Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_31622	LG8	49005474	49006313	PREDICTED: trihelix transcription factor ASR3-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
G/A	49005528	synonymous_variant	p.Phe262Phe
T/C	49005536	missense_variant	p.Arg260Gly

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31622.1

MALEQELSLGQNTNSNRNPNPVDCVDVRGEGGDEGGKAPRLPRWTRQEILVLIQGKRDAENKFRRGRTAGLPLGSGQVEPKWASVSSYCRKHGVNRGPVQCRKRWSNLAGDYKKIKEWESQIREESDSFWVMRNDLRRDRKLPGFFDKEVYDILDSGSQGPALALALSSPPSMTVTVCKDMRMDMDTKRGYAPAPSSASAPAPAPAPVPAPVPAPAEPEEPHLYDSNRSVPVEDGLFSDFEQDEASASPEKKDIFPPSNRDFPAPIPISGLNFIPFHVF*

CDS Sequence:
>Vu_31622.1

ATGGCTTTAGAGCAGGAATTGTCCCTGGGTCAGAATACGAATTCGAATAGGAATCCGAACCCAGTTGATTGCGTGGATGTTCGGGGTGAGGGTGGAGACGAGGGAGGGAAAGCGCCGAGACTGCCTCGGTGGACGAGGCAAGAAATTCTGGTTCTGATACAGGGAAAGAGAGACGCTGAAAACAAGTTCAGGAGGGGCCGAACGGCCGGATTGCCATTAGGGTCGGGTCAGGTGGAGCCCAAATGGGCATCGGTCTCTTCCTACTGCAGAAAGCATGGAGTCAACAGAGGTCCGGTTCAGTGCCGGAAAAGGTGGAGCAATTTGGCCGGAGACTACAAGAAGATCAAAGAATGGGAATCTCAGATAAGAGAGGAGTCGGATTCCTTTTGGGTCATGAGAAACGATTTAAGGAGAGACCGGAAATTGCCCGGATTTTTTGACAAGGAAGTTTATGATATTCTCGATTCAGGCTCCCAAGGTCCGGCGTTGGCTCTCGCTCTTTCATCGCCTCCTTCAATGACAGTAACGGTGTGCAAGGACATGCGCATGGACATGGACACCAAAAGAGGGTATGCACCTGCCCCTTCCTCAGCCTCAGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGTCCCTGCCCCTGTCCCTGCCCCTGCTGAGCCTGAGGAGCCTCACCTCTACGATAGTAATCGGAGCGTGCCTGTTGAGGATGGTTTGTTTTCAGATTTCGAACAAGATGAAGCCTCTGCCAGTCCCGAGAAGAAGGACATTTTTCCGCCCTCCAACAGGGACTTCCCTGCTCCCATTCCTATATCAGGTTTAAATTTTATTCCATTCCATGTTTTCTAA

Promoter Sequence:
>Vu_31622::LG8:49006313-49008313(-)

TATTTTAATAATTTAAAATTATTCTATAATCAATAATAATAATAATCATAAACATCAACAGAAATCAATTACATAAATCAATAACAGAATTATAGATGTTAAAACGTTGCCAACAAAATATTATCATAAAATATTGTACAATAAATTAATGAAAGAAGGAGACAACTTTATTTTGTTTTTTTAAATTTGTAAAAACACGTATTCTAAGTGGAAAGAGATGCCATGCATGTATGATTACTTTTTTCCTTAACTTATTGTCCAAAAAATTCATTACTGTAGTGATCTTTAAATAAAAATTACAAAAATAACTATCGAATCTTCTGTCTAAGTGTATTTTTGTTACAAGGAATAATAACCAAAATAAAGGTTATAAATACAATAAATAAATATAATAATATCAATCTTCTCTACTATAATATCAATTAAATATATTAGTAGAATCTAAATTTATTATTGGACAAACTTAGGCCTAATTTTGGCTTGATCATGCATGTCAGTTTTAATACACTACTTAGGTATGTTAACTCTATTCAAAGTGTGGTTTCATCTTATGTTATTATGGTCAGATATCTTGGCCCATATTCTTTGTCAAGTTAAGATTAAAATAGATAAATTAAAGTCATATCTTGAAAGATACACACCTCTCCAACCTTAAGTCTTCAGCTTTTGAGACGAAAAAGTTGGTATAACCTGTTTATTATTTTCTAATATCCGGTTAGACCTCAGATAATGAAGAGCATACAAGTAGTTAAATGAGTTTTAAAAAATACTTAAAAAGTAAAAATTTAAAAAAATATACACCAAAACATATAATCTTTTTATAATTATTATGAATAATTAAAAATGTTAAGCTATTGTTTATTTTGAACTTCGAAGTTCCATACAATTTTTGTGTGGATTGAAAGATGAAAAATATTTAAATTATTTTTAGTTGTCGTTCTTACACAATGTGAGATTATCAAATATATTAAAACGGGTCTCTAATTAAGGTTTAAGTGATTAAATATTCATTTTTCATTTCCCATAACAAACTAAACCTTCTAGTTGAAGTCTCCCATGGACAAATGTTCATATTTATAATATTTTTTCACTCCCTTAGTTGAAGGTTAAAAGAACTAGGCTTTCAATTCTATTTACAATAATTTCAATAAGGAGAATAGCAAAAGTGACTTTAAAGATGAATTATTGTTCCTATTTGATCTTTGGTTTGATATTATTCCATTAAGATCAACCACTTCATATGAAATAACACATTTCTCCTCTTGAATTCTCATTAATAAAAAAACTATTTTAAACATACAAGTTTGTTAGATAAATGTGTGTAATCTTTACATTTCTTTTAAAATCATATTCTTTCTTATAATTTTCTCAATCTACATATAGGTCAAAAACACTTAAAAAAAATTCTAAGCATATTATTGACATTCATGATAGTGATGCAATTAATTAAGGTTGAGTAAATTTAATTGAACATTACGTGCGCTTTAGACGTCGTTAGAAAAGGAAATCAAATTAAATCATTTAAAAAAAAGACGTTTAAAATATCTAAAAAATAAAAGGACAATTTTAAATAAAACAACTAATAAAGGAACCAAAATAAATATTAAACTAAAAGTAGCATGAAGAGGAAAAATAAAAGAATAGAAAAGAAAAAAAAGGAGTGATTAAATTTAATATATAGGAGGCAATTGCTATAAATAATAATATAGACCCTTTTAAAATGGTTAGGGTCAATAAGCTTTTATTTGGTAGTCAAGGGTCAATAAGCTGTTTGTTTAGTGTAGTATACAGGCACATATAAATATTGAAAAAATAACAAACAAATACTGCTGCAGTCTGAAAAGCCGCAAAACCAACACGCCTATTTCCTCCATTTCTGTGCCTTGGTGCTTAGTTACGGAGAGATGAGGTGACCTACTCTCCTAACGGCGTAACGGACATCCGAAAAGGAGACACGTGCCGAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGGGTCGGGCCAGTTG

Gene Sequence:

>Vu_31622(-)