Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31226 LG8 45476093 45477295 PREDICTED: putative receptor-like protein kinase At3g47110
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   extracellular region, cytosol
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 45476243 synonymous_variant p.Ala351Ala
C/G 45476298 missense_variant p.Arg333Thr
A/G 45476453 synonymous_variant p.Ser281Ser
C/A 45476504 synonymous_variant p.Ala264Ala
T/C 45476616 missense_variant p.Gln227Arg
T/G 45476796 missense_variant p.Tyr167Ser
G/T 45476992 missense_variant p.Pro102Thr
G/C 45477226 missense_variant p.Leu24Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31226.1
MQILYLAIISISLLLFHNTNTIVLVRALTSPSDIAALRAFKASIKPSSIAPWSCLASWNFTTDPCSLPRRTSFICGLTCTPDSKTINQITLDPAGYSGTLTPLISRLTQLTTLDLSDNNFFGSIPSSISSLSNLQTLTLRSNFFSGPIPSSITTLKSLQSLDFSHNYLSGYLQNSMNSLAKLRRLDLSFNNLTGSIPKLPPNLLELAIKANSLSGSLQKQSFEGMNQLEVVELSDNALTGTVESWFFSLPSLQQVNLANNTFTAAQISGPHPDRGGITSRSNLVALDLGFNRIQGYAPANLASFPTLSFLSLRYNALRGTIPLEYGQIKSIRRLFLDGNFLFGKPPPGLVASGTEVTGSLGDNCLQECPTSSQLCSPAQKPISVCKRAYSGRPTSIPVVG*


CDS Sequence:
>Vu_31226.1
ATGCAAATCCTCTACCTCGCCATCATTTCCATCTCTCTCCTTCTCTTTCACAACACAAACACCATCGTCCTAGTCCGAGCCCTCACCTCACCCTCAGACATTGCAGCCCTCAGAGCCTTCAAGGCCTCCATCAAACCATCATCCATCGCACCCTGGTCTTGCCTTGCCTCATGGAACTTCACCACCGACCCCTGCTCACTCCCTCGCCGCACCAGCTTCATCTGCGGCCTCACCTGCACCCCTGATTCTAAAACAATCAACCAAATCACTCTCGACCCTGCAGGGTACTCAGGCACACTCACCCCCCTAATCTCTCGACTCACACAACTCACCACACTTGACCTCTCAGACAACAACTTCTTCGGCTCAATCCCCTCTTCAATCTCCTCCCTCTCCAACCTCCAAACCTTAACCCTCCGATCCAATTTCTTCTCAGGCCCAATCCCTTCCTCCATAACTACCCTCAAATCACTCCAATCTCTCGACTTTTCACACAATTATCTTTCTGGGTATCTACAAAACTCCATGAACTCCCTCGCCAAACTCCGCAGACTCGATCTCAGCTTCAACAATCTAACGGGTTCAATCCCAAAACTCCCACCCAACTTGCTCGAACTTGCGATCAAGGCCAATTCTCTATCTGGGTCTCTCCAAAAACAGAGTTTTGAAGGGATGAACCAGTTAGAAGTGGTGGAGCTAAGCGATAACGCCCTCACCGGTACCGTGGAATCGTGGTTCTTCTCTCTACCGTCCCTGCAGCAGGTAAATTTGGCCAACAACACCTTCACAGCGGCGCAGATCTCAGGACCACACCCGGACCGTGGGGGAATCACCAGCCGCAGTAACCTCGTGGCACTCGACCTTGGGTTTAACAGAATCCAAGGCTACGCACCCGCGAATCTCGCTTCGTTTCCCACACTGTCATTCCTGTCGCTTCGGTACAACGCCTTACGTGGCACGATCCCTCTGGAGTACGGCCAAATCAAGTCCATAAGGAGGCTCTTCCTCGACGGAAACTTCCTCTTCGGAAAGCCACCACCCGGGCTTGTCGCTTCCGGCACGGAGGTTACCGGAAGTCTGGGGGACAATTGTCTGCAGGAGTGCCCAACCTCGTCGCAGCTGTGCTCGCCCGCGCAGAAACCAATCTCAGTTTGCAAGCGAGCCTACAGTGGTAGACCAACATCGATACCTGTTGTCGGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_31226::LG8:45477295-45479295(-)
