Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32158 LG9 12178472 12180056 PREDICTED: disease resistance protein At4g27190-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 12178517 downstream_gene_variant
A/G 12178552 downstream_gene_variant
G/C 12178665 missense_variant p.Ser316Cys
T/C 12178690 missense_variant p.Arg308Gly
T/C 12178704 stop_retained_variant p.Ter303Ter
G/A 12178758 missense_variant p.Ser285Leu
G/A 12178780 synonymous_variant p.Leu278Leu
C/A 12178785 missense_variant p.Arg276Ile
A/C 12178807 missense_variant p.Trp269Gly
G/T 12178836 missense_variant p.Ser259Tyr
T/G 12178876 synonymous_variant p.Arg246Arg
T/C 12179203 missense_variant p.Arg137Gly
C/G 12179304 missense_variant p.Arg103Thr
C/A 12179338 stop_gained p.Gly92*
T/A 12179360 downstream_gene_variant
G/C 12179402 downstream_gene_variant
A/G 12179461 downstream_gene_variant
A/T 12179514 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32158.1
MKAAVVAHHLGNLISNRSILEILKTDLKTLQVQRQKVQENLIWEDKEFQTKSDWLKRVDEILGQGDNLLNSYEGRSSCTNILLRYKVEFDLEEFGVPPGNEHEGCKVFLTSGNLKFIQYLEDASKLNKVFQLEELQKEEARKLFEKKVGSFDEDQSSIVEEIVRSCEGSISLIYALAKALENKGEDALMQFKENSSPAKLLSYCLEENEEHKALLYLLAIRGRRFINSYSMYIDMWTGVFKNLETADAARKKRESRISDLKAYGLVVENGKDWVKVDDYIYHTAYRMALHDRRASVISTEWPPKELLTDLHFCNLHPVGDLKLPATLQCPNLKHLLIRP*


CDS Sequence:
>Vu_32158.1
ATGAAAGCAGCAGTGGTTGCACATCATCTTGGTAACCTAATTTCCAACAGAAGCATTTTGGAGATTCTCAAAACTGACCTCAAGACTCTGCAAGTTCAAAGGCAAAAAGTGCAAGAAAATCTTATTTGGGAAGATAAAGAATTCCAGACTAAAAGTGACTGGCTCAAAAGAGTGGATGAGATTCTTGGACAAGGGGATAATTTATTGAACTCCTATGAAGGCAGAAGTAGTTGCACAAATATTTTGTTGCGGTACAAGGTTGAATTTGACTTGGAGGAATTTGGAGTTCCTCCGGGTAATGAACATGAAGGGTGCAAAGTATTCTTGACATCAGGAAATTTGAAATTTATACAATATTTGGAGGATGCCTCTAAGCTTAATAAAGTGTTTCAATTAGAAGAATTACAAAAAGAAGAGGCTCGGAAGCTGTTTGAGAAGAAGGTTGGAAGTTTTGATGAAGATCAAAGTTCCATTGTAGAAGAAATAGTGAGAAGTTGTGAAGGTTCCATTTCTTTAATTTATGCCCTAGCAAAGGCATTAGAAAATAAGGGCGAAGATGCCTTGATGCAGTTCAAGGAAAATAGTTCACCAGCAAAACTATTGTCCTATTGTTTGGAAGAAAATGAGGAACACAAAGCATTGTTGTATCTTCTTGCTATTAGGGGAAGAAGATTTATTAACAGTTATAGCATGTACATAGACATGTGGACAGGTGTATTCAAAAATCTGGAAACAGCAGATGCTGCAAGAAAAAAGCGTGAGTCACGGATTAGTGATCTGAAGGCCTATGGTCTTGTGGTTGAAAATGGAAAGGACTGGGTCAAAGTAGATGACTACATATATCATACTGCTTATCGAATGGCCCTACATGATAGAAGAGCTTCAGTGATTTCCACAGAATGGCCACCTAAAGAATTGCTAACAGATCTTCACTTCTGCAACTTACATCCTGTTGGTGATTTGAAGCTTCCCGCAACGTTGCAATGTCCAAACTTGAAACATCTTCTGATAAGACCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_32158::LG9:12180056-12182056(-)
GGGTTGGCCACTTAGTGAGCCAACCTAACCCGACTCATTTAGTAGCAAGTCGAAAAAATTTGAACCCGACCCGACCCACCACGGGTTGGTGGATTAAACGGGTTGGCTCATTGGTTTACTTAATTAACGTTTTTTCACCCTCTTCTTCTAAGATTCTTATAACATGTTACTTTGATCGATCAAATGGAAACAATAATAATTGGACCGATTGATATAAAAAAAATGAAACAAAAGAAATATATTGTTATATATATTCTAAGCTATCAAGCATAAAATTTTGCCAATTTAGTTTAATGAGACATACACAACCGTTTCACGAAGAAACTACATATAGTCGTTAACAAAAATATATAACACAAGATAAAATTGTCATGCTTGTAGATATGTCTAAAAACAAGATAAAACAAATTATATATTCCTGAATTATCCAATCTATAATATTATCCATCTATTAAATTGGATTCCTAAATGGATAAATCCACAGTATTATGCTCTCTTGAAACATTTTCTTCTTTATCTCCATCTATAATATTATCCAATCTATATTCTTAGGGTTTTATTTGCAAAGGAAACTTTTGGAAAGACAACAATGTGAAAGGCTCTATTGCTAAGTAAAGGTTGTGCATTTTGATTAACTAATTTAATTAATTTGATTTTAATAAAAAAATAGGATTTGAATAATTAATTTAATTAATTTGATTTAATTAAAAAAAATAGGTGGGTTGGTGAGCCAACCCGACCTACCATGGGTTCAACCTATGTGAGCCGGGTTCTTAGTGAGCCGAATCAAAACTGGCTCGCATAAAAAATTTTGCATTTTTTTCAACCCAACCCGACTCAAACCCGTGGTGAGCCAGGTTGGCTCACAGGTCTCAATCCATTTTGACAGCACTAGAGAAAACGACTAAATCCAAGTTTTGTTTCATATTCCTCTTCTTAGCTTAACCAATTATTGGTTTCAAAGTGGACTTTTAATTAGGGTTGACCCAATTACGATCTATGAGCCTATAGGCATATTTTACCATGTTAAACATGTTGGATTTGTGATGATGATTTTAATATGTACTACTGATTGGTCTTCTGTAGAAATGGTAACCGATTGGTCGATGCTGCTATGGGGTTTTAGGAAATCTTCATTATTTTGGGAGAGTTGATCGTTCGGTGACATAGAGAATGCATTGACAGGGCAATTAATTATACGGTACAATAACTATAAACTTACTATGATTAAAATTGTTCTTTTGAAAATTTACTATGATTGGTGTGCTTTGAAGCACTACAAGAAAATCTTTAAATAACAATCAATTTTTGAAATAAAACAATTGGTCACTATAGGAACTAATTTAGGTACTAATTTATAAACTAAAAATTATTATTATCTAAAATAGTATTTATTATTAATAAAAAAATTATAATTACTTTATGAATTAGACTCTAAATTGGTCATTAACATTAATTATAATTACTAATATATAAAAAAAATTTAATTTATAAATTGACATTTTGTCAATAACCAATTATTTTTTATCTTTAAAATTTGTTACATTTAAAGATTATTGCGAAATGTGAATCTAAATTATATGTAAGATGTGATAATACATACTCATGCCAAACTTTTACATATAAAAAAAAAACTAATATAATATTGTCCTTTTATTTATAAAATTATAATCATGTCCTTTCGATACCGGTTAAATGTGAAATGATAGAAGTTTGTGTACGATATTATTTTTTTGCCAGTAATAAATTAAATAGTTTGTTCAATCTGTTGTGTTCATGACAGGAAGTACAGTTGAAGATAAATTGCTCTTAAAGTCACATCCTTTCTGTTTTCGTCATTATATAAAAGAGGGTGAGCCATTTGCTTCAAATTTTGCGTCGCTTCATTAAAGTTGTTACCTCTATCTATTATCCTATCCGAGATTAAACTAGTATCTCCTTTGCAGCAACCAACACAAGAACAAAGGAAAGGAAGATCATTTGGCACATTGTTTCAAAAG


Gene Sequence:
>Vu_32158(-)
ATGAAAGCAGCAGTGGTTGCACATCATCTTGGTAACCTAATTTCCAACAGAAGCATTTTGGAGATTCTCAAAACTGACCTCAAGACTCTGCAAGTTCAAAGGCAAAAAGTGCAAGAAAATCTTATTTGGGAAGATAAAGAATTCCAGACTAAAAGTGACTGGCTCAAAAGAGTGGATGAGATTCTTGGACAAGGGGATAATTTATTGAACTCCTATGAAGGCAGAAGTAGTTGCACAAATATTTTGTTGCGGTACAAGGTTGGTAAACAATCAAGAAAGATGCAACCAGAGATTTCAGTATTAATTAATGAAGGACACTCTCATGTATCAGCGGAAACACGAAAACATTATGAAAGACCAGAATCAAGAGATGAAACGATAGTAGATATTATGGAAGCCCTACAGAACCCTGATATCCAAGCAGTTGGAGTATGGGGGCTGGGTGGTTTAGGCACAACCTCATTAGCCGAAAACATTAGAGAGAAAGCAAAAGAACAGAATTTGTTTGATGCAATGGTTTTCATAACTGTAACTGATAAGCCTAATCAGGAGCAAGTTCAAAATGCTATTGCAGATGAATTGGGAATGCAGTTTATCAATGGAGAAAGTCTTGTGAAAAGAAGAAATAAATTGCGTCAGAGAATAAAAAAAGAGCAAAGTACTCTCATCATAGTTGATGATACGTGGGGGAATTGAACCCAGAAGAATTTGACTTGGAGGAATTTGGAGTTCCTCCGGGTAATGAACATGAAGGGTGCAAAGTATTCTTGACATCAGGAAATTTGAAATTTATACAATATTTGGAGGATGCCTCTAAGCTTAATAAAGTGTTTCAATTAGAAGAATTACAAAAAGAAGAGGCTCGGAAGCTGTTTGAGAAGAAGGTTGGAAGTTTTGATGAAGATCAAAGTTCCATTGTAGAAGAAATAGTGAGAAGTTGTGAAGGTTCCATTTCTTTAATTTATGCCCTAGCAAAGGCATTAGAAAATAAGGGCGAAGATGCCTTGATGCAGTTCAAGGAAAATAGTTCACCAGCAAAACTATTGTCCTATTGTTTGGAAGAAAATGAGGAACACAAAGCATTGTTGTATCTTCTTGCTATTAGGGGAAGAAGATTTATTAACAGTTATAGCATGTACATAGACATGTGGACAGGTGTATTCAAAAATCTGGAAACAGCAGATGCTGCAAGAAAAAAGCGTGAGTCACGGATTAGTGATCTGAAGGCCTATGGTCTTGTGGTTGAAAATGGAAAGGACTGGGTCAAAGTAGATGACTACATATATCATACTGCTTATCGAATGGCCCTACATGATAGAAGAGCTTCAGTGATTTCCACAGAATGGCCACCTAAAGAATTGCTAACAGATCTTCACTTCTGCAACTTACATCCTGTTGGTGATTTGAAGCTTCCCGCAACGTTGCAATGTCCAAACTTGAAACATCTTCTGATAAGTAGGGAAAATTCCACAATAGATGTTCCAGATTCATTTTTTGAGGAGACTAAACTTCTGAAAGTGCTAGATTTTGTTTCCTTTCATTGTCCAAAGCTGCCTCTTAGTTTTGTTGTTTTAAAGGACCTTGA