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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31285 LG8 45989196 45991554 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 15
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09143 Cell growth and death   C 04218 Cellular senescence [PATH:ko04218]
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31285.1
MLNKDACSPSSNGGFGPAAVSGQLPSNGGYGSLYSALSNDNLPSLSANCSNGGGVSLYPYSDSTTQYDSCVIQKHQDMVNRQSMCLNRLVETSKEVDALRQENGQLRAANKELQKQLHLVIQASLESQYAAAGSGSSGQTQPTLFDVLHGFRSLHIGEGKENYADWNNNNNHNHNNILNNNNNKDLQEASDESPTSVMENNVVEVERFSLPKSISVRSNGYLKMAQSAALATNNNVTRNKGATRPRATATPPEAVQKVYVRGGQKEEEPLEMVVYNQGMFKTELCNKWQETGTCPYGDHCQFAHGIGELRPVIRHPRYKTEVCRMVLAGVVCPYGHRCHFRHALTEQEKAVVSQPKPRTMKLER*


CDS Sequence:
>Vu_31285.1
ATGCTTAATAAGGACGCTTGCTCTCCCTCCTCCAATGGCGGATTCGGCCCCGCTGCCGTCTCTGGTCAATTGCCGTCAAACGGAGGCTACGGTTCGCTGTACTCAGCTCTGTCGAACGATAACCTTCCTTCGCTCTCCGCGAACTGCAGCAACGGAGGCGGCGTTTCGCTGTACCCATACTCGGACTCAACAACTCAGTATGACTCGTGCGTGATTCAGAAGCACCAGGACATGGTGAACCGTCAAAGCATGTGCCTGAATCGCCTGGTGGAGACTTCCAAAGAGGTGGATGCTCTGAGGCAGGAGAACGGTCAGCTCCGGGCAGCAAACAAGGAGCTGCAGAAGCAGCTGCACCTCGTCATCCAGGCTTCGCTGGAGAGTCAGTACGCCGCCGCCGGCAGTGGATCCTCCGGCCAGACTCAACCGACGCTGTTCGACGTCTTGCATGGCTTCCGCAGCCTCCACATTGGGGAAGGCAAAGAGAATTATGCCGATTGGAATAACAACAATAATCATAATCACAACAATATTTTGAATAATAATAATAACAAGGACCTGCAGGAAGCGTCAGACGAGAGTCCAACGAGCGTGATGGAGAATAACGTGGTGGAGGTTGAGAGATTCTCGCTCCCTAAGAGCATATCTGTGAGGTCCAATGGCTACTTGAAGATGGCTCAGTCTGCTGCTCTTGCCACCAATAATAATGTAACTCGCAATAAAGGTGCCACTCGCCCACGCGCCACCGCAACTCCACCTGAAGCCGTTCAGAAGGTGTATGTGCGGGGAGGGCAGAAAGAGGAAGAGCCTCTGGAAATGGTAGTGTATAACCAAGGGATGTTCAAAACTGAGCTGTGTAATAAGTGGCAGGAAACTGGTACATGCCCATACGGAGACCACTGCCAATTTGCTCACGGTATTGGGGAGCTTCGCCCAGTCATCCGCCACCCACGCTACAAAACCGAGGTCTGCAGGATGGTCCTTGCGGGGGTTGTGTGCCCATATGGCCATAGATGCCATTTCCGCCATGCACTCACTGAACAAGAGAAAGCTGTCGTATCACAGCCTAAGCCCAGAACAATGAAGCTGGAAAGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_31285::LG8:45991554-45993554(-)
