Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32153 LG9 12064139 12065841 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108342152
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 12064264 intron_variant
G/A 12064300 intron_variant
G/A 12064312 intron_variant
A/G 12064399 missense_variant p.Lys63Glu
T/A 12064422 synonymous_variant p.Ile70Ile
A/G 12064469 missense_variant p.Tyr86Cys
A/G 12064474 missense_variant p.Thr88Ala
C/T,G 12064475 missense_variant p.Thr88Arg
C/T 12064480 missense_variant p.Pro90Ser
T/C,A 12064488 missense_variant p.Ser92Arg
C/T 12064489 stop_gained p.Arg93*
G/A,T 12064490 missense_variant p.Arg93Gln
A/G 12064507 missense_variant p.Lys99Glu
G/T 12064526 missense_variant p.Cys105Phe
C/A 12064579 missense_variant p.Leu123Ile
C/G,A 12064592 missense_variant p.Pro127Gln
C/G 12064794 missense_variant p.His194Gln
A/G 12064826 missense_variant p.Lys205Arg
A/G 12064957 missense_variant p.Ser249Gly
A/T 12064965 missense_variant p.Lys251Asn
C/T 12064966 missense_variant p.His252Tyr
C/A 12065157 synonymous_variant p.Pro315Pro
G/C 12065201 missense_variant p.Gly330Ala
G/A 12065301 synonymous_variant p.Lys363Lys
T/C,* 12065356 missense_variant p.Ser382Pro
G/C 12065368 missense_variant p.Ala386Pro
A/T 12065390 missense_variant p.Asn393Ile
T/C 12065424 synonymous_variant p.Ile404Ile
A/T 12065427 synonymous_variant p.Gly405Gly
G/A 12065437 missense_variant p.Val409Met
A/T 12065444 missense_variant p.Gln411Leu
G/C 12065454 missense_variant p.Glu414Asp
A/T 12065528 missense_variant p.Lys439Ile
A/C 12065531 missense_variant p.Asp440Ala
T/A 12065693 missense_variant p.Ile494Lys
G/A 12065717 missense_variant p.Arg502His
G/C 12065740 missense_variant p.Glu510Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32153.1
MPSSTQEVQDKESVEKDVSDDEKVERLKSERDNEKADLRKDSKEEVVEKVVEAINKKIKKSTKKLGVSEIETEAKEKGKTPKTVHYPTLPLSRDDETLKLVLKRCQASYDALNSHSKVCCLSLSIFPENVVIMKRHIIYWWIGEGFVKRSTEKTAEKEGENVFDELLNSNLIVPHGSAKCPVVNKFKINPWIRHMLVSSVLGENKQPFGFYPQITTSSYGCLVLDQQKVEIGGDFAPKSDQWRSVFNLSAKHLTIEPQWMAKMKKLVVLQLGRWQESPKYHVEVAGTEFMTDTKAQKHLKYLSLRGISGISALPPSIAQLVSLEILDLKGCHNLESLPNEITSLKKLTHLDVSLCYLLESMPKGIGKLTELQVLKGFVVGSSNKTATISDLANFKKLKRLSIHIGSEAVIQDKEFENLRKSQVKCLKISWGVSSNTKYKDIDIVLPQGLEKLNLEGFPGENTPTWLKLLPSELKRLYIIGGKLRSIEELKDSTINCKVEILRLKYLKNLEIDIDHLRKLFPSLKYAEVKKVKEDSYEWSIMW*


CDS Sequence:
>Vu_32153.1
