Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_31679	LG9	933253	939977	protein REVEILLE 6	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
T/A	933277	missense_variant	p.Leu278Phe
T/A	935705	intron_variant
A/G	936137	intron_variant
G/T	936203	intron_variant
A/T	936207	intron_variant
A/G	936227	intron_variant
T/A	936423	intron_variant
A/T	937177	intron_variant
A/T	937391	intron_variant
A/G	938301	intron_variant
A/C	938302	intron_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31679.1

MVSKNPNPPEGFYLDPTVMALPGMPPFASVSAAAAAAVSASNSSEDAAKKIRKPYTITKSRENWTEPEHDKFLEALQLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKSGASEHLPPPRPKRKAAHPYPQKASRNAPVLPQVSGSFQSSSSLLEPGYILKNDSPAMLKIPMNTVVSSWSNNTLQTVNLSPVTKVNNPCSSGESTPKVRPAVESHGQGPHQGNKIHPLRVLPDFTQVYGFIGSVFDPNATEHLQKLKKMDRIDVETVLLLMRNLSINLTSPDFEDH

CDS Sequence:
>Vu_31679.1

Promoter Sequence:
>Vu_31679::LG9:939977-941977(-)

TTACTCATATACATCTTAAACATTGTTTTGGATGTGGGATCAAGAATCCTAATTAACACTTCACACTTTCCTTCCAATCCTTTGACAGTGTCTTAAGTCTTCGTTACAAAGTTATCCTTAATTCTTCGTCTTCAAACTCCAAGTCGAGTGAGTGAATACCTGTCAAAGACACTCTAACGCTCAAGTCAGTTATATGTGTTTGATAGATTATCACAACAAAGTCTTAACTTCATAATAAATGAAATCACTTACTTTTTTAAATTACTTCCATATTTATGGGTTTCGAAGTGGATTTTTCATTAAAGTTGGTTTAATCACGGTTCAAAAGTCAATAAATATGTTTTGCTCATAATTATGTTGAATTTGTAATGTTGATGCGTAAGTCGTCCAGTTTACACAAACTTAGGCTCAATTAATGAAAGACCATGTGGTATAAACACTATAAATTAATAATAATAAATGTATCCGGTTTTCTGTAGATTTATTTTCTTAATTCCTATTTTAGATATTTTAAAAGGGTAAAATTGAGTAAGAGGATTATTTTCCCGGTAATATATTCCGTAAGAATATTTTTTTTATTTGCTACATTTACCAGGATTAGTTAATTTAAATTGTATTTTTAAATTGGTATTATTTTCTGTAAATAACTTTTGAAGAGTTTCTTTTTACTATACTAATAGGTGTCTCTTACGCAATTTATATCTGCGTCGGAATTGATTAGAGTTATGAAAGTTATGGAATATTCTTAATTAATTTTACTTGTAATTCTTGTTGCAAGGTTTTAATCCTATTAATTAGAGCCGTGTCTGGTTGAAATTAAGTCTTCTTGGTTATCCTAATTTTGTTTATTATTATATGAATCTTGAATTATTTATGACTTCATATTCTTTTAATCTTTTCAATTTTAGTTTAATTTCTTTTTTCTTTTTTTTTAAAATCTTTTATGGCCATTCTTTCCGAGATCTTGTAAATTGTTATAATATTTTTGAGATGAAGAAAAACTCTATATTTATTGAACTCTTGATACCGAACTTTTTCTTAATGTAACGAAAGAAACTTCCAGAGCTCTTGAATAATATTTAATTATAGTATCTCATTACATTTTTTATTCTAATAAACATTTTAATCCACTTATTATTTCGATGTACTATTACATTTTTAAGACCAAAACATTTTACCTTTTCAAGATTTGTTATTAAAATAGTAGTTTCATTGTCAAGAAACATTATAATTTTGGAGCTAAAGTTTTCACTACATTATACTATATTGTGTAAATTACAATCATAGGTATGGATCTAGAATTTAATTCTTCACTAATAGTTTTAATATCTAATATACTTTTTATATATATTGGATATTATAATTTTCATAAAAATATAAAGGTCTATTATTTTTTTAATATATGGCAAAAAATGTTTGCCTTTTATTGCTATTTGGATTGGCCTATGGTTCTTATATTCTTCAATATTATGATCGAACTCATATTTTAAATATTTTATGTGAAGTTAGGTAATCTATAGATGAAATTTGCCCAACTATCTATTATCATGTTAAGTTCCCATCTAGAACAAAGTAGAAGCAATAATAGCACACACAAAAAATTAAAAAAAAAACATTTTGAGAGCATTTATAACAAGTATTATGAATTAATAAAATAAATTTTTGTTCTCTCTTAGGAGAAATAGAAAATATAACTATTAATTAATTGAGTAGAGAGTGATTAAGTGAAGAGAGAACACATTTGATTTTCTGTTAAATTCCTTTTAACAAAATTTAGGCATCTAAAAGTTTGAAAATATAACTTTAGAAAAATAATACAAATTATTAACTATTTTAACATTTATACCTAAATAAATAGTTTTTTTTAATATTTCTCTGTGTAGAAATAGCGCCAGTCGTACACCATACCTAACAATTGTTCTTACAGAAATTTGCCATACGTTTCGCCACAAATTCAACGTTAAATCTCTCTCTCCTCTTTCTCTCTCTAGAATCTTTGA

