Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32219 LG9 13149943 13153368 PREDICTED: AP2-like ethylene-responsive transcription factor At1g16060
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 13150121 synonymous_variant p.His240His
T/A 13150199 missense_variant p.Lys214Asn
T/C 13150265 stop_lost p.Ter192Trpext*?
T/A 13150365 intron_variant
A/T 13150588 intron_variant
A/C 13150646 intron_variant
T/C 13150651 intron_variant
C/A 13150660 intron_variant
T/A 13150664 intron_variant
A/T 13150665 intron_variant
A/T 13150862 intron_variant
A/T 13150878 intron_variant
G/A 13152026 intron_variant
A/C 13152080 intron_variant
C/A 13152122 intron_variant
T/C 13152215 intron_variant
A/G 13152225 intron_variant
T/C 13152316 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32219.1
MARKSQKTLKNTDTNNNTAKRTRKTVPRDSPPQRSSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQSKKGRQGAYDDEEAAARAYDLAALKYWGQDTILNFPLTNYEEKLKEMEGQSKEEYIGSLRRKSSGFSRGVSKYRGVARHHHNGRWEARIGRVFGNKYLYLGTYATQEEAAAAYDMAAIEYRGANAVTNFDVSRYINWPGPKSEEEHKNVAINENVNSNGDIELGFVSHEHGSITDENTTEHVAQSTESNPSRRTFPEDIQTIFESQGPDIYTENDDIIFGDLGSFGAPIFHFELDV*


CDS Sequence:
>Vu_32219.1
ATGGCCAGAAAATCGCAGAAAACCCTCAAGAACACTGACACCAACAACAACACTGCAAAACGCACACGCAAAACCGTTCCGAGAGACTCACCACCACAACGAAGTTCAATCTATAGGGGTGTCACAAGACATCGTTGGACTGGTCGGTATGAGGCTCATCTCTGGGACAAAAACTGTTGGAATGAATCGCAGAGCAAGAAAGGAAGACAAGGGGCGTATGATGATGAAGAAGCCGCAGCACGTGCTTATGATTTGGCAGCATTGAAGTACTGGGGCCAAGATACCATTCTCAATTTTCCATTAACAAATTATGAGGAGAAGCTGAAGGAAATGGAGGGTCAATCGAAAGAAGAATACATTGGATCCTTGAGAAGAAAAAGCAGTGGATTTTCTCGAGGAGTTTCAAAATACCGAGGTGTAGCAAGACACCACCATAATGGAAGATGGGAAGCTCGAATTGGAAGGGTCTTCGGCAACAAATACCTATATCTTGGAACATATGCTACACAAGAAGAGGCAGCAGCAGCATATGACATGGCAGCCATAGAATATAGAGGAGCTAATGCTGTTACAAACTTTGACGTGAGCCGTTATATCAATTGGCCAGGTCCTAAAAGCGAAGAAGAGCACAAAAATGTTGCTATAAATGAAAATGTAAACTCTAATGGCGATATTGAGCTAGGATTTGTTTCACATGAACATGGTTCAATCACTGATGAGAACACAACAGAGCATGTAGCACAATCTACAGAGTCAAATCCTTCTCGTCGCACATTCCCAGAAGACATTCAAACAATTTTTGAGAGTCAAGGACCAGACATCTATACTGAAAATGATGATATCATTTTTGGTGATTTGGGTTCATTTGGGGCACCAATTTTTCATTTCGAGCTTGATGTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_32219::LG9:13153368-13155368(-)
TGACAGGTGACTCAGCAGTGCTTTTATGGTGACGTGACAATATGTCTTCAGAATAAACTAATTGGCCATCAATCTATATAATTTTATGCTAATTAAGTGTGGATTCATTAACAAAAAAAAAATATTAAGATCTATTTAGATTTCATAGGCTTTAAGATTTTGAGATTTTGTATTAAGATGTTTGAAGATTTTAGCTAGGATACAACAATTGTTTGTATTCACCCACTGATAAATTCTTTTCAAAGAAAAATATAAATTGTTCTAGGATTAATAATAATAATAATATACCGACCAAAATAAAAACAATAAAAACATGGTCGAGTTATGATTAATTTCCGGACTGCAAAAAGCAATGTCTACTCAACGATAGTGACTTATATGCACTTATATCAATTGCTGCATTTTTTTTTTAAATCTTTTGTATTTTAAATTTGAAAAATAAAATTACATTTACAATCTAAATAAACAAAGCTCCAATTCACACAAAAACAATTTAAGTGTTTTCTTTTTATAGTTTTTCCTATACTCTCTTTTTACACTAACACTTACAGCACAGTATGAGTAACCTTTGATTGTTTGAAACATAAATATAATGTTATATCCCTTAGAGATGATAAAAATTAAAAAACAAACAGAAATTTTATATAGAATTTGAAAATTTTCAAAAAGGGTTATTGCAATTTATCAAAATGATTACAATCATGAAAGTAAGAACAGTGAGACAAAAGCATAGTGGACTAGCTTAGAGACAGCCACAATAAAAAGCAACACTTTTTTTTTCGTTTTTCCGTCCAAAACTGAATTATTTAAGTTAGTCAGAAGAACAAAGAACAAAAACTTACAAAATCTACTGCAAATATAAACTTCATAATCCTTAAAAAAAAACAAAAAACAAAAGAATATATTCAAAATGTGCAAAAAAAAAAAACAAAGGTGATAAAAAAAACTTATTTGTAAGAATTTTTTTTTTTCAAATTTAAGATACATTTAGTTTTAATCTCTTAAACTTAAAAAGAAAGTAGTTTTCCAAATTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTCTTAAATTAAATTATAAAGTATTTTGTTCTTCTATCTTAAAGAAGTTTTCATCTCTACAACACCTTAATAGGTCAATAATAGATACGTGAAATCGTCTGTTTGTTAGATCGTTAGATAGATAGCTTATGTGACTTTTATAAAACGTAAGAACTAAATATTTTATTATTTAATTTAAATATCAAATATAATTTGTTTATAACAACTTAAAAACAAAAAACTAATTTAATCTAATATTTTTTAAATTTAATGGTCAAAAGAGAGTTATTTTCCAAAAATAAAAAATATAACTTTTACTTACAAATCTTCAAAAATAGTATTTTTCTTATGATATAAAAATTAATTAGAAAATATTGTTGCAATTCATTGATTATGTTAGCTAAACTAACTGCCTAGGTTTCGTGTAACCACATTGACTTTTCTTTTTTTTTTTTCATTCTTTAAAAGAGAATAGGTTACCCAACCAGAAGCAGTTTTACAGTGAAAAATATAATTACAAAAACTCAATAATATTAACTTATTAAAAAATGTAAGAATGGATGAAAAAGTTTATGAAAGCATTAATGATATGATAGAAAAGTAAAATACAGAAAAAGTATTAATGAAGTGTTAGAGATTATTACTCCTTTCCATCCTGAAGAATCTGTGTGTTCAACCACTAACCGCTACTGCATCAACAATAAAAAGGAAAATAAAATGTGAATAAATATATTATTAAATTATATAATTTATTTATGGGAGAAATAAAGAATAAACCTACTTTTTCATTCCCTCACTATTTCTATTAATTAATGCCTTTTTTATTGGATGACTTGGTCATATTTATAACCCTCTCGAACTGTATGCACTGCAGTGGTCCTCTCTTCTCTGCTGAGTTTTC


Gene Sequence:
>Vu_32219(-)
ATGGCCAGAAAATCGCAGAAAACCCTCAAGAACACTGACACCAACAACAACACTGCAAAACGCACACGCAAAACCGTTCCGAGAGACTCACCACCACAACGAAGTTCAATCTATAGGGGTGTCACAAGGTTATAATTATAACAACACTTCTCACTGTCTACTCATCAATCCAGATCTATGTCTCTGACATTTTTCTTTTTCGTTTTCTTTCTTAGCTCTTTCCCGTGTTTCATAATGCTGTCTTCTCCTCAAATGGCTCATGAGCTTGTTTGCATGCATGTGGTTTTTTTTTTTCAGACATCGTTGGACTGGTCGGTATGAGGCTCATCTCTGGGACAAAAACTGTTGGAATGAATCGCAGAGCAAGAAAGGAAGACAAGGTTTGCTGCTTTTTTAATTTCATCTCTTCATTATCACTTCTCTCTCTGTTTCTGATTTTCTTCACATGATTTATGTTGTCATGTTGATTGTGTTCCGGCAATGGAAAACAACTCCGTTGATGCAGTGTATCTAGGTATGATATGAATCATGGTAACTTTCATTGATGTTGTTTTTTTCTTCCTTAATTTTTGGCATTGAAAATTGATTGCGATGGACTTTGTTAGGGGCGTATGATGATGAAGAAGCCGCAGCACGTGCTTATGATTTGGCAGCATTGAAGTACTGGGGCCAAGATACCATTCTCAATTTTCCAGTATTATTTTTCTCACCTTTGATTCAAATGATGTTTCGATAAACAACTTTTGTTGTTCATACATCAGATTTGATCGATCAATGTTTTTGGTCACAGTTAACAAATTATGAGGAGAAGCTGAAGGAAATGGAGGGTCAATCGAAAGAAGAATACATTGGATCCTTGAGAAGGTTGATTTTCAGTTATTAATTCCATTAATTTCTACACATGATAATGCATTTCCGAAGCTTTTTCTCTGTCTTCTTTATTTTTGGAACTGTTGAAGTTGTTTCTTATTATATTCAATTTTCATTTTGCAGAAAAAGCAGTGGATTTTCTCGAGGAGTTTCAAAATACCGAGGTGTAGCAAGGTATTCCAACCTTGCTCTGTTTTGTTTGGAAAATGCTAGGTTTCGTGACATTTTATATATATATATATATTTTTAAAATATATAAATGTAGTAATTGTATCAGTTCTAAAAGAAATTAAAGGGAGTAGCTGAATAAAAGTCAGTCTATTGATAGACGAAAGGATAAATAGTGTAAATTATATAAAATATTATTTCTTTTGAAGTACAATAAATGAGTTAGTTTGCAGGTAGTATCCAATATTCTTGGAGGCAATTAGGAAAAATAAAATTAATAAAATATCCCATTTTAGATGGATTCCCTCGGGAGAGAAGAAAAATACAAAAAGCAAAATAAATATAAGAAAAATTAAAATGTACATTTATAATTATTGAACAATATTTTTGTGCTAAAAGAGTAGTGAGTTCTCACCATTAGTTGTGGACATTTATTAAAATTTCATATTTTAAAGATCAATTATGTAAAATACAATAAGTGTGAAATTACAATCATATATACCAAACAAGTTTTTCAATGTCTCTAACTTTTAAGTTAATTTTCATAAACATAAACTTTCTCCCTCATTCCCTTTTTCTCTTTATATAGAAAAATGATATTTCAACACACATAAATTTATACATTTGACCCTGTTTTTTAATTTTTTTATTGTATTTTTTAAATACAAAAATTTATTTTTTTATAATTATTTTATTTTTGTAACGTGTTTTAAAAGCACGTTACTGAACCATTATTTCTCTGTATATAGTTAGTTAGATTGAGAAAAATAGTCTGAATTTTTGTTTAAAATGATTAGACACCACCATAATGGAAGATGGGAAGCTCGAATTGGAAGGGTCTTCGGCAACAAATACCTATATCTTGGAACATATGGTAATTTTCTTAGACTATGATCTATATTTAGATTAGGTATGACTCATAATTGTAAAAAAGAAAAAAAAGGTGTTGTGTCTATTTTAATTAATGGTTTTTATGTGCAATTCCCATCTTTACAACGAAGCATATGGTCTTTACATTTAAATGCATCTTTAATATGAAATTTGAAATTGTATTTGACCATTGTTTGTAATTCTAACAAGAAAATACCTACTTCATTTCAAGAGGTCCCGCATAACAAATATAAAGGTCAAAATGTGCAATCAAATCACATTGGTTGCAATATAGATCACCAAACTCCAACTGCTTAATAAAGCTATTTAAGAGTGACATCATTCTTCCCTGTTCTTTTTTATTCTAAACCAAACCGAAAGAAGAAGAAATATCATAGGTTTGGTAGTGACATGGGCATATGTCTCAACACATTATGTCAAAATTGTACCTTAGGTTTTAACTGCTATTGTTCCTTACCTAATTAAATATAAAGTTTAGATATAAAATTTAGAGTAACAATATAATGACATATATTTATATTTATTTTACACCCATTATAAAGATCAAGTAGTTATAAAAAATATGAATTTTTGTATTTAAAAAAATAGTAGTATTAAATGAAGGTAAAAAAATTATATATATTAAAGTGTTATTTCTGAAAAGTTTAATATCTAATTTTTAATATATTTTCAACTTACTTTATCTTAAAGGATTTCATGTGTACTAAAGACAAAATTAATTTACAATATATAAATACATGTAAATATAATCTCAAAATGTTAAGTTTCTAAAATTAATTGGGTTAAATATGTTTTTTTTCCTTAATTTTTTTGAAATTAGAATTAATCCTTCTTAGAAACTTTGGTCCAACTTAGTCCTTTAATTTTATAAATGGGTAGATTTAGTCTTTTTAACCAAAATTTATTAAGTTCATTTGATGTTTCAAATGTATTTCATGATAACATTTGAGTTGTTTACATTTCTAAAAATGTGAGACTAAATTATACCAAACTTTTGAATAGTCACTAATTCCGATTTTTACTGAAAGTTAAAGAGCCAAAAATATATTTAACTTAAATTGATTTAGATTTTAAAATTTTCATGTTATATTTGCAGCTACACAAGAAGAGGCAGCAGCAGCATATGACATGGCAGCCATAGAATATAGAGGAGCTAATGCTGTTACAAACTTTGACGTGAGCCGTTATATCAATTGGCCAGGTCCTAAAAGCGAAGAAGAGCACAAAAATGTTGCTATAAATGAAAATGTAAACTCTAATGGCGATATTGAGCTAGGATTTGTTTCACATGAACATGGTTCAATCACTGATGAGAACACAACAGAGCATGTAGCACAATCTACAGAGTCAAATCCTTCTCGTCGCACATTCCCAGAAGACATTCAAACAATTTTTGAGAGTCAAGGACCAGACATCTATACTGAAAATGATGATATCATTTTTGGTGATTTGGGTTCATTTGGGGCACCAATTTTTCATTTCGAGCTTGATGTTTAG