Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31932 LG9 7265671 7266106 "Serine/threonine-protein kinase svkA, partial "
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 7265826 upstream_gene_variant
A/T 7265828 upstream_gene_variant
C/T,* 7265888 upstream_gene_variant
A/T 7265890 upstream_gene_variant
A/C 7265891 upstream_gene_variant
A/T 7265900 upstream_gene_variant
C/A 7265903 upstream_gene_variant
C/T 7265906 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31932.1
MLRFIELLFRLLLLGTVCQGSEGLLPKMADIAGLVEAAGARFGSLELIGQGSFGDVYKG*


CDS Sequence:
>Vu_31932.1
ATGCTTCGCTTCATTGAGTTGCTTTTCAGATTGCTATTGCTGGGGACAGTGTGTCAGGGTTCTGAAGGGTTGCTCCCGAAAATGGCTGACATAGCGGGTCTGGTTGAGGCTGCAGGGGCAAGATTTGGCTCATTGGAGCTTATTGGGCAAGGGTCATTCGGCGACGTGTATAAAGGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31932::LG9:7266106-7268106(-)
ATAAAGTACTTGGATGCTTGTATACCTTGTTCTTGATATTCATGCAGATCACAAAAAGTACAAAGACTTTATCAGAATCACTGCACACAAGATAAAAGATGTTGAGAGATGTAAAGAACATTATGGGAATGTTTCCCTTGAAGTCTTCTTCTCTGACATATCGTACAAGCTCTGTTTTGATAAAGGCTATGACAAATCACTATACTTTTGTAAAGTAGACTTGAGTCTGACTTCTCACCTATAAAGGCTACTAACTCTACATGAAGTCAACCTCTCTGTCTAATGGTCATTTCTTAAGCAGAGTTATAAATAGACGAAAGCTTGAAGAGAAGACAAGAACGATAAGATAGTGAATTCGTGAACGTTAAAACAAGCTTACTATTGCTCTATATCGTATGAAGCTAAATTTTCTAAGAGAAAGAACCTTAGCAAAATCTCATATTTCATTGTATTGTTTTTATCCTCTCTTTGAGAGTTATCAATCTATATTTGTTTCAATACTCATTGTGTTGTACATTCTAAAGAAAATTAAAACACTTGGTGTTTAACTCAATTGAGTTAAACTATCTAGATAATTGTCTAAGGTTGAACCAGAAGTGGTTAAAATACTTGTATACCAAGAGTTGTTAAGCTCAGACTAGTCGTGTTGACTAGGTGAACCAAGAGTGATGCTAATAATCGTTGTAGAAAAGGTAAAACTTGTGTAATCTTTTTTAAGAGTTCTTAAGGGAGAACTGGATGTAGCTTAAAATTAAGTGAAATGGTATAAAATTTGTGCTTTATTGCTTGGATCTTTGCAACGTTTTCCATATACACATTTCATAAAAACTAGCGTTTAAACATCTTATTTAAATTATATATCTTTTACAATTCATTAGACGTTGTTTTGTGAAAAATATTTAAAAACACTATTCACCACCCTTTAGTGTTTTCCTGTGATTTTATCTCCTAAGAATAAAATCAATCTCATCTATAACAATATATTGTAATTGTCAATCCCTAATAACTATAACTAATAACAAGAACTTCTATTACTGTACCCGAAACTTTTTATAATAAAAATTCTCACATCATAGTTATGAGAGTCATATAAAATTCGTTTTTCTATGACACTCCAAAATCCTGTCGTAAACTTACTATAACAAATAAATTATAACCATTTTCTAATTTTTTATGACCTATCATAATATAACTATTAAAACTAAATTATTTTGACTGAAAGTATACATATTTTAAAAGAACTTATATCCATTAAATATTTAGCAGTTTGGTAAGAGAAATTTTTTCTACTTATTCAAATTTTTACAATAAGAGGCATATCATATATGTAAAAATCAAACATATACGCATAAGTGATTAATCAATTAATTCATTTGATTATATATGTTTGAGTTCGATCTTCTTCGAATGATTGAGTTATAGTCACATGGGATAGTTCATAACACTGGACAATTATATTTATAAAAAAAATAAAGTACTTAATTATATAAATAAATATTAGTTAATTAAAATTGATAAAAATCATTAAATATTAAATTAAATTACAACTGGAGTTAATTATAGAAATAAATGTGAGAGAAGTTAAGAAGATTCTATTATGAAACAGACCAGCACTGAGACAACATACTTGTCCTTCGATTCATGTGTTGAACAACAACGAAGCAATCAAGCTCCGAGTTAACCCAAATCCCCAACTCGAAATTCTCCAAAAGATTCATCTCTTTGTGTGTTCCTTGAACCCCTAACCTTCTTGCTCTTGGTGAGTTGAGTACCAATCCCTCAACGATTCGTGGGACTGTCACAAAAGGGTTGATGCTGTGACTTTTTTTGTTATTGTTTCGCTTTCCTTTCGTTTTCGCTCAGTGTCCTCGCGCATTCAATTCTGCTGTGTGGTCACTTTACCATCTCACTTCCACCTAACAACTTTTATCTCTATCTCACACATACTCACACACGCACACTCTATCTTTCTCTTTTGCTTTGCTTTGAGTTCAAGTGCA


Gene Sequence:
>Vu_31932(-)
ATGCTTCGCTTCATTGAGTTGCTTTTCAGATTGCTATTGCTGGTTTTGTCTTTTTAATGTTTACAAATTTGGGCTTTATGGTTCCCCTTTGAAGTTTGGTTGACTTGGGGTGGTGGGGTTGGCTTCGATTTTCTGTTGTTGGTCTTTTTGTTGCTGTTGATTAATTGTTGTTGCTCTTGGTTTTGAGGGTCAATAGTTGGGGTGTTTGTTTGGATTTGGTTTGGATTGTGGGGTTATGACTTATTGGAATGTGGTTTGTGTCTAAGGTGTGATCTTGGTGTTTCAGATGTTTATGTAGGGGACAGTGTGTCAGGGTTCTGAAGGGTTGCTCCCGAAAATGGCTGACATAGCGGGTCTGGTTGAGGCTGCAGGGGCAAGATTTGGCTCATTGGAGCTTATTGGGCAAGGGTCATTCGGCGACGTGTATAAAGGGTAG