Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31777 LG9 3830124 3843297 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 37
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   cell fate determination, cell fate determination
Cellular Component   located in   nucleus, nucleus, nucleus
Molecular Function   enables   RNA binding, protein binding, protein binding, protein binding, RNA binding, mRNA binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 3830305 missense_variant p.Ala37Ser
G/A 3830604 intron_variant
G/C 3830605 intron_variant
T/C 3830606 intron_variant
G/T 3831197 intron_variant
G/T 3831198 intron_variant
G/A 3831311 intron_variant
G/T 3831316 intron_variant
T/G 3831320 intron_variant
A/T 3831627 missense_variant p.Gln99Leu
T/A 3831888 intron_variant
G/A 3832168 intron_variant
T/G 3832810 intron_variant
G/T 3833174 intron_variant
G/T 3833212 intron_variant
C/T 3833345 intron_variant
G/T 3833395 intron_variant
G/T 3833606 intron_variant
C/G 3833629 intron_variant
T/A 3833674 intron_variant
G/A 3833766 intron_variant
G/T 3833882 intron_variant
A/G 3834050 intron_variant
G/A 3834051 intron_variant
T/C 3834052 intron_variant
A/T 3834251 intron_variant
T/A 3834697 intron_variant
G/A 3834864 intron_variant
C/A 3834986 intron_variant
G/T 3835031 intron_variant
G/A 3835041 intron_variant
C/T,* 3835378 intron_variant
A/T 3835385 intron_variant
A/T 3835878 intron_variant
A/T 3836174 intron_variant
T/A 3836417 intron_variant
G/T 3836474 intron_variant
A/T 3836594 intron_variant
T/A 3836920 intron_variant
A/T 3837641 intron_variant
T/C 3837757 intron_variant
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C/T 3838010 intron_variant
T/A 3838088 intron_variant
A/T 3838093 intron_variant
G/A 3838334 intron_variant
G/A 3838717 intron_variant
G/A 3839229 intron_variant
G/A 3839337 intron_variant
C/A 3839550 intron_variant
A/G 3839559 intron_variant
A/T 3839560 intron_variant
G/T 3840299 intron_variant
A/T 3840683 synonymous_variant p.Pro363Pro
T/A 3841020 intron_variant
C/T 3841098 intron_variant
G/T 3841639 intron_variant
A/T 3841725 intron_variant
T/A 3841749 intron_variant
T/G 3841751 intron_variant
G/A 3841764 intron_variant
G/T 3842400 missense_variant p.Cys397Phe
T/A 3842401 stop_gained p.Cys397*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31777.1
MENHIYSSYSPSTNYRFRDSDSSTMFLSHHHRAADSAALRFSSSLADDIAPPGVTSRIASSAAANYLSPWASSAATSSLDFKRSSDALYHPTILGTIGQSEAWYSTNSLAKRPRYESASNMTIYPQRPGEKDCAHYMLTRTCKFGDSCKFDHPVWVPEGGIPDWKEVPNVVTSETPPERPGEPDCPYFLKTQRCKFGSKCKFNHPKVSSENDDVSSGLPERPSEPPCSFYMKTGKCKFGASCKFHHPKDIQIQSSDELSHTQTEINSMIGGSLGDTQPIKSLISPSLQNSKGLPVRLGEVDCPFYMKTGSCKYGATCRYNHPDRNAINPPIAGLGASILPSSAASLNIGLLSPAVSVYQAFDPRLSNPMSQVGIAESIYPQRPGQIECDFYMKTGDCKFGERCKYHHPIDRSAPSLSKQASVKLTPAGLPRREGAVICPYYLKTGTCKFGATCKFDHPPPGEVVEMAKSQGTSADGGEAED*


CDS Sequence:
>Vu_31777.1
