Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31879 LG9 6410192 6415031 PREDICTED: ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 2 isoform X2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 6410228 3_prime_UTR_variant
C/T 6410488 synonymous_variant p.Glu325Glu
G/T 6410638 intron_variant
A/T 6410641 intron_variant
A/T 6410646 intron_variant
G/A 6410928 intron_variant
C/T 6411018 intron_variant
C/T 6411019 intron_variant
G/A 6411076 intron_variant
A/G 6411182 intron_variant
G/A 6411401 intron_variant
A/T 6411525 intron_variant
G/T 6411652 intron_variant
A/T 6411693 intron_variant
A/G 6411786 intron_variant
T/A 6411871 intron_variant
T/C 6411906 intron_variant
A/T 6411965 intron_variant
A/G 6411981 intron_variant
A/T 6411986 intron_variant
G/A 6412131 intron_variant
C/A 6412133 intron_variant
A/T 6412226 intron_variant
G/A 6412269 intron_variant
T/C 6412371 intron_variant
G/C 6412649 intron_variant
G/T 6412650 intron_variant
T/A 6412728 synonymous_variant p.Arg282Arg
G/A 6412800 synonymous_variant p.Pro258Pro
T/C 6413223 synonymous_variant p.Glu117Glu
C/T 6413390 missense_variant p.Val62Met
C/A 6414030 intron_variant
A/G 6414031 intron_variant
C/A 6414053 intron_variant
C/T 6414489 intron_variant
A/C 6414662 intron_variant
G/T 6414834 5_prime_UTR_variant
T/C 6414840 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31879.1
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>Vu_31879.2
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>Vu_31879.3
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CDS Sequence:
>Vu_31879.1
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>Vu_31879.2
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>Vu_31879.3
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Promoter Sequence:
>Vu_31879::LG9:6415031-6417031(-)
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Gene Sequence:
>Vu_31879(-)
GCTTCTTTTCATTCTCTCTATTTCTCAAATCTCTCTTTCGTTCACAAGTCACACAAATCCACCTTTGATTGTTTTTCTTCGACCAACGCACGAATGCACAAACACAAACACACACTTATGTTGTGAAAGCTTTGTTCATCACCTACAGCTTCTTCTGATTTTCGCTCCAAAAACCCATTTTTCAATCTCTCACTCTCCTCTTACAGATCGCTGTATCTCTCTCCGACACACACGAAAAAAAAAAGGTTCTTCTCTTCTCTTACTCACGCGCTTTTATTCCTTACATCACACTCTTTCTTTTCCATGATGTGTTCCTCTTCAAATTTTGGATTTTTATCACTGCATGTGGGAAACAAATACTGGGTTTGTTGTGGGTTTGATCTCACACCCTTTTGTGTCTTGAAATATTTTCAGGATACCTTTCTTTTCCTTTCGGTGTTTCAATAGTGATGCTCAATTTGTTGCATGCAAATGGGTTTTCCTCCAAGTTCTTCGTTGAAAGATTTGATTTTGAATTCTGGGTGTTTTTCTTCGTTGTCTTCGGTCTCTGAATTGATCTTCTTATGATGAACTTGTGTGCCTTTCAATTTTGATGTTCTGTGTCCATGACTTGTGGGAAAACGGGCCCTGGTATTTTAATGCCGAAGTTTAAGAGGGCATTTGCGTGTTTCGAATATGGGGTTTTGGGTTTCATTGCAAATTTTATTTACTTGACTGTTTCTCCGAGCTTGCATGCAAGGGATCAATGCTCTAATAACCCTTTTTTAAGTAATATGAATTGTTCTTTTTATTTTTCTCCAAGAAGGGTACCTGCACGGTTTCGTGTTTTCATTTGCTTGAGTTTAACAGTGCTTCATTGGAAGTCTGTTATATTCACTTGGTTTTATCTGCTTGCCCTTCTAGAGTTTATCCTCTGTTTAAGTTTTCAATTTCATTTATGATCTCGGTTATTAAAATTTTGTCTTTAGGTCAACATCAGTTTTCTCTCAATATATTTTTGTGTTGTGAATAAATCGTGAATCAGACTAACAACTTTCACCGTTTTCATCTTTGTTTGTTTCATTTTTAGAGGAAATGAAATGTACCTTGCATCCTGCTGCTAAATTACAAGATCTCACATTTTTTTTTCTCCTTTGACTGGTTTGAGCCATGTGTTATGTATTTAAAATTATTTTTCTCGTGGGAAATCGCAACTCTGCCAGCTGCATGTACATGATATCATGCTTGACAGAAAGTTTTGGAAATTATCTTGCTTTGTTACAATTGACGGTTTCCTTTAGTGTGCCGGAATGCATGTTAGGCATGTAGATTATTATGGATTCTAAAAGCTTATGCGTTATCACTACAAACAAGGTGATGCTAATTTCTTTTATTTATCAGCTTCTGATTTTCTGGGGCAGGATTGAAGATGTGGACTAGTTTGAACTGAATTGTTAACAGTTATATTATAATTGGTAAATGGGGACTCAAACGATGGGATCTCAAGGTGGTGATAAAGACAGTAATGGAAAACAGTCACAAGTCCAGCCCCTGGTGCGGCAAAACTCAATGTACAGTCTCACACTGGATGAGGTTCAGAATCAATTGGGTGATCTAGGGAAGCCGCTTACTAGTATGAACCTTGATGAGCTTCTGAAAAATGTGTGGACTGTTGAGGCAGGCCAGACAGCTGGTATGGACAATGAAAGCGCGGCACAAGCTGGTCAAGCTGCTCTGCAGCGTCAGGCTAGTCTGTCACTGACTGGTGCACTGAGCAAGAAGACGGTGGACGAGGTTTGGAGAGATATCCAACAAAACAAAGCCATTGAAGAGAAGAGGTTCCGTGACGAAAAACAGCCTACTTTGGGAGAAATGACATTGGAGGACTTCTTGGTGAAAGCAGGAGTTGTTACAGAAACATCTTCTAACCCAAAGAATGCTGGTACTGTATCCACACCGGTACCAGTACCAGTGCCAGTACCAGTGCCAGTACCGATGGATTCAAACGTGGCAGTAGCACCACAGTTTCCTTCACAAGGACAGTGGATACAATATCCACCAGTGCAATATCAGCATCCACAGCAAAGTTTGATGCAGATTTATATGCCTGGTCAGGGTATGGCACAACCAATACACATGGGGCCTGGAGCTTCATTGGATGTTTCGTTTGCAGATGGCCAGGTTGCAATGCCGTCTCCTATGATGGCAACAATGTCGGATTCACATACTCCTGGAAGAAAAAGGACCACTCCCGAGGACATGATGGAGAAAACTGTTGAGAGGAGACAGAAAAGGATGATAAAAAATCGTGAATCTGCTGCTCGATCAAGAGCAAGGAAACAGGTGCTCTTTCATGTTATGTGAGTCTTTATCCTTTGATTAATTTTTCGCTTAGTAAAAATCCTAATCCTGAATCATAAATGTTATGAACAGGCATACACAAATGAATTGGAGAATAAAGTCTCCCGTCTAGAAGAGGAAAATGAAATGCTGAGGAAACGACAGGTTAGTTTCTGCTTTGCAGGTCTACTTTAATTGCCTTGACTGTGTTTTGCTGTTAATTCAAATTCCAGAGTATACCATCAGTACCAAGATTGAGTGGTTTCTCGTTTTGCCGAGTATTTTTCAGATTAAGATTGACTATGCAATCTTAGTTTCAATTGTTATTTGATGTATTTTGCAGAGGAAACTCTGCATATTATGATTCATTAATCAATACTTGAATTAACAAGTATTAAGGAAATTTTGTTGACCCTGAAACATTTTTCCTCAACCATTCAAAACTTTGTTTCTTATGTGACTTGGGAATTAAATCAGATGTTTGATTGCTTCATGAGTTTGCTGTCTTTTAAGTGTATGATTATGGTATCTGGCAACTAGAGATTTAATGTTCACACTTCTCATTATACAGTATGGTGTGTCGATGGAAAAGGAGATTCAATATAAAGAAAATTTCTCCATCACATAATTTTTCTGGGAGGAAATATTATTAGATGAAAAATCAAAACAAGGGGTCTGGGGAAGAAGCTTTCTCCCATGTTTGATACTAATCCTTTATCTTTGCTTTGCCCTTTGTTTCAATACTTGTTCTTTATCTTTTGAGCCAATGATGGGGAAATTTATTTTTGTTTCATTCTTTGATTTACATTCGGTGTTTCAAATGTGCTGATGCATTTCAATCATTTTTAACAAGTATCTTACTCTCTACCCCTTCCAAAAGATTAAGCAAAGTAGATCTGTATAAATATGTTGGTATAACACTTTACTATAACTAGATTCAATCCACATCTTGAAAATCTTTAACATTAATATTTTGAACAGCAGGATTATACAATCACGTGATTTTTAGATGTTTTCTTTTCCCTATTATTAATCAAGCCATAGGGCACTTCTTTTCTTCCTGCTTTTGCATTATCCTTGTGTCTTAGGATTTTTTTTGGAAGCAACATATTTCTATGCATTGTGATGCACAATGTTTATACCACTGTCATTTTTCTCCATAGATTTTTTATTTACTAGCAGCCATATAGCAGTGTAATAATCTGTCCTTTTTTATATTTCTGGAGCATGCCAATATTAGCAACCCTGCATTTATTTTCTCAATAAATTAAACTATTTGATCATGTATGCTGGCTTTGGTCGATCACACTTCTTCTGTACACAAGTCTCTGATCAATCCATTTATTTGTATCATGGAAGCTGGGGAGATGGGTTATTTTGGACTATCATAATTGATTCTGGTATATTGAAATAAAACAGAATTGCACTTTTCATCAATATGATGTCCCTGATATACTTTTTCATCAATTAGATTTTAGAGCTCTATCGTTTTTATATCTTGATTTTTGGGTAAATGTTTTGTGGATGTACTCTGAGCTGTGCAATGGGATGTTTCTTTATGATGATTATGATGCTTTTGAACTTTTCAGTGCTTGAGGAGGTTGTAAGTGTTATGATAGTAGTTGGCTTATTTTTTCAGAAAGGAAAATGGTGGAAGAATGTGGAAAAAGGCTTCTAAGCTTGTTATAGTTAAGGGGTCAGTCACAATCAAATCTTGTAACATCAAAGGTTGAGTCATTACCAAAACAGATTTGATCAGTGATGATGACAAATTTATTTGGATGCATCTCTCTTGCTGTCACCACTCTAGCCTGAACAGTGATATTAGATTTCCCCCTTTTGTGAATGCCTTGTGATGTTTTAGCTTTGATTAGTGATGGTTTTTTGAACTGTCACTTGGTTTTTTCTGCTGCTTCATGTGTTTTGGTTTTTTGGTTACAGTGAATTAGACTTTGATCTTCAAGCTTTACTTTCCTTACTCATTGTACAGTTGCAGTTCATTATTACAAAATGTTGGATTATAAATCCTTCATGCAGCTATACCTAAAAAATTCTCAGATTGTTAGTATGGTCACTTTTTACTTGATAAAATTATGATGCTCATGTATCATAATGGTGCATACTTACTTTCTTATTTGTCCAATATTTGAATTGTTTATAATTTTTTTTTTCTCTTCAACTTGCAGGAGATAGAGAAGATGTTGCCAAGTACACCACCTCCTGAGCCTAAGTATCAACTTCGCCGAATAGGATCAGCTCCTTTCTGAGATCTGTACCTAGTTGTAGAGGTTTTGTAAATATGAGTACCAGTGAATTCTCCTTATGGATTACTGTGAGGTTGACTCTGGTATGTCAGTTCAGTAGTTTGTTAAACATTTGCATCCAATGTCTTGTCTTTAATTATTATTAGGTTCTTTATAACTCTCAATGTTCTTTAAGAAAAAAAAAAAAAATTAGAGAAATGTTGTAGTTGTGCTGTTTTCAATATAACCATAATCATGGCTTCATGAGTTTACTTTGT