Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31340 LG8 46614563 46616372 PREDICTED: zinc finger protein CONSTANS-LIKE 16-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 46614651 3_prime_UTR_variant
C/A 46614670 3_prime_UTR_variant
T/C 46614703 3_prime_UTR_variant
T/G,* 46615060 intron_variant
C/T 46615087 intron_variant
C/G 46615150 intron_variant
T/C 46615180 intron_variant
G/A 46615251 stop_gained p.Gln330*
T/A 46615266 missense_variant p.Asn325Tyr
C/T 46615400 missense_variant p.Gly280Glu
A/G 46615470 missense_variant p.Ser257Pro
A/G 46615771 synonymous_variant p.Ala156Ala
T/C 46615774 synonymous_variant p.Ala155Ala
T/A 46615797 missense_variant p.Thr148Ser
C/T 46615879 synonymous_variant p.Glu120Glu
T/C 46616012 missense_variant p.Gln76Arg
C/A 46616153 missense_variant p.Trp29Leu
C/G 46616160 missense_variant p.Ala27Pro
C/A 46616201 missense_variant p.Gly13Val
T/C 46616256 5_prime_UTR_variant
A/G 46616277 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31340.1
MSTAKNAANAVGGKTARACDSCITKRARWYCAADDAFLCQACDSSVHSANPLARRHERVRLKTASYRSTDEQQQQQQPPTWPTKKARTPRHGKHSRSNNPFHLVPEVGSEEVNSHDENEEQLLYRVPIFEPFVAELCGNNSSSPSSVTSTDQGVAAAVAEAENKGVESNVLYHSNNEMENLHGMLPSDAELAEFAADVENLLGRGLENECVGMEDLGLIDAKEEECSVGSGEVKVEEEESPEMEMEMEMEMVGRDVSFEFSFDYDTCEEVKERVCDLELGKENEEEPRENDEVKKKKISLQLDYEAVIIAWASQKSPWTTPDKPNLDPDQCWHECIESYGRGIHDSYGEVGGFGIHPVIIDGGREARVSRYREKRRTRLFSKKIRYEVRKLNAEKRPRMKGRFVKRASFAPSTFPLLNH*


CDS Sequence:
>Vu_31340.1
ATGAGTACGGCAAAGAACGCGGCAAACGCGGTTGGAGGCAAAACCGCAAGAGCATGCGACAGCTGCATAACCAAGCGGGCACGTTGGTACTGTGCTGCCGATGATGCTTTTCTCTGCCAAGCTTGTGACTCTTCGGTTCACTCCGCCAATCCTTTGGCTCGCCGACACGAAAGAGTCCGCTTGAAAACGGCGTCGTACAGGTCCACCGACGAACAACAACAACAACAACAACCTCCCACGTGGCCCACTAAGAAAGCTCGAACGCCCAGACACGGGAAACACTCTCGTAGCAACAACCCCTTCCATCTGGTCCCGGAAGTGGGTTCGGAAGAGGTGAATTCCCATGACGAGAACGAGGAGCAGCTTCTTTACAGGGTCCCCATATTCGAACCTTTTGTTGCCGAGCTATGTGGGAATAACAGCTCTTCTCCTTCTTCGGTGACTTCAACCGATCAAGGAGTAGCAGCTGCTGTGGCCGAGGCCGAAAACAAAGGGGTTGAGAGCAATGTTTTATATCACAGTAATAATGAGATGGAAAACTTGCACGGGATGCTTCCTTCCGATGCAGAACTTGCCGAGTTTGCGGCTGATGTTGAGAATTTACTGGGTAGGGGACTTGAAAACGAGTGTGTGGGGATGGAGGATCTGGGACTGATTGATGCGAAGGAGGAGGAGTGTTCGGTGGGTAGTGGGGAGGTGAAGGTGGAAGAGGAAGAGAGCCCTGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGTGGGAAGAGATGTATCGTTTGAGTTTAGCTTTGATTACGATACGTGTGAAGAGGTGAAGGAGAGGGTTTGTGATTTGGAATTGGGGAAGGAGAATGAAGAAGAACCGAGAGAGAATGATGAGGTGAAAAAGAAGAAGATATCGTTGCAGCTTGATTATGAGGCAGTGATTATCGCCTGGGCTAGCCAAAAGTCTCCCTGGACCACTCCTGACAAGCCAAACTTAGACCCCGACCAGTGCTGGCACGAATGCATCGAAAGTTATGGAAGGGGAATTCACGATTCTTATGGTGAAGTGGGTGGATTTGGGATTCATCCAGTGATAATTGATGGAGGCAGAGAGGCAAGAGTGTCAAGGTACAGAGAAAAGCGGCGAACAAGGTTGTTCTCTAAGAAAATAAGGTACGAGGTTAGGAAATTGAATGCAGAGAAGAGACCCAGAATGAAGGGGAGGTTTGTCAAGAGAGCTTCCTTTGCACCATCAACATTTCCCTTGCTAAATCATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_31340::LG8:46616372-46618372(-)
ATATGAAATCTAACCAAATTGTAAAAATATTAGATTAATTTTAAAAAAATTTATATTAAAGTTTTTTTTATAATTACTATATATATATATATATATATATATATATATATTATTAGAAGAGAATAAATAATTGGTAGAATTTAAGTTATATATTAAAAAAATAAATAAAATAAACAAATGTAATAAAAAAATTCATAAACTTGTTATTCATAAATTTTAGAGCTGATGGGTCACAATCCGGGTCAACCCGGCCTATCACGGGTTTGAGCCGGGTTGGGTTTGAAAAATTACATTTGTTTTATGCGAGTCAGATTTAAACCCAGCTCATGCGGGTTGAACCTGTGGTAGGCCGGGTTGGCCCACCAACCTACCTACCTAATTTTATTTTATTAAAATTTAATTTTAATTTTATAAAAAAATATTTATTATTTTGTTTTTGCTTGAAAAAATTATTTAAGTTCCTTATTTTCAAAATTAATTAAACACCCATGTTGGGAGTGAAATTTGTTTAGATTTGAATTATAGAAAGTTTGTAATTTTTTTTATTTAAAAAAATTGTAATTAAGTGAGCGAGTGAGCCAATCCGTTTACCCACCAACCTGTGGTGGGTCGGGCCGATTTCGAATTTTTCTGACTCGCTAATAAATGAGCTGGGTTGGGTTGACTCACTAAGTGATCAACCCGTGGTAGACCGGACCGGGTCGGGCCGGGTGGCCCGTTTTGACAACTCTAATAAATTTATTATTTTAAAATTTCAAATTGAGATGTCGTATTTAGTTGAGTCAGATTTAGATGAATTTTTCGGACAATAAAATTAAATGATTATCTTATATAAACAAATAATCAAGTTTATTAAAACTATTATAAAGTCTACGTTAGTCTGATTAAAATATTTTATATAATTTTCTAACAAATTAAAAATACTTAATTTATCATAAATTAAAAGTTAATTATAGTTTTTTATTTAAAATGAATATTTAAAAAAATGTTCACGGACTGCGTATAAGACATTTATGGATATTTTTATTTCAAGAAAGGTTTTCTAACTTCAATATATGTATATGTAGATGAAGAACAAATTAAATGATACGACCAAATGGACGTTGGTAATCCAAAACCTTATAGTTTGCACGTTTTCTGCAAATATTACATGATTAGAAAATAAAGTTTATAATATGTTTATTTATATTTAGTAAATTCATCAAAGAAGCAAGGTTGTTGTTAGATAGAAGTAAGGACTGTGACATGGTTTATTAATAATTTCTAAATAAAACGTTTTAGTGCGCGTGACATGTTAATTTGTTTGGCATCTCCCCAAGTTGGGAAAAACATGATTATTGTCTAATCAATTGTCTCAAGGGACTTGACCAAATAACCCGATCTACTAGGATGCCTCACATTTGTGGTTGTTTCCAGATAAAGATGTTATTATCCAAAATTAAGGGGATGGAAGTCATGTATACACACTCAGCAGCAAGGAGGTGTAGACAAATCGAAGTAGGGTATAGATTTAGCTGGCGGGACTGCATTGGCTACGCTCTCGCACTGAACGAAATAGATATAATTGGTAAAATGCCAGAAAAGTGAATGGGGAAGAAGAGAAAAGGATGAAGGGGACCACAGAACAAAAGTCTTACCCTTTTAACGTCACTGCGAGGCTGAGGCAACAGAAACTACCAAATCTATCTCACTCAGATATTTCTAGCAAGACGGGAGTGGATTAACTGTTTTTTGTTTCTGATATACGATTAAATTTTGAAAAGCCCATGCTCATCCACAGGGCAAGTGGGTCACCACGAGAAATCGCTCTGATTAGAAATCCACCCAATAAGAAACCAGAGAATAGGATGAACTTTCCATGTTCTACCAATGAAAAATCAGATAAGGCGTTCCACCGTGGACCCCAAAGTTCACTCCCTTTCACTGTTAGAGGTCCCAAAAGTGCAAACCCAAACAATCTCTCCCTGTTAAATGGAATGCAAAAGCGTCTCCTGTGGGTC


Gene Sequence:
>Vu_31340(-)
ACCGTTCACACTCACACCCACCCTTTTTTCATCAAAATCATAATCATTGTATTGTATTCCCTCCTCTGTAGCCAAACCCACACTGTAACCAATCCTCCCGTTTCATATCTGCCTTCAAATTTTGTTTGAGTCTGATGAGTACGGCAAAGAACGCGGCAAACGCGGTTGGAGGCAAAACCGCAAGAGCATGCGACAGCTGCATAACCAAGCGGGCACGTTGGTACTGTGCTGCCGATGATGCTTTTCTCTGCCAAGCTTGTGACTCTTCGGTTCACTCCGCCAATCCTTTGGCTCGCCGACACGAAAGAGTCCGCTTGAAAACGGCGTCGTACAGGTCCACCGACGAACAACAACAACAACAACAACCTCCCACGTGGCCCACTAAGAAAGCTCGAACGCCCAGACACGGGAAACACTCTCGTAGCAACAACCCCTTCCATCTGGTCCCGGAAGTGGGTTCGGAAGAGGTGAATTCCCATGACGAGAACGAGGAGCAGCTTCTTTACAGGGTCCCCATATTCGAACCTTTTGTTGCCGAGCTATGTGGGAATAACAGCTCTTCTCCTTCTTCGGTGACTTCAACCGATCAAGGAGTAGCAGCTGCTGTGGCCGAGGCCGAAAACAAAGGGGTTGAGAGCAATGTTTTATATCACAGTAATAATGAGATGGAAAACTTGCACGGGATGCTTCCTTCCGATGCAGAACTTGCCGAGTTTGCGGCTGATGTTGAGAATTTACTGGGTAGGGGACTTGAAAACGAGTGTGTGGGGATGGAGGATCTGGGACTGATTGATGCGAAGGAGGAGGAGTGTTCGGTGGGTAGTGGGGAGGTGAAGGTGGAAGAGGAAGAGAGCCCTGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGTGGGAAGAGATGTATCGTTTGAGTTTAGCTTTGATTACGATACGTGTGAAGAGGTGAAGGAGAGGGTTTGTGATTTGGAATTGGGGAAGGAGAATGAAGAAGAACCGAGAGAGAATGATGAGGTGAAAAAGAAGAAGATATCGTTGCAGCTTGATTATGAGGCAGTGATTATCGCCTGGGCTAGCCAAAAGTCTCCCTGGACCACTCCTGACAAGCCAAACTTAGACCCCGACCAGTGCTGGCACGAATGCATCGTATGTACTATTCCCTTTCCTTTTTCATCTATCTTTTCTTATTAATTCTCACCAACTGTTAGATTCGCCCTAACTTGTTCGTCTTTGCATGTAGTATCAGTTATATTTGTATTAATCAGTTTTAATAAATTTTACTTAACAACGGTCAATGTATTAAAAAATTGTGTTGGAGGATTTTGGTTTTTGAAAAATTAAATTGAACATAGAATTTGGGGGTGATGTGATGTTTGTTTGTTTGTTTGAGTGACTAATGATGTTTAATTTAATTAAGCAGGAAAGTTATGGAAGGGGAATTCACGATTCTTATGGTGAAGTGGGTGGATTTGGGATTCATCCAGTGATAATTGATGGAGGCAGAGAGGCAAGAGTGTCAAGGTACAGAGAAAAGCGGCGAACAAGGTTGTTCTCTAAGAAAATAAGGTACGAGGTTAGGAAATTGAATGCAGAGAAGAGACCCAGAATGAAGGGGAGGTTTGTCAAGAGAGCTTCCTTTGCACCATCAACATTTCCCTTGCTAAATCATTAAGACCTCATTCAAGTTTTGTTTACTATTTATTTCCGAAATATTATATTTTTGCTTAGTGCATCCTAATGCTTTTCATTTTCTTTTCTCAGCTATTTGTACATAGCAATTTTGTTAAGTTAATAAATGCTCCAAATTTCTAATC