Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31877 LG9 6357849 6362649 PREDICTED: calcium and calcium/calmodulin-dependent serine/threonine-protein kinase
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 6358248 intron_variant
T/C 6358354 synonymous_variant p.Ala463Ala
A/T 6358472 intron_variant
A/T 6358671 intron_variant
A/C 6358707 intron_variant
T/A 6358748 intron_variant
C/G 6358792 intron_variant
T/A 6358903 intron_variant
A/G 6358954 intron_variant
G/A 6359199 synonymous_variant p.Asn416Asn
A/T 6359332 intron_variant
T/A 6359336 intron_variant
T/A 6359340 intron_variant
A/T 6359360 intron_variant
T/A 6359370 intron_variant
G/T 6359379 intron_variant
C/A 6359454 intron_variant
C/A,G 6359459 intron_variant
A/G,* 6359466 intron_variant
A/G 6359485 intron_variant
T/C 6359492 intron_variant
T/C 6359494 intron_variant
C/G 6359504 intron_variant
T/C 6359527 intron_variant
G/A 6359532 intron_variant
G/A 6359535 intron_variant
T/C 6359567 intron_variant
G/C 6359575 intron_variant
C/T 6359578 intron_variant
C/T 6359595 intron_variant
A/G 6359599 intron_variant
C/T 6359600 intron_variant
A/G 6359616 intron_variant
G/T 6359638 intron_variant
A/T 6360180 intron_variant
C/G 6360185 intron_variant
C/A 6360206 intron_variant
A/G 6360219 intron_variant
G/A 6360262 intron_variant
A/T 6360263 intron_variant
C/T 6360299 intron_variant
T/G 6360365 intron_variant
T/A 6360368 intron_variant
G/C 6360382 intron_variant
G/A 6360430 intron_variant
C/T 6360442 intron_variant
G/A 6360472 intron_variant
C/T 6360483 intron_variant
G/A 6360489 intron_variant
G/A 6360494 intron_variant
C/T 6360505 intron_variant
A/T 6360506 intron_variant
C/T 6360623 intron_variant
T/A 6360628 intron_variant
T/C 6360732 intron_variant
C/T 6360804 intron_variant
A/T 6360811 intron_variant
T/C 6360910 synonymous_variant p.Thr272Thr
T/C 6361037 intron_variant
T/A 6361123 intron_variant
T/C 6361185 intron_variant
T/G 6361438 intron_variant
G/A 6361442 intron_variant
G/C 6361446 intron_variant
A/T 6361451 intron_variant
T/G 6361458 intron_variant
G/A 6361469 intron_variant
C/T 6361558 intron_variant
T/A 6361564 intron_variant
A/C 6361655 intron_variant
G/T 6361752 missense_variant p.Thr225Lys
T/A 6362043 intron_variant
C/A 6362044 intron_variant
A/T 6362047 intron_variant
A/T 6362051 intron_variant
G/A 6362072 intron_variant
