Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31581 LG8 48631308 48636936 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 48631636 missense_variant p.Arg283Trp
A/T 48631643 missense_variant p.Phe280Leu
A/G 48631949 synonymous_variant p.Ser178Ser
G/T 48632017 missense_variant p.Leu156Met
C/T 48632051 missense_variant p.Met144Ile
G/T 48632150 synonymous_variant p.Thr111Thr
A/G 48632517 downstream_gene_variant
A/C 48632539 downstream_gene_variant
T/A 48632623 downstream_gene_variant
C/T 48632686 downstream_gene_variant
G/T 48632737 downstream_gene_variant
A/T 48632783 downstream_gene_variant
A/G 48632784 downstream_gene_variant
G/C 48632888 intron_variant
C/A 48633246 intron_variant
A/T 48633501 intron_variant
G/C 48633666 intron_variant
G/T 48633806 intron_variant
C/T 48634017 intron_variant
A/T 48634081 intron_variant
G/T 48634082 intron_variant
G/T 48634149 intron_variant
A/G 48634486 intron_variant
T/C 48634503 intron_variant
A/G 48634594 intron_variant
C/T 48635051 intron_variant
A/C 48635150 intron_variant
T/A 48635151 intron_variant
T/G 48635153 intron_variant
A/T 48635246 intron_variant
A/T 48635281 upstream_gene_variant
C/T 48635347 upstream_gene_variant
G/A 48635370 upstream_gene_variant
A/C 48635444 upstream_gene_variant
G/T 48635447 upstream_gene_variant
A/T 48635651 upstream_gene_variant
G/T 48635764 upstream_gene_variant
T/A 48635770 upstream_gene_variant
A/T 48635793 upstream_gene_variant
G/A 48635851 upstream_gene_variant
T/G 48636315 upstream_gene_variant
T/G 48636321 upstream_gene_variant
T/A 48636324 upstream_gene_variant
A/G 48636654 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31581.1
MDHRKRGRSEAAFNVNGAAKKFRPETDSFPTGLGSKSKPCTKFFSTSGCPFGEGCHFLHYVPGGFKAVSQLINVGNDPGIPHVGRNPIPPSFPDGSSPPVVKTRLCNKFNTAEGCKFGDKCHFAHGEWELGRPTAPSYEDPRVMGQMPSSRIGGRLEPPLPAHGAAASFGASATAKISINAALAGAVIGKGGVNSKQICRVTGAKLAVRDHDTDSNLRNIELEGSLDQIKQASAMVHELILNLSSASGPPMKTFTTQTSAPASNFKTKLCENFAKGSCTFGERCHFAHGTDDLRKTGI*


CDS Sequence:
>Vu_31581.1