ACACGTGGGAAAGAGTTTATGTATTGGCCATTGAGAAAGAAATCAACGTGAGGATTTTGAATAAGTGTTATTTTATTCAACAAACATTTTGATACCAGATTTTGATGGAGTAGCGATTAGAGGAAGAGGTTGTTGTAAATGTGATAAAGAAGCAATCCCTCTAACCAAATAGAAAGACCATGATTTCTTTTCTTTTCTTTTCTAAATGAATGTCAACCTGTCTTAATCCACTTCATGACTTGAAAATGGGAAACCAAAGCCTAGACCACCAGCCAGTACCCTCCTTCAAACTAACTTCAAATTCAAGCATTATATAATCAAATGCTGCCCTAACCGCAACTGCACCTTGAATACGCCCTCTAAACTGTCTTCGCCTCTTATATTATCTTTCTGTTAGAACCAAAGTTTATTTTTTCTATTTATGTCTATCTTCAAAACCAACAATAAATCATACAACGTGGACCCCCATCTACCAATTTTATGTCATTCACTTTTTACCACAAATAAAACCTATAACGTTTTATTTTCCCAACTTTATATGGATGTAATTTTTTATTTTCTTCTCCAAAGGGTTTTTTAAATATATGAATAATTTCTATGGTGATCATTAATATTATTTTGAATTTGTTAGCTGTTATTGTTGATAATACAAAAAATTAAAACATTTTTTATTAAAATATAAAATTTCATATTAACAGTGTATAACTTTTAATGAGAATGTTTATTACGCTATTTGACATATACAATGGTTTAGTAACCTCCGCACAATAGTTTCTGCATTAAGTAATAATTATTGATGTGAGCGCATATATGGATTTGACATTAAATGCAGATATTAGTTAATATATAGCAATAATTGAGAGTAAAATTGTAGTTTATAAAAGGAAAATATTACCTTGATACCCCTTTCTTTTCTCTTATTTCTACTTCAAAATCTCTAAAATCTCTGTTAATAATAAAAATATCATATTTAACTAATATAAAACAAAAAATTTAAATAAAATAATAATATTTATAGTTATTAATGGTAGTATAAAATATAATCGATGTCAAATTATGACCATCCTTTACAAAATATTGCTGAATTGAGATTAGATGAAATTAACCAGGTTGCAAAAATTAGTTACGGCAGCGAGAAACTGCATTTCTCCATAACTATTTTGTAAGAAAAAAAAATTAAAATTAAAATGAACCTTCTTTAGAATTTTTTTTTTATATAACTCCTCTGAATTTTAATTTTTAAATTGTTTATAATTAAAAATGAATTTACCAATAAGACTAAAAAATCACGCCATTACTATTACATAAGAGCAAAAGAGAAAGTATATCAATGGCCAATGCTTAAGCACGAAATTTAGTTTTAAGAAACACACCAATTTAAAATACCAAAAAAATCCTAAAAGGATGCAGCAGATCTAACGAATTGAGTAGGGGTAATTAGGGAAAAGAAAAAAGTTGAATAAGCTCCGAAAGAGCGTTCTGTTAGGAAGTGTGTCAGAGACGGTTTCTTTCTTTCTTTCCATGGCACCAAACACACTCGCCTCAACCATTACTACTATATAATCTCTTCTTCCACTTCTCTCTCTCTCTCTCAAATCGCTTTCTCTTTCTAAAATCTCCTCAGTCCTCGACAGAAGCTCAAGCAAACAGCGAGGTCAGTGATTTTCAAGAAATTCTCTGTTTATTCAATGAACAGTATCTTCTTTAATTCAATTTTAATTCCTCTATGTATTAACTTCATTATACATTAAGTAATTTGCATGGTCGACTTATCGATCATTTCATCGACATTTCTTGAATACAACTTAGTTCGACGTTTTCTTCGATCGCGCACTGTGATTCTTTAACAAATCGGTTATCAAATTATTATTATCTGAGTATAAATATGAATTAAGTGATGGCCGATGAAACATTTCAGTTAATGATCGTTCATCGCGTTGCGATTCCGCAATTCTTTTCATTTATAACTATCTTTGTCTGATTTTGCAGAATCAAGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_31285(-)
