Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32221 LG9 13166684 13169569 cell division control protein 2 homolog C
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 13166781 missense_variant p.Lys33Met
T/A 13166991 missense_variant p.Leu103His
A/T 13166996 stop_gained p.Lys105*
G/A 13167162 missense_variant p.Gly160Glu
G/T 13167272 missense_variant p.Gly197Cys
A/C 13167529 upstream_gene_variant
G/T 13167723 upstream_gene_variant
A/T 13167762 upstream_gene_variant
T/G 13167769 upstream_gene_variant
T/A 13167783 upstream_gene_variant
A/G 13167897 upstream_gene_variant
A/T 13168250 upstream_gene_variant
A/G 13168273 upstream_gene_variant
T/A 13168777 upstream_gene_variant
T/A 13168891 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32221.1
MEKYEKLEKVGEGTYGKVYKAREKASGNVVALKKTRLEMDEEGVPPTALREVSLLQLLSQSIYIVRLLSVEHVDKVPKAQKASANPLTKPILYLVFEYLDTDLKKFIDSHRKGPNPRPLPPQLVQSFLFQLCKGVAHCHSHGVLHRDLKPQNLLLDQQKGILKIADLGLGRAFTVPLKSYTHEIVTLWYRAPEVLLGSTHYSTGVDIWSVGCIFAEMVKRQALFPGDSEFQQLIHIFKMLGTPTEEQWPGVTSLRDWHVYPRWEPQSLARNVPTLGPDGVDLLSKMLKYNPSERISAKAALDHPYFDSLDKSQF*


CDS Sequence:
>Vu_32221.1
ATGGAGAAGTACGAGAAGCTTGAAAAGGTGGGAGAAGGAACGTATGGGAAAGTGTACAAGGCACGAGAGAAAGCGAGTGGCAACGTGGTGGCGCTGAAGAAGACGCGTCTGGAGATGGACGAAGAAGGTGTGCCTCCGACGGCTCTCCGAGAGGTTTCGCTTCTGCAACTTCTCTCCCAATCCATCTACATCGTGCGCCTCCTATCTGTAGAACACGTGGATAAGGTCCCCAAAGCCCAGAAGGCCTCCGCCAACCCACTCACCAAGCCCATCCTATACCTCGTTTTCGAGTACCTTGACACTGACCTCAAGAAGTTCATCGATTCCCACCGTAAGGGCCCTAACCCTAGGCCACTCCCTCCCCAACTTGTTCAGAGCTTTCTCTTCCAGCTATGCAAGGGCGTGGCGCACTGTCACAGCCACGGAGTCCTGCATCGCGATCTCAAGCCCCAGAACCTTCTCCTCGACCAGCAGAAGGGGATTCTCAAGATCGCTGATCTGGGCCTCGGGCGTGCCTTCACGGTCCCTCTCAAGAGCTACACCCATGAGATTGTTACTCTGTGGTACAGAGCGCCCGAGGTTCTCCTTGGCTCCACGCATTACTCCACTGGGGTTGATATTTGGTCTGTTGGCTGCATCTTTGCTGAAATGGTGAAAAGGCAAGCGCTTTTTCCTGGGGATTCTGAGTTCCAGCAGCTAATTCACATATTCAAGATGTTGGGGACTCCAACGGAGGAGCAATGGCCAGGAGTTACTTCTCTGCGCGATTGGCATGTGTACCCGCGGTGGGAACCTCAGAGTTTGGCAAGGAATGTACCTACCTTAGGACCCGATGGAGTGGACCTGTTGTCGAAAATGCTCAAGTACAACCCTTCTGAGAGAATATCTGCCAAGGCAGCACTTGATCATCCCTACTTTGACAGTCTCGACAAGTCTCAATTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_32221::LG9:13164684-13166684(+)
TGGGTCGGATGACCTGTTTTGGCAGCATTATAAAATACAATTTGTCCCGTGATGGGCTAATGGACTAACATGCCAGCCTATCTAGTCCATATTTTTTCAACACCTCCAACTCACTATTTCCCTCTATTCCACCATTTCGAATTTCTAGACCTAGTCTCTTCTCTCAAACACAAAATTACTCTCGAAAAAATCAAACAAGGCCAATAGATCCCAACAGAGAGTCCTATATATAATCAACATCTCAAATAAAAATGAAGAAGAATAAAAAATCACAATATTATGAATCAAATAAAAAGAGAAGAAGTGAAGAAAAAAGGTTGAATGGCCATGGAGAAAGAGGAGTGACGACTGCAACTTCCTCCCTTGGTTAGGCTAGTAGCAAGAGTGGGTTCGATCGTGAAGGCAATGTGACACTAAGGGTGTCTTCAGGTGTGGTGGCGGCCCTAATCTGTGTGATCGTTGTCTCCTCACATTCTTCTTCCCCAAGCATGAACGATTAGGTTACAACGAATCTGGGTCACAACTCGTCGTTCACACGTTTTTCCTTGGTTTGTGACGTGCTGATTTTTGAGCTGTTTTTATTATGTTTGCAATTTGACAGAGTTAGGAGGGGAAAGAGGAAGTGGTCTGCCATGGTTTTTGTTGAAGTAAAACTATATATTTGGTACTCTAAGCCTTTTTGAGTTTGTTCCTCGTTGTGGCTTTATTGGTTTCATTGATGTGTTGTGTTGTTTTTTTTTCTTTGTGGTGTTTGTGTTTCTTTCTCTATTGAATTTAGGAGAACATTAACCACATAACACAAATAAATTAATGATACAGGCCATAACAGGCCAACCTGTTTTACATATTAAAACATGGAATATGTCAGCTTGCGGCTAACCTGTTCTACAACCTAACAGACTGACATACCAAACATGCCAGGTTAATACAGGCTAATGGGTCTGACCTACCTTTTCTTCTATGGGGTTGACATTGAAGTGAGAACATGTTAAACCGTATAAATAACTTAAATCTAACATAAATGCGTTTGACACATACGTAATTGGATTAAAAATACTATATTTATGCATTTTTTAAAGTTTAAAAATTAAAATATATCAAAATTTTATTAAAAAACAAATTTCAATTTCACATAAAAAAAAGTTGAGAGAAAAAAAACATATTTAACCTAATTTATTATTCTAGGTGGTCTCGAAAACTAGTTTTGAAACTAATTCTAAAATCAAGACATGGACCAAATTTTCATTTTAATTTGCTCTATTTTAAAACACAAATAATATAACTTTTATAGAAAAGAAAAAAAAGAATAGAATGCATTTTAAATGTGGATTTAGGAAGGTTTTAAATGGCATGTGATTTTAAACATTTCTCCTTTTATAGTTAATTTTTTTTTTTTAGTTTGTCGGTACCTGTGTGTACCTTGTACTGAACAAGAGTGGAGAAAAAACAGAAACACTACAGAGCAGGCAATCTGCAGTGCATTTTCTAGTCTTCCTGTTAGCACAACTCATACAGTACACATATTTATGCGCTATCACACACACGCTATCACACACACGCTATCACACACACAATGGCAATGCGTTGCCACAAAATTTGACTTATTTTTTAAAATATGTTTAAAATATCAAAATTAATTTTTAAAACACAAATATAAAATTATCATTTAAAAGATTATAATTTTTTATATTATATTGATGGAAAGATACAAATATAGTAAAATAAAAAAGAAAAAATATTTGAAAATCAAAATGGCGCCTCTTAGACTGGATCTGGAACGTTACGTTACACAGTTTCACATTCAAATTCGCCTTTTCCCCAATCATCTACCCTAATCTGGCTCCGCGCCTCTCTTACACTCTCTTATCATCATCAACAACACTCTCAGGTTTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCGTCTCCGTAGTTTCATTTTGCATATTCTGTGGATTATCTGTTTGATGAAATGCACCATCGATGATGAAGTGAGTAACCGAAA


Gene Sequence:
>Vu_32221(+)
ATGGAGAAGTACGAGAAGCTTGAAAAGGTGGGAGAAGGAACGTATGGGAAAGTGTACAAGGCACGAGAGAAAGCGAGTGGCAACGTGGTGGCGCTGAAGAAGACGCGTCTGGAGATGGACGAAGAAGGTGTGCCTCCGACGGCTCTCCGAGAGGTTTCGCTTCTGCAACTTCTCTCCCAATCCATCTACATCGTGCGCCTCCTATCTGTAGAACACGTGGATAAGGTCCCCAAAGCCCAGAAGGCCTCCGCCAACCCACTCACCAAGCCCATCCTATACCTCGTTTTCGAGTACCTTGACACTGACCTCAAGAAGTTCATCGATTCCCACCGTAAGGGCCCTAACCCTAGGCCACTCCCTCCCCAACTTGTTCAGAGCTTTCTCTTCCAGCTATGCAAGGGCGTGGCGCACTGTCACAGCCACGGAGTCCTGCATCGCGATCTCAAGCCCCAGAACCTTCTCCTCGACCAGCAGAAGGGGATTCTCAAGATCGCTGATCTGGGCCTCGGGCGTGCCTTCACGGTCCCTCTCAAGAGCTACACCCATGAGATTGTTACTCTGTGGTACAGAGCGCCCGAGGTTCTCCTTGGCTCCACGCATTACTCCACTGGGGTTGATATTTGGTCTGTTGGCTGCATCTTTGGTCAGTCCACACCCACTCCCTCTCTCACTATCTTTATTCTAGTTTGTTTGTGTTTGAGTTTGGATGAATGAGTGCTTGCAAAAGAGATTTTGAATTGGATTTTTGTCAATAAAATCTGACTTTTGAAGTAGTGTGCTAAATTATAGTTGTTTTTATCTAAACTTTTTTTAGTAAATAATTGTATTTGAAGATCTCGCCATCGACCATAACAACTAGAAATAGATCAAATTATAGCATATAACTAGATGTTAGTTTCATTTTATTGAATTAAGTTGGATTTAAATTCTACTATTACAGAAGTATTATAGGTTCAAATTGTTAGAGGCAATTTCTCTGTAGGATTTAAAACTGTATTATCAATTGTCAATGCTAATGATATAGCTAATATTATGAGAGGAAGTATTATTCTAGTGAACATGTTTGTTTGTATTTTAAAAAATGTTAAGTTTATTTAATTAAAAAAATGGGGAAACAAAAAAAAATGTCAAAAGGAAAAAGTTGGAAAGGGTAATTATTATAGAAAATAACATTCATTTTATGTGAATGCAGATACTCATTCTTCATAATGGAAATGGGAAGTAAGACATCAATTATTTCTGGAATGTTTTTATTTTCAATACTTGTAACAAACATAGTAATTTTGCATTCCTATGTTCACTCTTACGAGAATCTTTCTAGATACGTTGAAACAAACACAACCTTTTATTGAGTATTTTTCAAGTGCGTTTGGTTAAATTTGAATATTCTCTGGAATATTTCCTAAAATCTACAAGAATTGAAAATGGAAGTTAAATGTGCATTAGACTCTAACTTTTCATATTTTTATGGAAATTTCATATTGTATACTCACGGAATAGAAATATAAAATAAAACGTGCTAATGTAACTTAAAGAGGTACTTTTAGACAAACTTACTCACACTAGAACTCCAATTAGTCACATCCGAAAATATGCAGAACCAAACATGTTTATTAGTTGCTTAATATTATGTTAACTAGTATTTCAATACGATGATTCCGGATTATCTAATGTAAATCCCAACACTCCTTTCTAAATTCCTCGACATTTTTTTTGTTTGTATGTTTCTATGCAGCTGAAATGGTGAAAAGGCAAGCGCTTTTTCCTGGGGATTCTGAGTTCCAGCAGCTAATTCACATATTCAAGTATGTCTGAAAACTTATTTTTTAGTTGAGTGGAATATTAGAACTTAGAAGCTAGTCACTTTTTTTCTGTCTTTTCTTTTCATACCTTGTTTGTTGATTCAACTATGCTATTTACTAATTATTGATCCCTCAAGGATGTTGGGGACTCCAACGGAGGAGCAATGGCCAGGAGTTACTTCTCTGCGCGATTGGCATGTGTACCCGCGGTGGGAACCTCAGAGTTTGGCAAGGAATGTACCTACCTTAGGACCCGATGGAGTGGACCTGTTGTCGGTTAGTATTTGTATTTTTCCTCTCTTGAATCCTCTACGCTTCTGAATTCATAACCATCCAGTCCTTCACATAAATATATACGTATATATTTGTACAACATAACTTCCAGTCACGTAAATGCTTCTGACGTGTTCTCTGTTTCGTAACAACCCGAACAAAATCGAAATATGTCTGAGACTGTGACATAGGTGCTCTGCTTCATTTTTTTCTCAAAGTATCTTTTTCCTGGTGATGAAGTAATCTCGATGTAGTATCTATTGATAAAAAGAAATTTTACGTGCAATAGGAAAGAATGCTGTAAACCAGGGTGGGTTCCTCATGGATATCAGGTGCCTATAAAGAAATTTTGAAGCCAATTAAGGTTGCCTTAATACTTAAAATAGCATAATTCCATTTTAATTTTGGGTGGCACGGTTTCTAGTCCTATAAAAGTGGATAAGTCCTATAAAAGTGGATAGAAGGAGTTCAAGAAAATTATTAAAAAAAGCATTAAGTATATTTGAATTAATTTTTAGAGTGGTCAATTTAACTTATCTCACATGGCTGGAGTTTGTTATATATCATACACTTAATGTGGCTTATCACACTTGATTGGAGTTTCTTGTATACTATCACCTGATCCAGCTGTGATATGTTGCTAACCTTGAGTTTTGTACGCACTACGTATACATATATAACACCCCCTTTTGAACAATATATTTTCTCTCATCTGCAGAAAATGCTCAAGTACAACCCTTCTGAGAGAATATCTGCCAAGGCAGCACTTGATCATCCCTACTTTGACAGTCTCGACAAGTCTCAATTTTAG