Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31326 LG8 46446634 46447765 PREDICTED: myb-related protein 340-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 46446661 missense_variant p.Pro296Leu
T/C 46446758 missense_variant p.Thr264Ala
C/A 46446773 missense_variant p.Ala259Ser
T/C 46446970 missense_variant p.His193Arg
G/A 46447016 missense_variant p.Arg178Cys
T/A 46447017 missense_variant p.Gln177His
T/C 46447018 missense_variant p.Gln177Arg
C/T 46447281 intron_variant
G/T 46447326 intron_variant
A/T 46447499 missense_variant p.Trp55Arg
T/A 46447653 missense_variant p.His38Leu
G/T 46447657 missense_variant p.Arg37Ser
G/A 46447661 synonymous_variant p.Ile35Ile
T/A 46447706 missense_variant p.Arg20Ser
A/G 46447730 synonymous_variant p.Asn12Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31326.1
MSTIAKRDLSSNEEDSELRRGPWTLEEDSLLIHYIARHGEGRWNMLAKSAGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNLTPQEQLLILELHSKWGNRWSKIAQHLPGRTDNEIKNYWRTRVQKQARQLNIESGSKRFIDAVKCFWMPRLLQKMEQNNSPSPHCSMTSMVNLGNSGEASMSSTSSSFNIPSVFSSSPPQREFIMDGANHLGTMSNPINPSPDSFPFSQLLGISEHPKSPPNVLENNVYSYPIQDNCYADTNNYGMEGLNMDPLSAMGTYDFPQFDFQSAGNGWMLDSVEDTTLWNMDAM*


CDS Sequence:
>Vu_31326.1
ATGTCCACAATTGCAAAGAGAGATTTGAGTTCTAATGAGGAAGACAGTGAGCTGAGAAGAGGACCTTGGACTCTTGAAGAAGACAGCCTGCTCATTCACTATATCGCTCGTCATGGTGAAGGTCGGTGGAATATGTTAGCCAAGAGTGCAGGGCTGAAGAGGACTGGAAAAAGCTGCAGACTCAGATGGCTGAATTATTTAAAACCAGACATTAAGAGAGGGAACCTCACTCCACAGGAGCAACTCTTGATCCTTGAACTCCATTCCAAGTGGGGTAACAGGTGGTCAAAAATTGCTCAGCATCTGCCGGGAAGAACAGACAATGAGATCAAGAATTATTGGAGAACAAGGGTACAGAAGCAGGCACGCCAACTTAACATTGAGTCTGGAAGCAAGAGATTCATTGATGCCGTGAAGTGTTTTTGGATGCCGAGGTTGCTCCAAAAGATGGAACAGAACAATTCTCCGAGTCCTCACTGTTCCATGACAAGCATGGTGAATTTAGGGAATTCTGGAGAAGCTTCTATGAGTTCAACGTCAAGCAGCTTCAATATACCCTCTGTGTTTTCATCGTCTCCTCCACAAAGGGAATTCATTATGGACGGTGCAAATCATCTTGGTACTATGTCCAACCCCATCAATCCATCCCCAGATTCCTTCCCATTTTCACAGCTGCTTGGAATTTCTGAACACCCCAAAAGTCCTCCCAATGTGCTTGAGAACAATGTCTACAGCTATCCAATCCAGGACAACTGCTATGCCGATACCAATAACTATGGCATGGAAGGCCTAAACATGGATCCCCTTTCAGCCATGGGAACTTACGACTTCCCACAGTTTGATTTTCAGAGCGCAGGGAATGGATGGATGTTAGACAGTGTGGAGGATACCACTTTATGGAACATGGATGCTATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_31326::LG8:46447765-46449765(-)
ATACTAAGAAAACTTGCTAAAAGAACTTGACTGTTTTAAAAATATCTTATTCTAAACCTAATACATGATCGAGGTCACGAAATACCTATAAGCCAGGAAAGATCCAAAACGACCTCCAACAACATCAATAACCTCTTTATCAGCTAGGCACCAATTCAAAACAGCTACTTAGCCACCTAAAGATAATTACCTTATCTTCAAGAAAAAAGATAATTATCCTATTTCAACACACATTAAAAGCATATAGAGCTCTACAACCTACGTAAGCCAAAAATCCTAATCATCTCATGTTAAATTCTTACGGACTTAAACAAGTTCAACTGAAAGTGACTTTTTTTCCCTGTACTAACTACGAATTTACATATAAAGCTCCATTATTGAAGTTTGGGACACCTCAGAGGCTAACCTTAAAATGTTAAGAGCTCCTTTAACCATTTACCCAGTTGATGAATTATTACATGCACAGATAATATAAAGAATTACTATATCAATACAGGATATTTTTGTTAACGTACAGTAATTACTGAAAAACTAAATCAACAATTATTTTTAATTATTTTGTATGCTTTTATATGAGTGGTAATTTTTTAAGACTTATATCAATAATGAGATTTTATTGGTCGAGACTTAAACTCTTAAAAATAACATATTCTCAATAACGTAACTGAGATAAGGAATTGTACTAATTATATATTAACGGTTTAACTCCTGAGGGCAATATAGTTCGGAGAATGAGTGAAACACGTGATAGGTAAGTAGTACATGATGTTAAGGGAAAGGAAGTGTAGTTACTTTTCTAAGGAGTCTTTTTCTGCGCAGGAAAAAAACAAGCATGGTAACACCACTGTGTGATTACAAAAAAAGTGAAGACCACTTACTTGTACAATGATGCAAAGGACAACTTTTGAGAGAGAACTCTCTCAGAATCAGAAAAATACAATCATTATGTAGAGTAGTAACGTAGCAGTGTATAGATTGAGAGGAGAATCTAATGGCAAAGAAAGATATGTGACAAGAATTTCTGGTTCTTCTACTGCTGTATAAAGTATTACCCTAGACTGGAAAAAAGGCATTCCGTTAGAGATATATGTGGGTTAAATTTTCCTTTCTTGAAAACGTAATTTTTATCTAGAACATTGGTTTCTCGTTCAGATATATTACGACAGATGGATACTGGATTCTCTAAAAGTTAAAAAAGAATATAACGGACTCTAATTAGTATATAGAGATTTCTTTAGTCATTAACATGGGATACATGTATACTTAAGAAAGAATCTTTGGCGTGTTTCTCTTGGATTCTGCAATCTTGAATCGATTCTTACAGCAAAAAGGTGCACCAAGAAAAAAAAAACACCGTGCTTTATAATCAAAATATTCCGCAGCTAATTTCTGCACGATCAATATTTACACGGTCAATTCTCCAAAATCTTGTCCTGAGGGTAGAGGAAAGTCTTTGATTTGCCCAGTTCCAAGTTAGTTAATCAACTTCTATAGTTAACAGCATAACCTTAATATATTCCCTCCTTTAGTAGCGGCTTTTTAGATTATGTGATGTTTGTTTAGTGGGAGATAATGGAGCAATGGACGGGTGGGGGTGTTTTGTTAACACTTGCAATTTAGCGTCTTTGTTCAGGGTGTTTTGCATAACTAAGGAATAGTATGGGTGGGACCTATTTTGAAAAAGGGCATAATAATATAATCACTCACAACTTCTGTTATTCCAAGAGCTAACGTATAGCCTCTTGTTCCCTAGTCTACCAAACCCATTTAACAAAATTCCGTGGGGAGTATATATATATATAGGCCCATGATGATGATGTAGAAACCCTCACAGAAACTCATTTCTAATTTGCTTGCCTCTACTGGTGTTAGCTTAAACTTTTTTCTCAGCAGTATCATACTCAAACCGTCCATAACTTTCTTTGCTCTTGCAAACACCAACTATAACTTGTGTGGCAATTCTTTTGCTGTGTTGAAAACCACAAAAACACAAACTAACC


Gene Sequence:
>Vu_31326(-)
ATGTCCACAATTGCAAAGAGAGATTTGAGTTCTAATGAGGAAGACAGTGAGCTGAGAAGAGGACCTTGGACTCTTGAAGAAGACAGCCTGCTCATTCACTATATCGCTCGTCATGGTGAAGGTCGGTGGAATATGTTAGCCAAGAGTGCAGGTACAGATTCCACGTACGCTTAAAGTTAGAGGAATAACTTCATTCACTTTCACTTGTAACTGTTCTATACCTTTCTAACATTATTCCAATCCAACATCTCAGGGCTGAAGAGGACTGGAAAAAGCTGCAGACTCAGATGGCTGAATTATTTAAAACCAGACATTAAGAGAGGGAACCTCACTCCACAGGAGCAACTCTTGATCCTTGAACTCCATTCCAAGTGGGGTAACAGGTAACCGATATTCAATGATCTGTCCCAAAAATGAGTATTTATGCACTCAAAATTAGCCTTGTTGAACAAATCACAATGAGTTTGACAAGCTTTTGCTGTTGGTTGGGGACAGGTGGTCAAAAATTGCTCAGCATCTGCCGGGAAGAACAGACAATGAGATCAAGAATTATTGGAGAACAAGGGTACAGAAGCAGGCACGCCAACTTAACATTGAGTCTGGAAGCAAGAGATTCATTGATGCCGTGAAGTGTTTTTGGATGCCGAGGTTGCTCCAAAAGATGGAACAGAACAATTCTCCGAGTCCTCACTGTTCCATGACAAGCATGGTGAATTTAGGGAATTCTGGAGAAGCTTCTATGAGTTCAACGTCAAGCAGCTTCAATATACCCTCTGTGTTTTCATCGTCTCCTCCACAAAGGGAATTCATTATGGACGGTGCAAATCATCTTGGTACTATGTCCAACCCCATCAATCCATCCCCAGATTCCTTCCCATTTTCACAGCTGCTTGGAATTTCTGAACACCCCAAAAGTCCTCCCAATGTGCTTGAGAACAATGTCTACAGCTATCCAATCCAGGACAACTGCTATGCCGATACCAATAACTATGGCATGGAAGGCCTAAACATGGATCCCCTTTCAGCCATGGGAACTTACGACTTCCCACAGTTTGATTTTCAGAGCGCAGGGAATGGATGGATGTTAGACAGTGTGGAGGATACCACTTTATGGAACATGGATGCTATGTGA