ATGCTTAATAAGGACGCTTGCTCTCCCTCCTCCAATGGCGGATTCGGCCCCGCTGCCGTCTCTGGTCAATTGCCGTCAAACGGAGGCTACGGTTCGCTGTACTCAGCTCTGTCGAACGATAACCTTCCTTCGCTCTCCGCGAACTGCAGCAACGGAGGCGGCGTTTCGCTGTACCCATACTCGGACTCAACAACTCAGTATGACTCGTGCGTGATTCAGAAGCACCAGGACATGGTGAACCGTCAAAGCATGTGCCTGAATCGCCTGGTGGAGACTTCCAAAGAGGTGGATGCTCTGAGGCAGGAGAACGGTCAGCTCCGGGCAGCAAACAAGGAGCTGCAGAAGCAGCTGCACCTCGTCATCCAGGCTTCGCTGGAGAGTCAGTACGCCGCCGCCGGCAGTGGATCCTCCGGCCAGACTCAACCGACGCTGTTCGACGTCTTGCATGGCTTCCGCAGCCTCCACATTGGGGAAGGCAAAGAGAATTATGCCGATTGGAATAACAACAATAATCATAATCACAACAATATTTTGAATAATAATAATAACAAGGACCTGCAGGAAGCGTCAGACGAGAGTCCAACGAGCGTGATGGAGAATAACGTGGTGGAGGTTGAGAGATTCTCGCTCCCTAAGAGCATATCTGTGAGGTCCAATGGCTACTTGAAGATGGCTCAGTCTGCTGCTCTTGCCACCAATAATAATGTAACTCGCAATAAAGGTGCCACTCGCCCACGCGCCACCGCAACTCCACCTGAAGCCGTTGTAAGGACACACGTGCTAACTATCTATATATGCTTGGGCTTTTTATGTTTTAGTTATTATTATTATTATTTGTCTTGATATGTGATTATTGCGTTTATCGTTATTTACCGTACTTGACGTGCTTGTTAGTTGCTAATTATTTTCCTTTCAAAAGAAGTAAAGCATTGCTTGTCTCTGTCATTACCTGGAGGTAGCTGCAACGAATGGAGTAGTTTGTGGTTGTTGTTTTCATTTGCGTGTGCTTGTTTTGCAAGTGTGCAACTCTAGTTAGCAATCGGGTTCGCAGGACCCATTAGCTCAAGTTGCTCTAAGCCATAAAGAAGTAGCCCGAGCCTTGCTGTGACAGTTGTAACCTGTTTGGTGGGTGGTGGCTGGCATAACCTGGGCTTTAGGGTCGTTAGGTGGGGCTCTAGCTTTTCGCGTTGTTTCCTTTTCTTGCGTGGGTCTCATGTCCCAGTTAAGTAAGATTAATTTTGATAAGGAGCCATACAGTTTTGGTATTGTATAGGGGTCAAATAATTGTTTTTCAACCTCTAAAAATTTTGAAATATAGAGAAATTGGCAAGACTGTTAGCCATACAACACACGTCCACTAAATATTGTTCTTTCATGTCTTGATTTGAAAAGATTTATAATAGTCAAGTTAGATATGTCATTCTGCTGCTAGCTGCTAGTGGTTTGGTATGTTCAACGTTTTGATAGCCACAAACAACAGTTTCTAATTAGTGTTAGATGACATAACCAATTTTAATTGGTAGAGTAGAGCTGATGCAAATATATTTTATTTATTATATGGAAATTTTTACTGTCAGCAAAAAACATAAAGAAGTCATTTTAGTAATTAAAGTATTCAGTGTGTGGAAAATATATATCTAGTTTGTGCACCGTGTACATAAATGAATAATTGGACATATGATATACATAACCATATCTAACAAACATTAAATAATTTTTGTATGAATCCACGTTATATCCTTTCCTCTCTTATACACTTATGCTCGTTTAGACGATGACATCTAAATTAAGAGAGAGTATAGTTCATCTTACTTAGAGGATGACACATAAGTTAAAAAGTCAGCTTAATTGGTTGAGCACAGTATGTATGAATTGTTATAAAAGCTTAAATATATTCAATGTTTATGGATGAAAAAATAACGAATCTAACATAAAAAATAGGAAGGAGTTTATTTTTTTATTATTATTGTAATTTATGCTACTTGATTGTTGTTGAAATTTTTGCATATGTTGCCATGGAATGGTACAGCAGAAGGTGTATGTGCGGGGAGGGCAGAAAGAGGAAGAGCCTCTGGAAATGGTAGTGTATAACCAAGGGATGTTCAAAACTGAGCTGTGTAATAAGTGGCAGGAAACTGGTACATGCCCATACGGAGACCACTGCCAATTTGCTCACGGTATTGGGGAGCTTCGCCCAGTCATCCGCCACCCACGCTACAAAACCGAGGTCTGCAGGATGGTCCTTGCGGGGGTTGTGTGCCCATATGGCCATAGATGCCATTTCCGCCATGCACTCACTGAACAAGAGAAAGCTGTCGTATCACAGCCTAAGCCCAGAACAATGAAGCTGGAAAGATAA

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