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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31992 LG9 8323979 8327159 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 8324016 missense_variant p.His849Leu
C/A 8324813 missense_variant p.Ala783Ser
C/T 8325104 missense_variant p.Gly686Ser
G/A 8326033 missense_variant p.Ala376Val
C/A 8326282 missense_variant p.Gly293Val
A/T 8326284 missense_variant p.Phe292Leu
T/C 8326342 missense_variant p.Asn273Ser
G/T 8326345 stop_gained p.Ser272*
A/C 8326346 missense_variant p.Ser272Ala
T/C 8326352 missense_variant p.Asn270Asp
T/A 8326413 synonymous_variant p.Ala249Ala
A/C 8326457 missense_variant p.Phe235Val
G/A 8326545 synonymous_variant p.Leu205Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31992.1
MELHRYCRMAFVQWSFLAWFVFFSVGLETLANSCDQHDLLGLKEFAGNLTKGSIITAWSDGVFCCKWVGVVCEDVVDGGSRVSKLILPGMGLNGTISSSLASLDQLKVLDISFNRLQGGLPSEFSNLKQLEVLDLSHNILSGPLVGVLSGLQSLQILNISSNLFVGDLFQFGGLQHLVALNISNNSFTGQFNSQICSFSKGIHILDISQNNFSGGLEWLANCSTSVQELHLDSNFFTGYLPDSLYSISALEQLSVSMNNLSGQLSVKLSNLSNLKSLIISGNRFSGELPNVFGNLSDLEQLIAHSNSFSGSLPSTLALCSKLQVLDLRNNSLTGSVGLNFTGLSNLSTLDLGSNHFNGPLPNSLFNCHELTMLSLAKNELTGQIPESYANLTSLLTMSLSNNSFENLAGALYVLQHCKNLTTLILTKNFRGEEISENLTVSFKSLVVLALGNCGLKGRIPVWLLNCSKLEVLDFSWNHLEGSVPSWIGWMDHLFYLDLSNNSLTGEIPKGLTELKGLISLNYHISSLFASAAIPLYVKRNKSANGLQYNHASSFPPSIYLSNNRLSGTIWPEIGRLRELHILDLSRNNITGTIPSSISEMKNLETLDLSNNNLYGTIPPSFNNLTFLSKFSVAYNHLWGTIPAGGQFSSFPNSSFEGNLGLCGETYNHCNNEKNVDISTPSSGKFGKSSVLGITIGCGVGLALLIAVILLRMSKKDEDKPVDNFDEELSWPNRVPEAVVSSKLVLFQNSDCKDLTVEDLIKSTNNFNQENIIGCGGFGLVYKANLQNGRKLLTGRRPVEVIVGQCSRNLVSWVFQMKSENRDQEIFDSVIWHKDIEKQLLEDLMALNSHHLKIAAFMTSI*


CDS Sequence:
>Vu_31992.1
