Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_31606	LG8	48857804	48862170	PREDICTED: trihelix transcription factor ASR3-like	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
A/T	48858065	missense_variant	p.Tyr277Asn
A/T	48861196	upstream_gene_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31606.1

MALEQELSLGQNTNSNRNPNPVDCVDVRGEGGDEGGKAPRLPRWTRQEILVLIQGKRDAENKFRRGRTAGLPLGSGQVEPKWASVSSYCRKHGVNRGPVQCRKRWSNLAGDYKKIKEWESQIREESDSFWVMRNDLRRDRKLPGFFDKEVYDILDSGSQGPALALALSSPPSMTVTVCKDMRMDMDTKRGYAPAPSSASAPAPAPAPAPAPVPAPAEPEEPHLYDSNRSVPVEDGLFSDFEQDEASASPEKKDIFPPSNRDFPAPIPISGVTNEKQSTPNPEMGSTSQGERKRKRLSTDGGEETLQIHLIDVLERNGKMLSAQLEAQNINFQLDREQRKINGSNLVAVLDKLADALGRIADKL*

CDS Sequence:
>Vu_31606.1

Promoter Sequence:
>Vu_31606::LG8:48862170-48864170(-)

TACTTTTTATAATATTTTAATTTAAAATTATTCTATAATCAATAATAATAATAATCATAAACATCAACAGAAATCAATTACATAAATCAATAACAGAATTATAGATGTTAAAACGTTGCCAAAAAATATTATCATAAAATATTGTACAATAAATTAATGAAAGAAGGAGACAACTTTATTTTTTTTTTAAATTTGTAAAAACACGTATTCTAAGTGGAAAGAGATGCCATGCATGTATGATTACTTTTTTCCTTAACTTATTGTCCAAAAAATTCATTACTGTAGTGATCTTTAAATAAAATTACAAAAATAACTATCGAATCTTCTGTCTAAGTGTATTTTTGTTACAAGGAATAATAACCAAAATAAAGGTTATAAATATAATAAATAAATATAATAATATCAATCGTCTCTACTATAATATCAATTAAATATATTAGTAGAATCTAAATTTATTATTGGCCAAACTTAGGCCTAATTTTGGCTTGATCATGCATGTCAGTTTTAATACACTACTTAGGTATGTTAACTCTGTTCAAAGTGTGGTTTCATCTTATGTTATTATGGTCAGATATCTTGGCCCATATTCTTTGTCAAGTTAAGATTAAAATAGATAAATTAAAGTCATATCTTGAAAGATACACACCTCTCCAACCTTAAAGTCTTCAGCTTTTGAGACGAAAAAGTTGTATAACCTGTTTATTATTTTCTAATATCCGGTTAGACCTCAGATAATGAAGAGCATACAAGTAGTTAAATGAGTTTTAAAAAATACTTAAAAAGTAAAAATTTAAAAAAATATACACCAAAACATATAATCTTTTTATAATTATTATAAATAATTAAAAATGTTAAGCTATTGTTTATTTTGAACTTCGAAGTTCCATACAATTTTTGTGTGGATTGAAAGATGAAAAATATTTAAATTATTTTTAGTTGTCGTTCTTACACAATATGAGATTATCAAATATATTAAAACGGGTCTCTAATTAAGGTTTAAGTGATTAAATATTCATTTTTCATTTCCCATAACAAACTAAACCTTGTAGTTGAAGTCTCCCATGGACAAATGTTCATATTTATAATATTTTTTCACTCCCTTAGTTGAAGGTTAAAAGAACTAGGCTTTCAATTCTATTTACAATAATTTCAATAAGGAGAATAGCGAAAGTGACTTTAAAGATGAATTATTGTTCCTATTTGATATTTGGTTTGATATTATTCCATTAAGATCAACCACTTCATATGAAATAACACATTTCTCCTCTCGAATTCTCATTAATAAAAAAACAATTTAAAACATACAAGTTTGTTAGATAAATGTGTGTAATCTTTACATTTCTTTTAAAATCATATTCTTTCTTATAATTTTCTCAATCTTCATATAGGTCAAAAACACTTAAAAAAATTCTAAGCATATTATTGACATTCATGATAGTGATGCAATTAATTAAGGTTGAGTAAATTTAATTGAACATTACGTGCGCTTTAGACGTCGTTAGAAAAAGAAATCAAATTAAATCATTTAAAAAAAAGACGTTTAAAATATCTAAAAATAAAAGGACAATTTTAAATAAAACAACTAATAAAGGAACCAAATAAATATTAAACTAAAAGTAGCATGAAGAGGAAAAATAAAAGAATAGAAAAGAAAAAAAAGAGTGATTAAATTTAATATATAGGAGGCAATTGCTATAAATAATAATATAGACCCTTTTAAAATGGTTAGGGTCAATAAGCTTTTATTTGGTAGTCAAGGGTCAATAAGCTGTTTGTTTAGTGTATATACAGGCACATATAAATATTGAAAAAATAACAAACAAATACTGCTGCAGTCTGAAAAGCCGCAAAACCAACACGCCTATTTCCTCCATTTCTGTGCCTTGGTGCTTAGTTACGGAGAGATGAGGTGACCTACTCTCCTAACGGCGTAACGGACATCCGAAAAGGAGACACGTGCCGAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGGGTCGGGCCAGTTG

Gene Sequence:

>Vu_31606(-)

ATGGCTTTAGAGCAGGAATTGTCCCTGGGTCAGAATACGAATTCGAATAGGAATCCGAACCCAGTTGATTGCGTGGATGTTCGGGGTGAGGGTGGAGACGAGGGAGGGAAAGCGCCGAGACTGCCTCGGTGGACGAGGCAAGAAATTCTGGTTCTGATACAGGGAAAGAGAGACGCTGAAAACAAGTTCAGGAGGGGCCGAACGGCCGGATTGCCATTAGGGTCGGGTCAGGTGGAGCCCAAATGGGCATCGGTCTCTTCCTACTGCAGAAAGCATGGAGTCAACAGAGGTCCGGTTCAGTGCCGGAAAAGGTGGAGCAATTTGGCCGGAGACTACAAGAAGATCAAAGAATGGGAATCTCAGATAAGAGAGGAGTCGGATTCCTTTTGGGTCATGAGAAACGATTTAAGGAGAGACCGGAAATTGCCCGGATTTTTTGACAAGGAAGTTTATGATATTCTCGATTCAGGCTCCCAAGGTCCGGCGTTGGCTCTCGCTCTTTCATCGCCTCCTTCAATGACAGTAACGGTGTGCAAGGACATGCGCATGGACATGGACACCAAAAGAGGGTATGCACCTGCCCCTTCCTCAGCCTCAGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGTCCCTGCCCCTGCTGAGCCTGAGGAGCCTCACCTCTACGATAGTAATCGGAGCGTGCCTGTTGAGGATGGTTTGTTTTCAGATTTCGAACAAGATGAAGCCTCTGCCAGTCCCGAGAAGAAGGACATTTTTCCGCCCTCCAACAGGGACTTCCCTGCTCCCATTCCTATATCAGGTTTAAATTTTATTCCATTCCATGTTTTCTAATTTCTCGTACGTGATTTTGTTCCTTTTGCCTTTTCTGCACTCCACTCGTACTCTACTACCTTGTTTTTGCCACTTTGTCATCTATCTTCTTTACTTGCTTGCTCGCTTCTTGTCTTTTTCTTCTACCAATGATATTGCTGTGCTACTGTTACACGTCTGTCTCTTTTAAACATGGAAAAACTATAAGCACGTCACATTGTTTGATTGCTGTCTGGACCATTGCCAGCATATTTTCTTCTCCTTTACGTAAAAGCAATATCAACCACTCCTCCGTGGATGCCAAGGGGAAGGTAATGTTCAATATAATACCACACAGCTTTCACAACTGCTTTATCACATTTGTGTTATTGCTTCTGATTTCCTAAAGGCTTAAATATAATTTTGGTTTAGTATAGGAATCATTTTTGTCTCCCTAGTTTTTAATCAGCTTATTTTTTACGGAGACAACTTAATTAGTGAAATCTAAGCTTATTTTAAAATAGCTGACTTTTAGACTTGTTTGATTGATATTCTCCATAAGCACGTGGAAGAGAGTAAAGAATGTAAAGTGAATCGAGTTTCTTTCGTAAGTTCAAACCAACTTATGCACTTTAGCTTTTGGAGAAGCTAAATGAGATAGCTAAGTTCATCAGTTGATTTTAGATGACTTCTAGTCATAACATGATAGATGGTCTACCATGCACCAAAATTTGTAGCCCTTAGATTAATCTCAACCTTTCCCTTCAGTTTTCTCCATCAAAAATTATTTCTAGCAATATAAATAATTGTATGGTTCAAGACTCCACCTACAAACCGCTCCTTAATGTCAAAGCACCAGCTTGGTGGTTGGCCGATTAGCATTGTCAGCATTGCTACAGACAAGATCTCCGACATGCTAAAAAGTGCAACAAGAACCTTGACAAGGAAAAGGACATTGAGATGCTTTTGAACCCATCCATAACTATGTTTTTGACCAACTTGCATCCATTGAGAAGTTCCTACCAATATGTTTTAGACCAACTTGTATCAATTGGGAAGTTAACTGACAAATTTCAGGAGGCTGCACATGTTCTAAAGTGGTGGAATTTGACGCTTGATGGTGAAGATGGACCCGATGTTGTTTTTTTTTTAGATCGGCAATATTAGTTAGTAGTGTTTTGTTAGTAGGGAGAGATGAACGCACAACATCTCCCACCTTCTCTTCCAACTTTACCTTTAAGCCAACCTTGAGAGTCCCAAGATGTTGTTGGTGTTTCTAAGGGAAGTGATTTGGATATCTGAAATATGTAGGAAAGGAGATGAAAACAGGGGAATCAAAACATTGCCACTGGAAATTAATGTCATGTTATGCCTCTATTACATTTCGGTTAATTATTGAATAGAAATTTTGAAGTGAGAGACTTAGCCTAAAAACAATGATGACTAAATGTGAGCAATTAAAATAAATAGAGGACCAAAGTCACACATAGATTCAGGTATGAGACTAACAGTGAAATTAAGTCATTTTCAAATGAGAATATCCATTTCGCAAACGTGCTGAGTTCATAATGTATGTCATAATTGATTGAAAATAACATGTACCTTCTTAAGATTTAAGACTCAAATGATATTGTTAGTAATAGCATTTAGTCGTGGAATTATGTTTAGTTAAATTCCAACTGTGTTTGGAGAACTTTTTAATAAATTATTTATAGAAGAAAATAAAAACGTTAAATGTTTCCAACTTTTTCACAAGTTAAACTCATTTTAACTTCTCTAGAAGTTTCCTCATCTAGTTTTTTTTTTCAAAACTGATGTATAAGTTGATTTTAACTTGTAGAAGTTTATAATTCATCTTGCTATCTATTTTTTTTTTGTTTGAAGTACTTTTTTTTTCAAAACAGTCTTAATATTTAATTTGATTCGGCTTCTATGTGTAGTTCTTAGGACAACTTTCTCATTTAACCAATTATGATGTGGGCTCTAATTCTAATTACTAATGCATGTTTAAGTAAGTTATACCGCACTTAATGACAAACCCGAACACATGGAAGTTACTTCAATGACCTTTACTTTATCTCCAAAATATAATGAACACGAGGCTTTTAGACATTGAGTCAATCAACTAAAATTCATGTGTCGCAGCTTGCTACTGTTGGATTGAGTGGTAAACAATCATGCATGATACTACTTAAGAATGTAACAATCGAATGTCACAATTTGATTCCACTTTACCTAAGCAACCTATTTCACAATACAATTGATATATCCTGCAACAATCTCTCCCTCAACAATTTTTCTAATTGGAATCAAACTATTTGATTGTGACTCGGTTCACCTATCCAATCCTATGCCATGGAATAATTGTATAACTTGCAATAATCTCTCCCTGAACAATTATTCCATTTAGAATTAAACTCATGATCTTAACTATGATACCAATTGTTAAATTGAACACTCACCACTATGCTTAGCTGATAGTCAGGACACAAGTCTTTCTACTTAAAAGCGTAAAACGTCATGATTTAACTGTGACTTGGTTCACATTACCTAGACAATTAATGCACCTTGCTACAGCTACCTTGTTCAATATCTAGACCACTGCTTTTGTTTCTGCTGCTGTTTCTGATTCCTGCAACAGCCTTAGAATAGAGTTGATTGGTTGCTTTTCAGTTTCCTATTTCTGAATTTGGAATTTCAATAATGCCAATATATAATTATTTCTTGTGCTAAGTATCATTTACTCGTGTCCACTTTTTGGGGGATAATCATCCAACGTATGATTGCTTACTTAGGATGGTTCAGATTTTTTTTTGGAAAGCTGGCATATAAATCATGCATATGTACAATATGAATTAGATCAAGGTTCGTCACGTATAGGTAAATGATGTCAACTTGTATAATCGCACAAGTAATGCACTTTATAACTCCTTCGCTCCTCCACAAGTCATTGGATATTAAATTCTGCCGAGAAATTTTTTGAAAGGTCCAAATTCTTTACATGCCTCATATGGTACTCTTGAACTGTTAATGTTTCAGAGGCATGCTATTCATAATTAGCAAATTCCTGGATAAAATCGTTCCTTGAGCTCCGTGAAATAGCCTAAGATGATCAGTAACTGCCTCCCAGCCACAAGCACCGATTGTGTGATTTTAAACCTTTTAGCTTTAGCTTCTTATAATAAAATTAGAAACTAAGTTACTGGTTTAACAATGATAACATTGGGGACTTAACTGATTTTTTACTATACATTTAATTTGTTTAAACGTTCTCTTTTTCCGTAGGTGTGACTAACGAGAAACAGTCTACTCCAAATCCAGAAATGGGTTCTACCTCTCAAGGAGAGCGGAAAAGGAAGCGATTATCAACTGACGGAGGGGAGGAAACTTTGCAAATTCATTTAATTGATGTCTTAGAAAGAAATGGCAAGATGCTAAGTGCTCAACTTGAAGCGCAGAATATAAATTTCCAGTTGGATCGTGAGCAGCGGAAAATCAATGGTAGTAATTTGGTTGCCGTGCTGGATAAGCTTGCAGATGCTTTAGGGAGAATCGCTGATAAATTATAG