ATGGATCATCGCAAGAGGGGGAGGTCTGAAGCTGCCTTCAATGTCAATGGCGCCGCCAAGAAATTCAGACCAGAAACGGACTCCTTTCCAACTGGTTTAGGAAGCAAATCGAAGCCATGCACAAAGTTTTTCAGCACCTCTGGCTGTCCATTTGGTGAAGGATGTCATTTCCTGCATTATGTTCCTGGTGGCTTCAAAGCAGTCTCTCAGCTGATCAATGTTGGGAACGATCCTGGTATTCCTCATGTTGGTAGAAATCCTATTCCACCATCCTTCCCTGATGGGTCTTCCCCTCCAGTTGTTAAAACCCGATTGTGCAACAAGTTTAATACCGCTGAGGGTTGCAAATTTGGTGACAAGTGTCACTTTGCCCATGGTGAGTGGGAGCTTGGCAGGCCTACGGCCCCATCATATGAAGATCCCCGTGTTATGGGACAAATGCCAAGCAGCAGGATCGGTGGACGTCTGGAGCCCCCACTTCCAGCTCATGGCGCAGCTGCCAGCTTTGGAGCCTCGGCCACTGCAAAAATTAGTATCAATGCCGCACTAGCTGGAGCAGTGATTGGAAAAGGAGGCGTCAACTCAAAGCAAATTTGTCGTGTAACAGGAGCTAAACTTGCCGTAAGGGATCATGACACGGATTCTAACCTCAGAAACATCGAGCTTGAAGGCAGTCTTGATCAGATCAAGCAAGCCAGTGCAATGGTACACGAACTTATTTTAAATCTTAGTTCTGCCTCTGGGCCTCCAATGAAGACCTTTACTACACAGACTTCCGCCCCGGCAAGCAACTTCAAGACCAAGCTCTGCGAAAACTTCGCTAAAGGTTCCTGCACTTTTGGGGAAAGGTGTCACTTCGCTCATGGAACTGATGATTTGCGCAAGACTGGAATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_31581::LG8:48636936-48638936(-)
TAATTTAATTTAATATTTTATTATTTTGTGTTTCAATATTATTAGTTAATATTCCTTTTATTATATGCTAGATGAGGTAAAAAAAGAATGTTATAAGAGAGAAAAATATTATAGATTTATTTATTCAAAAATCTAATATTATAAATGAAAAACGAATACAAAAATTATCAATATTAAAAACTTATTTGTTTGTCTTTTGTGTTTGTTTTTTTATTATATGACATATTATTTTTATTATTTTGATTTGTCTTTCAAGTTTAACATTAGTGAAATTTATTTAGATTTAAATTAATTTTTTTTATTTTAAAAAAAATATAATTAAGTGAGTGAGTAACCCAACTCGTTTAACCTACCAATTTATGGTGAGTCGGTGAGATTTAAGTTTTTTCAGTTTCCTAATAAATAAGTCAAGTTGGATTGACTTGCTAAGTGACAAACCCGAACCCGTAATATATTGGATTGAGTCAGATCTGTCCTTTGAACAACTTTAAGTTATGAATATTCTCCCCATGTTATTAATATTCTACAGCGTTATTCTTTATTATTAAACCCAAAATGTTACTATTTTAATTCGTAATTAAAAGTAAGATAAAAAATTAAACCAAGCGACAAATTAATTATAATTTTTTTAGCCAACACTAATTACAGAAAGTAACACGATAAAAAAGTGAAAAAGAAGAAAAATTGCATGTGTGGTATGTTTGAAAAGACAGAAGAAAAGTTGAAGAAGAAGGTCGGAGTCAAAGAGGTGGTTTCTTTCACATAAATTGAAAGATATAAATTTATTAAGTGTTAATAGATCATACAAATTTATTAGTGATTTAATTAAAAATTTTCAAATTTATTATAAACTTAAAATATAATTAAGTGCAAATAAAAATGATGAGATCATACAAATGATTTACCTTATAAATAGTCACGTGTTAATGTTGAATTATTTATTTAAATCAAATTTTAATGATAATTTATATATTTTTTATTCTACCTTTAATTAATCATGAAATAATTAAATTTCAATTATTTTTCACTAAAATTTTATTTATTTTATTAAATATCAAGAATAAATGTTTTATATATAGTGTTTTTCTTAAATATTACTACAAAAATATATTATTGCAGTTTAGTAAATATATAAGATATTTTTTATATTAACATATTATTCCATTTAAATTATGAATTATTTGTTAATTTGACATTTTAAAAATGTTAATCATAGAGTTATTATTAATTATTTTTAATTTTTATAACCAAATTTTATAACATTCAAATACTTTTACAATAATCATTTTAACTTATATTATTAAACATCTTAAAACTTCCTATAAATTTTTTTCAACATCTCAAAAATTAGTTATCATCACAGACATTACAACAAAATTTACTAAATTAAGGAACTTTTATTTCTAATATCTTTAACTACTCAAAATAGTATTTATTTTATTTAAACCAGTACATTCATTTTTTTAATTCAAAAATGGAAAATTAAAATTATATTTTCTATTATAAAGTTTTTATTTCAAGAAAACTACAATAATAAATTTAACTTCAAATCTTGTTATAAAAGTAATATTACAAAAACAAAACAAAAAAATTTACCTTGTTCTTCCTGTTAAACTAATTAAAATTTAATATTAAAATTTATAATCAAATATTTTAAATTAATCTTCTCTAATTTTCAATTTTAACTTATTATTTTATATATATTTCAAAGAATAAAAAGTATACGTTTTTCTAAGTTGCATGGTTTTTCAGGAATAGAAATATTTTGGTGAAAGAACGTGATATTTATGTGTAAAAATTTATTTACATATTAGAATTATGTCTCTAAATTTTTAAAGAAATTATATTTTTAAAATTAAAAAGAGTGAATTTTATTTATAGTATAATAAAATGAATGCTTGATAAAAAAAAAAAAAGGTTGGTGAGATAAGAAAGAGATAGGGCATGATGTCCATAGATCTAAGATGATATATATACAGGCGGAAGAGAGAGAATGAGAT


Gene Sequence:
>Vu_31581(-)
GAGGTAAAGAAGATACGTACGTAGCCTATTCTTTGATGCTCTTGCTCTTGCTCTTGCACTGCCACATCCAAAAATATTAGGGTTAGGGTTTCAGCTCAAACCAACTGTCAGTGGATCTATTCTCTGTTGCTTTTGCGTTTCCATGGATCATCGCAAGAGGGGGAGGTCTGAAGCTGCCTTCAATGTCAATGGCGCCGCCAAGAAATTCAGACCAGGTTTGCTTTTATTCTTTCATTACTTACCGTCTTCTCCTTTTCGTTCTGCTTACGACTTACGCACACTTCCGATTTGTTTTCACTTTTATCGGCTCCTTTTCTCTTTAACTGTTCTTTTTGTTTTCATCTGCGCGAAAAATGATTAACAATGGAAGAGCGACGAAAAACAGTTAAAACTCCGTGTTCTCTTTCACCGTACAGATGCAGTTTTGTAAATATTTTACCTTTCCATATTATCACAGCAATTTACCTTTTGTCGTGGTAATATGTATGAAATGTTGAATTATTTTCTCGGGCACCTTCTCCGAAAACACTCGGTATAAGTTAGCTTAAATGAGCTGATATTGGTCAAATAAGAAGAAGAAATAGTTATTGGATGTTATCCAAGTTGAATCATAAAAGATCAATGGAATCTTAACTGAGAGAACTTAATTAATGTTTTGTAACAGAAACGGACTCCTTTCCAACTGGTTTAGGAAGCAAATCGAAGCCATGCACAAAGTTTTTCAGGTTCAAATCTTTAACTTATCTAAAATAAAAATTTAATGCACTTTCGTATATGTATAAATTTTATAATGTTTTAGATAAAATTGGTACACAATCTCTTCAAGCTGAATCCATATGATCTGACTAATGAATTGGGTAGTTAAAGCTGTGATACAGGTTCTACTTCTAATTATGATAACAAGACTATGAACAGAAATTGTTGATTCCCAAGAATGATCAGTTCTATTAAGTGCTTCCTGGGCAATATATAATTGAAAGCAGTTCTATGGGATGCATAACTTGATCTACGTAATTGGTCGTATACAATTTTCTGCAATCTTTTCAAGTAAATGGGTGTGATGCCAACCACTGAAATGGCTAGAGCAGTACAGGGCCTAAGACATATATATCTATCAATACTCCAAAACATTAGTGGATGGAATGGTGCTTAAAAGCATTTACGACACTCTTCTTTCTTATTTTTGTATGGAATTTTGAATTACCTGGTGTTCAATTGATCTCTATGATACAATGGTTCTTACGTTGATTATACTGCTTAGCTGATATATGCTATTGTACAATTGTTTGGTATATTACTCTCCAAGCTGATATCTGCTGTATTTTTGTCGCCTTATTTATATTGAAGTCTGAAGATTTCCATTCGATTCTGAATGCATCAATTTGAAGATTAGCCATGGCTTGGAAAAGTAATGGCTAAATTGAAAGAAAGGATATTGAGCTACAAGGACAAAATAATATAGAGTTTGTAACCATGGAAACTGGAAAGGCTTTAGAGTTTTAGGAAGAGCATAGTGATAATTTGAAATTATTGAAGTTTTTACTTCTGTTGAATATAATCATTCTGCTTAAGAGCCTGGTACCTCACCAGCTTATAGTCCCACAAACAATATTCTGGTTGTTCCATGGGTGACTAATAATATATATTGGATTCTCTTCACCCTTGCAGATATACAAAAATCATAACATCTTCCATTAGCAATTATTTTCTTTTGCAAATCTCCCCAACTCTTTTGCCAAATAGGACTTTAAATTCACTGCAAGGTATTGTACCTTCAGATTTTACATTAACTTAGCTTAAACATCTTTTCTAGGATGGCATAGCTGTTGTCATGTATTTATTGTAAATCCTATTCAATCAGAATTCTTCCTTGTGCAGACCAGTCGCATTCTTTGTCCCTTCCTCTCTTTCATTTGCTGTGGAATCGAAAACAATCTTTTGTTGTATTCTTAGTTTGTCAGTTTTAATGGCATTTTTGTCAACTTATATTAATTTAATTTTAATTCTTTTTTATGGCTAAAAATTTCTTTCTATAACTGTTTGTTAGCTGATTGGAATCTTGATTCAGATAGATTTAATCTGTTTATGTTTAGCGTTAGTGCTAGTTGCATCGTCTTGATTCTTAATCAGTAACTATTACGTAGAAGTTTGACATCCTTCTCTTGCTTGACAGTAAGCAAGGTAAGCTATGTTCATGACTTGATAGTGAATTTTTTGCTTGATAATTTGCAATATCTTTCACCCATCTGTGCTAGGAAGCGGCCCCTGCTGATGGGAGCTTAATACATGTTTTTAGTTCCTTATATGATACATATTCTGCACCTGATTTTTTTACAAAAATATATATTTTACAATATGTACGAACATTTGTTAAATATTAGGATTAAGCCTTATACCTGTTTTTTTTTTTCGGCTCAAGGTTTGATTTTTCGTAGTCTTTACTTGTGAATTTATTGTTATCTCTGGCTTGAAACATGGAGAGATTATGGGTTTGTACCTGGTGGTTTGTTTTCAGTTAATGCTTTCAATTTTTTTAGTCTTAGTTGATAAAATCCTATAATGATAAGGAAGTGGGTCATTCTTGAACCTTGAGTTATTCAATCAACCTTTTTTATCACTATCGGTTTGCATATTATGCTGACATTTACTTTAAACTGAGGGAGCCGCTGATTTGCAATGTTTCACGTTTTGGATTTCTGTTCAAGTTCATTGTCATTCCTGATTTATACTGGTGATTATCTCTATTTGAATTGAAGATGGAGCTTTACTGATATCTGTATTTATGAACCATTAAAAATTGTGATGTTGTCATCCTTTCTCATTTGCTCTCTTCCTTAGAAGATACAGATAAATGCTGGGAGTGTTTGTCAATTGTCTAGCAAGTTAGGACCCTTGAATGCCTTGGTAGTCTATAATATTGTATATGATTGCTTGTTTACATTAGGAGTGTGATTGCCGGCCCTATGCTTGGTTAGAAATGGAGGAGGGAGATAGGATACAAATATCCAATTTCCACTATTTGTAAATTCATCTTTTTTTAAGTTTTCTCTTGTAAATTTGTCTTCATGTGTCTATGTTCTGCTTGTGTTTTTAATCTGTGTTTTTATCTATTTTTACTCGTGAGTTTTCCCCTCTCTTGTTTTCTCTGTTCCATGTGTCTATGTTCTGCTTGTCCTGTCTCTGGTCTGATTTCTTAGGTCTCCACTCACATATCCTCATTAATCTGTGCTTTTATCTGTTTACCCTGGGGTTTTTCGCCCCTCTTGTTTTCTTTGCTCCATTAGTCTGTGTTCTCTGTTTAGTTTCTCTCTAATATGAGTGTTAGTTATGTACTTTTGGTCATATCTACTCCCGGAAACCCAAATTATTCATTCCTTTTTCTCCATTTATTGGTAGTCAGCCATAACATTTTTGTTACTAATTTTCTTGGATGATTGCTTAAGGGATGAGACCTATAACTTCTTATTGTTAATTGTGAACATCTCAAGATTTGAGTATTTTGAAAATTTATATGTATTTAGTATGAATTATATAAAATGTATGAGAAACGTTAAAAATACAAGTCATGTTGCTATGCACCGTAATGTTTTTGTGTTTTTGGGGACAACTGTACGGTTTACTTCCTGGACTGGTAGTTGTGTCCTCTCTCGAATCTGAACGGCTGCTTCTAATTCAGTCTAAAGTGACCACGGTTAATGCATATTTATGTTGTTCCTTGTTGAAAAGAATATCAGATAGACATTACAAGTTACAATAGAAAATTGATGTATGTGAAAATTACTTACGAAGAAGGAACAAGACTATTTTCGTAAAACTCATGTGACTGTGTCACATGGATCCTAGATTTTCGATTATCTTTTGTTAATGTGTATTCTTAATGTTCGTTCAATTGGGAATTTGATGTTTGTAGCCCCTCTATGTTTGTTGCCTCTACTATGAGAAATCAGATTGAGCATTGTTGATTGCTGAATCTTATTATTTTAGACTTCAAAATGATTTATAGTTTCTATATTACTGTGAATTAGATATGCCATTCTGTAGTTTGTTTCGTATGTTTTCTCCCATAATATGTGCTCAAATTTCTAATCTTATTTGTACTTGATTATAATGCTCCTAGCACTATTCTCTTATTTTGTCTTTAGAATAATTTGCTTGCTTACTTATGAAATACTTTACCAGTCTGAACCTGCTTTTTCCCCCCTGTACTGTCTTTGGGTATTCAATATTTTTTGTTACTTCGGTCATCCATCGTTAGTATTTGCACTGCTAAGAATTCCCAGATAACGTTATATTGTATTTGCTTAGCTAGAGGAAGATGTTCTTAATTATGAAAATAAAGAAAAAAGGCATTAGTTTTGTAAGGGAAAGCATTCTTGATACATTTTAAATGAATCATCTTAATTCTTAAACGATGCTACTTTGGTGTATATTATTTGTCTGTCACTTTTTCGGCTAATTTTCAGTTCATACTTCGTAGAGTGAATTAGTATTTCACTTAGGTCCCACCTCTACCTGTATAAGCTTTGGAATCTTACTAGTTGGATATGTTATTAACCTCTTATGTCATCTTCTTTCCTCTATAATGCAGCACCTCTGGCTGTCCATTTGGTGAAGGATGTCATTTCCTGCATTATGTTCCTGGTGGCTTCAAAGCAGTCTCTCAGCTGATCAATGTTGGGAACGATCCTGGTATTCCTCATGTTGGTAGAAATCCTATTCCACCATCCTTCCCTGATGGGTCTTCCCCTCCAGTTGTTAAAACCCGATTGTGCAACAAGTTTAATACCGCTGAGGGTTGCAAATTTGGTGACAAGTGTCACTTTGCCCATGGTGAGTGGGAGCTTGGCAGGCCTACGGCCCCATCATATGAAGATCCCCGTGTTATGGGACAAATGCCAAGCAGCAGGATCGGTGGACGTCTGGAGCCCCCACTTCCAGCTCATGGCGCAGCTGCCAGCTTTGGAGCCTCGGCCACTGCAAAAATTAGTATCAATGCCGCA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