ATGGAAAACCACATCTACTCCTCCTACAGCCCGTCCACCAACTACCGATTTCGCGACTCCGACTCCTCAACCATGTTCCTCTCCCACCACCACCGTGCCGCCGACTCCGCCGCCCTCCGCTTCTCCTCCTCCCTCGCCGACGACATTGCCCCGCCAGGTGTTACCTCCCGCATCGCCTCTTCCGCCGCCGCCAACTACCTCTCCCCCTGGGCCTCCTCCGCCGCCACCTCCTCCCTCGACTTCAAACGCTCCTCTGACGCTCTCTACCATCCAACCATTTTGGGTACTATTGGGCAAAGTGAAGCTTGGTATTCTACAAACTCACTGGCCAAGCGCCCTAGATATGAAAGTGCTTCCAATATGACTATATATCCACAGAGGCCAGGAGAAAAAGATTGTGCCCACTATATGCTCACAAGAACCTGTAAGTTTGGAGATAGCTGCAAGTTTGACCATCCTGTTTGGGTTCCTGAGGGTGGAATCCCGGATTGGAAAGAGGTTCCAAATGTTGTTACAAGTGAAACTCCTCCTGAGAGACCAGGGGAACCAGATTGTCCATACTTTCTGAAAACTCAGAGATGCAAGTTTGGTTCAAAGTGCAAATTTAATCATCCTAAAGTTTCCTCTGAAAATGATGATGTATCTTCTGGCTTACCTGAGAGGCCATCAGAGCCCCCTTGCTCGTTCTACATGAAAACTGGAAAATGTAAATTTGGTGCTTCTTGTAAATTCCATCACCCCAAGGATATCCAGATTCAGTCGTCTGATGAGTTGAGTCATACTCAGACAGAAATAAATTCTATGATAGGAGGTTCACTTGGAGATACACAACCAATTAAGTCTCTAATATCTCCATCATTGCAAAATAGCAAAGGACTTCCAGTTAGACTGGGGGAAGTGGATTGTCCATTCTACATGAAAACTGGCAGTTGCAAGTACGGTGCCACTTGCCGCTACAATCATCCGGACAGGAATGCAATTAATCCACCCATTGCTGGATTAGGCGCTTCTATTTTGCCATCCTCAGCTGCTAGTCTGAATATTGGACTTCTTAGTCCAGCTGTGTCTGTTTATCAAGCTTTTGACCCAAGGCTGTCAAATCCAATGTCTCAGGTGGGAATTGCAGAATCCATCTATCCTCAACGACCTGGCCAGATCGAATGTGATTTTTACATGAAAACTGGCGACTGTAAATTCGGTGAAAGATGCAAGTATCATCACCCAATTGATCGCTCAGCACCATCACTGTCAAAGCAGGCTTCTGTCAAGCTCACTCCTGCAGGACTACCAAGAAGAGAGGGTGCGGTTATTTGTCCATATTATTTGAAAACTGGAACATGCAAGTTTGGTGCGACCTGCAAGTTTGACCACCCACCACCTGGAGAAGTTGTGGAGATGGCAAAATCTCAAGGAACATCAGCCGATGGAGGGGAAGCAGAAGACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_31777::LG9:3828124-3830124(+)
GACTACTGGTTATTGTACTTCTTTTGTTGGAACTTGGTAACTTAGAAGAGTAAAAAGCAAAGTGTGGTAGCTAGATCCAGTGCTAAAGTAGAATGTCAAGCAATAACATAAGGGAATGTGAGCTATTGTGACTAAAAATTATATTGGAAGACTTGAAGATAAAATGAGATGGACCTATAAAGTTATATTGCAATTACAAATCTACAATTAGCTTAGTCCATAATATAATACAATATAATAGAACCATAATATTGAAGTAAACAAACATGTTATTAAGGAAAAGCTTGACAACGACATAATTTGCCTACCATATATTTCTTCTCAAAGACAACTTAGAGTATACTTACCTAAGGGCTAAATAACATTAAGGGCTAAATAACAATAATTTTGAGAAATGAAAAACATGTATTTAGCAGGAAAAGTGTTGAGATATTTAAAATATTTTTTAACATTATTCTTATTTGTTATAATTATGCATTTATTACACTTTATTCTTTAGATTTTATTTTATTTCCAAAGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATATATATATAAAACTTAGAATGATTTGTATTCTTGAGAATCTTTATCCATTATTTGGCCAAAGGTTAATTTGTGATATACAAATAACACATATTATGGATTATTACTTTTCATTTTTTTTTTCAAATCAAAACTTTGTCTATATCTTCGTTTGTACGTAACAATGTTATTATTAACAAACTTTACATTTATTTTGACTTAATGACAAAACTAACATACCATTCTTTATTTCTTATCATAATTATTCATTTCCAAATACTAATCATCAGTACAATTTGATGTTGTCACCATAATATGAACAAGATCAGAAGAAAAAAAATTATAAATATCAATTTATGACATTTGAACTTCATTCTCCTGATTTTCCAAATGTAGCATTCATCTAAAAAAACAACTTATTTTTTACATGCATAATACTACATGTTTTACTTATCAAATTTTTGTCCTTGGTTTCATTTTGACAATTCTTCCACAGCTTCCATTTATACATTGAAGCTTGCTAAATTCCAAAACCAAAAAAATTTACAAAATAGAAAAAAAAACCACGGATTAGGATTTCTCACACAACGCAACCCTCGCAAGCTAGTAATCATTACACATAGTTCCACTATCAACGTAACTCTCTATATACTTAGGTTAAAAGCACCTACATGAACAAACAAGAAAATTAAGGGAGAACAAGATGATTAATTATGATCATTATTGTTTTTAGATATCTTAAATAGCCCACTATCTACATCACTTTTTATTTTTTCTAACAAACAAAATATTTATTCTTCAAAAATGTCTATAATTTTTTATTAGAAAATATGTAAATGATAATTGTAATTAGATAATGAAGGGTGGTAATATGTGGTATTGAAAAATATGAATGACTTAAGAAATTAAAATAAAACTATAAAAAAATAATAACCATAATTACAAAAGAGAAAGGAGGACATGTAAGATATATCCTAATAAAAATTCTCCAGCTCTCAAATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGATTATTTAACAGTTGTAGTAAACTACATTTTTGGTATAATCTACTTCATATATCAAAGGAGATAATCAAGGATTAATATATGTCCATTTTGAGTGAAGAACGATCATTTTAACAAGCATCAATCTAAGAACCACTAAACTAATATTTATATACCTTGCATAGAACTTCTTGACACTGGATCAAGAGGTTGTAACTGAAGAAAAAAAAAAAGGTAAAAAGACAAAAAAAGCTAAAAAGAGAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGTGTGTGAGCACTCACCAGGCTTGTAAAATCCCACTAAACACACTAATGCCAACCCATTCTGCAAAGTGCAATCTCACTCATTCACTCACTTACTAGTATCAAATTCTCAAGCCAAAGCAACCA


Gene Sequence:
>Vu_31777(+)
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