C/T 6362079 intron_variant
T/C 6362120 intron_variant
A/C 6362158 missense_variant p.Phe135Val
G/C 6362161 missense_variant p.Leu134Val
C/A 6362177 synonymous_variant p.Leu128Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31877.1
MGYETRTLSDEYEVSDVLGRGGFSVVRKGTRKSSSDTKSLVAIKTLRRSGTASNSNHPSGFPRPKGAEKSSAAMMGLPWRQVSVSDALLTNEILVMRRIVENVSPHPNVIDLYDVYEDSNGVHLVLELCSGGELFDRIVAQDRYSETEAAGVVRQIASGLEAIHRANIVHRDLKPENCLFLDVRRDSPLKIMDFGLSSVEEFTDPVVGLFGSIDYVSPEALSQGTITTKSDMWSLGVILYILLSGYPPFIAQSNRQKQQMIMNGNFSFYEKTWKGITQSAKQLISDLLTVDPSRRPSAQDLLSHPWVVGDKAKDDAMDPEIVSRLQSFNARRKLRAAAIASVWSSTIFLRTKKLKSLVGTHDLTEEEIENLRINFKKICVSGDNATLSEFEEVLKAMNRPSLVPLAPRIFDLFDNNRDGTVDMREILCGFSSFKNSKGDDALRLCFQMYDTDRSGCITKEEVASMLRALPEECLPADITEPGKLDEIFDRMDANSDGKVTFDEFKAAMQRDSSLQDLVLSSLRPQS*


CDS Sequence:
>Vu_31877.1
ATGGGGTATGAAACCAGAACACTCTCAGATGAGTATGAAGTCTCAGATGTTCTAGGAAGAGGTGGATTTTCTGTTGTTAGAAAAGGCACAAGAAAATCAAGCAGTGACACCAAAAGCCTTGTGGCCATCAAAACTTTGAGAAGATCAGGCACTGCCTCAAACTCCAACCACCCTTCTGGGTTTCCAAGACCAAAGGGTGCAGAGAAGAGCTCAGCTGCTATGATGGGGCTCCCATGGAGACAAGTCTCAGTCTCAGATGCCTTGCTCACCAATGAGATTCTTGTGATGAGGAGAATAGTGGAAAACGTTTCACCTCACCCTAATGTGATTGACCTCTATGATGTGTATGAGGACTCAAATGGAGTGCACCTTGTGTTGGAGCTGTGTTCTGGTGGAGAACTGTTTGATAGGATTGTAGCACAAGATAGGTACTCAGAGACTGAAGCTGCAGGTGTGGTTCGCCAGATAGCTTCAGGATTAGAGGCTATTCATAGAGCTAACATTGTGCACAGGGACTTGAAGCCTGAGAATTGTCTTTTCTTGGATGTGAGGAGGGATTCTCCTCTTAAGATCATGGATTTTGGTTTGAGTTCTGTTGAAGAATTCACTGACCCAGTTGTTGGTTTGTTTGGATCCATTGATTATGTTTCACCAGAGGCTCTTTCTCAAGGGACGATAACTACCAAGAGTGACATGTGGTCTCTTGGGGTGATTCTATACATCTTACTCTCTGGGTATCCACCTTTCATTGCTCAGTCTAATCGCCAGAAACAACAAATGATAATGAATGGGAACTTCAGTTTCTATGAGAAGACATGGAAGGGCATTACTCAATCAGCAAAGCAACTAATTTCAGATCTTCTGACAGTTGATCCTAGTAGGAGACCTAGTGCTCAAGATCTTCTGAGTCATCCATGGGTGGTAGGTGACAAGGCCAAGGATGATGCAATGGACCCTGAGATTGTCTCAAGATTGCAGAGCTTCAACGCAAGACGCAAACTGCGAGCAGCTGCAATTGCTAGTGTTTGGAGCTCCACAATCTTCCTCAGAACCAAAAAGCTGAAATCTTTGGTAGGAACACATGATCTCACAGAAGAGGAAATTGAAAACCTCAGGATAAATTTTAAGAAAATATGTGTGAGTGGAGACAATGCCACTCTAAGTGAGTTTGAAGAGGTGCTGAAAGCAATGAATAGGCCATCACTGGTCCCTCTAGCACCACGAATATTTGACTTGTTTGACAACAACCGTGATGGAACAGTTGACATGAGAGAGATTCTATGTGGCTTTTCCAGCTTCAAAAACTCCAAAGGAGATGATGCTCTTCGTTTGTGCTTCCAGATGTATGACACAGATCGATCAGGCTGCATCACCAAGGAAGAAGTCGCATCCATGCTCAGAGCTTTACCAGAAGAGTGTTTGCCAGCTGATATCACTGAACCTGGGAAATTGGATGAGATATTTGACAGAATGGATGCCAACAGTGATGGAAAAGTTACCTTTGATGAATTCAAAGCTGCCATGCAGAGAGATAGCTCTCTTCAAGACCTTGTTCTCTCTTCTCTAAGACCACAATCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_31877::LG9:6362649-6364649(-)
