Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31871 LG9 6217159 6221621 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 6217262 missense_variant p.Ser35Leu
T/C 6217291 missense_variant p.Cys45Arg
A/C 6217329 splice_region_variant&intron_variant
C/T 6217912 intron_variant
T/C 6218640 intron_variant
G/T 6218788 missense_variant p.Gly159Cys
G/T 6218801 missense_variant p.Arg163Leu
T/C 6218907 intron_variant
C/T 6219540 intron_variant
T/C 6219541 intron_variant
A/T 6219581 intron_variant
C/T 6219670 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31871.1
MKRSPSSSCSSSSETPIAEQGKRRPNYPRRNNLKSQKCKQNQTTCRRSSVYRGVTRHRWTGRFEAHLWDKTSWNNIQSKKGKQGAYDTEEAAARTYDLAALKYWGKDAVLNFPIGNYTKDLEEIDKVSKEEYLASLRRQSSGFSRGISKYRGVARHHHNGRWEARIGRVCGNKYLYLGTYKTQEEAAVAYDLAAIEYRGLNAVTNFDISNYIDKRKKDQTQETVAQRETVPNSSDSEEAEVEQQQNTTTPTPSENLHMAAVQHNQVPHTPLKEESSSLVTIMDHVLEQDLPWSFMYTGVSEFQDQDFAFSKAEDLVAMFGGGSGFEEDIDFLLSTEPCCETGSDVNMRAVFDSIECGEGGGNMVHGDNKQKEILSFASSSPSSTTTSVSCNYA*


CDS Sequence:
>Vu_31871.1
ATGAAGAGGTCTCCATCATCTTCTTGTTCATCATCTTCTGAAACTCCCATTGCTGAGCAAGGAAAAAGAAGACCTAATTATCCAAGGAGGAACAACTTGAAGTCACAGAAATGCAAGCAGAATCAAACCACTTGCAGAAGAAGTTCTGTCTATAGAGGAGTTACAAGACATAGGTGGACAGGTAGGTTTGAAGCTCACCTATGGGATAAGACCTCTTGGAACAACATTCAAAGCAAGAAGGGTAAACAAGGAGCATACGATACTGAAGAAGCTGCAGCCCGTACCTATGATCTTGCAGCCCTGAAGTACTGGGGAAAAGATGCAGTTTTGAATTTTCCGATAGGAAATTACACAAAGGATCTTGAGGAAATTGACAAAGTTTCAAAAGAAGAATATTTAGCTTCTTTGCGGCGCCAAAGCAGTGGTTTTTCTAGAGGCATATCTAAGTATCGTGGGGTTGCTAGGCATCATCATAATGGGCGTTGGGAAGCGCGCATAGGAAGAGTGTGTGGAAACAAGTACCTTTACTTGGGAACATATAAAACTCAAGAGGAGGCAGCTGTGGCATATGACTTAGCAGCAATAGAGTACAGAGGACTGAATGCAGTGACCAATTTTGACATAAGCAACTACATTGACAAAAGGAAAAAGGACCAAACTCAAGAAACAGTAGCACAAAGAGAAACAGTTCCCAACTCCTCAGACTCAGAAGAAGCAGAAGTAGAACAACAACAGAACACAACTACGCCAACCCCTTCTGAGAATCTGCACATGGCAGCAGTGCAGCACAACCAAGTTCCACACACACCCCTTAAGGAAGAGTCATCATCACTGGTCACTATTATGGATCATGTGCTTGAACAGGATCTGCCATGGAGCTTCATGTACACTGGGGTGTCTGAGTTTCAAGATCAAGACTTTGCTTTCAGCAAAGCTGAGGATTTAGTAGCCATGTTTGGAGGTGGTTCAGGGTTTGAGGAAGACATTGATTTTCTGTTGAGCACAGAGCCTTGTTGTGAGACTGGGAGTGATGTCAATATGAGAGCAGTTTTTGATAGCATTGAATGTGGTGAGGGTGGTGGAAACATGGTGCATGGGGATAACAAGCAGAAGGAGATACTATCTTTTGCATCTTCTTCTCCATCATCTACAACAACTTCAGTTTCTTGTAACTATGCTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31871::LG9:6215159-6217159(+)
