGAATCAAACATGACCGTACGATTACAATCGAACGGCTCACATCACGCGTGTGTACTTATGTCTCATCGAATCCGTGTGACACGCACTCACTCTCTCTCCTTCCTCTCTCTTTCGCCCCTCTCGTCCTCTGCAATTCCCGGTGACGGAGAAACCCTACCCACCGTCGAAAAGCGGTCATTTCTCTTCGAACCTCACTATTCATGTGTGTTTCCGCCACCTCTCGGAAGGGAAAAAGGTTTCCACCAATCAGCGTTTCTGATTCTTCTTCAACCCCAAAATTGGGAGATTTGACAATCAATTTGTCGTCAGCTCCTAATAATTTACAGTCTTTGCTGTAAGTTTGGGTTTCTCAATTTCCATATCAATTTGCGCAAAGTTGTATGGTTTGTACAAAATTACCTTTGTGGTACCTGAGTAATTCATTCTCTTTGCTTAACTCTGTTTTGTTATTGAGAATATACAATACTTTTAACATATGTGCTCAGAAAATCGTTATGATGTTTACATACTGAAGTTTTGCGCAGTCTTAGGTGATCACTTTTTAATTCTCTGAAGCAATATTTTCTTAAAAAACTTTATTTCCTTGGACACATGCAACTTAGATGGCACCTACTTTCTATATGATAGGATTAAAGCAATCAGTCCATGGTCAGGATATTTACCCATGAAATAGGCACAGTAAGATAGTGGTATTAACTGTTTGAA


Gene Sequence:
>Vu_32408(-)
ATGGATGTTCAAGTGATAAATGCGGAAGGAAGTGGTCATCAGTCAAAGGCAGATAACGGGGATGCAGAACCAAGTGACAGTGAAGTTAATAATACTGAAAAGTATGGAACTCATGCGGAGGACCGGATTTCTGAACCATATGTGGGTATGGAATTCGACACTGTAGATGTTGCTAAGGCATTTTATAATGAATATGCTAGACACATGGGTTTTAGCTCTAAAGTTGGCCCATATGGTCACTCTAAAATTGATGGGGAAAATTATAGGGAGTTTGTATGTGGTAGGGAAGGTTTAAGAAAAGGACTAAATGAAAGTTGCAATGCAATGATTAGGATCGAGCTAAAGAGTCAAAATAAATGGGTGGTAACAAAATTAGTGAAGGAGCATACTCATTCCCTGTTCAGTTCCAGTAAGTCACACAATAATCACCCAAGTAAGCATTTTTCTAGTGTTGGAAGGACAATGCCGGAAACTTATCAAGGAGTGGGTCTTGTTCCTAGTGGTGTTATGTATGTATCTATGGATGGGAATCGTGTTTCGAATCAGAATACTCGTGGGATGAAGAATATTCATACCACTGCTGCTGAACGAAGTCACCCAGTTAAAAATTCCTCATTGATGAATTATACTGTTAGGCCTTCTTTGCAAAACCGGACATTGGGGAGGGACGCTCATAATCTGCTGGAGTACTTCAAGAAGATGCAGGCTGAGAATCCTGGTTTCTTCTATGCTATACAACTTGATGAAGACAATCGAATGTCTAATGTCTTTTGGGCAGATGCAAGATCAAGGACAGCATACAGTTATTACGGTGACACAGTTCATCTTGACACAACTTACAAAGTAAATCAATATAGAGTGCCATTTGCTCCTTTCACTGGGGTAAATCATCATGGTCAAATGGTTTTGTTTGGTTGTGCGCTCCTTTTGGATGATTCTGAGGCATCTTATTTATGGCTGTTGAAGACATTTCTGACGGCAATGAATGATTGTCAGCCTGTCTCTATAACTACTGATCAAGATAGAGCCTTGCAAACTGCAGTTTCTCAAGTTCTCCCACAAACCCGCCACTGTATTAGCAAGTGGCATATCTTGAAAGAAGGTCAAGAAAAGTTGGCTCATGTATGTCTTGTGCATCCAAATTTTCAGGTTGAACTTTATAATTGTATTAACATGACAGAAACCATTGATGAGTTTGAGTCATTTTGGAGTTGTATCATCGAAAAATATGAACTCAGAAGAAATGATTGGCTCCAGTCATTGTATAATGCTCGTGCTCAATGGGTTCCAGCATTCTTTCGCAATTCGTTTTTTGCAGCATTATCTCCTACTCAAGGTTTTGATAGTTCTTTTTTTGATGGTTATGTCAACCAACAGACAACATTGCCATTGTTCTTCAGGCAGTATGAAAGAGCTTTAGAGAGCTGGATTGAGAAGGAAATAGAAGCAGATTTTGAGACAGTTTGCACAACACCAGTTTTGAAGACACCTTCACCAATGGAGAAACAGGTTGCTAATCTTTATACAAGAAAAATATTTTCAAAGTTTCAAGATGAACTTGTTGAAACTTTTGTTTATACTGCGAATAGAATTGAAGGAGATGGACCAAATAGCACATTTAGAGTTGCAAAATTTGAGGATGACCAGAAGGCATACACGGTCTCATTAAACCATTCTGAGTTGAAAGCTAATTGTAGTTGCCAAATGTTTGAGTATTCAGGCATTCTTTGCAGACATATTTTAACAGTTTTCACCGTGACAAATGTACTTACGTTACCACCCCATTACATCTTGAAACGTTGGACAAGAAATGCAAAAAACAGTCCTGGATTGGATGAACATATCGGTGAGTTACATGCACAGGAATCTTTGACAGCAAGATATAGCAATCTATGCAAGGAAGCCATCAGGTACGCTGAGGAAGGGGCAGTAACTGTGGAAACATATAATGCTGCAATAAGTGGTATTAGAGAAGGTGGAAAGAAGGTTGCTAATGTGAAAAGAAGTGTTGCCAAAGTATCTCCTCCTAACAATCAGGCCGGTGGGATTGCATATGATGACAGGAAAACTCCCACTCCAACTTCAGATACAACTCCTCTTTTATGGCCGCGGCAAGATGAGATAACGAGGAGGTTTAATCTTAATGATGCTGGTGGTCCTGTTCAATCAGTTGCTGATCTAAACTTGCCACGGATGGCCCCAGTCTCTCTTCATCGTGATGATGGCCTATCTGAAAACATGGTAACTGAAAGTATAAATCTGTTTTTGTTTCTCTTGTTAAAAGAATAGAAATCCATTACATTGTTGTGGTCCTTGGGTTCTTTCATGTAGGTAGTTCTTCCATGCCTAAAATCAATGACATGGATAATGGAGAACAAAAACTCAACTCCTGGGAATAAAGTAGCTGTTATCAATCTTAAGGTATTCTCATTAACCGCAAACGGGAAAAGACATTGTATTTTACTTTGTTTAGTTTAAGACCAAATTTGGTTTGGCTGTCAATCTTTGATTAGCATCGGTATAAATATCTTATGTAGTGTTCAGTCTGTGAAGTGCTTTACTTTTCTCAATTCTTTTGGTAATTAGTGTTAGTCCATTGATATTTCACGCATCATATTGCAGTTGCAAGACTATAGCAGGGTTCCATCCACAGAATCTGAGGTTAAGTTTCATCTTTCTAGAGTTACTTTGGAACCAATGTTGAAGTCTATGGCTTACATCAGTGAACAGCTCTCAACACCAGCTAATAAGGTTGCAGTAATAAATCTCAAGGTATTTTCACTTTATTTTCTAAGGTTATGATAAATTTTCTCAACAATATTCTTCATGACAAGTTACTAAAGAAAGATGTACACGTATGGATTTATGATTTATAAGGTTAGAATTTAAGTAGCTATTGATAATTGTAATTGATTTTGTTATTGTAGAAGATTATTTAATGCTTTAAATTTCAATATTTGGCAACTGAACAAAGCTTGTTAACTGTATTTAAGGAAGCCTTGGTGATAGATTTCTTTAGTACAGAAATCAATCTCTCTTGCACTCAGCACACACGCACACAAAATATTGGACAAAAAGTCTGTTTATTACTTTGATGAACAAGAATACAAATGTACAACATCCAACTCTCAAGGGAGCACTCTCCCTCCACAGGAACAATCTCTTGTCTATACAACTAATATCAAAAGCTCCCCGACACAAGACCTCCATGTCTTCTTATGAAGGCCCCCCTAACCAACTAACAACTAATTCCTAATATGTTTCCGTCTATCCCTCACCCATTATATCCTATCACATGAGGATTTAGTGTAGTCCCTGCTGTTTTGTAGCTCTTAGCTTTCAGCTACCACTGTTGATCCCGTCACTCATTCATCATTGATTGGGAATCAGTCCTTGCAGCTTGTCATTGTCCACCACTGCTCTCCTTCATTCACTTTTGAAGTTGAAGTTTCACAAGCTGCTGTTAGTCCATCTATGTTTGCCTCACACTCTTGAAGACAAATCATCTAGTTCAACACTGAGTTCATCTATTCCAAGCTTAGTTCATACAATTTGTATGCTCCCGCTTGAGGGGGAGTGTTAGATATATTATATCTTTTATCTTTTAGTTAGTTTGTTATTATTTCTCATTTGTATTTTGGGCTTAGCCTATATTTCTTCTATTATAAATAGAGAACCCTATGTGTGTATTTAACACAAGGGAGATTAATCCAAATATAGTTTTTCACTATATTCAACAGGATCCATTGGCAACTGTAATGAAATGAGGGATTTTTAGAGAGGACATGGAAGAAAATGAAGGAATGTTACCAGAGATATGATCTAAGGCACCTGAGTCAAGGATCCATGGACTGTGACCTTCCACAGATTGAGATATGCAGACAATTGACATATTGGACATGGATGAGGATTGGCCAGGATTAGAAGATTTTCCAGACTTGTACCTCAAAAATTCTTTGTACTCTTCATTTGGAATTTTGGATTCTAGATCATCAGATTTAGAAACATGAGGAGCTTTGTCTGGATATCCATGTAAGGCATAACATTTTTCTCGAGTATGGCCTATTTTCTTACAATATGTGCGCATTGAGGATGCATACTATGACCACCACGTCCTCCCCGCTTCTGCCTCCTCCTCCTCTTCCTTGTGGTGCTACCATAGTTGATGTTTCAATATCATCAATTGATTTTTCGTCTTTAACTAATGAAGGTACCCGAAGAAGTCGAGTAACTAGGTTGTGCATTGATGGGACTTGATCACCAGCTAACATTTGATCACGAACATGATCAAAATCTGAGTGTAGACTTCTTAGAATTAAGACCATGTAAAACTTATTAAGCTTCTTGTTTATGCCTTCTAAAGAATCAACCACAAAAATTCTTTAATTCCTCTATGGTAGCATAAACCTTTCCTATGTGAGCGACCATATCATGATTGGCTTGTTTGAGGGAAGTCACTCTTTGAGTTGCATCAAAGTGATGTTGCACATCATTAGCAACGATATCCTGTTCTCTTTTCCAAAAGGAGGAGCACGTTTTGTAAGGTCTCAAAATTTCTAAGACCTCTTGTTTGACATATTGCCATAGGACAGTGCATAAATGAAAATCAAGCTTTTGCCATTGAGATTTCTCTTCATCGGGTACAGTGGAAATATCTTGTTCAAGATGATCATGGTATCCTTGACCAAGAAACCATAACTCCACGGAAGAAGACCAAGATAAATAGTTTTTCCAATTGAGTTTTGCAGAAGTAATGGTAGGGGTAGCAGATAGAGAAGGTGTTCCAAAACCAGAAGTCATTCTAAGGCTAAACAGAAGAGAGAAAAATTGATTTGAGGGTAGAAACAGCGGCAACGGGCAGCAGAGGCCGGCTCTGGATACCAATTTAAAGAGTTGGGAGAGAAACTACAATTTTTATTATTACTATTCACTTAACCCTAATACACATACTACCCTATTTATAAGGGATAATAGATCAACATAAAAAGGAAAAATAGAAG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