ATGCCATCTTCAACCCAAGAGGTGCAAGACAAGGAGAGTGTGGAAAAAGACGTATCAGATGATGAAAAGGTGGAGCGTTTGAAGTCTGAGAGAGACAACGAGAAGGCAGATTTACGTAAAGATTCCAAGGAGGAGGTGGTAGAAAAAGTAGTGGAGGCCATTAATAAAAAGATCAAGAAATCAACTAAAAAGCTTGGTGTTAGTGAAATTGAAACAGAAGCTAAAGAAAAAGGAAAAACACCCAAAACAGTGCATTACCCCACACTGCCTTTAAGTCGAGACGATGAGACTTTGAAGCTAGTCTTGAAAAGGTGCCAAGCCAGTTATGATGCCCTTAATTCTCATTCAAAAGTTTGCTGTTTGTCTCTCTCGATTTTCCCAGAAAATGTTGTTATAATGAAAAGACATATAATTTACTGGTGGATTGGAGAGGGGTTTGTAAAAAGGTCAACAGAGAAAACAGCTGAAAAAGAAGGTGAGAATGTTTTCGACGAGCTTCTGAATTCTAATCTGATTGTACCACATGGTTCAGCCAAGTGTCCTGTTGTCAATAAATTCAAAATTAATCCTTGGATCCGCCACATGTTGGTATCATCTGTTCTGGGAGAAAATAAACAACCCTTTGGATTTTATCCACAAATAACAACCTCTTCCTATGGTTGCCTAGTACTTGACCAACAAAAAGTTGAAATAGGTGGTGACTTTGCTCCGAAATCTGATCAATGGAGAAGTGTTTTCAATCTTAGTGCCAAACATCTTACTATTGAACCTCAATGGATGGCTAAAATGAAGAAGTTGGTGGTGCTTCAGCTTGGTCGTTGGCAAGAGTCTCCTAAATATCACGTTGAAGTTGCCGGTACAGAATTCATGACAGACACAAAGGCTCAAAAGCATCTGAAATATCTCAGCCTTCGTGGTATATCAGGAATATCAGCTTTGCCACCCTCTATTGCTCAACTTGTTAGCCTAGAAATTCTTGACCTCAAGGGTTGTCACAATCTCGAAAGCTTACCTAATGAAATTACTTCATTGAAAAAGCTCACACACTTGGATGTGTCACTGTGCTACTTGTTGGAGAGTATGCCAAAGGGGATTGGGAAGCTCACTGAGCTCCAAGTACTCAAGGGATTTGTAGTAGGCAGTTCCAACAAGACTGCTACAATATCGGATCTTGCAAACTTTAAAAAGTTGAAACGATTGAGCATACACATTGGAAGTGAGGCTGTGATCCAAGATAAAGAGTTTGAAAACCTGAGAAAATCACAAGTTAAATGTCTCAAAATATCATGGGGCGTGTCATCCAACACCAAGTACAAAGATATTGATATCGTTCTCCCACAAGGTTTGGAAAAGTTAAACCTTGAAGGCTTTCCTGGTGAGAACACTCCAACATGGTTGAAACTCCTACCTTCTGAATTGAAGAGACTATACATAATAGGAGGAAAACTCAGGAGCATAGAAGAGCTAAAAGACAGTACAATAAATTGTAAGGTGGAGATCTTGCGTCTGAAATACCTAAAGAATCTTGAAATTGATATTGACCATTTGAGAAAGTTGTTTCCTTCACTGAAGTATGCTGAGGTGAAAAAAGTCAAAGAGGATAGCTATGAATGGAGCATTATGTGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_32153::LG9:12062139-12064139(+)
TAGTATGTAATTCATAAGACATATTAAGTCATTTTGACAGTTCAGATTTGTAATTAAATGTCTGTGCTTAGGGAAATTAGTTCCGCATTTTTAGTATAACCGAAAACCACCTAAAATTCTGCACCTGAGTTACCTCGGTAAAACCTCAATATCTATCTAGTTAACCGTTGGATCAACCTGAAATTTTAATATGTAGTTTATAACAAATAGTGAATTATTGTGACCATTCAGGTTTGAAATCGGAGTTACAGATTTAGAGATATTAATTTCGTATCTTCTCAGGGATCTCAATATTGCTTAATTTCTATTTTTTTGATATCTATATTAAATTTCGGTGTTAATATTATATGTTGTTGTTTTAAATCTGTTAATAAGAAATTTGTTAAAAAAAAATAGTTGAGGAGTAGTTTGGCTAAGGAAAGATTTGGTACTTAAGATGTCCATTGTGACGCACCTCTCTTTCCTGGAAGTCTACTCGATGAGTTTTTTTTAACCAAAATCTTATCAGGCAGATTATGTACAGTTAAATTAGTATGTGATATAGTCAATTTGTATGACTTTTGGGATGGATGGACGTGATGCATATTGGTGTATGCATTCTGATTTGGTGTTTGATGCATATTAGTGTATGCATTCTGATATGTTGTTGATGCATATTGGTGTATGCATTCTGATTTGGTGTTTGATGCATATTGGTGTATGCATTCTGATATGTTGTTGATGCATATTGGTGTATGCATTCTGATTTGGTGTTTGATATATATTGATGCATGCAATGTGGTTTAGTGTGTAACTCATATTTGTTTATGTAATTTGATCTGGTAAAGTGAGCATAGTATGGTTTGGTATTGAGGTATGGTTATTGTATTGATTGTTAGCTCACCCTTGCTTGTAATGCGTGATGTTATACGGGAGCAGATGTTATTACAGATGCGATGGCTGACGCTTTTGAACATGCATAAAGGTCGAAAGAGAGATGGGATAGAAGACTTGGGATTGTGATTTTAGTGTTTTAAAAATTTATTTCGATCCTGACTATGTGGACATTTTATTTTCGGAAGAATCGATTGTAATAAATAATGTACTATTTTCTGTCTATGTTGAAGTTTAAAATTTCAAAATTTCTACATTTATTTTTTTTACGGAAAAATTTAGTCGATGTAGCGCCAAAAACTCGGGGTGTTACAAAAAACGCACTTATATGCCTCGGTTCTGGTAAGAACCGAAGTCAAAAACCCACTTACTGCCTGAGTTATGGTCAAACCCGAAGCAGAATGTGTCGCGGAAGAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTCTACTGCCTCGGTTGTAGCCAGAACCGAGGCAGTAGAGTGCAACTTTATGCCTCGGTTGAAGGGACCCGAGGCAGTATCTCCTACGAAAAAAATAAATTAAAAAAACCTAAAACTTAATGCTTCGGTTGGGGATGAACCGAGGCCGTAGAGTGGGAGTATATGCCTCGGTTCACAACCGAGACCAAAAGTATTGGACTTTTTACCTCACCTGAATATGCCTCGGTTCAGAACCCGCTGCCTATAGACAAAAATAACCGCTGTCGTTTCCCCTGATTGTACTAGTGTAGATTTTACCTATGTAAAATATTCTTGATTTTTTTTTCCTATCTTAGGCTTTTCTACAATATTCTAGAACTTTATTACATTTTAGTACTTCTATATTAAGACTTTCTATATTCTTCTAGAATTTGCATTATACTTTTAATATTATGGTTGTGATCATTGCAGTTTTATCTTAATCCTTGATACAGTGAAACGTTGCCCAGAAATGTAACTGCAAAACTTTCATCGTTTGACATGATGAAAAACTAGAGAAAAATATGACTACAATCAAGACATGACATATTACAATATCTTGAAAAACTTACATTTTTCAATTATAATTGTTGTTTCAGTCCGTAATTTGAGCATACATAAAATCTCTTCTCATTTGATATCTGTTAATCTGTGCTTGTAGGTGTTGATA


Gene Sequence:
>Vu_32153(+)
ATGCCATCTTCAACCCAAGAGGTGCAAGACAAGGAGAGTGTGGAAAAAGACGTATCAGATGATGAAAAGGTGGAGCGTTTGAAGTCTGAGAGAGACAACGAGAAGGCAGATTTAGTAACATTGAAAAAAAATAAGGAAAATCTTCTAAAACACACACCAACGAAAAAGTCTCAGATGAGAATGTCAAGCGTAAAGATTCCAAGGAGGAGGTGGTAGAAAAAGTAGTGGAGGCCATTAATAAAAAGATCAAGAAATCAACTAAAAAGCTTGGTGTTAGTGAAATTGAAACAGAAGCTAAAGAAAAAGGAAAAACACCCAAAACAGTGCATTACCCCACACTGCCTTTAAGTCGAGACGATGAGACTTTGAAGCTAGTCTTGAAAAGGTGCCAAGCCAGTTATGATGCCCTTAATTCTCATTCAAAAGTTTGCTGTTTGTCTCTCTCGATTTTCCCAGAAAATGTTGTTATAATGAAAAGACATATAATTTACTGGTGGATTGGAGAGGGGTTTGTAAAAAGGTCAACAGAGAAAACAGCTGAAAAAGAAGGTGAGAATGTTTTCGACGAGCTTCTGAATTCTAATCTGATTGTACCACATGGTTCAGCCAAGTGTCCTGTTGTCAATAAATTCAAAATTAATCCTTGGATCCGCCACATGTTGGTATCATCTGTTCTGGGAGAAAATAAACAACCCTTTGGATTTTATCCACAAATAACAACCTCTTCCTATGGTTGCCTAGTACTTGACCAACAAAAAGTTGAAATAGGTGGTGACTTTGCTCCGAAATCTGATCAATGGAGAAGTGTTTTCAATCTTAGTGCCAAACATCTTACTATTGAACCTCAATGGATGGCTAAAATGAAGAAGTTGGTGGTGCTTCAGCTTGGTCGTTGGCAAGAGTCTCCTAAATATCACGTTGAAGTTGCCGGTACAGAATTCATGACAGACACAAAGGCTCAAAAGCATCTGAAATATCTCAGCCTTCGTGGTATATCAGGAATATCAGCTTTGCCACCCTCTATTGCTCAACTTGTTAGCCTAGAAATTCTTGACCTCAAGGGTTGTCACAATCTCGAAAGCTTACCTAATGAAATTACTTCATTGAAAAAGCTCACACACTTGGATGTGTCACTGTGCTACTTGTTGGAGAGTATGCCAAAGGGGATTGGGAAGCTCACTGAGCTCCAAGTACTCAAGGGATTTGTAGTAGGCAGTTCCAACAAGACTGCTACAATATCGGATCTTGCAAACTTTAAAAAGTTGAAACGATTGAGCATACACATTGGAAGTGAGGCTGTGATCCAAGATAAAGAGTTTGAAAACCTGAGAAAATCACAAGTTAAATGTCTCAAAATATCATGGGGCGTGTCATCCAACACCAAGTACAAAGATATTGATATCGTTCTCCCACAAGGTTTGGAAAAGTTAAACCTTGAAGGCTTTCCTGGTGAGAACACTCCAACATGGTTGAAACTCCTACCTTCTGAATTGAAGAGACTATACATAATAGGAGGAAAACTCAGGAGCATAGAAGAGCTAAAAGACAGTACAATAAATTGTAAGGTGGAGATCTTGCGTCTGAAATACCTAAAGAATCTTGAAATTGATATTGACCATTTGAGAAAGTTGTTTCCTTCACTGAAGTATGCTGAGGTGAAAAAAGTCAAAGAGGATAGCTATGAATGGAGCATTATGTGGTAA