TATATTGAGTGCCAAAAATTCAAACACTTTGCCTAACGTTGTTCATTAACCAAATTAATTTGTAGAAATTGTATACGTATTAGCATAGTTTATTAAAAGAATGAGATATCTTAACAATAATTTTAAAGCATAAACATTGTGAAATTGTGAAATGACAAATTTCAAGCCAGTTTTTTAATTGAAAATATAATTGTAAGAGTTGAAAGATGATTATTTTTTATTCATGAATAATATTCAGAGTTGGTATTTGAAATGGTATGAATTGATATGTAATCAAATCATTTAAATAGTAAAAAATTAATGCTAACTATTAAATATGTATAGTTTTTCAGACAACAACGTCTTAAATGTTTTTTAATTAATGAATTTGGGTGTTTCAATATTCTTTTATAGACAGTTTTATACGTTATTTTGTTCAGTAAATCAATATCTGAGATGTTAAGAGAATCACTGCAAAGTAATTAATAAGAGAGAAAACGTGATTCATGCATAATTAAGAATAACTGAGTTCATCTTCAACAACACCACGGAAGGAAAAAATACCACATTAATGTTTGGTCTATAACACAATATTGTTTCAAACATTCATAACTCTATTCAAATTGAGATGATGCGTCAAAATAATAAATGAATGAAAATGATTAAATATATGTATTATTTTTTCTTTTTGCTTTCAATAAAGTAATATATTTTGAATTTCCTTTATTTGATATATAAAAATTTTGAATTTCATATTTATTTTTGTGTGTTATTTTTCTTGTATTTTCAAAATATATGAATCGATGTTGATTTTTAATTTTTAAAATATATTTAAAACTTTTTAGTATATCAATATCATATATTTTAAAAATTTAACACACAGATAATATAACAAAAGAAACAAATACTAAACTTAAAAATAATGGTACTATTATTTTAATACCCAATAAATTTTTATAACTTTAAATTCATTATTTTAATTTTTAACTTTTTTCTACAAATACAAAAATTGATTTTTTTAATGATCAAAGAGTTGTTAGTGATAAAATAGACAATCTAAACTTATACATATATGAAAATAACTTAAAGGAAGCATTGCTTAATGTGATTCAACTTTCAAAGTGGCACTATTCATCTTGTAAATTGCACACACAAGAATTATGATGAGAATGAGATAAAAAGATTAAAACATATATAGCTAACAAACAGAACAAAGATTGAGAGTGTTTCCATCCTTTCATAACTTCTGAATTTTCTTTGTTTCTTGCACATAAACATTCTCAACTAATTTCTGATTAAGGTACATTCTCTCATATCTCACATGTTTGTGCCAACAACTAATATTACAGACACACAAAAAAGAAAAAACACAGTCTAAAATCACAGTATCTGACGTGGACTCTTGACACTACCCAATTAAGTCAGGTAAAGTTCTCTTCTTTTTCATCTTTTTTCATTATTTTAATGACTGAGAACCAATTTAAAAATGGTTAAAAAATAAGGTTGAGATTCCTAAACAAAAGAAAGCCAGCTTAGAATACATAATCCCATTGGTAGCATGGCTGCACCACCCTGCCAAGTGTTCCTCAAGTTCAAGCCACATAATTAGCCATGGTTAATTCATCAAGTTAAATTCCAACCCAAGGTTAAACCAACCATCATCACTTCCTTTTCTCTTCTTCCATTTACTTTCAGTTCCTTTTTTCCACTTCCACCCTTCTTACAATTGCAGATTCAATTGTCTATATAACTATTTTCCCCTTCTTTTTATACATCCAAATTTCTTCCTTTTTTTCCTTCTTTCTCTCTATTTTGGTGAACCACTTTAGGTAACCAGATTGCTCCCACAACTGTACATATAAATATGCCATCATAGAACATCATAGAAGGGAAAAAGAGAGAAACTTGGCAAGGCAAAACATTTAAAAATCCATTTTTTATCTCCATTCACATACCCCATTTGAGTTTTTCTTCCATTTTTGTTCTTTTGGGGCAAAAGGGTGTTCAGATTGAGACACCAA


Gene Sequence:
>Vu_31871(+)