ATCTCTCATGTGTTGTTTTGCGTCTCTTTCTTGTGGTTGTTGTATCCTCTTCTAAAGCAATGAAGTACTAAAGTGACCTAATTTTATCTTCTTTTTTTCTGTTTTTCCCTATTCATCCCACACCACAATACAGGTATGAGATAAAGAAAAATCTATCTTAAGAAATTACAAAATTATCCTTACAAACAAGGAAAACTAAAAAAAAAAAGCTAGCAATCAATCCTTGTTAACTTCTTCGATTTTGTAAATTAAACTGCATCTTACACTAAGCTTAAATTAACATTTTTTAGTATTCAAATTAAAGCTCTTTCAATATAAAATCTAACGCAAAAAAAAAATCAACTCAGTTTGAATCTAAAATTTAATGCAGCAAAGAATCAACTCAGTTTGAATCTAAAATCTAATGCAAAAAAAAAAATCAACTCAGTCGAATACCTGTAGAAAAAGTTATCAGCAAAATAATTAGCATCCGTCAAAACTAAAAATTGTGTATTTTTAGACTGTGTTAGACATCAATAAAGTGGCGTTAGACGCGAACAAAATAGGAAGTACCTTCTCAGCTACGTGGGAGCACCAATAACACAACCTCGGACAATAAACAAGATTCAAAAGCACACTAAAAGATAAAATAAACAAATATGCTAAGGGATGAAAGATAAAAAAGTAAAAGTTAATATATTTAATTATAAAAGAGATCATGTATGAAAATATTAGTTTTTTTTTTAATTTATTTTACGCTTGTATTTTTCATATTTATGACTTGTATAAGTTCCATCTCAAGAAAGTAGCCAAATTTTTATATCAAAGCCCCTACAAAAGTTCATCTAATAATTTACTTTAAAAAAAATTAAGTTTAATTAATTATATTTTTTCTATTTTGAATAACTCTTTTGCTTCGTAAGTAGTGATACCAAATTAATCACTTGATTATATTATATTTATGAAGATGGTGACCATTATAAGGTGAATAATCCTAGAAGCTCAAATGTCTAGTTTATAGATATATATATCTTATAATTTTATTAGAACCTAAAAAACTCATAATTACAAATTTTACATTTAGTATTTGATCACTTTTTTTTTCTTAATTTACGGTTCTTAATTTTTTATTTCATTTTGCATTTGGTTCCTCCTATTACATTATTTATATTTTCGTATATTAAAAAATATGTTGGTTCATATGATGAAAATAAATAAAAGTTTTTTTTTAATTCACTTAAAGTACTAACATAATGATAAATATAAGTACATCTTTAGAGACTAAATAAAGAAGAACTACTAATATTTCAAGGATTAAAAATATATGTTAACTATATAATAAAAAAGTTGTTTATGTATGTTTTCATGAAAAAAAATCTATCAGAGATTATAAACAAAAGTAGTAAATTTTTCAAGAATTAAAACTATATGTTAACTTTAAAATTTAAGAAAGAAAATAGTTAATATCGTGATATGGATAAGTTTAACGAGAGTGATTAGATAAAATCCAAGTGAGTCATCCTAGTTTCAGCAATGGATTGGATAAAATCCAGTTTGGGTTTTTTTTATAACTTTGCTGTATTGTTCCTTTGTATTGTGTCTTGGAAATACAAGGGATGATACTCATTTTTATGATTTAAAATATATTAAAATTTTAATATATCAACATTAATGTATTTTTAATGCTTGAAAAAAAAACTCATCAAAAAATCTGATTTAGATAAAATCCAAGTGAGTCATCCTAGTTATTTTCTTTTGTTTTACTCTTGATCTTGACACAGTTTTAATCTCAATGTGGCTAAATGGTGAAGATGGAAACATTAAACACAGAACATAGTGCTAGCAGTTGACTCTGTCTTTGTCCCTTCTCAAATACCTTCCACCAGCCACATTGTTTTTTCTCTTGTACCTATCCCAATTTGCATAATATTTTATGCCATAAACTAATGCACAAACTCTTACAGGTTATGATGTCACTCTCAACCGTTTCAACACGCGTTTTGAAGGCTCCTCCTATCATT


Gene Sequence:
>Vu_31877(-)
