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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31469 LG8 47790086 47792305 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 47790191 3_prime_UTR_variant
T/A 47790304 missense_variant p.Leu587Phe
T/A 47790649 missense_variant p.Glu472Asp
C/A 47790858 missense_variant p.Gly403Cys
T/C 47791317 missense_variant p.Ile250Val
A/G 47791375 synonymous_variant p.Ile230Ile
T/A 47791443 missense_variant p.Thr208Ser
A/T 47791721 stop_gained p.Leu115*
T/C 47791792 synonymous_variant p.Gln91Gln
T/G 47791816 synonymous_variant p.Gly83Gly
T/C 47791894 synonymous_variant p.Ser57Ser
T/A 47791915 synonymous_variant p.Ala50Ala
A/G 47791923 missense_variant p.Phe48Leu
T/G 47792059 missense_variant p.Gln2His
C/T 47792089 5_prime_UTR_variant
G/A 47792264 5_prime_UTR_variant
T/A 47792272 5_prime_UTR_variant
A/T 47792283 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31469.1
MQLGTCVLNLVLIFSLLGQFSGSVSESSSSTPQAPICSEEDRASLLSFKAGISQDTSQTLSTWTGRDCCDGGWEGVQCNPSTGRVNMLQIQRPERDDETFMKGTLSPSLGNLHFLEVMIISGMKHITGPIPNSFSNLTHLTQLILDDNSIGGCIPPSLGRLSLLQSLSLAGNHLKGQIPPTFGGLRNLVQLNLARNSLSGPIPLSLKTVINLQYLDLSYNLLSAPIPDFIGELKNLTYVDLSSNLLTGKIPVSLFGLVNLLDLSLSNNKLTGNIPDQVGNLKSLTSLQLSANLLTGHIPLSISRLQNLWYLNVSSNWLSDPLPVIPTKGIPSLLSIDLSYNNLSLGTVPDWIRSKQLKDVHLAGCKLKGDLPHFTRPDSLSSIDLSDNYLVDGISNFFTNMSGLQKLKLSNNQLRFDISAIKLPTELSSIDLHANLLVGSLSTIVNNRTSSSLEVIDLSNNFISGHVPGFVEGSSLKVLNVGSNNITGPIPVSISNLVYLERLDISRNHVLGTIPSSLGRLLKLKWLDVSINGLTGQIPSSLSQLTSLKHANFRANRLCGEIPQTRPFNVFRPVAYGHNLCLCGKPLQPCKKHGSMGQ*


CDS Sequence:
>Vu_31469.1
ATGCAACTTGGGACATGTGTGTTGAACCTTGTTCTGATATTTTCACTTCTCGGTCAGTTCTCTGGAAGTGTGTCAGAGTCATCGTCTTCAACACCGCAGGCACCAATCTGTTCAGAAGAAGACAGGGCTTCACTTCTGAGCTTCAAAGCAGGCATTTCGCAGGACACGTCACAAACACTGTCCACGTGGACGGGCAGAGATTGCTGCGATGGTGGGTGGGAGGGAGTTCAGTGCAATCCATCCACAGGACGAGTAAACATGTTGCAGATTCAAAGGCCGGAGAGAGATGATGAAACGTTCATGAAGGGTACTCTTTCTCCATCTCTGGGCAACTTGCATTTCTTGGAGGTAATGATCATAAGTGGTATGAAGCATATTACAGGACCCATTCCTAATAGTTTCTCAAATTTAACCCACCTTACCCAGTTAATTTTGGATGACAATTCCATTGGGGGTTGCATTCCTCCGAGTTTAGGTCGTTTATCCTTGCTTCAGTCCCTTTCACTCGCTGGAAACCATCTGAAAGGACAGATCCCTCCAACATTTGGGGGTCTGAGAAACCTTGTCCAGCTTAATTTAGCAAGAAATTCTCTGTCTGGTCCTATCCCCCTCAGTCTTAAAACCGTTATAAATTTGCAATACCTTGATCTCAGCTACAATTTGTTATCAGCTCCCATCCCGGATTTTATTGGGGAGTTAAAAAATTTGACTTACGTAGACCTTTCCTCTAACCTTCTAACCGGAAAAATTCCAGTTTCCTTGTTCGGCCTCGTGAATCTTTTAGACTTGTCCTTGAGCAATAACAAGCTCACAGGGAACATTCCAGATCAGGTTGGAAATCTGAAATCCCTGACCAGTCTTCAACTCAGTGCCAATCTGCTCACAGGGCATATTCCACTGTCCATATCAAGACTACAGAACCTTTGGTATCTCAACGTATCGAGTAATTGGCTTTCAGATCCCTTACCAGTAATCCCTACCAAGGGCATCCCTTCCCTTTTGTCCATAGACCTGTCTTACAACAACCTCAGCCTTGGAACTGTTCCTGATTGGATCAGAAGCAAGCAACTCAAAGATGTACATCTTGCTGGGTGCAAATTGAAGGGAGATCTTCCACACTTCACGAGACCAGACTCTTTGAGCTCCATAGACCTATCAGACAACTACTTGGTTGATGGTATTTCAAATTTCTTCACTAACATGTCCGGCCTGCAAAAGCTCAAGCTCTCCAACAACCAGTTGAGGTTTGACATATCTGCAATCAAGTTGCCAACGGAGCTCTCTTCCATAGACTTGCATGCAAATTTGCTGGTGGGTTCATTATCAACAATAGTGAATAACAGGACAAGCAGCTCTTTGGAGGTTATTGACTTGTCAAACAATTTCATTTCGGGACACGTTCCAGGATTTGTGGAAGGCTCAAGCTTGAAGGTACTAAACGTGGGAAGCAACAACATAACAGGTCCTATCCCAGTCTCTATCTCAAATTTGGTATATCTTGAGAGACTGGACATCTCAAGAAATCACGTATTGGGAACCATCCCCTCAAGTCTAGGTCGGTTGCTGAAACTAAAATGGCTTGATGTATCCATAAATGGATTAACTGGCCAAATTCCGAGTAGTTTATCACAGTTAACTAGCCTAAAGCATGCAAATTTCAGGGCAAACAGACTGTGTGGTGAAATACCACAAACCCGACCATTCAACGTCTTTCGACCGGTTGCTTACGGCCACAACTTGTGCTTATGTGGCAAACCTTTACAACCATGCAAGAAACACGGAAGCATGGGTCAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_31469::LG8:47792305-47794305(-)
ATTATTTAGATGGAATTAATATATTTTTGGTTTTTATATCTCTACCAGAGTAAATCCTTATAAACAAATACAAGTTTACAATTGACATGTTTTTTATAATTATTTAATGAGAAAAGTGCTAATAAAAGAAATTAAATTTATTTGAATTTTTTATAAATTAATTTTAAATTAAAAAATATTTATTTTTTCTTATTAACTTTACTCCTCTTTTATTTTTATTTCTCATATTTAACACCGAGTCTCCGTTTTTATGAATAAATTTAATTTCTCAAATAAAATTTGAAGTAAATTTTCCTGTGTTAATGTCATTAGTCATTATTCAGAAATTTATAAGAGAATGACAAATATTCTATTGTTTTTATTTTAAAATAATAAGAACAGTACATGTGGAAATTTTAAATCTGAAAAACGAGAAAATAAATTATCTAATCAGTGTCTGCTGTGCTTAAGATCTTTTACAATATATGTCAAAAAATGTAGATTTACAGTAATTATTTTAATAACTATATATCATAATCAATTATTTGTTCATAGTGTAAAGAACTTTATTGTCATGACATGATACATAGAAATTAAATTTAAACATAAAATTCTAAGAAAAAAAAGACTATTTTACTTATAAAAATAGTCCATTAATAATTATGAAAGCATACTGTTTTTTTAAATATGTGATATTTTCCTATAAAAATACAACAAAAATAAAGGTGGTATTAGTATTAAAAAATGCTTAAGTTTTATACATTGTGACGGTAAAAAAAATTACGTCATTAAAATTCTATCAATTATTATACATAATTATATTTTGTTTATAAATTAAATTATTTAATTTTTAAACTTTACGAAACTCATAAAATATTCTCTCCAGGAAATCCCATTATAGTCTAACATGGAATTATGTTTATCACAGTGAAAAATAAGAAGTATTTCATATATTATTTATTAAAATATTTTATGAATTTTATAAAATTTTAAAATGTAATGATGTATAATTTCATTTTAAAATATATATTTTATATTAATTTAATATGGAATACATATTTAATTATATATATTAAAAATTATCAACTATTTTTTTTCATTATTTTGCTTAAAAACTAAGAATACAGTTGAATGAACGTGCGGCGTACCAAACATCCAATTTATTGTCGCCTCAATGGGGTTTGTCGTGGGCCATTCTTTTTTTTTTTTTCATTTTTCTATTCTCTCCTTTCAACATTTTAGTAACACATTTCTTATTGATGTATTTTTTTAAACCTTCAACTAATAAAAAAATCATATAATTATATAACTCAACAAATTATTATATATGTCAATTTATTCAATAACATTTACGAATTACTTTCTGAATATAAAAAATATTAGGTCTCTAGGTATGATGACTACATAGCATTGTCAATACATTCTGATTTAATTACAATAGTTGATTAAAATAATTAAAAAAGAAATTAAAAGCTTAATTGTTATTCTTGATCAGCACTACACAATGATCATGTTTTAAAATATATTAGCTTATTTAAAAAAAAATTATATAGGTTAATTTCCTAGGAACAGGAAAAAATAGAAGTCCAGAAGAACAATCTCAAGAGATTAAGAACTCTAAGTAAAGAATAAAAGAACCAATAAAACAAATGGAATGTGTTCAAAGAAAATGACATCAAGGGTTAGGTTCTTCAATACTTACATGTAATAAATAATACACATAAATATTTATATAATCATGAAAAGATTGGTTAAATTGAAAATAATAAAACTTACGAGAAGGTGAATTTTGTTTTAGAAAATAGGAGAGTGGAAAGAATTTGATTTGAATCTGGTGCGCTCCAACGTTCAAATAGACCAAGGATCCTCGTGATTCATCAAACGGTCAGAAATTTCCATGTGAAGTTCTTTAAATTGATCCCAGGCTCGCTGGTAAAATCCCCCTTCCATTTCACTCACAAGCTCTTTTCATTCTTCTCTGACTATGTATCTATAAATATCAGAAACTGCATGCAGATCTC


Gene Sequence:
>Vu_31469(-)
CAACAAACAAAATTACAATGCTTATTTTTCACCATTTTTATCATCATTATACCTTCTTCTCTACGTGAAATAATACAATAAGAACCCCAATGTCCCACTGTTACTTTTTCAACCCTTCTTCTTTTTCTCCCTAAATTATACTCACTCTTCTTTTCAAATTTCTTTTCAAATTTCCCAAAGTTCTCTTCTCAGATCCCAACTTCACACCAATCCCTCGTCTCAACAGACCCACCTTCCAAAAATGCAACTTGGGACATGTGTGTTGAACCTTGTTCTGATATTTTCACTTCTCGGTCAGTTCTCTGGAAGTGTGTCAGAGTCATCGTCTTCAACACCGCAGGCACCAATCTGTTCAGAAGAAGACAGGGCTTCACTTCTGAGCTTCAAAGCAGGCATTTCGCAGGACACGTCACAAACACTGTCCACGTGGACGGGCAGAGATTGCTGCGATGGTGGGTGGGAGGGAGTTCAGTGCAATCCATCCACAGGACGAGTAAACATGTTGCAGATTCAAAGGCCGGAGAGAGATGATGAAACGTTCATGAAGGGTACTCTTTCTCCATCTCTGGGCAACTTGCATTTCTTGGAGGTAATGATCATAAGTGGTATGAAGCATATTACAGGACCCATTCCTAATAGTTTCTCAAATTTAACCCACCTTACCCAGTTAATTTTGGATGACAATTCCATTGGGGGTTGCATTCCTCCGAGTTTAGGTCGTTTATCCTTGCTTCAGTCCCTTTCACTCGCTGGAAACCATCTGAAAGGACAGATCCCTCCAACATTTGGGGGTCTGAGAAACCTTGTCCAGCTTAATTTAGCAAGAAATTCTCTGTCTGGTCCTATCCCCCTCAGTCTTAAAACCGTTATAAATTTGCAATACCTTGATCTCAGCTACAATTTGTTATCAGCTCCCATCCCGGATTTTATTGGGGAGTTAAAAAATTTGACTTACGTAGACCTTTCCTCTAACCTTCTAACCGGAAAAATTCCAGTTTCCTTGTTCGGCCTCGTGAATCTTTTAGACTTGTCCTTGAGCAATAACAAGCTCACAGGGAACATTCCAGATCAGGTTGGAAATCTGAAATCCCTGACCAGTCTTCAACTCAGTGCCAATCTGCTCACAGGGCATATTCCACTGTCCATATCAAGACTACAGAACCTTTGGTATCTCAACGTATCGAGTAATTGGCTTTCAGATCCCTTACCAGTAATCCCTACCAAGGGCATCCCTTCCCTTTTGTCCATAGACCTGTCTTACAACAACCTCAGCCTTGGAACTGTTCCTGATTGGATCAGAAGCAAGCAACTCAAAGATGTACATCTTGCTGGGTGCAAATTGAAGGGAGATCTTCCACACTTCACGAGACCAGACTCTTTGAGCTCCATAGACCTATCAGACAACTACTTGGTTGATGGTATTTCAAATTTCTTCACTAACATGTCCGGCCTGCAAAAGCTCAAGCTCTCCAACAACCAGTTGAGGTTTGACATATCTGCAATCAAGTTGCCAACGGAGCTCTCTTCCATAGACTTGCATGCAAATTTGCTGGTGGGTTCATTATCAACAATAGTGAATAACAGGACAAGCAGCTCTTTGGAGGTTATTGACTTGTCAAACAATTTCATTTCGGGACACGTTCCAGGATTTGTGGAAGGCTCAAGCTTGAAGGTACTAAACGTGGGAAGCAACAACATAACAGGTCCTATCCCAGTCTCTATCTCAAATTTGGTATATCTTGAGAGACTGGACATCTCAAGAAATCACGTATTGGGAACCATCCCCTCAAGTCTAGGTCGGTTGCTGAAACTAAAATGGCTTGATGTATCCATAAATGGATTAACTGGCCAAATTCCGAGTAGTTTATCACAGTTAACTAGCCTAAAGCATGCAAATTTCAGGGCAAACAGACTGTGTGGTGAAATACCACAAACCCGACCATTCAACGTCTTTCGACCGGTTGCTTACGGCCACAACTTGTGCTTATGTGGCAAACCTTTACAACCATGCAAGAAACACGGAAGCATGGGTCAGTGAGATGCTGACTCTATCATACTATATATAATATATATAAATGCTCATGTCCTGCGACCATTGTTACATAGAGCAAAATAGAATAGGCATTTCTTTTCTAGGTCGACCACAATGCAAGTTCAATTTTATAATTCAACATTGTTTCTAATAAAATATGCACTCATTTTATTACGTGCTTAGATTGT

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