ATGAAGAGGTCTCCATCATCTTCTTGTTCATCATCTTCTGAAACTCCCATTGCTGAGCAAGGAAAAAGAAGACCTAATTATCCAAGGAGGAACAACTTGAAGTCACAGAAATGCAAGCAGAATCAAACCACTTGCAGAAGAAGTTCTGTCTATAGAGGAGTTACAAGGTTAATGAATTTCACTTTTCAATTGTAAATTTTGAATTCTTCTCAGTGATTCTTCTTCTGCATTTGCATGTCTCTCATTTCTCTTTGATCATCAGACATAGGTGGACAGGTAGGTTTGAAGCTCACCTATGGGATAAGACCTCTTGGAACAACATTCAAAGCAAGAAGGGTAAACAAGGTAATTGCTTTTCTCTCTTCAATTATCCAATTAACAAGAGAGAAAATCAAGGAGATCTAATCTAATTTAACATCTTTTCTTTATGTTTTCTTAATTAATATTATTATTACTGTTATTATCAGTTTCTGACCTTGTTTTGTTTCTGCTAATCTTTCTGATTGCAACGTTTACACGCTTTTGGGGCTGTTTAGTTTATTTGGGTAAGTCATTTTCTCATGCACTTGGATCTCACAAAATCCTAGTCAACTTTTTCATTTTTTTTTTCTGAATTCTTAATTATTAATTGAACTGCAGTATTTCTTTTTCTGGATTGTTATTGTTTTTTTTAATGTCAAGAAAGATTCTGATCATGATGCTGTTGTTTGGACCCAATTCTCTGCTTTTTTTAATTTTATTTTTTAATATTTTCCTTTTTTTTTTCTGCAGGAGCATACGATACTGAAGAAGCTGCAGCCCGTACCTATGATCTTGCAGCCCTGAAGTACTGGGGAAAAGATGCAGTTTTGAATTTTCCGGTATATCAATTTTTTTCAATATATCCCACAGATAAAAATGTAATCTTTTAAAAGTTTACAATATGGTGTAAAATTCTCTTCTCTAAAGTATATTAAATATATAATTTTTTAAATTATAAAAAGTTGTATTTCATCTTTATAATGTATTATATAATAGTTAATCTTTATTCTTTATAAAAATAAAGTAAATCATTTTTTTGACAAATAATATATTACAGTTCCTTGATAAATTAATTATAATATAAAAAATATTTCAGATGTTGTTCATTAGAATCAATGTTTTATATTAATTTTATAAAATATTGAGACTGAATTTTTAGAATTTAATTTAGGGGAAAAATATTTTTTTATAATAGTTTAGAAGAAATATTTAACCTAAAAAAAATATAATCATATGATTAAAAAGTTTATTTTCTTGTGTAATGTAAAAAATTGTGACAATATAGTGTTTTTGTTTTGTTCAGATAGGAAATTACACAAAGGATCTTGAGGAAATTGACAAAGTTTCAAAAGAAGAATATTTAGCTTCTTTGCGGCGCCAAAGCAGTGGTTTTTCTAGAGGCATATCTAAGTATCGTGGGGTTGCTAGGTTAGTTGAATTGTGATTAAAATCATTTCTTTTTTTACTTTTTTTTTCACTGTATTTTACAATTGTAATTGTAATTTTCCTAATAAATTAAAGGTAAAATTAAATTTCTTTTTTCTGTAAATATTGTTATTCTGATATTAATATATTTATGTTTATATTTGCACAGGCATCATCATAATGGGCGTTGGGAAGCGCGCATAGGAAGAGTGTGTGGAAACAAGTACCTTTACTTGGGAACATATAGTAAGTAGTCACATTTATTTTCTATTTTTCAATCATTAAATTTTACTGTATATTTTTTTTTTGTGAAATTCCAAAGCTAAATAAAAATACAGATAATTTCACATGTGGCAATTGATAAAGTGGGAGAAAGTACACTTTGTAGACCCCAAAGCTATGAATACTCATATCTTGGTTACAATTTAGAAACTTGCTATTTTTCGGCTTCTTTCTTATCCATATGTTGCACAAAAATAAGTCAAACTTTCAATCAGATTTATACCCTCTTTTTTTATTTAAAGATAACATCCACAAAATACTAATAATTGAATGATAAAAGTTAGAGTTAAACAGTATTTGTATTCAGCTGAAGAAAATATGTGTAAATAGAAGAGACACAGAAAATTTACAAAATTTTAGTTTTCTTTCTTTTAATTTTCAATTCAAATTTCAAAATCTTCTCTTTATACTCAACCTCCCTCTAGTTAAACAAAATAGTATTTGGTTATAATCTTCTTCAAAATCACATTTTCACGTTATATAAGACAAAAATTCGCTCACAAATTCCAAGTACATGTCACGGCTGATTACAAAATTTCTATTCTCTTTGTCTGACTCTATTTATTTTTGTAATTGAAAAATAATTTTGACAAAAAAAAATTGTTCAAGAAATAAAACACCAGTAAAAGAATTGTTTTAGCTTCATTTTTATTCTGAAAGAATAGTTTTTAAAGAATTTTTTTTGTTGAGTTGAAGAGAAGGTGTGTTTGACATAAAATCTCTTGTTGTGTGTGACATGTAAAAGAACATGGTATTTTATAATGAAAGGTGAAAATAAAAGAACAAACAAATGTTTCCTTAATTTTTAAGAAAATATTTGACAAGTACAGGTTGTAAACCTGCAGTTCTCATAATTAATGACAGTGAAAAAAAGAAAAAAAGAGAAAAGGTTGAGTTCTAGGATGCATCATGTGTGTGAGTTGTTCTCATTGCTTGAACTGTAGCTGCAGTAGTGTTGTCCAGTAGTTGCAGTATGCATCAATTTCTGGTCTGACATTACAATATGTGGCTGTGGATCACATAAAAATAGCAGCATAGGAAAGTTACAGCTGCAAACACTCACCAACATGGCACGTGCATTACCCCCCTCTTCCTTTCTTCATGGGTCCACTTTATTCAAAGTCACCACCACACCCTTCTCTGTGGGGTTATCATAACCATAATTCAGTTGCAATTTTATATAACTTTTATACTAGTTAACTTTTTAACTTTTATTCATGGTAAAATTTTAATTCTTCTGCTGATTTTTTATCATGTCAAAAATTTTACAGAGATCAAATTCATAAAATGACAAGTGTAAGCAAGTAAAAACATTATGCCATTTCTTCTATTGAAATATTTTGTTCTAATTAAGAAGTTTTTGAAAGTTTAAGCAATGTGATTTGTGATAATTAGGTTAGTTTGAAGAGAATTTAGTTGGCCAAGTTGAATCTAACATTTGACAATAGAACCCTAAACCTCATAGACAAGCATGTTGGAGGGTACAGCATATGCTTGACTTTGTACTTTGTTCATATGCAGTGTCCACAATCTCTTGCCAGCATGTCGGTCAAAAGTATGAATTTAAAAATTGTCAATCTTGAGGGCAGAATAAAATAAAAGGCTTGTTTGAATAGTTATATAGATAGCTGAAAAGATATGCTAAGAATTAAAAAGAGAAGTAGATCAGGAAGCAGGACACAAACACCCCCCAAATTCAGTAAGCACGTGAACACTAATCCTGTCCTCATACTTCAAAAGCTTTTAACTTTGTGAGATTCTATGTATGTCATAAAGTTGTCTTTTTTTCAAACCTTATTCTTTCTTAATTAAATAATCACCAACTACTTTTAGTTAACACTGCTGTGTTTCTTAACAATTTTGATTGTCTTTTAATCCAGTGATCAGATTCTGAATCTGATAATGTCATCAAATAAACTGTCTACAATTATCACTTCAAATGTGTTAAGATAACATCATAAGATCATATAGAATTTTGTCTTTAAAACATCATATGATCATATATTTTCCCTGTGTAAGAATCATTTCTTCTGTTTTAAGTGCTAATCATTTAGGGGTATTTATTTTTTCTTTTGCTTGATTTGAACTGCAAAGAAACTCAAGAGGAGGCAGCTGTGGCATATGACTTAGCAGCAATAGAGTACAGAGGACTGAATGCAGTGACCAATTTTGACATAAGCAACTACATTGACAAAAGGAAAAAGGACCAAACTCAAGAAACAGTAGCACAAAGAGAAACAGTTCCCAACTCCTCAGACTCAGAAGAAGCAGAAGTAGAACAACAACAGAACACAACTACGCCAACCCCTTCTGAGAATCTGCACATGGCAGCAGTGCAGCACAACCAAGTTCCACACACACCCCTTAAGGAAGAGTCATCATCACTGGTCACTATTATGGATCATGTGCTTGAACAGGATCTGCCATGGAGCTTCATGTACACTGGGGTGTCTGAGTTTCAAGATCAAGACTTTGCTTTCAGCAAAGCTGAGGATTTAGTAGCCATGTTTGGAGGTGGTTCAGGGTTTGAGGAAGACATTGATTTTCTGTTGAGCACAGAGCCTTGTTGTGAGACTGGGAGTGATGTCAATATGAGAGCAGTTTTTGATAGCATTGAATGTGGTGAGGGTGGTGGAAACATGGTGCATGGGGATAACAAGCAGAAGGAGATACTATCTTTTGCATCTTCTTCTCCATCATCTACAACAACTTCAGTTTCTTGTAACTATGCTTAG