Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31864 LG9 6014949 6016377 hypothetical protein E1A91_A02G004900v1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 6015467 missense_variant p.Asn25Lys
A/T 6015536 synonymous_variant p.Pro48Pro
A/C 6015564 missense_variant p.Asn58His
T/A 6015575 synonymous_variant p.Pro61Pro
C/A 6015594 missense_variant p.Gln68Lys
A/G 6015632 synonymous_variant p.Arg80Arg
A/G 6015643 missense_variant p.His84Arg
G/T 6015675 missense_variant p.Val95Phe
G/A 6015856 upstream_gene_variant
C/T 6015898 upstream_gene_variant
G/A 6015937 upstream_gene_variant
A/G 6015969 upstream_gene_variant
T/C 6015985 upstream_gene_variant
T/G 6016000 upstream_gene_variant
A/G 6016161 upstream_gene_variant
G/A 6016168 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31864.1
MFVKMADNISTRTSKRVFRRDLEPEYLLLDENDNLMVSDFGLSALTESKRQDGLLHTKCGTSAYVAPAVISRKGYDWMKANIWSCGVILFVLLAGHLPFHDSNLMETYRNISKGDNVPMKEIRFMSNKPALSIISKLEEICKKLCSKITPHLYMVELQKSNDDTMEYQKLFTQDIRPALEDIVWTRQGEQQ*


CDS Sequence:
>Vu_31864.1
ATGTTTGTGAAGATGGCTGATAACATAAGCACCCGGACCAGCAAGCGTGTGTTTCGTCGAGACTTAGAGCCTGAATATTTACTTTTGGATGAAAATGATAATTTGATGGTTTCAGACTTTGGGTTGAGTGCCTTGACTGAATCCAAACGCCAAGATGGATTGCTCCATACTAAATGTGGTACCTCTGCCTATGTAGCTCCAGCAGTGATAAGCAGAAAAGGTTATGATTGGATGAAAGCGAATATTTGGTCATGTGGGGTAATCTTGTTTGTTCTGTTGGCTGGTCATCTTCCATTCCATGATTCAAATCTGATGGAGACGTACAGGAATATCAGTAAAGGGGACAATGTTCCCATGAAAGAGATACGGTTCATGTCAAATAAGCCTGCTTTGAGTATAATCTCTAAGTTGGAAGAAATTTGTAAGAAGCTTTGCTCGAAAATTACCCCACACCTCTACATGGTGGAACTTCAAAAGTCCAATGATGATACCATGGAGTATCAGAAGCTTTTTACACAGGATATCAGACCAGCACTTGAAGACATTGTTTGGACAAGGCAAGGAGAACAACAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_31864::LG9:6012949-6014949(+)
TCCTAATTGGTGCTCGGTCATATACCTAGCGTTCGTTCTAAATAATGCTCGGTCTTATACCAAGCGCTCGTGTTATTGTATATTTACCTTTGATAAAATAGCGTTCGTTCAATTTTTATAATAATTCCTTTTCTTACGTTCGGTCATTTGCTGGCATTCGGATTTCCGTATGCGATTTACTCCAAAGATAGTTATAAATATTCTTGGCTCTTCTTCTTACATTGGATCCAGTCTAAAGTCTTCATAATGAAATTTTCTTTAAGTACCAGTGTACATCCAAACGAGTTAGTTCATTTAACTGACCACATAGAAAGTAGCGTCCGTCACAGATTTCTTAGTTCATTCAGTCCATTTTCTTAATGCTCGTCCTCGTTCTTCAGAGGGCTGAACGTTCGTTATTTTATGTCTCTAAAACTAAAGATGAAAATGATAATAAAGTACAAAATTTTGAAGAGTGAACATTATATTGAATGATTATACGATTATGGAATTTGAACGAGCGTTCCAGGGAGGAACGACTCATGTATGGATGAATATGAAATTTGGTAAAGTATGACTGTGGGCATGCTAATGCTGGCTGGTCCATCCTGATGTTCCGTGAGTACTCACCTCATGTAGAGGGGGTAGGTCATGTGTGGGAACGACAGGAGGTTCTATTCCTTAGGGGTACTTTGGATAGGACTAACCTCGAGTGGCAGCTGTTGAGTGTATCCCAGTTACTACATCACTCGGGTTCAAGGACGCTTGTAGCTACACAGATTCATACAGTCCGGACGGTCTGTCTAGTACTATATATTTCTTATGATGTTATATGTTAAGTTACATGTTGTGTGAATTGAAAAGTTAAATGTATATGTTGATGTATGAATTAAATTACATAAGCTTCCTTGTGTTGTCCATTGTCTATGTACGTTCGTCCTGTCTTTGCGATGATCATCCGTGTGGATGTGAGCAGAAGGCGAGGCCACTTTGGAGGACGTGATTGAAGAAGAAAACCTGGTTGAAGTGGAAGTTAAAGCCGAACCTTAGCACGCTCGTTCATACTAGAGTTTAGACGTTAGGTTTTAAATTCTGACGTTCGGTTATTAAATTTTGTAAAACCATTCGTCCCAGCTTCTATTATTCTGATATTACTGTATTGAATTCTGTAATTAAAGCTTTTGGCTTATGAACTTAAATCTTAGTGTAAAGACTGCAATGTGTTACTATGTTTTGTCTTCTATAAGTACAAACTAAACCGTTCATATATGTACTTGTGTTGTGCCGCTTCCAAGAAGGTGACTGGGGGGACTGGTAGGTCACCAATACCCTTTGTCATGATGCATTGAGAATTTCTTTTGATGCATTGAGAATTTCTTTTAATGAGTGTTTGTTTTATTGTTTACGTGTTGCGTGCTTTGGACAAGACTAACGTTGTTATTGATTGTTTTGTTGTGCTTACTGTTCGTGTGTATTGTTAGCTAGGAGGTTTGATTTTATTTTCTTTTCAATAGGGTTGTTTTAGTTAAAGTTTCTGAAGAGTGAAAAATGAACTGGGTCTTAAATGTAGCAACAAATCAGGTGAAGTGAGTTTATATAAGAAGCTGCGCCCACGGAATTCAAGATTTGCCACAAAGAATAAAACGACGACAAATTTTTGTCACTCTTCTTTCCCTTCTCTTGCTAATTACTCAGTTCTCTGCTTACCTCCGATTACAGAGCCACACAGACGTGCCTTCCTTAAATGTTTCGTTTTTGGATGGTTGAAAGCTAAGCGGGTGATGCTTCAAGGAGTTCATCTTCGGTATTATCTAGTGTCCTTTACCAAAACCAGGGAATGCTGAAAGATGTGGTTGAAAGTTAAGAGTTGCCTCTCTAGTGTTAATGAAGTTGTAGCACCTCGTGTGCTAGCCTTATTAGTCCTTGATGAGATTGGATATTTAGACCACTGAATATCTGTTTTATGCTCATTTGCCCCAGGAAGTTGGAAATCTGAGCAATTGTGTGATGTCAAATCGTGA


Gene Sequence:
>Vu_31864(+)
ATGTTTGTGAAGATGGCTGATAACATAAGCACCCGGACCAGGTAAATACTTGGTATACTATACTATTAAAAGTAGCATCGGTCTTATTCAAAAAGTGCTGCAGAAAATGGAATAGAAGGGAGGTGTGCTTATGCAAAAATAAGAACTTGGTAGGTTATAAGGGCAAGGGACCTTAGCAAAGGTCTACCATGGTAGGAATCTGATAACTGGCATGAGTGTGGCCATTAAGGTAATTAATAAGAATTTTTTTTTTAAATTTGAATTGTTTGATCAGCTAAGCGTGAAGTTTCAGTGATGAGATTAATCAGACATCGGCATGTGGTTGAGCTTTATGAGGTAATGGCCACTAAAACCAAAATTTATTAAGTCATGGAGCATGCAAAAGGTGGTGAGCTCTTCAACAAGGTACTCAAAGGAAGGCTCAAGGTGGATGCTGCTAGGAAATATTTTAGCAACTGATTAGAGTTGTTGACTACTGCCATAGCAAGCGTGTGTTTCGTCGAGACTTAGAGCCTGAATATTTACTTTTGGATGAAAATGATAATTTGATGGTTTCAGACTTTGGGTTGAGTGCCTTGACTGAATCCAAACGCCAAGATGGATTGCTCCATACTAAATGTGGTACCTCTGCCTATGTAGCTCCAGCAGTGATAAGCAGAAAAGGTTATGATTGGATGAAAGCGAATATTTGGTCATGTGGGGTAATCTTGTTTGTTCTGTTGGCTGGTCATCTTCCATTCCATGATTCAAATCTGATGGAGACGTACAGGAATATCAGTAAAGGGGTATCCAAATTTCCTAAATAGTTAGCACCAGATGTCGCCGGTTATTATCCAGAATATTGGATCCAAACCCAAAGACCGGGATATCAATTGTCAGAATTATGAAATGTTCTTGGTTTAAAGTGGGGTTGGAGAATCCTGCTATTAATGCAACCGAAAACCAAGAACCAGCTCACCTGAATGCTGATGGAATACTTGAAGCGTGCGAGAATGATGGTCCACCTATTGCAGAATCAAAACATGAATTGACCACGTCTTGTAATTTGATTTCTTTTGCTATTATCTCCTTCTCGACTAAGTTTGATATATCTGGTATTTTTTAGGACAATGTTCCCATGAAAGAGATACGGTTCATGTCAAATAAGCCTGCTTTGAGTATAATCTCTAAGTTGGAAGAAATTTGTAAGAAGCTTTGCTCGAAAGTAAGGAAAAAAGATGGAGGCTTGTTGAAGTTGGAGGGTTCTAAGGAAGGCAGAAAAGGGAGTTTAGGTGTTGATGCTGAGATTTTTTAGATTACCCCACACCTCTACATGGTGGAACTTCAAAAGTCCAATGATGATACCATGGAGTATCAGAAGCTTTTTACACAGGATATCAGACCAGCACTTGAAGACATTGTTTGGACAAGGCAAGGAGAACAACAATAG