GAGTTAACAATTTTTTCTTATTGTCCCTGCATATTTTCTGAGTCTTCAAGATTCCTTAGTTTCAAACACTTCGTGTGCACCACAACAGCATGGGGTATGAAACCAGAACACTCTCAGATGAGTATGAAGTCTCAGATGTTCTAGGAAGAGGTGGATTTTCTGTTGTTAGAAAAGGCACAAGAAAATCAAGCAGTGACACCAAAAGCCTTGTGGCCATCAAAACTTTGAGAAGATCAGGCACTGCCTCAAACTCCAACCACCCTTCTGGGTTTCCAAGACCAAAGGGTGCAGAGAAGAGCTCAGCTGCTATGATGGGGCTCCCATGGAGACAAGTCTCAGTCTCAGATGCCTTGCTCACCAATGAGATTCTTGTGATGAGGAGAATAGTGGAAAACGTTTCACCTCACCCTAATGTGATTGACCTCTATGATGTGTATGAGGACTCAAATGGAGTGCACCTTGTGTTGGAGCTGTGTTCTGGTGGAGAACTGTTTGATAGGATTGTAGCACAAGATAGGTACTACCTCTCAAACATTCAAGCCCTTTAAAATGTTCTGAAAATCTCACTCGGTTATTACATGTAACTCACAAGTGCGTGTAATTTAGAAACATAGAAACATTGTTGAATGCAATATGTTTGAATCAATGACAGGTACTCAGAGACTGAAGCTGCAGGTGTGGTTCGCCAGATAGCTTCAGGATTAGAGGCTATTCATAGAGCTAACATTGTGCACAGGGACTTGAAGCCTGAGAATTGTCTTTTCTTGGATGTGAGGAGGGATTCTCCTCTTAAGATCATGGATTTTGGTTTGAGTTCTGTTGAAGAATTCACTGACCCAGTTGTTGGTTTGTTTGGATCCATTGATTATGTTTCACCAGAGGCTCTTTCTCAAGGGACGATAACTACCAAGAGTGACATGTGGTCTCTTGGGGTGATTCTATACATCTTACTCTCTGGGTATGTTGACTTTTTTTTTCAAAATCACATGTTCATTTTGTGTCTGTCTCCATCTACCCATGTGCAATTGCAGCACATATCATGCCAAATAGGGAAAGTCTTCAATCAGTTATAGACATTGAAATAAAATATGGTATCGCCTTATAATTGGATGAGATTTCCATTGAAATTAACATCACCACTCAGTTTTGGCATTTTGCACATTGTTAGCATGTTTTGTCTCACATGCCAATATAATTTTTCATCTTTCGTGATAAGTAAGAAGACAAAAGTTATAGCTCTTACATATTTTCTAGCAAATTTGACATGATTTTTCCAGTACATGCATTATGTATTTGATCAATTGTTCTATGCTTCACTGTAATCTTTCCTTCTATGCTTCAATTACATATTTTGCAGGTATCCACCTTTCATTGCTCAGTCTAATCGCCAGAAACAACAAATGATAATGAATGTAAGTAACAAAGGCAGAGCAAAACTTAGCAATGCATCAGGATGTGACTTTTACTTAAATACATAATCCATTTTGGCTCCACTTCATGTTTCTGTCATAGTACATACTACTTTCACATAAAAGTGGTAAATACTTAGAATACATCATTTGTAATTCACTTGCCTTTGCATTGTGTCTTATCCAATGACCAGGATAAAGGTATAGTGTCTTGTTAAATTACTGCAAGACTACAATTATCTTTTGTTCATCAAGTGACAGTTCTATAATGATCTTGCTTACCAAATCAAATACTCTGAAACAGGGGAACTTCAGTTTCTATGAGAAGACATGGAAGGGCATTACTCAATCAGCAAAGCAACTAATTTCAGATCTTCTGACAGTTGATCCTAGTAGGAGACCTAGTGCTCAAGATGTATTGTACACTCTTACCAACGTCATTAATCTCTTCAATTGAGGCATATCTACTATGAAAAAAGTCATGTGTAGTATAAAAATTATCACAAAAATCTCATTTTCTGTCAAGTCTTTATTTTTTCTCTTAAATAGCCTAAAGTTATGCATCGTCAAGAATTCTTGAGGAAAAAATAGGAGTGTTAGTTAATGTTAAAGATCTCGTATCCATTATAAATAAGATAAATTCATATGATATTAATAGTGCAAATCTCAGTGTTATAAACTAGTTTTTATAAGATTGAATTAAACTTAAAATATATTTTTCAAACATAACAAAATGGTTATGAAATCTATTCTAAAAGATTTGTTATTCGTTATTCCTTGAACATGTTAAGTTATTATGAATTCATAATACTTAAATGAATATAAACTTTACTTTAATAGTTAATTTTGTAAGGTTAACTTAAATTAAAGTAACAAAAACATAGCCTTTGAAACACATTTTATTATTTGACAGAAATTTATAGTAAATAAAAAAAATTATCGGTTCTATTTTTTATCTGACAAACTCACATCTTAGTTCTTTTGTAGTTTCTAATAAAATTCCAATCGACAAAATGTACGTTAGAAAAAGTGTTGTACAGAATGTGCTACTAACAGTAATTACTACTAATGAGTGTTAGTATTTGTTCAACATTTTGCATCTTTGAATTGAAATTGTTATAGAGAACAACAACCCTCTCACACTTACATTGTATGTGTTGGAACAGCTTCTGAGTCATCCATGGGTGGTAGGTGACAAGGCCAAGGATGATGCAATGGACCCTGAGATTGTCTCAAGATTGCAGAGCTTCAACGCAAGACGCAAACTGCGAGCAGCTGCAATTGCTAGTGTTTGGAGCTCCACAATCTTCCTCAGAACCAAAAAGCTGAAATCTTTGGTAGGAACACATGATCTCACAGAAGAGGAAATTGAAAACCTCAGGATAAATTTTAAGAAAATGTAAGTACTCACAAGTTAAAAGATCAAATTTCAGAACTCACCATACTAGTAGCAATGTATATTATGCATTAGATTCCATTTCCTAGAAGTAATTTCAGTTTCACTTTGAAAGCCAACCCAACAAAACAGTTACTCCTATTTTTCATCAATGATCATAGGCACTATAATTAATTTTGATAAATATATTATTAACCACTGACATACAAGAGTAAACGGATATCCTACTTAAACAACAAATATTGTTAGGATAGATTATAATCATAGCTCTGATATCATATTAGGAAGTAGATTTTAAACTTAACTCAACTCCACAAAATTGACTCATAAAATAAAGTTTGCATCCACTTATATATATTTTAAATTGGTCTTATCTTCTTTTTAAGTGAGGTGAGACTTTCAACCATCTTAAATAAAAAGAGTCATGAATAGATTGTTTTAAAATGTTTTGATTAAAGGTGATATCATTTTTTAAGTGGTTGTTTTTGAGAGTTTTGGAGTGAAAAAGAAAATGTTGTTGGGTATTAACAGATGTGTGAGTGGAGACAATGCCACTCTAAGTGAGTTTGAAGAGGTGCTGAAAGCAATGAATAGGCCATCACTGGTCCCTCTAGCACCACGAATATTTGACTTGTTTGACAACAACCGTGATGGAACAGTTGACATGAGAGAGATTCTATGTGGCTTTTCCAGCTTCAAAAACTCCAAAGGAGATGATGCTCTTCGTTTGTGCTTCCAGGTTTGCCTTTTCACTAATCTCATATATTTCTATATAAATTTGGAATGTACATTTTATTTCTTCTCATTTTATCTTTCAAGTAATTAATTTTTTAAATTAAAATAATTATTTTACAATTTTACTCTTTAAATGATATTTTTTTTAATTTAACTTTTTTTTTCATTTTATTGTTTTCTTAAACTTAATTGTTTTTTAAATTAAAATAACTTCTTATACTAAAAAAATTACCCATAAATTAAATAAAAATTGTTTACAATAAAATTATATTATTTTTACAATTATCTATACCATGGATTCACCATTTTTATATACAGATTTTTCTTTTCAATTTCATACTTTAAAAACCGTTTTTCTCATACTAAAAAAATTACCTTACCAATTTTTCTTTTCAAATGATATTTTTTAGATTTAACAATTTTTTATTTGATTACCTTTTTAAATTTAACTATTTTTTAAATTAAAATAATTATCTATAATAATAATATTACCTATAAAATAATAAAATTATCTACAATAGAATTATAAAAATTATTTCTATTTATTTTTATAACTATTATTTTTTATCATCATAAAAAAGAAAAATAAATACTTACATTACATGTTATAAAAATCACTGATCCTTAATATGACTTTTATTTTACTTATTATAAAAGAAAATAAAATAATTTACTGCCAATTTGCCTCACTAATTTCTTTAATCACAGATGTATGACACAGATCGATCAGGCTGCATCACCAAGGAAGAAGTCGCATCCATGCTCAGAGTAATGTTCTTTTCCTTTTTAGTATAAAATGCATTTTGGTTCTCTTAATTGTGGAATAAGTTGAAGTCTCTATGATTCAAAAACAGAGATATTAATTTTTTATTATTTTAACATGATTGAGCATAAAACAGGCTTTACCAGAAGAGTGTTTGCCAGCTGATATCACTGAACCTGGGAAATTGGATGAGATATTTGACAGAATGGATGCCAACAGTGATGGAAAAGTTACCTTTGATGAATTCAAAGCTGCCATGCAGAGAGATAGCTCTCTTCAAGACCTTGTTCTCTCTTCTCTAAGACCACAATCATAGTTCTTCAAATTTCCATTAATCTATATGCTACTCTTATCAACCATGCACTGCTATTTTTGTCCTTTTTTTCCCCTTGATACAGTAGGACAAAAACACTACTCCAGGACTATACAGTGATGTTGTATCATATAATTTTTGCTTAGACAGTTAATTAACTATGAACAATTATGCTTCTTATGTTA