ATGGAATTGCATAGATATTGCCGTATGGCTTTTGTGCAATGGAGTTTCCTGGCTTGGTTTGTTTTCTTTTCTGTGGGACTTGAGACCCTAGCCAATTCTTGTGACCAGCATGATTTGTTGGGCCTGAAGGAATTTGCAGGCAATCTTACAAAAGGGTCTATCATCACAGCATGGTCAGATGGTGTTTTCTGCTGCAAATGGGTTGGAGTTGTTTGTGAAGATGTGGTTGATGGAGGTAGTAGAGTGTCCAAGTTGATTCTACCTGGAATGGGTCTTAACGGCACAATTTCAAGTTCTTTAGCTTCTCTGGATCAGCTGAAAGTGCTTGATATTTCGTTCAATCGTCTCCAAGGTGGATTGCCTTCCGAGTTCTCTAATTTGAAGCAGTTAGAAGTTCTTGATTTGAGCCATAATATTCTGTCTGGACCACTTGTTGGGGTACTCTCTGGTTTGCAATCCCTTCAGATACTGAATATTTCTAGCAATTTATTTGTTGGAGACCTCTTCCAATTTGGGGGATTACAACATCTCGTTGCTCTCAACATAAGCAACAATTCATTCACTGGCCAGTTCAATTCTCAAATTTGCAGCTTCTCCAAGGGTATTCATATTCTCGATATATCACAAAATAATTTTTCTGGTGGTCTTGAATGGTTGGCAAACTGCAGCACATCTGTCCAAGAGTTACATTTGGATTCCAATTTTTTTACTGGCTATCTTCCTGATTCCTTGTATTCAATTTCAGCATTGGAGCAGCTCTCAGTCTCTATGAACAACCTCTCCGGTCAGTTAAGCGTGAAGCTAAGTAATCTCTCAAACCTAAAATCTTTAATAATTTCTGGAAATCGGTTTTCTGGGGAGCTCCCTAATGTTTTTGGGAATCTTTCGGACCTTGAACAGCTAATAGCGCACTCCAATTCATTTTCTGGATCATTACCTTCCACCTTGGCCTTATGCTCAAAACTTCAAGTTCTTGATCTTCGGAATAATTCTTTGACAGGTTCTGTTGGCCTTAATTTCACTGGGTTGTCTAATCTTTCCACGTTGGACCTTGGTAGCAATCATTTTAATGGACCCCTTCCAAATTCTTTGTTCAATTGCCATGAATTGACAATGTTAAGCCTTGCAAAAAATGAATTAACAGGCCAAATCCCTGAGAGTTATGCGAACCTCACTTCACTTTTGACTATGTCTCTGTCAAACAACAGCTTTGAGAACCTAGCTGGGGCGCTTTATGTACTGCAGCACTGCAAAAATCTCACAACTCTTATCCTCACAAAGAATTTCCGTGGTGAAGAAATTTCAGAAAATTTAACGGTAAGCTTCAAGAGCCTTGTGGTGTTAGCACTTGGAAATTGTGGTCTCAAAGGCCGTATTCCTGTTTGGCTGTTAAATTGCTCGAAATTGGAAGTTCTCGATTTTTCATGGAACCATTTGGAAGGCAGTGTCCCTTCTTGGATTGGTTGGATGGATCATCTGTTCTACTTGGATTTGTCAAATAATTCTCTTACTGGAGAAATACCAAAAGGTTTGACAGAGCTGAAGGGCCTCATATCCCTAAATTATCATATATCAAGTCTCTTTGCATCTGCTGCTATTCCTCTCTATGTCAAGAGAAACAAGAGTGCTAATGGGTTGCAATATAACCATGCTTCGAGTTTCCCTCCATCAATATACTTGAGCAATAACAGATTAAGTGGAACAATATGGCCTGAAATAGGTCGTTTGAGAGAACTTCATATCTTAGATTTAAGCAGGAACAACATCACCGGCACAATTCCCAGCTCTATCTCTGAGATGAAGAATTTGGAAACACTAGACTTATCTAATAATAATCTATACGGAACTATTCCTCCATCATTTAACAACCTCACATTCTTGTCTAAGTTCAGTGTGGCATATAATCACTTGTGGGGAACAATTCCAGCTGGGGGACAATTTTCAAGTTTCCCAAATTCAAGTTTTGAGGGCAACCTGGGTCTGTGTGGGGAAACATACAATCATTGTAACAATGAAAAAAATGTCGACATTTCCACTCCTTCCTCGGGTAAATTCGGTAAAAGCAGTGTCCTTGGCATCACAATTGGTTGTGGAGTGGGCCTTGCACTACTTATTGCAGTTATTCTGCTAAGAATGTCAAAGAAGGATGAGGATAAACCAGTGGATAACTTTGATGAGGAGCTTAGCTGGCCAAACAGGGTACCTGAAGCAGTTGTTTCTTCAAAATTGGTTCTTTTTCAGAATTCAGATTGCAAGGATCTCACAGTTGAAGATTTGATAAAATCTACCAACAACTTTAACCAAGAAAACATAATTGGTTGTGGTGGGTTTGGCCTTGTCTACAAGGCAAATCTTCAAAATGGCAGAAAGCTTCTCACTGGTCGAAGGCCTGTAGAAGTCATTGTGGGGCAATGCAGCAGGAATCTAGTGTCTTGGGTGTTTCAGATGAAATCTGAAAATAGGGATCAAGAAATTTTTGATTCAGTCATTTGGCATAAGGATATTGAGAAACAGCTCTTAGAGGATTTGATGGCTCTGAATAGTCATCATCTTAAAATCGCAGCATTCATGACATCTATCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_31992::LG9:8327159-8329159(-)
AAACTTTTATCGATGTATTTTCGAATCATAGCCACTGTTTTACGATTCAGAATCTCCCAATCTTTTTCGGTCTTTCCTTCTGGAATTTCCAGATTTGTGATCGGCTCATACAAATTCTTGCAGTATAGATGATCTTCCATCATCGGCTTCCAGTAGGAGTAATTATCCGCAGTTAGCTTGAACATGTCTCCTTCCATCTTGAGTTTCACAGGATTCTGACTTTTTTCGAACTGGTGGCTTTGATACCATTGTTGGGAAACAGCTGTATTTGTTCCCTCCTCTGCTAACCCAAAATGGGCACTATGCGGAAGCGTAAAAATAAAAGTGTATGCGTAGGGAAAAATAACACCAGAAATTTTAACGTGGAAAATCCTCTCGGAAAAAACCACGGGACCTAGTCCAGAAAATTATCTCCACTATGAAAGTAGGATTACAGTGTTTCTCTCACTCTCTGAGGATCTCTCAATAAATCTCACCCTCTCGGATGGTATACAAAAAAAACTCTCTTTTGCACACTCACAGTTTCTACTACACAGTGTCTTTCACCTCTCGGTGATGTTTCTCTCTTCACGGTAGTACCCGTGACTTTCTCTCTTTCTCCTCTTGAATTCTTTCTTCACCGTTTGATTCTTGGTGAGTTGTTTTTTGTTGCACATTTTGCATTCATTTTATAATGAATGAAGAAAAAAAGGACAAGAAACATGATTGGTGCATTGGAGCAATTTATGGAGCTTTAGTGAAGGTGGAAGACATTCTTCCTCAATATATGGTATTTGAAAACATTGACCTTTTTTTTGTATGTGGATGAGTCTCATTTTTGTTTTTATCCAACAAAAATTAATTCATAAAATTAATTTTTTATATATATTATTCTATTTTAATTAAATTTTTAGATAAAGAGAGATCTTTACATGAAAACAAAATGAAGTTTATCCAATTTTGTACAACTCAAACAAATTTAAACATATCTTAACAGAAATAATGCACCGTGGAAAATAAATGAAAGAGGTGAATAGTATTACGATAATACAGAATCTAAATTTTTTATTGATATTATTTTTATTTTTTTAAATACAAAATTTTATATTTTTATGATTATTTTATCTTTATTAAACGAATATAAAAGTGAATAAACAATGATACACTGTTCTCCTTTATAGTTAATGCCATTTTGTTTATTGAAAAAATAAGTGAGGTGATGAGATATAGCACCCGTGCTAACATTTTCTCCTTTTCACTGTTCATTGATGTGAAACATCCCTTTGTTTTGTTTTCCTCTCTACTCCACCACCTCCTTTTTGGTTCTGAAAATCATACACCCCTGCTCTGACACAGAGACCCAATTGACCAAAAGTCTGAAAAAGTTAGGTAAAATGCATTATGACTTTCCATTCCTTTTCTTTAATGCTTCTTCAACGCTTTCTGTGCTTCTTTTCAAACTTTTCTGCCGTCTAACTGACCCAAAATCACATTTTTACGAAAAATGACTTTCTGGTTGGCCTTAGAATGCCGAGGTTTTATTTGAATGGTGACTGTTGAGCATAGAGTTCAGCTACCTGCAATGTTAATGGTAATGGGATCTTTACTTTCTGTTTGGTATCTCACTGCTTCTACGTGAATTCAGTGCTCTTTTTCACTTCCTTTGTTACTTTTTATTTTCAAATGGTTACTATTGATTGCTTCATCCTCACGCTGTTGTAAAATGACCCCTTTTCTTTATTTGACCATCCTCTCTCCTGAAGTGGGTCGTTTTTTAATTTGCATTCAGATTTAGTAGTCTTTCCTTCTTGTTTTTCCAGTATTTAGTTTTGGCGCGTGGTGTTCATATCAACAGTTTTCACCTCGTTATTTGTCTTTTTTATGTATGCTGTTACAGTTTGGTTCATTTTACCGAGTGTTGAAAAATTTTGGAGGTTGGGGTCTTCCGAGTTATGGAAAGCAGTGACCTTCCAGTGATCATTTGAAGCTGAACACGTATATTATCTCTTTTGGTTTTTGAA


Gene Sequence:
>Vu_31992(-)
ATGGAATTGCATAGATATTGCCGTATGGCTTTTGTGCAATGGAGTTTCCTGGCTTGGTTTGTTTTCTTTTCTGTGGGACTTGAGACCCTAGCCAATTCTTGTGACCAGCATGATTTGTTGGGCCTGAAGGAATTTGCAGGCAATCTTACAAAAGGGTCTATCATCACAGCATGGTCAGATGGTGTTTTCTGCTGCAAATGGGTTGGAGTTGTTTGTGAAGATGTGGTTGATGGAGGTAGTAGAGTGTCCAAGTTGATTCTACCTGGAATGGGTCTTAACGGCACAATTTCAAGTTCTTTAGCTTCTCTGGATCAGCTGAAAGTGCTTGATATTTCGTTCAATCGTCTCCAAGGTGGATTGCCTTCCGAGTTCTCTAATTTGAAGCAGTTAGAAGTTCTTGATTTGAGCCATAATATTCTGTCTGGACCACTTGTTGGGGTACTCTCTGGTTTGCAATCCCTTCAGATACTGAATATTTCTAGCAATTTATTTGTTGGAGACCTCTTCCAATTTGGGGGATTACAACATCTCGTTGCTCTCAACATAAGCAACAATTCATTCACTGGCCAGTTCAATTCTCAAATTTGCAGCTTCTCCAAGGGTATTCATATTCTCGATATATCACAAAATAATTTTTCTGGTGGTCTTGAATGGTTGGCAAACTGCAGCACATCTGTCCAAGAGTTACATTTGGATTCCAATTTTTTTACTGGCTATCTTCCTGATTCCTTGTATTCAATTTCAGCATTGGAGCAGCTCTCAGTCTCTATGAACAACCTCTCCGGTCAGTTAAGCGTGAAGCTAAGTAATCTCTCAAACCTAAAATCTTTAATAATTTCTGGAAATCGGTTTTCTGGGGAGCTCCCTAATGTTTTTGGGAATCTTTCGGACCTTGAACAGCTAATAGCGCACTCCAATTCATTTTCTGGATCATTACCTTCCACCTTGGCCTTATGCTCAAAACTTCAAGTTCTTGATCTTCGGAATAATTCTTTGACAGGTTCTGTTGGCCTTAATTTCACTGGGTTGTCTAATCTTTCCACGTTGGACCTTGGTAGCAATCATTTTAATGGACCCCTTCCAAATTCTTTGTTCAATTGCCATGAATTGACAATGTTAAGCCTTGCAAAAAATGAATTAACAGGCCAAATCCCTGAGAGTTATGCGAACCTCACTTCACTTTTGACTATGTCTCTGTCAAACAACAGCTTTGAGAACCTAGCTGGGGCGCTTTATGTACTGCAGCACTGCAAAAATCTCACAACTCTTATCCTCACAAAGAATTTCCGTGGTGAAGAAATTTCAGAAAATTTAACGGTAAGCTTCAAGAGCCTTGTGGTGTTAGCACTTGGAAATTGTGGTCTCAAAGGCCGTATTCCTGTTTGGCTGTTAAATTGCTCGAAATTGGAAGTTCTCGATTTTTCATGGAACCATTTGGAAGGCAGTGTCCCTTCTTGGATTGGTTGGATGGATCATCTGTTCTACTTGGATTTGTCAAATAATTCTCTTACTGGAGAAATACCAAAAGGTTTGACAGAGCTGAAGGGCCTCATATCCCTAAATTATCATATATCAAGTCTCTTTGCATCTGCTGCTATTCCTCTCTATGTCAAGAGAAACAAGAGTGCTAATGGGTTGCAATATAACCATGCTTCGAGTTTCCCTCCATCAATATACTTGAGCAATAACAGATTAAGTGGAACAATATGGCCTGAAATAGGTCGTTTGAGAGAACTTCATATCTTAGATTTAAGCAGGAACAACATCACCGGCACAATTCCCAGCTCTATCTCTGAGATGAAGAATTTGGAAACACTAGACTTATCTAATAATAATCTATACGGAACTATTCCTCCATCATTTAACAACCTCACATTCTTGTCTAAGTTCAGTGTGGCATATAATCACTTGTGGGGAACAATTCCAGCTGGGGGACAATTTTCAAGTTTCCCAAATTCAAGTTTTGAGGGCAACCTGGGTCTGTGTGGGGAAACATACAATCATTGTAACAATGAAAAAAATGTCGACATTTCCACTCCTTCCTCGGGTAAATTCGGTAAAAGCAGTGTCCTTGGCATCACAATTGGTTGTGGAGTGGGCCTTGCACTACTTATTGCAGTTATTCTGCTAAGAATGTCAAAGAAGGATGAGGATAAACCAGTGGATAACTTTGATGAGGAGCTTAGCTGGCCAAACAGGGTACCTGAAGCAGTTGTTTCTTCAAAATTGGTTCTTTTTCAGAATTCAGATTGCAAGGATCTCACAGTTGAAGATTTGATAAAATCTACCAACAACTTTAACCAAGAAAACATAATTGGTTGTGGTGGGTTTGGCCTTGTCTACAAGGCAAATCTTCAAAATGGCAGAAAGGTAGCTGTGAAGAAACTTTCGGGATACTGTGGTCAGGTGGAACGAGAATTCCAAGCAGAAGTGGAGGCACTCTCTAGAGCTCAACATAAGAACCTTGTTTCACTCAAAGGTTATTGTCAGCATCTTAATGACAGATTGTTAATTTACTCCTACTTGGAGAATGGAAGTCTTGACTATTGGTTGCATGAGAGTGAGGATGGAAATTCAGCTCTAAAATGGAATGTAAGACTCAAGATAGCTCAAGGTGCAGCTCATGGACTAGCTTATTTGCACAAGGAGTGTGAACCACATATTGTGCACAGAGATATTAAATCTAGCAACATACTTTTGGATGATAAATTCGAAGCTTATTTGGCTGATTTTGGTCTTTCAAGGCTACTTCAACCCTATGATACACATGTTTCAACAGATTTAGTTGGAACTTTAGGATATATTCCTCCAGAATATAGTCAAGCACTGAAAGCAACATTCAAAGGTGATATTTATAGCTTTGGTGTTGTTCTTGTTGAGCTTCTCACTGGTCGAAGGCCTGTAGAAGTCATTGTGGGGCAATGCAGCAGGAATCTAGTGTCTTGGGTGTTTCAGATGAAATCTGAAAATAGGGATCAAGAAATTTTTGATTCAGTCATTTGGCATAAGGATATTGAGAAACAGCTCTTAGAGGTACTAGCTATTGCTTGTAAATGTATAGATGCAGATCCAAGGCAGAGACCCCATATTGAATTAGTTGTTTCATGGCTTGATGGTGTAGGATTTGATGGCTCTGAATAGTCATCATCTTAAAATCGCAGCATTCATGACATCTATCTGA

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