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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32376 LG9 17296083 17299438 PREDICTED: wee1-like protein kinase isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09143 Cell growth and death   C 04110 Cell cycle [PATH:ko04110]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 17296599 upstream_gene_variant
T/C 17296604 upstream_gene_variant
C/A 17297350 upstream_gene_variant
T/A 17298437 upstream_gene_variant
T/A 17298549 missense_variant p.Val301Asp
C/G 17298550 synonymous_variant p.Val301Val
C/A 17298554 missense_variant p.Pro303Thr
A/G 17298558 missense_variant p.Glu304Gly
G/T 17298796 missense_variant p.Glu383Asp
T/A 17298861 upstream_gene_variant
G/A 17299199 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32376.1
MNTKMQKEKPELLPSSGDDDDIILSQQLFCTPDYLTPEDQFPLKGFHSNIDKVEEDSPCPKSPEKPYATKTKRCRMDDGDTLRFTDDEPVVELGSDHNDPFVGLENHFFREEDYYNKLRTRRHVSSSAIALRCSTPLCIRNSFLKSNSEEEEDIFRSQTLKFDDLIPSIIGCNGRSRYLYDFRWIKKIGKGNLNEVFKVLKRLDGCMYAVKCTIKRLRTEPERLKAFKEAQSLAAIGFHKNIVRYYSSWIEDEQMYTQMEFCDHNLSSENCTTLLTERHEMDVLYQVSSALQFIHEKGIAHLHVKPENIYVKDGIYKLGGFGCATLLDNSLLVEEGDARYMPLEILNKNYDHLDKADIFSLGASMFDIIRRSHLPKAETEFSKLKEGKVPHLPGVTIQFQNLLQVMMDPDPLKRPSATEILGNSIFRGSLKMT*


CDS Sequence:
>Vu_32376.1
ATGAATACGAAAATGCAGAAAGAAAAGCCGGAGCTGTTGCCTTCATCCGGAGACGATGACGACATCATTCTCAGTCAGCAACTGTTTTGCACACCGGATTACTTAACTCCAGAAGATCAGTTTCCTTTGAAAGGCTTCCATAGTAACATCGACAAGGTGGAGGAAGATAGCCCTTGCCCCAAGTCACCAGAGAAGCCGTATGCTACGAAAACCAAGAGATGCCGAATGGATGATGGTGATACTCTCAGATTTACCGATGATGAACCAGTTGTGGAACTTGGCAGTGACCATAATGATCCATTTGTGGGATTAGAGAATCATTTTTTTCGAGAAGAAGATTATTATAATAAGCTGAGGACTCGAAGACATGTGTCGAGTTCTGCAATTGCACTACGGTGCAGTACTCCTCTTTGTATTAGAAACTCCTTTTTGAAAAGCAATTCAGAGGAGGAAGAGGACATTTTTAGAAGCCAAACACTAAAATTTGATGACCTCATCCCTTCCATTATTGGTTGTAATGGTCGGTCACGCTATCTCTATGACTTTCGTTGGATTAAGAAAATTGGTAAGGGAAACTTAAACGAAGTTTTTAAAGTATTGAAGCGATTAGATGGCTGCATGTATGCTGTGAAATGTACCATCAAGCGGTTGCGTACGGAACCAGAAAGGCTTAAAGCTTTTAAAGAAGCTCAATCTTTGGCTGCCATAGGTTTCCATAAGAATATAGTGAGATATTATTCTTCGTGGATTGAGGATGAACAAATGTATACTCAAATGGAGTTTTGTGATCACAACTTATCTAGTGAAAATTGTACAACATTGCTTACCGAACGACATGAAATGGATGTTTTATATCAGGTTTCTAGTGCACTGCAATTTATACATGAAAAGGGAATAGCTCATCTTCATGTCAAGCCAGAAAATATTTACGTCAAAGATGGTATTTATAAGCTTGGTGGTTTTGGATGTGCGACTCTATTAGACAATAGCTTGCTTGTTGAAGAGGGTGATGCACGGTACATGCCGCTGGAGATTCTCAATAAGAATTATGATCACCTAGATAAGGCAGATATCTTCTCCCTAGGAGCTTCCATGTTTGACATAATTCGAAGGTCACATTTGCCAAAAGCAGAAACTGAGTTCTCTAAACTTAAAGAGGGAAAGGTGCCACACTTGCCTGGAGTTACAATCCAGTTTCAAAACTTGCTCCAGGTCATGATGGACCCTGATCCTCTTAAGCGTCCTTCCGCCACTGAGATATTGGGAAATTCAATATTCAGAGGGTCCCTTAAAATGACATAA


Promoter Sequence:
>Vu_32376::LG9:17294083-17296083(+)
CCGTCTCGTCAATCCTTTCAGAGGGACGAAATCCTGGTTGGGGAAACTCTATCCCTGTGATCCTCAGCTTGGGAGGACCACCCTCTCTGTTTGATAAAAACTTTATAAGAATTGGCCACAGGAAACCATATAGGATGCCAAAATCAATGATATGGACGGTTTCTGATTTTGTTGCAGCTTCCATAATCATTGTGTTTGCAAAGAAATATGTAAACTTTTTAAAAGGTGTGGAAGATAGAAACACTTGATATGCCTTCAGGTACTCTGTAGCAGTAATCCTCTGAGAGTTCAGGAAAGAAAATTGTTCATGACCGCTAGAACCAGCCCCAACCAAGCGTGCATCAAGACCATTAGCGAAGTAGTGAGCTACCTTCTACGATGCATCTCCGAAGGGAGAAGAGTGTTGCCGAATTTGCGTTAGTAATTTGGTGGCAACTCTAATGTCATTGGCATACATCAGTAGAAGATTCCTCAAATCCACAGTTTCCTTCTACCTCCCTTTTTTCTTTGATCGGTCCTTCCCTCCATCTCGCTCCTCACCTTTCACTACTCCACTCTGTAAGGAATTGTGTTCACTACCCAGGTTTTCCACACTCAGAAACACCCGATCTATAGCATCTGTTCACTACCCACGATTTTCAAAATTATTTTTCTGTTCTTCACCGTTTGAATGAAGACCAGTTACAAACTTAGGGCCAGAAGGAAGAAGCTTGGTAGCTTCCTCTAATCCTCTCCTGAACTGGGAAACATAATCAACATCATTGAACATATTTTGTGCCAATAGTTTGGCGATAGAAGAATCCAAATATGAGAATCCATGACTAACAGTAAATGAAGGTGGCTGAGAAAAGACAACGATATTTCAAGTTGCATATGCACAATTATTTCAAGTTGATGTTCTTCACCCACCAACACTCATGCTTCCAATCGAACAATAAGGATTTTGTGGATGAGTGACGAGCCCTAAAATTCAAATTTCCCCAATTTTATTTCGATTTCGCAATTGCAGAGAGAGTGGGGCTTTCAGCAGAAAGTAGAATACGAATTCCCAACTTTGCCCTTTCTTTAATTAAATTTTGACTCTGTATACTTAATTTTTTAATTTAAAATTTAAAATAAAAGAATTGACACACGTTTCTAATGACACCTATGTTAAAACTACAATGTCAGCATGCTAGGTGACATAATCCTTAACGTTGTTTGATTAATTTGACGCATTAATTTTACAAAAATAAGGACCCAATCGAGATGCAAAAAAAGAAAGGGACCTATTTAAAATTCTGGACAAAAATAGGAACTTATTGAGACATTAAACCTAAAAGTAAATATATTGAATGATTTTGATTTTAAGTAAATAAAGTGTAGAAAGAAGCTATTAGAATTTTAATAACTAGGGACTTTTGGTAATTTTCAACTTTTACCAATTAAATAATTTTTTTATGATATCAATCAAATCCTACACTAATTCTTATAAACTTTACTTCTAAATTCACCCTTATTTACCTCCAAATCTATTCAAATAAACAACAAGTAATTCACCTTCAAATCCATCTACTCACTTCCTAAATCCTGGAACAAAGCATTGATTAAAACAATTAACTACCATATGCTTTAGTAGAATAAAATGTTACTACTATAATTTTTTATAATACAATTTTTTTAAAATTATATCTTTACAAACAATTATTTCTTTTACTATATAACACTCCGTAAACTACTTCTTACTTAATTTTCAGTTTTTTGTACATCGTATTTATGTTTTAAATAAAAAAAAATACAACACATTTTCCTTCAAATTGATTTGAACCATAATAAATACAATAGTAAAAAACGAAATAAAAGTAAATATATTGCATGATTTTGATTTTAAGTAAATAAAGTGTAGAAAGAAAGTATTAGAATTTGCCATCATGAGCTGCGCTTTTCAATGACAGGTCCAATCACAGATTAAATAAGTTTTTTATTACTCTGAAACAGTTCGTCTCCCACACCCAACCAGA


Gene Sequence:
>Vu_32376(+)
ATGAATACGAAAATGCAGAAAGAAAAGCCGGAGCTGTTGCCTTCATCCGGAGACGATGACGACATCATTCTCAGTCAGCAACTGTTTTGGTAAGAACTGTCTTACTCCCTTCAACCTTCTCTCTCTAACTCTCACCGTTGTTTGTCTTCCCCAGCACACCGGATTACTTAACTCCAGAAGATCAGTTTCCTTTGAAAGGCTTCCATAGTAACATCGACAAGGTAACATACATTTCAGTCTTTATATTTATATATTTTTATATTTATAGTTTTTCTTTTCCTCTCAGGTGGAGGAAGATAGCCCTTGCCCCAAGTCACCAGAGAAGCCGTATGCTACGAAAACCAAGAGATGCCGAATGGGTAAGAATAACTGTTGCTTGCTACTTTTTCCATTTTAGAATAATCTTAATTACAATGTCTTGAAAAAAATTTCATTTTTAACTATTATTCGGGTTGCTATTTCAGAAAATAACCACAAAAACCTATGATGGTGTTATTTTGAATGTAATATACACACGCACATACTTAATACATTTACCTTCGATGTGTCATAGATGATGGTGATACTCTCAGATTTACCGATGATGAACCAGTTGTGGAACTTGGCAGTGACCATAATGATCCATTTGTGGGATTAGAGAATCATTTTTTTCGAGAAGAAGATTATTATAATAAGCTGAGGACTCGAAGACATGTGTCGAGTTCTGCAATTGCACTACGGTGCAGTACTCCTCTTTGTATTAGAAACTCCTTTTTGAAAAGCAATTCAGAGGAGGAAGAGGACATTTTTAGAAGCCAAACACTAAAATTTGATGGTACGGATAAATGTTGTTCGAGTGATTTCGTTTTTTTTTATTTAGCTATTTTATTTTCACCTTTAGAGTTAAGTGGCAAATGTTTGCTTTTTACCACTGTATATAATTATGAATATGCACACTATGCAGACCTCATCCCTTCCATTATTGGTTGTAATGGTCGGTCACGCTATCTCTATGACTTTCGTTGGATTAAGGTATTATGTTTGACAAAGAAGTTGTAACTGCCTAACATGAATTGTTTTGGATTGGTATTGACTGGCTGATGATATGATTTTGGTTTTCATAACATTTTTCCTTGTTACCAGAAAATTGGTAAGGGAAACTTAAACGAAGTTTTTAAAGTATTGAAGCGATTAGATGGCTGCATGTATGCTGTGAAATGTACCATCAAGCGGTTGCGTACGGAACCAGAAAGGTGACATCATGATCATACCTTTGGATTTTATTTCTCATTGTGTTTGTTTTAGCTATTTACGCCAATCTTTTATCCTTGTAGGCTTAAAGCTTTTAAAGAAGCTCAATCTTTGGCTGCCATAGGTTTCTATTCTACGCTTTCAACTCTTCTTTTATTCAATATTGACTTTCATGTCCTTCTTTAGTCATATTTACCTCCTTTATGCTTTAGGTTTCCATAAGAATATAGTGAGATATTATTCTTCGTGGATTGAGGATGAACAAATGTATACTCAAATGGAGTTTTGTGATCACAACTTATCTAGTGAAAATTGTACAACATTGCTTACCGAACGACATGAAATGGATGTTTTATATCAGGTTGGCCTCATTTTATATGTACTCCTTTAGATAAATGATCTATTTGGTCCTTCAATTTGTGAGAAGTTGTCAATTTAATCACTGAAATAATGGGAAATCTGATTTACTTTCTGAAATAATGGTATTGTGTACAAAAGGAGAAAAACAGACAGTTGAAACAGTTAGTAGTTATAGCTGTTACAGACCTATATAAGTCTGTTTGGGGCTTAGAAGTTTTTTTAGTCTGTTCTGTTTTTAGGAAATTGTTGGGCAGGGCTGAGAGAAAGTCTCTCACAATACCACAGTGGTATCTTTGTAAACCTACGTGTGTTTTTGGTTGTTCTTTCTGTCACATTGATAGGAAAACAGCCTGTAATCAATAAAGAAGTATATCCAGAGTGTAGTGGGATATATCAATTCAATCAGTTTCTTCATATGTAGAAGATATAAATTGATCCATAAATATAGTTTAATATCAAATTAGTTCCTAATACTGTCACATTGATTCTTAAAATTACATTTTTTTGACTAAATAGTGGCACAAAACTTAACATGACCTAATTTTTGTATATTTTGGGAATGAAATAAACTTTTTCGTTCATTAAGCAGCCCTCCATTGCTCTGAGACCAAAATTGTCTTTTACTCATGTGTCTTACCAAGGAATCATTTCAGAATAATTTTATATAGTGCAAATCAGATTTGTTTAGGCATAACAAAAGTCATGTGTATACTGTACTCTCCTGGTTTCATTATCCTTTTAAATTCCTACTTAAATTTTTGTACTGGATAAGTTGTTTCTCTTTGGAGTTCATATTTTGATTTGTGGTTATAATTTTGGTCCAGGTTTCTAGTGCACTGCAATTTATACATGAAAAGGGAATAGCTCATCTTCATGTCAAGCCAGAAAATATTTACGTCAAAGATGGTATTTATAAGCTTGGTGGTTTTGGATGTGCGACTCTATTAGACAATAGCTTGCTTGTTGAAGAGGGTGATGCACGGTACATGCCGCTGGAGATTCTCAATAAGAATTATGATCACCTAGATAAGGCAGATATCTTCTCCCTAGGAGCTTCCATGTTTGACATAATTCGAAGGTCACATTTGCCAAAAGCAGAAACTGAGTTCTCTAAACTTAAAGAGGGAAAGGTGCCACACTTGCCTGGAGTTACAATCCAGTTTCAAAACTTGCTCCAGGTGCTTCTTTTCATTCTATTTTTTACCTGCAATCTGGTGGAACACGTTCTGGGTTGAAGTATTGAAATATTGCAATAATTATTTGCTCCCTTGTTTCTAAAATTTGCTTTCATTGTTTTGATTGTTTAGCAAATGTTATACCAGTAATGGGAAGTCCAATAGGGTACACTTCAGCGAAGAAACTAGAGATGGATACGTATATAATAACAGTTATTTAATTTTGTAAAATATACATTTAGTTCTATTTAAATGTGATCTGTAAGCTGTAATTAGGATAATAGAGTGAATGTTGTATGTTGCTTCTCTATTTACTGCCGAGTCATCTTGTCATTGTGACATTTAAATTCCGGCCATGTTAACTGGTGTTCTAGTGCATAAGAAATTTTAAAAGTAGAAAGTTTTAAATGGTGTTCTTTGATCAAATCTTGAATGTGTTGAATATTATAATTTGAGGTTTGATTTGGTTTACTTGACGAGTTTTTGGTGATTAACTTACAGGTCATGATGGACCCTGATCCTCTTAAGCGTCCTTCCGCCACTGAGATATTGGGAAATTCAATATTCAGAGGGTCCCTTAAAATGACATAA

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