Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31790 LG9 4181302 4184843 putative kinase-like protein TMKL1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, phosphorylation, protein phosphorylation, developmental growth
Cellular Component   located in   extracellular region
Molecular Function   enables   protein kinase activity, protein kinase activity, ATP binding, protein kinase activity, ATP binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 4181527 3_prime_UTR_variant
G/T 4181528 3_prime_UTR_variant
C/A 4181530 3_prime_UTR_variant
C/T 4181533 3_prime_UTR_variant
A/G 4182174 3_prime_UTR_variant
C/T 4182374 missense_variant p.Ala289Thr
T/C 4182397 missense_variant p.Tyr281Cys
G/A 4182399 synonymous_variant p.Phe280Phe
T/A 4182565 missense_variant p.Gln225Leu
G/C 4182996 intron_variant
T/A 4183261 intron_variant
A/T 4183450 intron_variant
G/A 4183740 intron_variant
C/G 4183904 synonymous_variant p.Leu129Leu
T/A 4183931 synonymous_variant p.Ile120Ile
T/C 4183994 synonymous_variant p.Leu99Leu
A/G 4183995 missense_variant p.Leu99Pro
T/C 4184114 synonymous_variant p.Glu59Glu
T/A 4184145 missense_variant p.Lys49Met
A/G 4184299 5_prime_UTR_variant
A/C 4184621 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31790.1
MLILVLGLVSATLLVIVAGYVLYCKKRVSRYESKDIESSEHKEEEVAQKEDLMIFQGGEDLTICDILDAPGEVIGKSNYGTLYKALLQRSNKVRLLRFLRPVCTARGEELDEMIQFLGRIRHPNLVPLLGFYTGPRGEKLLVHPFYRHGNLTQFIRDGNGECYKWSNICRISIGIVKGLEHLHTSQEKPIIHGNLKSKNILLDRSYQPYISDSGLHLLLNPTAGQEMLESSAAQGYKAPELIKMKDATEESDIYSLGVILLELLSGKEPINEHPTPDEDFYLPNFMRNAVLGHRIADLYHPAILLRNSREDSVPVTEEFILKVFQLAMACCSPSPSVRPNIKQVLKKLEEIMF*


CDS Sequence:
>Vu_31790.1
ATGTTGATACTGGTTCTTGGACTAGTTTCAGCTACTTTGTTAGTGATTGTTGCAGGTTATGTGTTGTATTGCAAGAAAAGAGTATCAAGGTATGAGAGTAAGGACATTGAAAGCTCGGAACACAAGGAGGAGGAGGTGGCTCAGAAGGAGGATTTGATGATCTTTCAAGGTGGGGAAGACCTTACAATATGTGACATATTGGATGCTCCGGGGGAAGTGATTGGAAAATCCAACTATGGAACACTGTATAAGGCCTTGTTGCAGAGGAGCAACAAGGTGAGGCTGCTCAGGTTTCTAAGGCCAGTGTGCACTGCAAGAGGTGAAGAATTGGATGAGATGATTCAGTTTCTTGGAAGGATAAGGCATCCTAACTTGGTTCCTCTTCTGGGGTTTTACACTGGGCCAAGGGGTGAGAAGCTTCTTGTTCATCCCTTCTATAGACATGGGAATCTTACTCAATTCATAAGAGATGGAAATGGAGAGTGTTACAAATGGTCAAACATATGCAGAATATCCATTGGTATAGTGAAAGGATTGGAGCATCTTCACACATCACAGGAGAAGCCTATTATCCATGGAAACCTCAAGTCTAAGAACATCCTTTTGGACCGCTCCTACCAGCCCTACATCTCAGATTCTGGCCTACATCTTCTGCTGAATCCTACTGCTGGACAAGAAATGCTTGAAAGTTCAGCAGCACAGGGTTACAAGGCACCTGAGCTCATAAAAATGAAGGATGCTACTGAAGAGAGTGATATATATAGCCTTGGTGTGATCTTGCTGGAACTGCTTTCAGGAAAGGAACCTATCAATGAGCACCCTACTCCTGATGAGGATTTCTATTTGCCAAATTTCATGAGAAATGCAGTCCTTGGACACAGAATTGCTGATCTATACCACCCTGCCATTCTTCTCAGAAACAGCAGAGAGGATAGTGTTCCAGTCACAGAAGAATTCATCCTCAAAGTTTTTCAACTTGCTATGGCTTGTTGCTCCCCTTCACCCTCAGTTAGACCTAACATAAAGCAAGTCCTCAAGAAACTTGAAGAAATTATGTTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31790::LG9:4184843-4186843(-)
ATCACCAAAAGTTCTTACAAAATTCAAATCTGCGTCAATTTATAGTATAACACATATCAGACGCATTTTAATCGATTGAGCTGCTAACGTAATCAAATATAACAATCAGTTATAACAGAATTAACAGCCGTCAAACAAATAATTGAATGTACAATTAATGCAGTCGACTATCATTTAATGCTTGGTCAACATATTTAAAAATATGACCGTTGTGTTAGTTGTTACCAGCATTTAACAGATTTTCAAAACATCAACTAACTTATTCGAATACATAGTGCATGCATTCGCTTAAGTGAAATTTTTTTGCATAGGTTTGAAAACTTTTCTCTTTGAAAAAACTCACAGCACACTTCAAAAGAGTTTGTGCAAACACACGAGTTTTAATCGATTCACCCCGTAATGTAATCGACTTAAAACTGTTGTTCTGCCACACATTTAAAGTTCAACCATAGTGTTTGTGATTTTTCTTTTCCCAAAAACATATGTCATACATACACATATAAAATCACATATTTCACACAGTGATATGCAATGAACAACACAAACATAACTCAAACATGTTCTCAAATATGCTTTAAGAGATTTAACACATTAAAGAAAAACATATGATACGTAAACACAGAACATGTAACACAGAACATGTAACACATAATATACATGTATTATTAATTATGTGTTGTCATCGTAAAAAACTCAAATATTACTGAGATTGTGGGTTAAGCTAAACATGTGCTTCCCCTATCAACAATATGCAATCAAGACAACAAGGCTAGATCCAAAGAGAGTAGGCTACAACGAGTCAAGCGACAATGATCGAAGCCGAAGAAGACGATGCATATGCCACCACATATGACTGGAACAAACGATGACTGCAAACTTCGACCTACGCATGGTAGCACATCTAGACTCCGATAATGAAAATTTCAACAATGTTGGGATTGAGCATAGCTGTGTTTCCACTTCATTTTAATCAATTAAATTTTCAAATAGTGTAAATTCTGTATGTACTTTTTATTGAAAATTTTAGATATTTTGTTATAGGTATTTAGGTTGAGTAGTATAACAAAAATTATTTATGCTTTCTTATATAGAATTTTAAATATTGAGATGACTTGTCTCACAATATGTTAAGTTTTATAGAAAATTGTGCGTTAATTCAACGTATTTAGAATGTTTGAGTTTCAAAATAAATCTTGTTTGATGTAAAAAAAGTCCATTTAAATCTTAAATGATTTGTTTTTTTAAAAACATTAATTGAAAAATAATTTTAGATAATATCAATAGAAAAACATCATCAACTAATCTTTTGAATTATTAAATTATTAAATATTAAAATAAATGTTTACATTTAATAATAATTAAGTATTCTATAACAAAAATTTAAAGTAATATAAATATAATTTAAATTATCTGAATAAATCATTTACAAATTCACACAATCTAATTTCGTCAAACTCTCAAATTCCCTATCTTATCTAATTTTTAAAAGTATAAAATTCTAATCTTAACACGTAAGAATTATAAGTATATATAGACAATCAACAACAAAACAAAATAATGCATATTTAGTACTTCAAAATATTGATTTTGACGTACTTCAAACTTTTACATTCTTAATTATGAAGAAATCACTCTAACTAATTGCATGATTACCTCCACCTTCCCTGGGAACTTTCCTTTTTACAAATGAAGTTAATGCCTTTCAATTGAATTCATTTATATATTAATTGGCATAAAACAGTTATGCTGAAAAGTTGAAGCCAGTAACAGTTTATAAAGACTCAGTTTTTACTCTAATAAGCAATTTTTCAAGAATAAAAATGTGACAAGACATCATATTTTAGAGTAAACGAATACCCCATAGATATTTTATTCTGATATTACCTTATCATGACAGAAAATGAACATAACATCAGAAATTGTGTGCAGAATGAAGCAATGATATTTGTGGCAGCAAAGTTATGAAGTATAAATGTAGGACTCACCAGAATGATAGAAGC


Gene Sequence:
>Vu_31790(-)
AGGGTTTGATGTTGTGGTGTGGCAAATGAGTATTTTCACATCACATAACATAACATCAGCAATATTCAGAGACAGTCAAATTGGGATAGAACATCACATGCCTTAGATCTGTCTCATATTGCATTCACATTCAGTCATTCCTTCCAGCTTGTATCTTCCAACCCTTTTCCACATTTTCCACCCAGAAATTCTCCATTCCTCTCTCCTACTACCTATGTCCATTTCTGCTTCAATTATTGCACACTTTAGCCACCTCATTCAATTCCCCTTCATCTTAAAATTGGGTTCCACAGCCACAAAGTTCTCTTAACCATGCTTCTCCTTGTCCTATATACCCACATGGGAATATTATCATTTTCCATGTAAAATCACTCTACTTTTTTCATCTACATGTGCTCCTTTCAGTCTGTCTCATCACACCCCAGATCTTAATTATCCCATTTATCCAAGACTCTTGTGTGTGTCATTCGGTCCAATTGTGTTGCTAGCAGTACTCACTACTGGGTGTGCTGAAAGATCAGGTTTTTCAGTGGTACAAGGAGAATCACCCTCCATGTTGATACTGGTTCTTGGACTAGTTTCAGCTACTTTGTTAGTGATTGTTGCAGGTTATGTGTTGTATTGCAAGAAAAGAGTATCAAGGTATGAGAGTAAGGACATTGAAAGCTCGGAACACAAGGAGGAGGAGGTGGCTCAGAAGGAGGATTTGATGATCTTTCAAGGTGGGGAAGACCTTACAATATGTGACATATTGGATGCTCCGGGGGAAGTGATTGGAAAATCCAACTATGGAACACTGTATAAGGCCTTGTTGCAGAGGAGCAACAAGGTGAGGCTGCTCAGGTTTCTAAGGCCAGTGTGCACTGCAAGAGGTGAAGAATTGGATGAGATGATTCAGTTTCTTGGAAGGATAAGGCATCCTAACTTGGTTCCTCTTCTGGGGTTTTACACTGGGCCAAGGGGTGAGAAGCTTCTTGTTCATCCCTTCTATAGACATGGGAATCTTACTCAATTCATAAGAGGTAAATAAATTGTTTCTCTTGCCTTTTTGTACTTCTAATTCTGTTATCTGCTTTTGCAGCAAATCTGTGTGTCTTCTTTCTCTTGGGATGTTCATTTGGTGTTTTGTCCTGATTTTGTCAATATAATAATGGGTTTGAAGGCTTGTGGCAAATCTTGATCTGTATTTAGTTTGAAAACATTCACTACTTAGTTTGTGTTACTGTTACTGTTAGTGTTTTGTTGGGATTTGGGAATTATAGAAGAAACATGGAGTTGTTTTTTCATTCTAAATGTTCCTTCCTCCCTTGCAAGACTCTAACACAGATATTACGATATACTCAATTAATTCATATTTAGTAGTAAAAAATATCTCTAACTTTTCAACTATTTTTGTGTTTCTTTTCAATGTTTCTGGTTCTTCATTAATTGCTCTTAATTATGTGTACGAATACTGTTACAAAAATTAGCTTAAAAGAAGCTAAAAGGATTATTGTTTTGGTACAAACAAAAAAAATCTGAAAGAAATTACTTTAGAATGGACCGAGTAGTAGTTGGTTCAATAGAAAAGTGAAATGATATTAGTGCAGCAAAAGAGTTACATCATTTTTACACAGTAGTGACAGAATGTGGTGTTGGAATATGTATTACTTGTTTTTGTTTTATTATTTTAAAGGGAATCAGTATAAGAACTGTGTAAGGTTTTTTATTATTGGTTTGCTCTGTTACTTTAACGAAATAGACCTTTTTCTTTTACAGTGTCTGAAAACTGAATAAACCCATCTTTCTTCTTTTAGTATATCATTGACATTTTCCATGCTGATATTAACACTACTCAATTTTAATTGCCTTATGTATGGTCATTTTCATGGCATTGATATTCATTCATCTGTTAATAAAATATCAATTAGATTAGTAAGTTACTACATTAAGAAGAGCAAGTGATGATGAAATAGCTAGACAGAAAGTTCCCAACCAAGCTATTTGATTCATTAGGCCTACTCTTCACACCTCAGAGTGAATTTTGTTTTGCATTATATGTTTCACTTATTGATCAAATATGTTCACTATGCAGATGGAAATGGAGAGTGTTACAAATGGTCAAACATATGCAGAATATCCATTGGTATAGTGAAAGGATTGGAGCATCTTCACACATCACAGGAGAAGCCTATTATCCATGGAAACCTCAAGTCTAAGAACATCCTTTTGGACCGCTCCTACCAGCCCTACATCTCAGATTCTGGCCTACATCTTCTGCTGAATCCTACTGCTGGACAAGAAATGCTTGAAAGTTCAGCAGCACAGGGTTACAAGGCACCTGAGCTCATAAAAATGAAGGATGCTACTGAAGAGAGTGATATATATAGCCTTGGTGTGATCTTGCTGGAACTGCTTTCAGGAAAGGAACCTATCAATGAGCACCCTACTCCTGATGAGGATTTCTATTTGCCAAATTTCATGAGAAATGCAGTCCTTGGACACAGAATTGCTGATCTATACCACCCTGCCATTCTTCTCAGAAACAGCAGAGAGGATAGTGTTCCAGTCACAGAAGAATTCATCCTCAAAGTTTTTCAACTTGCTATGGCTTGTTGCTCCCCTTCACCCTCAGTTAGACCTAACATAAAGCAAGTCCTCAAGAAACTTGAAGAAATTATGTTCTAGAATCCATGGGGGGCTTTTTGTGATTATTTTGTGTAGTATTGGCCACTCTGGCAGCAGTGATACTGCACGCTTTAAATTCTTCAAGCTCATCATTAACAATGATGTGGTTGGAGACAATATAACATTTATTATATATATGAGAAATTAGGAAGAAAAAAAAAGTAAGTAGTCTGCTTACAAAATGTGCAATTGACAACCAAACAAAGACTTCAGAACAGTTGATGTTGATGTTAAGGATTAAAGTCACATGAAGAATCATAGCTTGAAACTAAAGCTACCAAATTCTGAACTCCAAATCTCAGATCTGGCTCCCAGTTACTGAATTGATTTTGCGATTTCTGAGACTATGCTTGATAAAGAAAAGTGAGCTTGTGACATGGACAATGCCACTCATCCTGATACTAATTGCAGACATTTGAAGGGAAATTACTCAGATTCTTTTACTGTCAAGAATGTTCTGCTGCTGTCCAAGAATTTGTAGCCAGAATGTGAGTTTTGCTGTTGTGGATAACCACAGAATCTGCTGAGAAATGGTCTTTATACAGAGTGACCCAATCAAATTCCATGTCATGACCATAGAGTTGAACATGCAAAAGTGCAAAGGAATCTGAATAATTATGTAGGCCAGGAAGTGGGATCATTTGGTGGCAGATTTTCAAAATCTCACCAAGAACAAGTTACATTGTTTGTTATGGTTAGATCTCTCAGCAACACCATTTCATTCTGAGTATGCCCTTTTGTTTACTTAAGAGAAAATTTTGCAGTTCATTTATCTTGAGAGACCATACTTTCCCAGTTGTAATCTTGTTGATTTGGTGAAATGTTAGTTTTCAGTTATGCTACTTACAATGAAAGCAACTCATTATTGTTCCCTC