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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31851 LG9 5610034 5615095 PREDICTED: probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 5610808 missense_variant p.Ile166Ser
C/G 5610809 missense_variant p.Ile166Met
A/C 5611043 synonymous_variant p.Leu244Leu
T/C 5611103 synonymous_variant p.Ser264Ser
T/A 5611207 missense_variant p.Leu299His
T/A 5612350 intron_variant
A/T 5612616 intron_variant
T/A 5612756 intron_variant
C/A 5613212 intron_variant
G/T 5613417 missense_variant p.Lys651Asn
A/G 5614320 intron_variant
A/G 5614332 intron_variant
C/A 5614467 intron_variant
T/G 5614512 intron_variant
C/G 5614630 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31851.1
MAQKPVFLSLLPLLILFLANIQLSEQLEFSQSQTLLKVQQLLGYPSALSALSSTSDFCNIEPTPYLTIVCYEDSLTQLHVVGNNDFTTLPPNFSSDTLFTTIGTLSSLKVLSLVSLGLWGPLPESIAQLSSLEILNISSNYFNGVIPSQLSLLRNLQSVVLDDNNINGEIPNWVGSLQGLAVLSMKKNWLCGSLPTSLDGLQTLRVLDLSSNQLSGEVPHLKNLANLQVLNLENNTFGPHFPSLPTKLVSLVLRNNSFRLSVPSGLNSLYLLQRLDLSLNGFVGPFPPSLLSLPSINYLDISSNKFTGMLFSNTSCNDDLHFVNLSSNLLKGEIPSCLEPKTRVVLYDGNCLSNKNQDQHPLHFCSNEALAVKIIPREPKHKRTTGKTVIVSSMGSVVGVVLILGVVILVVSRVHKKQVVKIPSKSPSENVTSQLHNEDEVKTTTRSIMEHIIKRVPDKRAVETLTRSIKEHVMSRVKNKRVVRASTRSIIEHVSSVNTAKLLTDARYISETMKMGASLPPYRTFALDELKEATNNFDSSCFISEGPHGQIYKGVLSDGMHISIRGLKMRKRHSPQTYMHHVEMISKLRHSHLVSALGHAFECNQDDSCVNSVFLIFEFVPNRSLRSCVSGSSGEKISWTQRIAATIGVVKGIQFLHTGIVPGLYSNNLKITDIVLDNNHNVKISSYNLPLSSENKRMISNGTYPGLKGNVQARIKGEDKNDVYDIGVILLEIILGRPIMFHNEVGTLKDLLHVSIKTDDIARRSIVDPAVHKECSDESLMTMMEICVRCLSDDLTERPSVEDILWNLQFAAQVQNSWKRDSSDHSYSPAPSSRD*


CDS Sequence:
>Vu_31851.1
ATGGCACAAAAACCAGTTTTCCTTTCTCTTTTACCCCTTCTAATCTTGTTTCTTGCCAACATCCAACTTTCAGAGCAGTTAGAGTTTTCTCAGTCTCAGACACTTCTCAAGGTTCAGCAACTTCTTGGTTATCCATCAGCATTAAGTGCCCTCAGCAGCACCTCAGACTTCTGCAATATTGAGCCTACCCCATATTTGACAATAGTCTGCTATGAGGATAGCTTGACACAGCTTCATGTTGTTGGCAACAATGATTTTACTACACTGCCTCCAAACTTCTCCTCTGATACTCTTTTTACTACAATAGGAACTCTGTCAAGCTTGAAAGTCCTCTCTCTTGTTTCTCTTGGACTCTGGGGGCCCTTGCCTGAAAGCATTGCACAGTTGTCTTCATTGGAAATACTTAACATTAGCTCAAACTACTTCAATGGAGTCATTCCATCTCAGCTTTCACTTCTCAGGAACCTGCAGTCAGTGGTGCTTGATGATAACAACATCAATGGTGAAATTCCTAACTGGGTAGGCTCACTTCAAGGTTTGGCTGTGCTTAGTATGAAGAAAAACTGGCTATGTGGGAGCCTTCCAACTTCATTGGATGGTCTTCAGACCTTGAGGGTGTTGGATCTGTCAAGTAATCAGTTATCTGGGGAAGTTCCTCATCTTAAGAATTTGGCTAACCTTCAAGTTCTTAACTTGGAAAACAACACATTTGGACCTCATTTTCCTTCACTACCCACCAAGTTAGTTTCTCTTGTGCTCAGAAATAACAGCTTCAGGCTAAGTGTCCCTTCTGGTTTAAATTCTTTGTATCTGCTCCAAAGGCTAGACCTTTCTTTGAATGGCTTTGTGGGGCCATTTCCACCATCATTATTGTCACTGCCTTCCATAAATTACCTTGATATTTCCTCAAATAAATTCACTGGAATGCTTTTCAGTAACACGTCATGCAATGATGATCTCCACTTTGTAAATTTGTCTTCAAATCTTCTGAAAGGGGAAATTCCCTCTTGTTTGGAACCAAAGACCAGGGTTGTTCTGTATGATGGCAACTGCTTATCAAATAAGAACCAAGATCAGCATCCTTTACATTTTTGCAGCAATGAGGCTTTGGCAGTGAAAATCATACCTCGTGAACCAAAACACAAGAGAACAACTGGTAAAACAGTTATTGTATCAAGTATGGGAAGTGTGGTAGGTGTAGTGTTGATTCTAGGAGTGGTTATCTTGGTTGTTAGCCGAGTTCACAAGAAACAGGTAGTGAAAATCCCTTCAAAGTCCCCTTCGGAAAATGTCACCAGCCAGTTACATAATGAAGATGAAGTGAAAACTACTACAAGGTCCATAATGGAGCATATCATCAAAAGGGTTCCTGACAAACGTGCTGTGGAAACACTGACAAGATCCATAAAGGAGCATGTAATGAGCCGAGTGAAAAATAAGCGTGTTGTTAGGGCATCAACAAGGTCCATAATAGAACATGTATCATCAGTTAACACAGCAAAACTACTCACAGATGCAAGGTATATATCAGAAACAATGAAGATGGGAGCCAGCCTTCCTCCTTATAGGACCTTTGCTTTGGATGAACTTAAGGAAGCTACAAATAATTTTGATTCATCATGTTTCATAAGTGAAGGCCCACATGGTCAGATTTATAAAGGGGTTCTCTCTGATGGGATGCACATTTCTATTAGAGGTTTGAAAATGAGGAAGAGACATAGCCCTCAAACTTACATGCACCATGTTGAGATGATTTCAAAACTAAGGCATTCACACTTGGTTAGTGCTCTTGGGCATGCTTTTGAGTGCAACCAGGATGATTCGTGTGTGAACAGTGTATTTCTCATATTTGAGTTTGTTCCAAACAGAAGTTTACGAAGCTGCGTTTCTGGATCTTCTGGGGAAAAGATTTCTTGGACTCAGAGAATAGCAGCTACAATTGGAGTGGTGAAGGGCATTCAATTTTTGCACACAGGGATAGTGCCTGGACTATATTCAAATAATCTCAAGATTACAGATATTGTTTTGGATAACAATCACAATGTTAAAATAAGCAGCTACAATCTGCCACTCTCTTCTGAAAATAAAAGAATGATAAGCAATGGAACTTACCCTGGACTCAAAGGAAATGTCCAAGCAAGGATAAAGGGTGAAGACAAGAATGATGTCTATGATATTGGGGTAATCTTGCTAGAAATCATTCTGGGCCGACCAATAATGTTTCACAATGAAGTTGGAACACTAAAAGATCTTTTACATGTAAGCATTAAAACTGATGACATAGCTAGAAGAAGTATTGTTGACCCAGCAGTTCACAAGGAATGCTCAGATGAATCATTAATGACAATGATGGAGATATGTGTAAGGTGTCTCTCTGATGACCTAACTGAAAGGCCTTCTGTGGAAGATATTCTGTGGAACTTGCAGTTTGCAGCACAAGTTCAGAATTCATGGAAAAGAGACTCAAGTGATCACAGTTACTCTCCTGCACCATCCTCCAGGGATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_31851::LG9:5608034-5610034(+)
CATCTATTTTGAAAGGAGAAAGTGAAAAAAAAATAGAGAAATTCATGTGAAATGTTTATAAGTGTGAAGTATCTATCTTCATTTATGATTAATGTTTATTTCTGAAGATAACTAACTACTTTTCAGGGCACTCTCCTTCTCTGTTATATCTTTTCTATCTATAAAAATTCAAAATTTACTTAAAATGTAGACAGTTCAACTGTACCAACATCTTTATGAAAGACAATTTTATAAAAAATATCATTCTAATTCACCATAAAACCTTATTTCAGAAAATTTGCCGTTACATGTTTTGCAGGCACAATGAACTACAAATACATTATCCAAAACTCTTTTTCCAATTTAATAAGAAAAATGTTATTAAAAGGTAAGTAAATATAGAGAAAAATAGTTACTTGAAGAGGTGATTGATAAGGGTGTCTGTCACGAGAAGGAAAGGAAAAGCAGACCCGTGAAGTATGGTCCCATCACCACTTGTCTCTTTCACTTCTCTGCCTTAAAATAAAAAGGTTTGCTTTTTATCTGTCACGAGCTCAACAATTTATATTAACATATTCTTTCTTTCCTTATATTCACACATCGATGCACCAATTTTCCAACACTATTAAACAATTCCTCCAATTTCTCACACAACATCTCATAAATATCCATTTTCTACTTTCCTTTCCATTACCTTCGAATTATCAATCATTTCAACAACATCGTTCATGTTCACTAATAATATTTCATAATACTTTTTTGAAGTTTCTACTTTCTAAATTACACATTTCTTAAACTAATTATTCTAAATTACAATATAAGTTAAAGTCAAATCAGATTTATGTATTTTAAATATTTAATATGATAGATTAAAGTAATTAATAATTTATTACATGATGATATGAAAAAAATGAATTTAAATTAAAAATAAAAAAATTTAAATGTAAATAAAACTTTAATTTAATTAATATTCTTTATAATATCTAATTCAGGTAGAAAATAGTTTGTTTAAATAAAAAATGATAATACTTTTAAAAAGATAATAGAAACAGTGAAAATTCCACTAAAAATTTAATTATTTAAAAAAATCTAAAATAATAATAATCATTATTATATAATATTATTTTTATTAAAAATCATACATTTGTTTTATTTGATGAAATTTATATAATTATGTTTTTATGTCAATAAAATAGATTACTAGCTTAAACTTTACAAATTAAAATTTTAGTAGTCTTACCAAACATAATCTTTTCTAATCTTATATTTAAAACAACTTTTTAGGGTCTGCGTGTGCAATTTCCAATGTAAAACGACAAACTACCTTCACATTTTTGGTGTGCCTTTCGCTGCTATGCTATGCTATGATATGATATATTACTACCACACAGTTATTAATTTGTGTGCCTTTGGGAATGCAGAATACCTTATGTTGATTGGACGTTTTTCACTACTTAGGGTATCTTTATTTTTCTCCACACAAATTTTTAGGATCATTATTGATGGATTTTGGCACCATTATTTTTAACAGAAAAAAAATAAAATAATAGATTGAAACCAAGAACAATTATTGTTTTACACTGTCTCATGCTAGAACAATTATTGTTTTCAATTAATAGGTATAAACATGGATAGATAGAGATGAAGAAAGAAAGTAGTGAGACCTATAACATCAAATGACTGCTTTAGTATGTGTTAAAAGATTCAGTAAAGTTTGAAAGAAAGTAACAAACTGTCATATGTATGAAACTCTGATTTCTATATACAGATTAGTAATTGTTCATGTATGATACTTTTAAATTACTATCATTACGTTATAAATTTATCAGAAATGAAATGCTAAAAGAGGGACCATTATATTATGTCTTAGATAAAGCCAAGCCAAGGCACAGTGGCAGCAGTGCAAATTTTAGTAAGATACAGAACAAAAAGGGTTCACATTTTTATAGAATATAAAATTAGGTAACTAGCGTGTTGTCACTTTGTATCATGTGCAGCCAAACCAACAAAACAAAAGCACA


Gene Sequence:
>Vu_31851(+)
ATAGCATTGCATTGCAAAAAATGGTTAACGGTTGAACTGAGAACATGGTCCACAGTAAAATGTTTCATGTTTTGCAGTGTTGGTGCTTGTTGTGTGCTAATACTTTTCTTAGTGCATTCCATTGAAGATCAGAAAGAACTAGAGTGAAACATAGTTGGTTCATTTGTGTTGAATATAAATGGCAGAGGCAGAAACTTGTTCCTCCTAGAGGCCTCATCAAAAACCCCTTTGTGCCTTCATTCATCCAAGTGATCTCTCTCTGTTTGTTGAAAGGAGAGATGGCACAAAAACCAGTTTTCCTTTCTCTTTTACCCCTTCTAATCTTGTTTCTTGCCAACATCCAACTTTCAGAGCAGTTAGAGTTTTCTCAGTCTCAGACACTTCTCAAGGTTCAGCAACTTCTTGGTTATCCATCAGCATTAAGTGCCCTCAGCAGCACCTCAGACTTCTGCAATATTGAGCCTACCCCATATTTGACAATAGTCTGCTATGAGGATAGCTTGACACAGCTTCATGTTGTTGGCAACAATGATTTTACTACACTGCCTCCAAACTTCTCCTCTGATACTCTTTTTACTACAATAGGAACTCTGTCAAGCTTGAAAGTCCTCTCTCTTGTTTCTCTTGGACTCTGGGGGCCCTTGCCTGAAAGCATTGCACAGTTGTCTTCATTGGAAATACTTAACATTAGCTCAAACTACTTCAATGGAGTCATTCCATCTCAGCTTTCACTTCTCAGGAACCTGCAGTCAGTGGTGCTTGATGATAACAACATCAATGGTGAAATTCCTAACTGGGTAGGCTCACTTCAAGGTTTGGCTGTGCTTAGTATGAAGAAAAACTGGCTATGTGGGAGCCTTCCAACTTCATTGGATGGTCTTCAGACCTTGAGGGTGTTGGATCTGTCAAGTAATCAGTTATCTGGGGAAGTTCCTCATCTTAAGAATTTGGCTAACCTTCAAGTTCTTAACTTGGAAAACAACACATTTGGACCTCATTTTCCTTCACTACCCACCAAGTTAGTTTCTCTTGTGCTCAGAAATAACAGCTTCAGGCTAAGTGTCCCTTCTGGTTTAAATTCTTTGTATCTGCTCCAAAGGCTAGACCTTTCTTTGAATGGCTTTGTGGGGCCATTTCCACCATCATTATTGTCACTGCCTTCCATAAATTACCTTGATATTTCCTCAAATAAATTCACTGGAATGCTTTTCAGTAACACGTCATGCAATGATGATCTCCACTTTGTAAATTTGTCTTCAAATCTTCTGAAAGGGGAAATTCCCTCTTGTTTGGAACCAAAGACCAGGGTTGTTCTGTATGATGGCAACTGCTTATCAAATAAGAACCAAGATCAGCATCCTTTACATTTTTGCAGCAATGAGGCTTTGGCAGTGAAAATCATACCTCGTGAACCAAAACACAAGAGAACAACTGGTAAAACAGTTATTGTATCAAGTATGGGAAGTGTGGTAGGTGTAGTGTTGATTCTAGGAGTGGTTATCTTGGTTGTTAGCCGAGTTCACAAGAAACAGGTAGTGAAAATCCCTTCAAAGTCCCCTTCGGAAAATGTCACCAGCCAGTTACATAATGAAGATGAAGTGAAAACTACTACAAGGTCCATAATGGAGCATATCATCAAAAGGGTTCCTGACAAACGTGCTGTGGAAACACTGACAAGATCCATAAAGGAGCATGTAATGAGCCGAGTGAAAAATAAGCGTGTTGTTAGGGCATCAACAAGGTCCATAATAGAACATGTATCATCAGTTAACACAGCAAAACTACTCACAGATGCAAGTAAATCCTCAAATCCTTTGCCTTATTGGTACATAATTTCTAGTTTGAAAAATGATATTATTGTTCTACAAGTACATGGTTTAAGGGCTAAAAGAAAAATTCTGGGAATATGTTCTTCTGTCCAGCTATGTATGTACGCCAAAAACATTGAATTAGAGCAAAGAGAAATTTCTAGTTTTATTTCTTCTGCAGATTGGATCAATTCAAATAAATGCTCATATATTGTACTGAAATGCAGAATGTATCGTTGAAATCTAGGTGTTAGAGCATGTCATTCAGAACCTTTATTTCTATTAATTATCACTAGTCACATATGGTCATTTTATATTATTTGTTTGCAGGGTATATATCAGAAACAATGAAGATGGGAGCCAGCCTTCCTCCTTATAGGACCTTTGCTTTGGATGAACTTAAGGAAGCTACAAATAATTTTGATTCATCATGTTTCATAAGTGAAGGCCCACATGGTCAGGTATGAACTTGAAGTTATAAATTTAGATTGATATAATCATATTTACCTTGGCCTTAGCCTGTAGGACTGTAATTTTGTGATGACTCTCACTTCACTCTGGAAACTGCATAGTAGAAGAAATATGTCAATAATCTGAATTTCATACTAGTTTTACCTTACCGAAAATTGAGCTTCATATAAGTAAGAATATTTGAGAAAATTTGTTAAGTACAAAGTCCATGGCTATGTGTATTTTTATAGTCTTTAAATGAGGTACATTTGACTATTTTGTCTTCCTTCAAATTATACCTAGAGCAGGATAAGTTAAAGTGCCAATCTTCAGTTCTGTTACAGGCATCAAACATCAATTCACACATTATAGAGTTTTCTTTTCATACTCAAATTTATTACGGTTTCCCTTTGCAGTAATTGTACAGTTTTGTGTTGTTTAAGTTCTGACAAGTAATTCACCATTCTGATTATGCATATAATTTTGTGGAACCGTTCTCTATTATCTTTGACTTAACAAATTTTAATCTATTTTAACTGTAATGACAGATTTATAAAGGGGTTCTCTCTGATGGGATGCACATTTCTATTAGAGGTTTGAAAATGAGGAAGAGACATAGCCCTCAAACTTACATGCACCATGTTGAGATGATTTCAAAACTAAGGCATTCACACTTGGTTAGTGCTCTTGGGCATGCTTTTGAGTGCAACCAGGATGATTCGTGTGTGAACAGTGTATTTCTCATATTTGAGTTTGTTCCAAACAGAAGTTTACGAAGCTGCGTTTCTGGTAAGGAAAATTCTTCATCAAAATCTTCCATCTAATATTGCCACATACCATAAATTCCAATGATTTTGTACACTATAGTCCTTCTAGGACTTGTTTGGCTTAAGATTTTATTTTCATTTTCTAAAAGTGATCATTTGTTTTCAATTTATTTCACATCTTCAAATGTTGTTTGAAAACAGATATTTGAAAAGCACTTCTCAAACCAAATAGGACCTAATATTTTCTAATGTTCACAACATGAAATGGATTTTTCATCTGACATTTGCTTTCAATAGGATCTTCTGGGGAAAAGATTTCTTGGACTCAGAGAATAGCAGCTACAATTGGAGTGGTGAAGGGCATTCAATTTTTGCACACAGGGATAGTGCCTGGACTATATTCAAATAATCTCAAGATTACAGATATTGTTTTGGATAACAATCACAATGTTAAAATAAGCAGCTACAATCTGCCACTCTCTTCTGAAAATAAAAGAATGGTAAATGGATAATTCTTTCTATATGCCCTTTATTACTACTATATCTTCACCCCTTTCTGATTTTTCGGAGCATAATTGTTTTCTACAAAACTTTCAGATAAGCAATGGAACTTACCCTGGACTCAAAGGAAATGTCCAAGCAAGGTGAACAAAATATTAATCACTGATATTGTTATAGAATCTAATCTAGCAACTAAGAAAGTAAGAACATACAATCAACACATTGGAATTTCTCATGAAAGGCATTTTATCATACATGCTTTCAGTTGAAAATTGAACTAAATATACTAGTATCTGTAGAGATAGTTAAACAGAAAAGAATTTTATTAATTCTTTCTCAATCCTTTATGTATGTATCCTTTGATAAGTTTGTACCCTGATCCATGTATCTCTCTGCTTGGGATCTCTAATGAACAAAAATGTTAGTTAAACACTCAACTTGTTGAGCCTGGTTCTTAAAGCTTTCAATGTCTGCAGTCATGTGAACTAGTGATAAAGCCTTTTTAGAGTATTGTACAACTATATTGGTGCTTTGCTAATTGTATCTAATAATGTGTATATTTTTTTGCCTTAACTAGCATTGATTATTTATGCAGGATAAAGGGTGAAGACAAGAATGATGTCTATGATATTGGGGTAATCTTGCTAGAAATCATTCTGGGCCGACCAATAATGTTTCACAATGAAGTTGGAACACTAAAAGATCTTGTGAGTATTACCTTCAAGTTTCATATTAAGGCATCTTAGATTATTAGATTGTGAATAAGTTTCCCAATTTGACATTAAGGGTGCATTTGATTTGCTAAAACAAACCATGAATAATTCAACATTAAAAAAATTGCTCATAAGTTGAGTTTTGCAATAGTACAAGTGCTAGACAAAAACAAAACAGCTCAAGAGACAGCACACAACTGAGTTTTTGTAATCCACTAAACAATTTTAAATCAATAAATTTGTGGTTTTTTTTTTTTATATGGTGTTTAATTTTTTCATTTTTATTCAATGTAGAACTTAAAATCATGTTTGGATTTTCAACAAGTTGATTTTTTTCTTTAATTATTTATTAAGTATCAAAACTTTGTTGTGTAAAGCACAAGGGGTAGTAAAGTAGATAGCACCTAAATCTAAGAATGTTGTGTGGTACTTCTGCAGTTACATGTAAGCATTAAAACTGATGACATAGCTAGAAGAAGTATTGTTGACCCAGCAGTTCACAAGGAATGCTCAGATGAATCATTAATGACAATGATGGAGATATGTGTAAGGTGTCTCTCTGATGACCTAACTGAAAGGCCTTCTGTGGAAGATATTCTGTGGAACTTGCAGTTTGCAGCACAAGTTCAGAATTCATGGAAAAGAGACTCAAGTGATCACAGTTACTCTCCTGCACCATCCTCCAGGGATTAAGATCTGTATGATATTTTCAGCTAGCAAGGGTTTGTGTTACATTGTACAAAAAGTTTAATTTTATATCATGATTGTCACAATTTTCATTATCAGAATTCAATAATTATGTGTCTAAATTTTTGCCTTTCAT

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