Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31617 LG8 48968090 48972167 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase PBS1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 48970400 upstream_gene_variant
C/T 48971286 stop_gained p.Arg216*
C/T 48971289 stop_gained p.Gln217*
T/A 48971331 stop_lost p.Ter231Lysext*?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31617.1
MGCFSCFDSREDEKLNPNPHQENHHHLHHHHDHDLNPPIPSRISRLPSASAGADKLRSSSNGNGNNGDSKRELAALKDGPAVQIAAQTFTFRELAAATKNFRPQSFLGEGGFGRVYKGRLETTGQAVAVKQLDRNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLIGYCADGDQRLLVYEFMPLGSLEDHLHDLPPEKEPLDWNTRMKIAAGAAKGLEYLHDKANPPVIYRDFKSSNILLDEDYHPKLSDFGLAKLGPVGDKSHVSTRVMGTYGYCAPEYAMTGQLTVKSDVYSFGVVFLELITGRKAIDSTRPHGEQNLVTWARPLFNDRRKFPKLADPELHGRYPMRGLYQALAVASMCIQEQAAARPLIGDVVTALSFLANQAYDHKGGGDDKRNRDDQGGRILKNDQGGGSGRRWDLEGCEKDESPRETARMLNNRDLDRERAVAEAKMWGENWREKRRQSAQGSFDGSNA*


CDS Sequence:
>Vu_31617.1
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Promoter Sequence:
>Vu_31617::LG8:48966090-48968090(+)
CTCCTTAGCTCCCGACTCCAGATAGGAACCTCCGATAACGTCTTCCCTCAGGGTCTCGTACATATCTAGAAATTTGAAAAGTTTCTCTGTGGTCCATTTTGTTAGAACAGCACACTGTGCAAAGTTGAGCAAATGGACGATGACTTGTCGTGCAAGATCGCAGAACAAGTTTTGAGAAATGGAGGGATGATCGGGGAAGATGGATTTATAAAGTTTTCTTTCAGACTTGAAAAGCACGGTGGTGCAGTGCCAAACCACTTGATTCCACGTTGCAATTTCAGCTTCAAGGGATTCCCATGACATTTTACACAAATCTTCCATCCTGGTGTTCCCGAATCCAAATGTTTGGAGCGTGGTTCTGAAAGCAGTTCGCCTGAAACTAGCAAAAACCAAGTAGCACTCGATGTGGTAGCCGGCTGAGATCATGGCAGTGGCGATCTTGTTCAAAGTAGAAATCTTTTGCGGAGAGAAATCAAAGGGGTCTTGGGTGTGGTGATCCTGCTGTGGTGGTCTAGGGGAGGGAGACTCGGGAACAGAAGAAAGGTATGAGGGAGAATTAAAGGAGAAGGATTTGTTGGGTGGTTTAGATTTGGGGTCGTCGTGTAGAAGATGAGAAAGATGTTTCTCTAGTAGGGACATTGCTTTTTCTAGGACGAAGGCGATCAGGTCCAACTCCTCCTGGAAGGCAATCACAGTAGAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAGATGATAAGGAAGCCGAAGCAGCGGAGATGCGATCCACCATGTCTAGGAATTGCAAGAGGGACATGTCCTCGTCTTCTGCCTCCTCATCCTCCCAAACAAAATTGCTCCTCCCGCTGCTGTATCTATCCACCATACGCTCCAACTCTTTGGCCAGCTCAGGGACGCCATCTGCAGGAGAAACATCTTCCACCTCATTCATTCGTGATGACATCTCCATCGCCTCTTCACATTAACGTTCAATTTCAGTGTTTATTGTTATCATATGAATTGCACAGGGGGTTCGGGCGGGAAAACCCCAGATTCCACCTCACGGGATGAACCAAGTAATTCATCTTTCCTCATTATTTTCTTCATTTCACTGCAATCTCCTAATGTAACTTTCTATTCTCTTCTATTCTATATTTTGTTTCCTTTTACTTTTTAGCTATTTTGGTGGAGCTGCCTCGCTAGCTCCGTCTTGACCGCTGATCCAAATGGGAACAAGGCACGGCATTCCGTTTTTTCGGCTTCGCTTCTGTCATATCTATTCTTTTCTCATCTATATCTTTCCCTCGTTTTCCTCTCAACACTTTCACTTCTTTTATTTTAATATACGTATCTTAGTTATTTTATTACCCTACACAATTATCTTCACATATTTCCTCTTTTTTTTTTTTATCCCAAAGTAAATTTTATTATATGCTTCACTTATTTGAATTGGAATTTTTAAATTCCATAAACTTGGAATTTTAATTTCTCGAGTATCGTTGTATCAACCCAGTTCCCCAAATATCAGAGTTATGTAGGTCTTAACTCTCTAATTATCTCACCAGTCAACGTCACTTAATTTGATGGAAGCGTTAAAATAACAGAATCTATTAAAATATGGGAAATTAGGAGCGCATATTTAAAACACCCAAAGACCAAAATAAAATTAAAGGTAGTTTTTCTGAAATGAGAAAATTTAGGATATTTCTGGTTTTAATAAAAGTATTTAATAATACATAGGATCCAACCCAGCCCAATTAAATCGAAAGGAAAGCCCCTGGGTGTTTCTTCTGGCAGTGGCGGAAGTGTGAAAGTGGAACCACTAACTTAACTTGTACGCGCATAACCAAAGGACCCAACTCTCTTCTTTCTTCTTCTTCTCCTTACAACCACTTTGTTACGCAAATTCATTCTTTCTTTCTTCCTTCCAACCGTACAATCTGTTTGGTTTTGTCTAGGATTGAATTGGAAGATGAGGCTTTGACTGATTGGTTGATTGACTGTGTCTGCGCGTCACTGAAGAGGAAACTGGAA


Gene Sequence:
>Vu_31617(+)
ATGGGTTGCTTTTCTTGTTTCGATTCGAGGGAAGACGAGAAGCTGAATCCCAACCCTCACCAGGAAAACCATCATCATCTTCATCATCATCACGATCATGATCTTAATCCCCCTATCCCCTCTCGTATTTCCAGACTGCCCTCTGCCTCTGGTAAGTTCTTTTTCCTCTTCTTCTTTTTTATGCAAAATATTTAATCCCAATACTCTGCTTGATCTGATCTGACGAACCAGATTGAAATCAGATCCCGTATTAGTTTTTGCTACCTTCCCCGTCTCATCCCATCACATCACATCACATCACGCATCATTTTCTCTATATCCTAATTTCTTATTGAATTCTAGTATTCGGCACACACTTCTTTCTTCTTAATATGATTTTGCTTAATTTCCATTGTATAGCCGGAGCAGACAAGCTACGCTCATCTAGCAATGGCAATGGTAACAATGGTGACTCCAAAAGGGAATTGGCTGCTCTCAAGGACGGACCTGCTGTACAAATTGCCGCACAGACTTTCACTTTCCGTGAACTGGCAGCCGCCACCAAAAATTTCAGGCCCCAATCCTTTTTGGGGGAAGGTGGTTTCGGAAGGGTTTACAAGGGCCGCCTTGAAACCACTGGTCAGGTAATCTTTCTTTCTGCTCTGTTAATCCTCTGTCCACCTTGTTATATTCACTACTTAGGTCACCTTTCACTTCTCACTAACTCCTCCCTTGTGTTCCTTTACCTCTACAGGCTGTGGCTGTTAAACAGTTAGACAGAAACGGTCTTCAGGGCAACCGGGAATTCCTCGTGGAGGTTCTCATGCTCAGTCTTCTACACCACCCTAATCTTGTCAATCTCATTGGATACTGTGCGGACGGGGACCAACGCCTCTTAGTTTATGAGTTTATGCCATTGGGATCATTGGAAGACCACCTTCATGGTATTCTTCTTTTCTACTCCTCCCATTTCAATCGTTACAATTTTTTTTTTTTAATTTTAGTTCAGTATTTGATGGCTAGTATTCTCTGTTAGAAATATCCGGATCACCAAGCTCAGTGGCTAATGCTTTTCCAAACTGTGAAATTCTCATTAGTATCTGTGCTGTCTTTATGCGATAGTACTAATACTTGGGAGGATAAGATTATATCTATGGTTTAGGATTTCTTACCAAAGACGTACGCACCCATGTTACATGATCTAACACCTGTAATCAAATTATGCTTTACTCTAAATTACCACTGTATATTTTCCAATACAGCAAAGTATAATTTGATGCTTTAAATCGATTATCTGTACTGAAATTAAAACCAGTAGTAGTCAGTGCATTATAGGACATACTTGGCTTTTCTATCTTAGAATCTTGTTTCTCTTTGCAAGGTAACCTTGGATATGTTCTTGTGCATTTGTCCTCTATAGTATGTGTTTAATTTTCTTTCATACGTATTTATAAAGAAAAATTCCCTTTTGGTGATTTGAACTACACACATTTTTTTTGTGTGGAGCTTATTATGGTGATAAAGAATTGTGCGTAGAGATAGAGTTTTGCCCTTTCACAGGAACACAGATGCTGCTATGATCATCATATTATGTGCTCTGGGTTATTATTTCCCATGCTTTACCTCTATAAAGTATAGAGGTTGTAGCTGTTAAAAATTGTTGATTTTCCATTTCACTGTCGTGAAAGTTTATAAATCCCACATTAGAATCTCATACTTTCAATGTGGGACTCAAATCTTAGACCTTGCAATTGGATCTTAACATCGGACCATGCTCTGCAGCCCTGGTAACACTTACTAGGCTAAGGCGAACATTGCAGTATCGATATCACTACCCATACCAATTTGGTGGAACCCACTGAGGTTCTGCCATGTTGTTAGGGTTTTGATAGACCAACAAATCTCCAATATTTCAAATGCCTAAATTGTTATTATTGTTCAGTTATGGTTCCTCTCTTTTTGTTGAAGAGGCAACCTAGAACAGGGAGCTAAATCTTGTCCAAATAAGGAAATAAGATAAGTCAATAATCCTATCTAGAATAAGAAAACACTAAGATATTATTTAAGTAATTCACTCATTCAATAAGATATCATTCTTGTAAAATAAACACTTCACAAACTCAATAGATTTCTGCTTAAGTTGTTTTATCTATTTCTATCGTTTAAATGTTTTACGTAGAGCATTATGTATCATGTATAGGAAATGATATTTTGTTTTTTAAGATGTATGCTTAAGTTGTTTTATCTATTTCTAGTTAAAAAAAATCATAGATCACTATTTATCATCTATATGAAATGATATATATAGGGAAGAATTTTATTTTATTTTTGTCTTGGAATCTTATGATTTGATACAAATTATGATTCATTATTTAAAAATTAGCTTTCAAATTCATGAGTGGAATGTCAATTAGATAACCTTGTTTGAGTGTATTTTCCTTAATTATTTGCTGCTGTATCCGTTGTTTTCTGGTTCTGCCTTCCTTTAAGTACACTGGGTCTAAAAAACCAGTTGACAATTTAGGATTTGGAACCTAAACATTAACTTTACTTCTAGGTTGAAAGAAAATAATATAAAGGAAGGTAACTATTTAATATTCATTATGGTCTCAAATTGCGAGATATCATAGAATAGCAGACTGTGTCTAAATGACTAATGAAACTTTCACACTATAAATTTAACGAGAAGGATGGAGGAAAGCATCTTCTACACATTCAAGGTGCTGCTTTGGCCTCTTCAAGAGAGACATAGATAAAAGAATTAAGTTGTCACACTAGAGTTTATTTTTCACCATGGACCATGGATATGCTATAAAGTGGTTCTGGCTGTTCAAATATGAAGCCTTTTGTAATAAAGCCAAGCCATCCAAGTGTTTGGACTATCTTTCCATGTTATTGCTAGCTATGGAAAAGGAATGTGATACATGTGATGATCTGATAACCATTATATAGTCTGCTAGAAATGTTTCCATTTTGCTTTGTGATAATCTTATATGCCTTCTAATTATTGATTAGCATCTCGGAACTTTGGTTAGAGAGGAGAATGAATGGCTCGTCTTTTACATCACCGCTTTCTTAGACAATGTAATTCTGTTGATTTAAAAAAAATGTTATTTATGGACTTGAGTGCAGATCTTCCCCCGGAGAAGGAACCATTGGATTGGAACACTAGGATGAAAATAGCTGCTGGGGCAGCAAAAGGATTGGAATACCTTCACGACAAGGCAAATCCTCCTGTCATTTATAGAGATTTCAAATCGTCTAATATATTACTTGACGAAGATTATCATCCAAAGCTTTCAGACTTTGGGCTTGCAAAGCTTGGACCAGTTGGTGACAAATCACACGTGTCCACCCGGGTCATGGGAACTTATGGGTATTGTGCCCCAGAATATGCTATGACTGGACAGCTGACTGTGAAGTCTGATGTATATAGTTTTGGGGTAGTCTTCTTGGAGCTGATTACTGGGCGTAAAGCCATTGACAGCACTCGACCCCATGGAGAACAAAACCTTGTCACATGGGTGGGTAGTCGTCCAATCCTTCCTTGTCTTTATTAGTTTGGCTTGCATTACATTAACTTATGCATAGTTAACAGCAGGGTAGTAATGTAATGATGGTTTTATGTATGTTGGATCAGGCACGTCCACTGTTCAATGACCGCAGAAAGTTTCCAAAGTTAGCAGATCCAGAGCTACATGGACGGTATCCCATGCGGGGTCTTTACCAAGCTCTAGCAGTGGCATCAATGTGCATTCAGGAACAGGCCGCAGCGCGTCCTCTCATTGGGGATGTGGTGACAGCCCTTTCTTTTCTAGCGAACCAGGCATATGACCATAAGGGAGGTGGTGATGATAAAAGGAACAGAGATGATCAGGGTGGAAGAATATTGAAAAATGACCAAGGTGGAGGATCTGGAAGGAGATGGGATTTGGAAGGGTGTGAGAAAGATGAGTCCCCACGTGAAACTGCAAGGATGTTAAACAACAGGGATCTTGATAGAGAACGTGCGGTGGCTGAAGCAAAGATGTGGGGAGAGAATTGGAGAGAGAAAAGACGACAAAGTGCGCAGGGCAGTTTTGATGGTTCTAACGCCTAG