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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31296 LG8 46110596 46113334 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 46112802 missense_variant p.His67Gln
G/C 46113082 5_prime_UTR_variant
T/G 46113101 5_prime_UTR_variant
G/A 46113302 5_prime_UTR_variant
A/T 46113307 5_prime_UTR_variant
G/T 46113329 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31296.1
MFPFVLLFYFFLLCCNSIAPLVHSLNAEGSVLLTLKQSLTDPQGSMSNWNSSDENPCSWNGITCKDHNVVSISIPKRKLSGSLPSSLGSLSQLRHVNFRNNKLFGDLPTQLFQAQGLQSLVLYGNSFSGPVSSEIQNLRYLQTLDLSQNFFNGSLPAAIVQCKRLKSLVLSQNNFSGSLPDGFGTDLSSLERLNLSFNHFNGSIPSDLGNLSSLQGTVDLSHNHFSGSIPASLGNLPEKVYIDLTFNNLNGPIPQNGALMNRGPTAFIGNPGLCGPPLKNSCGPDTPSAGSPPSFPFIPNNSSAEGSMGSEKNKGLSTGAVVSIVVGDIIGICLLGLLFSFCYSRVCGFNQDLDEDGINKGSKGRKECFCFRKDESEALSDNNVEQYDLVPLDSHVTFDLDELLKASAFVLGKSGIGIMYKVVLEDGLALAVRRLGEGGSQRFKEFQTEVEAIGKLRHPNIATLRAYYWSVDEKLLIYDYISNGSLDTAIHGKAGLLTFAPLSWSYRLKIMKGTARGLVYLHEFSPKKYVHGDLKPSNILLGHDMEPHISDFGVGRLANIAGGSPTLQSNRVAAEKQHGRQKSISTEVSTGVMGNGYMAPEALKVVKPSQKWDVYSYGVILLEMITGKPSIVQLGNSEMDLVQWIQFCIEEKKPLVEVLDPYLAEDADKEEEIIGVLKIAMACVHSSPEKRPTMRHVLDVLDRLTISSD*


CDS Sequence:
>Vu_31296.1
ATGTTCCCTTTTGTTTTGTTGTTTTACTTTTTCCTTCTTTGCTGCAACTCTATTGCACCTTTGGTGCATTCTCTGAATGCCGAAGGCTCTGTGCTTTTGACACTAAAGCAGTCGCTCACCGACCCTCAAGGCTCCATGAGTAACTGGAATTCCTCTGATGAAAACCCTTGTTCATGGAATGGGATCACTTGCAAGGACCATAATGTTGTGTCCATCAGCATCCCGAAGAGGAAACTCTCTGGCTCTCTCCCTTCTTCTCTGGGATCTCTCTCCCAGCTCCGCCATGTCAACTTCAGGAACAACAAGCTTTTCGGAGACTTGCCTACACAGCTCTTTCAAGCTCAGGGACTGCAAAGCTTGGTGCTTTATGGTAATTCATTTTCTGGGCCTGTTTCTAGTGAGATTCAGAATCTCAGGTACCTTCAAACTCTAGATTTATCACAAAATTTCTTTAACGGGTCATTGCCTGCTGCAATTGTCCAATGCAAGAGACTCAAGTCCCTTGTTCTCAGTCAGAACAATTTCTCTGGCTCCTTGCCAGATGGGTTTGGCACTGATTTGTCTTCTCTGGAAAGGCTAAACCTTTCTTTCAATCACTTCAATGGGTCAATTCCCAGTGATTTGGGAAATCTGTCAAGCCTGCAAGGAACTGTTGATTTGTCTCATAATCATTTTAGTGGTTCAATTCCAGCCAGCCTTGGTAATCTGCCTGAGAAGGTTTACATTGATCTTACTTTCAACAATTTAAACGGTCCAATTCCTCAGAATGGTGCTTTAATGAACAGAGGACCAACTGCCTTTATTGGCAATCCTGGTCTATGTGGTCCTCCTTTGAAGAATTCATGCGGTCCTGATACTCCATCTGCTGGTTCACCTCCATCGTTTCCATTTATTCCAAATAACAGTTCGGCTGAGGGTTCCATGGGAAGTGAGAAAAATAAAGGGCTAAGTACGGGAGCTGTGGTTAGCATTGTTGTGGGTGATATAATTGGAATTTGCCTCTTAGGTTTGCTGTTCTCTTTTTGCTACTCGAGGGTTTGTGGTTTTAACCAGGATCTTGATGAAGATGGAATTAACAAGGGAAGCAAAGGGAGAAAAGAGTGTTTCTGCTTCAGAAAGGATGAATCCGAGGCCCTGTCTGATAATAATGTTGAGCAATATGATCTTGTCCCATTAGATTCCCATGTGACTTTTGATTTGGATGAGCTTCTCAAGGCTTCGGCTTTTGTTTTGGGTAAGAGTGGAATAGGGATTATGTACAAAGTGGTGCTTGAAGATGGGCTTGCTTTGGCTGTGAGGAGATTGGGGGAGGGAGGTTCTCAAAGGTTTAAAGAGTTCCAAACCGAGGTAGAAGCAATAGGGAAGTTAAGACATCCAAATATTGCAACTCTGAGAGCCTATTACTGGTCTGTTGATGAGAAGCTTCTCATATATGATTATATATCCAACGGAAGCCTTGATACAGCAATTCATGGGAAGGCTGGACTTCTGACATTTGCACCACTTTCTTGGTCCTATCGATTGAAGATCATGAAAGGAACCGCAAGAGGATTGGTCTATCTGCATGAATTTAGCCCCAAAAAATATGTACACGGAGACCTGAAGCCAAGTAACATACTTCTTGGACACGACATGGAACCCCACATTTCTGACTTTGGAGTTGGGCGCCTTGCAAACATTGCTGGAGGGTCGCCAACCTTGCAATCCAACCGAGTGGCTGCAGAGAAACAACATGGAAGACAAAAGAGCATCTCCACTGAAGTCAGTACCGGTGTGATGGGAAACGGTTATATGGCTCCAGAAGCACTGAAAGTTGTGAAGCCATCACAGAAATGGGATGTTTACTCATATGGAGTGATATTGTTGGAAATGATCACAGGAAAACCATCGATTGTCCAGTTGGGGAACTCAGAAATGGACCTTGTTCAGTGGATTCAGTTCTGCATTGAGGAAAAGAAGCCACTCGTGGAGGTGTTAGACCCTTACTTGGCAGAAGATGCAGATAAGGAGGAGGAGATTATTGGAGTTTTGAAGATTGCAATGGCTTGTGTCCATAGCAGCCCTGAAAAGAGACCTACGATGAGGCACGTGCTTGATGTTTTGGATAGATTGACTATTTCCTCTGATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_31296::LG8:46113334-46115334(-)
ATAATAATAATAATATGTTGTATATAATGGTTATAATAATATATATTACATATAAAATAATAATAGATTAATTTTTTACCTGAAGAAAAAATAATAATTTTATATTTTAATCTATTAATAATTTTTTATTTATTATACAAATCAAATCACTGAATAACTTTACTTTAAAATTAATTTATTTTTATCTACAAATAACAAAAAAATTATTTCAAAATTGACTTAAATTAATCTATTTATTTTTATTCAAATCCATAAGACAACCTCATAAATAATTATAAGTTCAAAAACAATTACAATCAAATTCATCTATTTATTCTTATTCAAATCCATAGCACAACCTCATAAACAATTACAAGTGTTGGGTAGAGGGCATTACATTTTAAAGAGAGGTATTTACATTAGGAACGACTAGTAATAAATTTGAAGTAGATAAGAAGAGTGAGTTGAAAGGAATTATTTTTTTTGATCTGGGTAGTATGGTTTGTGTTGACTTGAATGAAAAATAGGGTTTGTTAGAAAGAAACCTAATACTAAAACATTAAAGAAGTGTACGGAAGGTCGATATAGAGAGTTATTCTGATAGTCACGAGCATAGGTAGCTGTTGCATGAGTGTTAATAACAAGAAAGGATGATGCAGACTCTCAAAAGTGGTAAGGTGGTAAAACAATGGAGAGGGATGTGGACATTAAATAAAAATAATAGATGTGCATGAAGCAAATAATAGAGGAGAAATGGACCTTTTTCAATTTTTTTATTTTTCAATTCCATGAGCTTTTAGTACTCTACAAAGGGGTGACATTTATTTTCTTAAAAGCTGATAAAAAGTAATATAGTCTTTTATCCTTAAAGGGAAACAAAGTAAGAAAATACATGTTGATAGCTGTTGATACATGAATACATAACTAAAAACTTATACCTGGTAACTTCCCATCTAGTGATTCAAAATAAAATATATAATTGTTTCATTCATTATATATATATTTTTTCATTTTATAAGCTTTTGTATCAAGTATGATAGAGATTTTCCAAACATACAAAAAATAAATTATATATTAACTAGTGAAAATATATGGACTATGTTTATGGCTGTTATTTTTTATGATAAGTAACTTTTTTTTAAAGAGAACAACCATGTTTAATAGAATATGCAAAGGTTTAATAGAATATTGTTTACAGAGAACAATCATGGCTGTCAATTGTTGTGGTCCTCAAAGTCACGTAACTATTCATTCTTCTTTTCCAGTTTAGAGGTTTTTAATTTTTTGCTTTTTTATTTATTGTGGTGGGTATTAATATTCATGATCTGATTAACTAAATATTGGGATCTGACCAAAACGCGATAAACAGGAACAAGTACAAAATGTGCACTGTAATGTGTGTTAATTATAATTAGAAATAATAAGAAAGTGGCACGCGCGCCCAAATTAGAAAAAAAATATATGTATTTATAAGACAATAATTACGATGAAAAATTAAACAAAAAGGACTCAGTTGAAAAATATAACAATATTAAATATTCAATAGACTAAAAAAAATTAATATAAATTTAATATATATATATATATATTTATCACAACTTAATCTTATTCAAATTTTAAAATCTAATTAAATAATTACTAATATATAAATTAGCATTTATGATATGATATGTAATATAAAACATGGCAATTAAGTATACAAAAAAAAATTACACTAAAAAAAACTAGAACGGATTTCATTATCAAAATTTAGACAATGTAAAATATCCATAATTACTTAAAACACAAGAAAGTTAACATATAATAAGGTTAAAATTCATTCAAAACATTGAATGTATACATTCTCACCATTTTATGTGATAATTATCCTAATAAATAATTTTATTCGATTTTAATTTTTTTTATAAAAAATGACTTTTAAAAACTAACAATTTAGAATTACAGTAAGTTTCAGTTAACTTTTTAAGTATTTTTTTCTTTACCATTTTGCATAAAACAAATATCGGGAGAATTTGGGAATG


Gene Sequence:
>Vu_31296(-)
ATACTCGTGCGGCGAGTTTTTTCTCTCTATCTCTCCCTCTCTCTTCACTGTCTCTCACAAACAACCTGGTAACTCTCCCCGAGGCTTTGGTCTCGCTTTCCCATTCTTCAACACTTCTTTTTCTCACTTTACTGTTTAAGCCTTTCTCTCCCCTCCACCACAGCCTAGCTTGCATTGTCTTTCTGTCTGTCTTTCCCCTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTCTCTTCTCTTTTCCATAACTCTAAACCAGTTTACACTAACCTTGCTCACTACCTTCTTCTTTCTCTTCGCTTTAGGATTTGCTCCAACGGTCTCTTAGTTGGAGGAGCTAGAGATGTTCCCTTTTGTTTTGTTGTTTTACTTTTTCCTTCTTTGCTGCAACTCTATTGCACCTTTGGTGCATTCTCTGAATGCCGAAGGCTCTGTGCTTTTGACACTAAAGCAGTCGCTCACCGACCCTCAAGGCTCCATGAGTAACTGGAATTCCTCTGATGAAAACCCTTGTTCATGGAATGGGATCACTTGCAAGGACCATAATGTTGTGTCCATCAGCATCCCGAAGAGGAAACTCTCTGGCTCTCTCCCTTCTTCTCTGGGATCTCTCTCCCAGCTCCGCCATGTCAACTTCAGGAACAACAAGCTTTTCGGAGACTTGCCTACACAGCTCTTTCAAGCTCAGGGACTGCAAAGCTTGGTGCTTTATGGTAATTCATTTTCTGGGCCTGTTTCTAGTGAGATTCAGAATCTCAGGTACCTTCAAACTCTAGATTTATCACAAAATTTCTTTAACGGGTCATTGCCTGCTGCAATTGTCCAATGCAAGAGACTCAAGTCCCTTGTTCTCAGTCAGAACAATTTCTCTGGCTCCTTGCCAGATGGGTTTGGCACTGATTTGTCTTCTCTGGAAAGGCTAAACCTTTCTTTCAATCACTTCAATGGGTCAATTCCCAGTGATTTGGGAAATCTGTCAAGCCTGCAAGGAACTGTTGATTTGTCTCATAATCATTTTAGTGGTTCAATTCCAGCCAGCCTTGGTAATCTGCCTGAGAAGGTTTACATTGATCTTACTTTCAACAATTTAAACGGTCCAATTCCTCAGAATGGTGCTTTAATGAACAGAGGACCAACTGCCTTTATTGGCAATCCTGGTCTATGTGGTCCTCCTTTGAAGAATTCATGCGGTCCTGATACTCCATCTGCTGGTTCACCTCCATCGTTTCCATTTATTCCAAATAACAGTTCGGCTGAGGGTTCCATGGGAAGTGAGAAAAATAAAGGGCTAAGTACGGGAGCTGTGGTTAGCATTGTTGTGGGTGATATAATTGGAATTTGCCTCTTAGGTTTGCTGTTCTCTTTTTGCTACTCGAGGGTTTGTGGTTTTAACCAGGATCTTGATGAAGATGGAATTAACAAGGGAAGCAAAGGGAGAAAAGAGTGTTTCTGCTTCAGAAAGGATGAATCCGAGGCCCTGTCTGATAATAATGTTGAGCAATATGATCTTGTCCCATTAGATTCCCATGTGACTTTTGATTTGGATGAGCTTCTCAAGGCTTCGGCTTTTGTTTTGGGTAAGAGTGGAATAGGGATTATGTACAAAGTGGTGCTTGAAGATGGGCTTGCTTTGGCTGTGAGGAGATTGGGGGAGGGAGGTTCTCAAAGGTTTAAAGAGTTCCAAACCGAGGTAGAAGCAATAGGGAAGTTAAGACATCCAAATATTGCAACTCTGAGAGCCTATTACTGGTCTGTTGATGAGAAGCTTCTCATATATGATTATATATCCAACGGAAGCCTTGATACAGCAATTCATGGCAAGTTTTGTTAAATACAATTTTTTTCTTTTCCTTTTTTTCCACTTTGTGGCAATGACTGATCTTTTGGCTTAACCTAACACTTAGTTTTTGTTCATTTGTTTGTCTGGTTCGATTTTATATCTCCAGGGAAGGCTGGACTTCTGACATTTGCACCACTTTCTTGGTCCTATCGATTGAAGATCATGAAAGGAACCGCAAGAGGATTGGTCTATCTGCATGAATTTAGCCCCAAAAAATATGTACACGGAGACCTGAAGCCAAGTAACATACTTCTTGGACACGACATGGAACCCCACATTTCTGACTTTGGAGTTGGGCGCCTTGCAAACATTGCTGGAGGGTCGCCAACCTTGCAATCCAACCGAGTGGCTGCAGAGAAACAACATGGAAGACAAAAGAGCATCTCCACTGAAGTCAGTACCGGTGTGATGGGAAACGGTTATATGGCTCCAGAAGCACTGAAAGTTGTGAAGCCATCACAGAAATGGGATGTTTACTCATATGGAGTGATATTGTTGGAAATGATCACAGGAAAACCATCGATTGTCCAGTTGGGGAACTCAGAAATGGACCTTGTTCAGTGGATTCAGTTCTGCATTGAGGAAAAGAAGCCACTCGTGGAGGTGTTAGACCCTTACTTGGCAGAAGATGCAGATAAGGAGGAGGAGATTATTGGAGTTTTGAAGATTGCAATGGCTTGTGTCCATAGCAGCCCTGAAAAGAGACCTACGATGAGGCACGTGCTTGATGTTTTGGATAGATTGACTATTTCCTCTGATTGAGAAATTTCAGGCAGCTGTGCACTGTGAATGCAGCTCATTTGTGAATCTTTTACCTTTACTCTCTTGTGTTGGTCATGTTTAACAATGTCTTCAACCTGATGAATCCTTGTAATTGGAGTACTAGAAGAGAAATTTAATTTGTTTCAGC

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