Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31375 LG8 47026239 47027327 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 47026588 stop_gained p.Arg180*
A/G 47026707 missense_variant p.Val140Ala
T/C 47026853 synonymous_variant p.Gln134Gln
C/A 47026927 missense_variant p.Val110Leu
A/G 47027031 synonymous_variant p.Asn99Asn
A/G 47027061 synonymous_variant p.Asp89Asp
A/G 47027082 synonymous_variant p.Asp82Asp
A/C 47027164 missense_variant p.Val55Gly
C/T 47027171 missense_variant p.Glu53Lys
A/G 47027184 synonymous_variant p.Asp48Asp
G/A 47027189 synonymous_variant p.Leu47Leu
C/T 47027196 synonymous_variant p.Glu44Glu
T/C 47027213 missense_variant p.Thr39Ala
A/T 47027224 missense_variant p.Val35Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31375.1
MLGSLQKVPSKFTRKHGSFLPNPVSLRPPDSKEWVVYWTQENGEVWLDKGWKEFVENYSLSYGYFVMFKFKGTSQIDVTILDPSAVELDYFSSGKESVNTMNNVERDANVQQQVYADKGGPSHQGTNVQKIIKQQPNWVRSTLSGKCLNKPRSLKAQKITKNFKSKYPYFTSLIVKAKLEENATKHVPKFLNCMSGQKDVMLQMENREWWVKLICCREKYDVFSSGWSKFAKESNLEVDDVCIFELIDPAIPMLRVHVVKS*


CDS Sequence:
>Vu_31375.1
ATGCTTGGTTCTTTGCAGAAAGTACCTAGTAAGTTTACAAGGAAACATGGGAGTTTTCTGCCAAATCCAGTGTCTCTTAGGCCTCCAGATTCAAAGGAATGGGTAGTATATTGGACACAAGAAAATGGTGAGGTTTGGCTAGATAAGGGTTGGAAAGAGTTTGTTGAAAATTATTCCTTGAGTTATGGATATTTTGTGATGTTCAAATTCAAAGGAACATCCCAAATTGATGTAACCATACTTGATCCAAGTGCTGTAGAATTAGATTATTTTTCTTCTGGTAAGGAATCAGTTAATACCATGAATAATGTGGAAAGAGACGCCAATGTGCAGCAACAAGTGTATGCAGATAAGGGTGGTCCTTCTCATCAAGGGACAAATGTTCAAAAAATAATCAAGCAACAACCAAACTGGGTGAGGTCTACTCTAAGTGGAAAATGTCTGAATAAGCCAAGGTCACTAAAAGCTCAGAAAATAACCAAGAATTTTAAATCAAAATATCCTTACTTCACATCTTTGATAGTGAAGGCTAAGTTGGAAGAGAATGCTACGAAACACGTGCCCAAGTTTTTGAATTGTATGAGTGGCCAGAAGGATGTGATGTTGCAGATGGAGAATAGGGAGTGGTGGGTGAAGTTAATCTGTTGTCGTGAAAAATATGATGTTTTCTCTTCTGGTTGGTCTAAGTTTGCAAAAGAGAGTAATTTGGAAGTGGATGACGTTTGTATCTTTGAGTTGATTGATCCTGCAATTCCGATGCTTCGAGTTCATGTTGTCAAAAGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31375::LG8:47027327-47029327(-)
ATAGTAGATCAATAGTATTGATTAAAACCATTACAAACACGATTTCATTGAATCTAATTTAAATTTAAATATTGAATTATTTTCATAAATTTCTAGATTATTTTATTGATACTAAACATATTTAGTTCACTTGCTGAAATTGATTTTGAATTAGATAAGTCTAACAACAAGTTTTTTTCTTTGGAAATTATTTGATTAAGATAACAGAATATTTATAATCAAATTAAATTGTTATATTAATTTGTAGATATATAAAAATTAATAGACTTACTCATATTTTTTTAGCTGTTATATAACATGTTCTACTCAACTACTTCTTCTTACATGTAAAGAAGAAAATATAACCAGATCTTCCTATTGGACTTTGAAATAGAAAAACAATTTTGAGGTTCATTATAATTTATAATCCAATCTATGTAATATAATATTTATAGTCTAAATGGATGTAGTATATGTGATTTTTTTTACATTGATAGTCTAAATAAATGTAAACAAACTTATTGATTTAGTATTTTTTTTTCTTTTATAAATTTGGATTATTTTAAAGATTTATATGAGGGTTTAATATTGATATATCCCAGTGTCATTTAGGTTAAATCTCTAATTGATATAAAATAAAATACTAGAAACATCAAACATTGAAGGTCTTTTTGTTTAACATAATATATAGTCTCAAAATAAGCTGTAAATATTATTGGCACTTAGCTGCACCCACAGGAAGGAAATTCTCACCTGTGATAATCTAAAATAAAAATTATAGGCTTAAACATTATTTTCAATTTTATTCTAATATAAAGTAAACAATTGTGTACCCGAAAAAGTTATGAGAGGTAAGTATTTGAACTAACATTATTAAGTGTTGCATATGAAGTTATTAAGTGTTGCATATGAAGTGTTTATTGTGCAAGACAGTGCAATTGGCATGACAGTGCAATTGGCATGACGGAGAAATTAAATTTAAAATATCATATTTTCTCTAATCAAACAACTAAAAACTCTATTTATTTAAAAAAATTAAATTACAAAAAAAAAGGTAATTAAATCAAAATTTCACATAAGCAGTCACTTACATAACTCAAAAATTTTTTAAAAGATTTTAACTTCAAAAGATGATATATATAGATAATAAACTGAAAGTATCCTACTACAATATTTTTTTTGTATTCTATAAATTAACAGTAGTATCGTTTTCAATAATAGAATATCAAATTTAATGTTTTTTTTATGGAAAATATCTTTTTAATAATTTTTTTTTTACTTTTTATAAATTAGTGTGTGATTGGTCCGTTTGAAACAGTGATACATTGTAAAAAAAATATCATGGTCTTTTTTTATATGTTTCAACCATCGTTTAAAAGCTTTACATAGACAATGAGACAGCTAGAGCACGCCTACTTTGACTTACAAGAGTAGGTGCAAGCATTTACCATAAATGAAGATTTCAGATTTCAAATTCACTGGAACGCATGCTGAGCCTGATGAGTTTTTAGAATTGCAGAATTGCACACACGTCATTGGATTGGAAAGCAAGCTGCCCGATTCGCATGCTGCCCGGTTGAGTATAGCAGTGCAAAACATTACTTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTCCCAACTTCAGATTCCTCTCATGGCTTCTCATCTTGGTCAGATAAGTGCAACTCTTCCAATCCATTTTTTCAAGATTATTCTTGAAACTAATATTGAAAGGATAGTAAGTGTTATTCATATTTTAGTATACTTGTCCTTTCTAAGCAAAGTAATTTAGGTGTGCTTGCATGAGATGTATGTATCTGCATCAGATGTTTCATATTTGTTTTTTCTTTTTGCTTAATTTGGAATAGATTACACCTGCATAACATGCATTATAAGATTTATTAGAACAGAAGAAAAATTCGAAAAATTGCTTGTATATTTATGATAGAAACATGAACCCTTGTTTAGGATACTA


Gene Sequence:
>Vu_31375(-)
ATGCTTGGTTCTTTGCAGAAAGTACCTAGTAAGTTTACAAGGAAACATGGGAGTTTTCTGCCAAATCCAGTGTCTCTTAGGCCTCCAGATTCAAAGGAATGGGTAGTATATTGGACACAAGAAAATGGTGAGGTTTGGCTAGATAAGGGTTGGAAAGAGTTTGTTGAAAATTATTCCTTGAGTTATGGATATTTTGTGATGTTCAAATTCAAAGGAACATCCCAAATTGATGTAACCATACTTGATCCAAGTGCTGTAGAATTAGATTATTTTTCTTCTGGTAAGGAATCAGTTAATACCATGAATGTAACTCAGATGGAGCAAGAGGCCAGACCAATGCCATCAATGGTCTCTTCTCAACCTTGTGGAAAAAACCCAGAATGTGGAAAGAGACGCCAATGTGCAGCAACAAGTGTATGCAGATAAGGGTGGTCCTTCTCATCAAGGGACAAATGTTCAAAAAATAATCAAGCAACAACCAAACTGTATGTTATTCATGAAAATATATCTACTGCACATAACATGTATGAAAATATACAGTTAGTTAACATTGTTAAATTCAATAGGGGTCTAAAATTTCAAAATGACGAATTCTACTTGTGCAATTCACAGGGGTGAGGTCTACTCTAAGTGGAAAATGTCTGAATAAGCCAAGGTCACTAAAAGCTCAGAAAATAACCAAGAATTTTAAATCAAAATATCCTTACTTCACATCTTTGATAGTGAAGGCTAAGTTGGAAGAGAATGCTACGGTATATAAGTTTTGATACGAATGTTGGTCATTGTTTTAATGAGTTTATTATAGGTTCTGTAGTGAGTTTCTTTCTAACTGTGTAATATTGTTTCTTTATGCAGAAACACGTGCCCAAGTTTTTGAATTGTATGAGTGGCCAGAAGGATGTGATGTTGCAGATGGAGAATAGGGAGTGGTGGGTGAAGTTAATCTGTTGTCGTGAAAAATATGATGTTTTCTCTTCTGGTTGGTCTAAGTTTGCAAAAGAGAGTAATTTGGAAGTGGATGACGTTTGTATCTTTGAGTTGATTGATCCTGCAATTCCGATGCTTCGAGTTCATGTTGTCAAAAGCTAG