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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31307 LG8 46215899 46217932 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 46216021 downstream_gene_variant
T/C 46216055 downstream_gene_variant
A/G 46216109 downstream_gene_variant
A/G 46216110 downstream_gene_variant
G/A 46216119 downstream_gene_variant
G/A 46216187 downstream_gene_variant
C/A 46216323 downstream_gene_variant
A/T 46216452 upstream_gene_variant
T/A 46216568 upstream_gene_variant
C/A 46216633 splice_region_variant&intron_variant
C/T 46216658 missense_variant p.His59Tyr
A/C 46216717 synonymous_variant p.Thr78Thr
G/A 46216720 synonymous_variant p.Pro79Pro
A/G 46216835 missense_variant p.Ile118Val
G/A 46217753 missense_variant p.Arg393His
T/A 46217844 synonymous_variant p.Ile423Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31307.1
MVVQVVLSKDCDECYNHRGGQCYLDRDHQFYCHKEPKHSSKTLRLVLGLVTGLCVILLAIVLTGCLVFRRKRTPSGPQHRSRNADTDSIGPSSNPDPENCRFYYRVPLFSYKELKEATYNFHNTRQLGSGGFGTVYYGKLLDGREVAIKRLYEHNYRRVEQFMNEVHILTRLRHTNLVSLYGCTSHRSRELLLVYEHVPNGTVACHLHGDFARPHTLPWHIRMKIAIETASALCYLHASDIIHRDVKTKNILLTQSFSVKVADFGLSRLFPNDVTHVSTAPLGTPGYLDPEYHECYQLTSKSDVYSFGVVLIELISSKPAVDMSRHRDEINLANLAMKKIQQSAFSELVDPSLGFDSDSEVKRMMISVAELAFQCLQRDKDLRPSMDEVLKVLVRIENDMPEHLDEEQLSPPSLPSPDWDENGLLKNLTVQLSPKAVTDRWHSESTASNASA*


CDS Sequence:
>Vu_31307.1
ATGGTTGTTCAAGTAGTATTATCTAAGGATTGTGATGAGTGCTATAATCACAGAGGAGGTCAATGTTATCTTGACCGCGATCATCAGTTCTACTGTCACAAAGAGCCAAAGCATAGCAGTAAAACTTTGAGGCTGGTACTTGGACTTGTAACAGGTTTATGCGTGATATTATTAGCCATAGTGCTAACTGGATGCCTTGTATTTAGACGAAAACGCACTCCTTCAGGTCCTCAACACCGATCGAGAAACGCAGACACTGATTCAATTGGTCCCAGCTCAAATCCAGACCCCGAAAATTGCAGGTTCTACTACAGAGTCCCTCTCTTCTCTTACAAGGAGCTTAAAGAAGCTACATACAATTTCCACAACACCAGGCAACTTGGAAGTGGAGGCTTTGGAACCGTTTACTATGGAAAACTGCTAGATGGACGAGAAGTTGCTATCAAGCGTCTCTATGAGCACAACTATAGGCGAGTTGAACAGTTCATGAACGAAGTTCACATCCTCACTCGCTTGCGCCACACAAATCTGGTGTCCCTCTATGGCTGCACTTCACATCGCAGTCGTGAGCTACTGCTCGTGTACGAACACGTTCCAAATGGCACTGTTGCTTGCCATCTCCACGGTGATTTTGCAAGGCCACACACTCTTCCATGGCACATAAGAATGAAAATTGCGATAGAGACCGCAAGTGCATTGTGTTATCTCCATGCTTCTGACATCATCCACCGTGATGTCAAAACCAAAAACATTCTCCTTACCCAAAGTTTCAGTGTTAAGGTTGCTGACTTTGGTCTTTCAAGGCTGTTCCCGAATGATGTCACACATGTCTCCACTGCTCCACTAGGGACCCCAGGTTACCTTGATCCGGAATATCACGAATGCTACCAGCTTACAAGCAAGAGTGATGTGTACAGTTTTGGGGTTGTGCTTATTGAACTGATATCTTCTAAGCCAGCTGTTGATATGAGCAGGCATAGGGATGAGATAAACTTGGCTAACTTGGCAATGAAGAAGATTCAGCAAAGTGCATTTAGTGAGCTGGTTGATCCTTCTCTTGGTTTTGATTCGGACAGTGAGGTAAAGAGGATGATGATTTCAGTGGCAGAATTGGCCTTTCAGTGTTTGCAACGAGACAAAGATTTAAGACCTTCAATGGATGAGGTTTTGAAGGTGCTCGTGAGAATTGAAAATGATATGCCTGAGCATCTGGATGAAGAACAATTAAGTCCACCCTCTCTACCTTCACCAGATTGGGATGAGAATGGATTATTGAAAAACTTGACGGTACAACTTTCACCTAAAGCCGTCACTGATAGATGGCACAGTGAATCTACTGCCTCTAATGCCAGTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_31307::LG8:46213899-46215899(+)
ATTTATTTAGACATTTATTTATTTTATTTAAAAAGGAAAAATCTTTTTAATTGTTGACTGAAAATATTCTTCATAAAAAAAAATAATTGTTGTTAAAATTAAGATTTTGGTAATTAATGTAACTGAGAAGACTACATTTTCATTTCATACTCTCTTAGACATGTAAGTTTTCATTAAAAGTGAAAAAAAAAAATGTTTCCACGATATATTATTTTTAAATGCACCAATATTTATAAAATAATACATTAATATTACTTAAAATCTTGGAGATGTATGGGTAAATTTATTCATCCACATTCTAAACAAAAAGTTTTAAAAGTTAAAATATAATTTGTAAAATTTCTCTTAAGTTTCTTTAAATTTTGATTTTTAAGTTGATAAAAAATTAGGTTTAACTTGTGAAAGAATTTGATTATTTTTATTTTTTCTTTTTCTATATGTCATTGATTGGTCCAAAATTACTCCACAATCAATAATAATAATAATAATAATAATCATAAACACTAATATAGACCAATCACAGAATGACACATAGATGATATTAAAATGCTGTCAAAAAATCTTGTCAAAGTATCGTTATCTTTTTGTTAACATCCACTTTTCCGTAAATGGTATTTTCATGAATAAAAGAATTAATACATATTTGGACAAGTTTATTATAACATATTATATAAAACAAGAAATAAATAAATAAACTAGCTTTCATAAAGCTAATATATTTCAGTTTAATATTTTATGTACTTTTATTTGTCAATTGATATATTGTAAACCCAGTTAAATTCAGATGAGCATACAGAAAGATCTTTGTAGCGATGGCTGAAATTCTCTACTTCTTTCCTTTTGAGAAATCCTGAAATGTTGAAATCTACTGGAGACTTTCTCAAGACGCGTTTTCTATAACATTTAAGACTCATACTTGTGCCCGTCACTTTGACACAACCCTCCGTCACTATCCACAAAACCTATTCTCATTTCCTGTTTCATTACCACATGTGTTAAATCTAATCTCTTTTTTAATTATCCATCAAAATCAATAGTATAATGCATATGTAGAAAATATCGAACTCTTTCGATTACCAAATACTGACGTTCAAAGTTCACCTATGTGGATTTTTCGGAAGAGTCAATTCCAGTCCTGTGTTTGTGTGAATATGCTTTTTTTTCCAAGTCTTCCATACTCTCATCTTCCAAGTCAACTTGCCAATCAAAGACGTTCTTTAGATTAGTTCGTTCATGACATGTATATATTGTGAATGGGGTGAGACTATGCAAGATTAAGAACACTGAGCATAACATCATTCATAGAGAATCCGCTCACTGTTAAGAGATTTCATCACTTGTTCCTTAAAATATTGTTTTACCAGCTGCTAGCAATTGGGAATTTGGTATGGCTATCGTATATTTGTTCAACTTCCTCTTGTTTTATCACCTTCTACTCATCCTCTGTGCTGGTTATGGATATGGGCACCAAGGTTGTCCACACTCCTTTACTTGTGGCAATCTTGGGTCTTTCCATTACCCTTTTACCAAGGCAGAACAACCAGACTGTGGCTTGATACCCATACATGGTTGTGATAATCCTCTATCAATCCAAAAATTGATCCAGCTGGAGAAAAATGGAAACTACTTTGTGCTTACAGGCAACATTCAGCAGGATGGGATTTCAATTTCGGATGAAGATTTGCACCGGCGTTTACAAAACAACATCTGTGACACTTTGAATAATAGCTACAGTCTTCAATCCCATTCTCCTTTATACTCTTATTATATAAAATATAATGTGACACTGTTCCGATGCAAACATGACCTCAATATGAAACCCCCACCACATTATTTTAATCATTCCTGCACTGAGTATGGTTATGATATCTATTATGACAGCCTTTCCTTACCAAGGAATGATGAAGCTCATAAACTTTTCTCATCCTGCTCAGTTCTTCACTTAGCAAAAAAGGACAAGGCCGATACCACAAACATTCTATCGTTTTTATCTGCTCAGA