Gene Sequence:

>Vu_31679(-)

ATGGTATCCAAAAACCCGAACCCGCCGGAGGGATTCTACTTGGATCCGACTGTCATGGCTCTCCCAGGGATGCCTCCCTTCGCCTCCGTCTCTGCTGCTGCTGCTGCCGCCGTCTCCGCCTCCAACTCCTCGGAAGATGCAGCCAAGAAGATCCGTAAGCCCTACACAATCACCAAGTCGCGGGAGAACTGGACCGAACCAGAACACGACAAGTTCCTCGAAGCCCTTCAACTGTAATAAAGTTCGCTCCTTTTATTGTTGTTCAATTCTGGTTTTGCTTCTGAGAATTATTCAGTGATTGAGGTTTAAAGCTCGGTTGAGGTATTGAGTAGTTGAATTTTAGTGCTCGGGGATGGTTTTCTGAGTTGCATGTGCTGAGTTGTGTGTGAGGGTGTGGGAATTAGGGTTTTGGGGTGGGTTTGGCGGAGGAAGAATTGGGGTTTGTGTTTTATGACGGTGAGTGTGTTAAAATGGATAGGGTAAAGCTTGGTTTTTTATGCTGCTTTAACATTGTCAAAGCAGTGCTGAATTAAGGGCGTATTTGGTGTGATAAAATGTTTTATGTTTTTAATTTATCTTTTCCCTAAAGAAATGGGTATTGTTTTTTCTTTCATTTTTAAATTTTTTAATGTAGAAATATTTAAAAATAAGAAAAAATGGTTGGAAAACAAAGTAGGATTTATTTAATTGTGAATGAAAATAGGAGAAAAATTAAAAACACAGGGAAAACAGGTAGAACACGTTATCTCAAACCAAACTGGTCCACGGGTGTGGTATTGCTAATATTAGCATGGATTCTCGTTAGAACTTAGAAATGGTGAATAATGTGATGGGATGCTTTAAAAGAGAGTATTGGAAACCGAAGCTAGTTTCTTTCAAAATGTTTTGTTACATGCTGGCATTGACATAGTTACTTATTCTTTATGGTGTCTAATTATCATTGCTGGTTGAAACCCTGTCTGGCACGCAAACCATGGTGAAGGAGTTTAATTTGAGATATCAATTGGATAAGTGGTAGATTCGGGATCTTAAGCAAAGTTTGAATGTCCATACCAAGGACAGAGAGTGGGGATTGGGGACATCTGGACAATACTCAATATTTTAGTTGATACTAAAGCAAAACAATAAAAGTTCTATTCAACGTACCTTGTAATCCTCCGATTGCTTCTATTACTATTGTTGGCTGGGGTTTAACCAGTTGAAGATGGCTGTCGTCTTCCCTTCTGACCAGTGCTTGCTTGGCTCCAAATATGGACTAGCCGGAATAATTGGAATTAGTTGTTTGAACCTTTTACTATTTCCGTTCTGATCTTTCCACTTGTAATTATAACGAAAGCTGATTTTTCCTTACAATGATAAATAAGCTAGGAAGAATAGGTGCATTTGAGCCCAAAGACATTGGCAATCACAACGTTAACAAAATAGATCAGACAAAAGAAAAGGATTACTGCACTAAGTAATCTTAAGAACATTTTAATATATTTAAGATTTCTTTTTCCTGCACATAATGCCTATATTTTGACATGATGTTTCTTCTTGGGATTGTATTAATGTGTGTTATTAGTTCATGATAGGACACAGAATTACCTGAAGCTGCATTAATGTAGATTCCTTAGTTTAATTTATATGATCATATTAGGAAGATTATTACCTCTTTTGGTTGAGGAAAATATTATTAAGTACAAATAAGAGATATATATAAGTGAAAGATAAGAACTCTACCTTAAAAGGAAAAAAAAAAGGATCTAATGGGCCAAAGTGACTAAAAAGGCGTAGTTATGTGAGTTTTTTGTCTTTCAGTAATAGAACTTCCATTGAAACATATATTAGGGCACCAGAGAGAAACCATATACACTGCTATCCAATAAAATATTATTGAAAATAAAAATACTGTTCAAATTATCTTTCCCTTTATTTTAAATTTTGGAAAAACTTGATAATGTTGTAAATCATTGGATTATTGTGGTGGACAGCTTCATTGAGAGGTCATACTTAATACCATTCCCTAGTGTTGCAATTTAAAGCTAGTATTTGTTTCTGCCCTCACATTGCTTTGCTCCTTCATTTGTTTACAGGTTTGACCGTGACTGGAAAAAGATTGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACTGTTATACAGGTAATTCTAATGAGCAAAAATCCCTTTTTTGCTAGAAGTGCATAATTTTCTTTAACATTTCTGGAGTTAAGTATAGATATTTCATTTTAGCTTGTACAGTTAAAGTATGCCATCTCTCATTTTCTTGTTAAATTTTCTGTTCTCAATTTTTTGGGATGAGATTCAATAGATCCTAGGCTAGAAAAGGCTTATGCACAGTTAAAAATTTGGGCCAGGGTATCATGTTAAGTGTGAACATTACGTAAAAATAATTTGAAATCCTTGGTGTTGGAATGTCGTTAATTGATTATGTAGTTTTCAAATTTTCCCGAAGGAACTATATCTTGTTGGAAATTAAATGTCAAAAGATAGGTGATAGGACTCCTAATAAGGATCATGGGAAGTGCACATGGGCTTGTTACTCAGCAAGGAAAAATTATAGAAGGAATAGATAGGCCCAAAATATGGAATGTGTATGTAAGAAGAAAGAAAATGGGGTTAGGAAAAGAAATAGGGAGAAGTTAGTTAGGATGGGGAATGACGTGTCAAGAATCCAAGGATGGGGGGAATTCTGTTGTAAGAGAGAGTAGGGAGAGTGTGGGGGTACGGGAGTAGGAGGTTGTGAGTTGGTTAGGTTGGTTAGGAGGAGAATAATCCTCTGGAGGAGTCTAGGACTCTGGGGTTTTCCTTGTGGCTGTAGAGCTTTCAGCTCAATCATCTTTTTACTGCATAATACTCTAAATAATACAACTTTGATATTCAGTAATTGTTTGGTTTCTATCAATAGGTCTTATTCCCACCCACCCCAAAGAAATGCTCTTTATTCAACCATATTCTCCTTGATTCACCATGTATTTCTCACTGTCATATTGTGCTCGCTGCTATAGTAAGGTTGGTTTGTTGACTTGCAGTCCATTTAAGGAAGGTTATATGAGTCAAAAAAATGTTAAACCTAATACCCATTTTACTCCTGTTTTTGAGGCAAGATACTTTAATTTAAAATTTGAGGTATAACGTGAATTTCCTGTTCTTTCTTTCTATTCAATGCAAGTTATTGCATTATAGTGTTATTGAGCTTTCTATTACTTCATTGTCAAACAAATTGTTTATTCCATAAACTAGATTAGTAGTATAGGTATTCTAATTGTGGTCACTTTGTGATATATGTTAATATATGCATCGTTTTAACCTTTTGAATTTTAATCCTTTATCATTAAATTATTGTTACAGTTTATACCCATCATTCATATCATAACTTGTTACTCTCTTAAAAAATGTCATGTACCTAAAAGCTTAGGTGTTAGATGCAGATTCAGCATGGTTTTGTAATCTTTAACTTAGCTACACATGTGGGTAGGGAATGGTTTTTCCTCTGAAAGAAATAATGAAAAATTGCTTTTGATGACATGCTGATTCTTTTGACTGAAAGAAAAGCAAGTGTGACAAGGAGCAGTATTTTATGTTAGATATTATTTATGACAGAACATTTAAAGTGTAATTTGATCCATGCCACTGACCACGCTTAGTGGGAAAATGCTTTTTTGTTGTTTTGGTTGAGACAGAAGTATGGAGCTGAGCTGGCTTGAAAATCTGAATATAAATGAATGTTTGAGTTGTTAGGGCTTGTGTTATTTTTTTTTTTCGACTTTAGATTTCAATTTCCATTCCTTAAGGTAGTTTCTGGATAGAGAATCTTAAAGTTCTAAAGAATTTGAATTGCATGGGAATTTACTTACTTTAATTACATTCCTTTCATTTTCGTAATTCTTTATTTTGGATAAACAATTCAAATTCATATTATATTTTCAATTCTTTGTGCAGATAAAATTATTTAATATCCATCATATGTGAAATTAAATGAGTAATTATATAATTTTTTCATAGGTAATCTTTAACTACAAAGTCAAATATTAAGCAGTTTGTGATCTGATTTTAATGTAATTTTGTAACTAAAAATGTATTGTTTAGCAAGGAGGGGGAAAAGTAAATATTGTTAACATTTTAATAAATAAAGTGTAATTTTGTTTCATATAAACTAAAAAGTATATATATTTGCTAATGGATAGAAAGAGGTGCGGAAGAGAGGGCAGAGTGAGGGCGAGAAGAGAAGTGATAAAATGATTGGGGGAGGTGTGAAAGAGAGATGCTTAGAAAAGGGATAGAAAGGGAGGAGCAGCGTGGATAGCACATACGAAAGAAAGGTCAGAGATGAGAGTTTGCAGTGACACTGATAGAGAAGAGAGGAACTACAAAATGCTTTTATTTTAGATGTTATTCGTGTGAAAACTCTAGGGAAAGAGAAACATTAAGCTGAAACCTTGTGTTTCTAAGACATCGTAGGTGCTTTATTTATATTGAGAAAAGAGTAATTCAATACAATAAATAGAGGAGCTTTGATATCCTCTAATAACAAATATATGATGTGTAAATAAATAAAAATATTCCTAATAATACATATATAATCTATATTCCTGATTATATAAGACCAACTCCTTATTTCTATAATTTCTATAATTATAACAATTTGAAATCCCTTCATTTTACTTGAAAATAAAACCTCTTTAAAATTCCCAGCATTATGAATTTTATTTGCATTTGATATCCAAGTAACTCATTTTGATATGCTATATGGTTTTAAATCCATTTAAAACTTGAATGCCTCTTTCAATTCCTCATCCAAATTCACTATAATTTAGCTTAAGGACTAATTATAATTTCTACTGGGTTTGTAGATACGTAGTCATGCACAGAAATACTTTCTCAAAGTTCAGAAGAGTGGAGCAAGTGAACATCTTCCGCCACCCAGACCTAAAAGAAAAGCAGCACATCCATATCCCCAAAAAGCTTCCAGAAATGGTAATAATCTTTTGCCATGTTTTTTGTAGACA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