Gene Sequence:
>Vu_31307(+)
ATGGTTGTTCAAGTAGTATTATCTAAGGATTGTGATGAGTGCTATAATCACAGAGGAGGTCAATGTTATCTTGACCGCGATCATCAGTTCTACTGTCACAAAGGTCAGCTTCGCATAGATCTATTTTATGTTCCTTTATCCATTGAATGTTTCTTTTCGGTACATTGAGTTTTCTGAATCAGACCACTGAGATTGTCACCAATGAAGGATAATTTTAGAGGTAGCTGCACCTATTTTTATTATTCTTTAAAAAATTATTGTTCTTGATTGACCATTTAATGATTTCCTGTTTAGCACTTCAGTGGCAACTTGGCAAGAGTCAAGCTGATTACTGAATGTTAACTTTTTTTCTGTTTACCAGAAATCAAGAGCTAATTCTCAACGTAAATCCACATTTAAAATACTAATCTCTTCCGAAAAATTTCCATGTACCGTGCTTTACTTTACTCGCACCAAGGCAAATTGGCAATTAGATCAGACTGTCGTAATTTTATGTTCTAATGTTAGTCTAAAACTTCATTACTTCATTGTTTACTAAACTTTCTTCAATAATAGCTTCATCTGCAGAGCCAAAGCATAGCAGTAAAACTTTGAGGCTGGTACTTGGACTTGTAACAGGTAAGTTAGTAATATATATATTTTATTTAATCCATGCCTGGGAGTGGGAGTTCGTATTTGTGGAAGTATTGTATCTTCAAAGTTTTTCCCGATTAATATTTGGTATCTCATCATTGCAGGTTTATGCGTGATATTATTAGCCATAGTGCTAACTGGATGCCTTGTATTTAGACGAAAACGCACTCCTTCAGGTCCTCAACACCGATCGAGAAACGCAGACACTGATTCAATTGGTCCCAGCTCAAATCCAGACCCCGAAAATTGCAGGTTCTACTACAGAGTCCCTCTCTTCTCTTACAAGGAGCTTAAAGAAGCTACATACAATTTCCACAACACCAGGCAACTTGGAAGTGGAGGCTTTGGAACCGTTTACTATGGTAAACCGTTCTCTCACCTTCATGTTATATACTTGTACAGATTTTGTGTGAATGAGTTGTAACCAGTGATTGATATGGTGTTTAACAATCAGGAAAACTGCTAGATGGACGAGAAGTTGCTATCAAGCGTCTCTATGAGCACAACTATAGGCGAGTTGAACAGTTCATGAACGAAGTTCACATCCTCACTCGCTTGCGCCACACAAATCTGGTGTCCCTCTATGGCTGCACTTCACATCGCAGTCGTGAGCTACTGCTCGTGTACGAACACGTTCCAAATGGCACTGTTGCTTGCCATCTCCACGGTGATTTTGCAAGGCCACACACTCTTCCATGGCACATAAGAATGAAAATTGCGATAGAGACCGCAAGTGCATTGTGTTATCTCCATGCTTCTGACATCATCCACCGTGATGTCAAAACCAAAAACATTCTCCTTACCCAAAGTTTCAGTGTTAAGGTTGCTGACTTTGGTCTTTCAAGGCTGTTCCCGAATGATGTCACACATGTCTCCACTGCTCCACTAGGGACCCCAGGTTACCTTGATCCGGAATATCACGAATGCTACCAGCTTACAAGCAAGAGTGATGTGTACAGTTTTGGGGTTGTGCTTATTGAACTGATATCTTCTAAGCCAGCTGTTGATATGAGCAGGCATAGGGATGAGATAAACTTGGCTAACTTGGCAATGAAGAAGATTCAGCAAAGTGCATTTAGTGAGCTGGTTGATCCTTCTCTTGGTTTTGATTCGGACAGTGAGGTAAAGAGGATGATGATTTCAGTGGCAGAATTGGCCTTTCAGTGTTTGCAACGAGACAAAGATTTAAGACCTTCAATGGATGAGGTTTTGAAGGTGCTCGTGAGAATTGAAAATGATATGCCTGAGCATCTGGATGAAGAACAATTAAGTCCACCCTCTCTACCTTCACCAGATTGGGATGAGAATGGATTATTGAAAAACTTGACGGTACAACTTTCACCTAAAGCCGTCACTGATAGATGGCACAGTGAATCTACTGCCTCTAATGCCAGTGCTTAA

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