ATTAACTTTTTTACTAAATATTACTTATATATTATTTGGTAATATTTTGCAGTTTGTTATATTTTAAAATTTAGATTAAAAATTTTACTAAAAATTATTTATATTTTATTTAGTAATACTTTATTGTTTGTTGTACTTTTAAATTTAAGTTAAAATATTTATTAAAATTTATTTATATTTTATTTGATAATATTTACGTAACTTACAAATAATTTAGTTACTTTTATTAATTTAAAAATTTTAATGTACATTGTTTTGTGCTTATAATTTTATAATTCCAAAATTTTGTTTTTTTTATAATTTCATTAACTATTTATTATTCTAAAATATTTTTGTTTCGAATAGTGGGTCAAGAGTTATTTCTTCACATTTTTACTCTTCAAATCCGGTACTTGTCAAAGATAATGTTCAAATTAATTAATTATACGGTTATTACAGTGAAGTTAAATGTTTAATAAATGTAATCACTAATCTCTTTATTTTGTCTTTGTATTTATACATTACAGAATGAGTTTTTGATTAAAATTGACCTAATTATGACTTAATGTCTCTTAAGTACATTTTATATTGTTAATATTTTTAGTTTATGTTAGTGATTTTAATATACAAAGTACCAGTTTCAGCGAAAATTGCTCGACCAACGAAATTTAGAATATTTTTAGTGAAAGTTGATCGATCGATTCCTTTGAAAATGCACCAATCAAACTGTCTATGCTATACAATTTTTAACATCTCATTTTACTTGCACAAATTAATGAATTTGAAAAAATTACACTAACAAAATATTTAAAAATTTGGTTTAATAGCCAATTTAGTCCTCACTTTGGTTGAAAAATCTCAATTTAGTCCCTCGTTATAAAAGTGTTTTGAATTAGTCCTAACTTTTAAAATAGTGGGTCAGATTGGTCCTTTCTGTTAAATATAAGTTAACAAAATTAATGGATGATGATGTGACACAACTTAAAGCTAACGAGGGACCAATCTAACACATCAGCTTTAAGCTGTGTCACATCATCATCCATTAATTTCGTTAACTTATATTTAACGAAAGGGACCAATCTGACCCACTATTTTAAAAGTTAAGACTAATGTAAAACACTTTTATAACGAGGGACTAAATTGAGATTTTTCAACCAAAGTGGGGACTAAATTGGCTATTAAACCTAAAAATTTATACCTGACGGATAAGGTACGTGTACTCTTAGTTATTATATAAAGAAAGTTACTTTTTTTTTTATTTTCACATATTTTTTCAATTACAAGTGTTTTTATTTTATTTTATACCATTATTTTATTTTTTATGTATACATTTTTTTTTAATTTCATCCTTTAATAAATAATATTTTTTAACTAAGATAATCATCTCACAAATCATACCCTTGAAAGCGACTTCTTTTAAATTTAACAGAATTTTATTGTTAATTTGATCGCTTTTATTGAATTTAACCACTTTTAAACTAAACTACTTATTTACAATAAAAATATTACTTACAAAATAAGTAGAAAGTATTTTTTTTTCTAAAAAATATTTATATTTTATTTTTACAACTAAAATTTTATTATTTTTATCATCATAACAAAAATAAACACCCTTACACATATTCCATGTATTTATAAAATTATTTATCTGATTAATTGTCATAACATTATTAATTGATTGAGATGTTATTATTAGTGTATTGTTATAAAAGAGTTATTTTATATATATATATATCCTCTTAAACCTCCCGTTCTGGAAGATGGCACCTTTCTCCCCTCTCACTGTCTTTCCCTCCTTTCATGTCCATCTGCAGCATCTACTTTTACTTTTCCTGAGCACTGAAAACAACAGACATTGTACCTCAACCATGGCCCTTCCCTCCTAAATTTCCCCAATCATTCAAAAACACAACCACACACCAACCCCACCACAACACAACACAAACCAACTCCTCAAAAATTAACATCAAACCACCACATCTTAACCATCTCTTTGTCAGACACCACGCACTAAATCCAAT


Gene Sequence:
>Vu_31226(-)
ATGCAAATCCTCTACCTCGCCATCATTTCCATCTCTCTCCTTCTCTTTCACAACACAAACACCATCGTCCTAGTCCGAGCCCTCACCTCACCCTCAGACATTGCAGCCCTCAGAGCCTTCAAGGCCTCCATCAAACCATCATCCATCGCACCCTGGTCTTGCCTTGCCTCATGGAACTTCACCACCGACCCCTGCTCACTCCCTCGCCGCACCAGCTTCATCTGCGGCCTCACCTGCACCCCTGATTCTAAAACAATCAACCAAATCACTCTCGACCCTGCAGGGTACTCAGGCACACTCACCCCCCTAATCTCTCGACTCACACAACTCACCACACTTGACCTCTCAGACAACAACTTCTTCGGCTCAATCCCCTCTTCAATCTCCTCCCTCTCCAACCTCCAAACCTTAACCCTCCGATCCAATTTCTTCTCAGGCCCAATCCCTTCCTCCATAACTACCCTCAAATCACTCCAATCTCTCGACTTTTCACACAATTATCTTTCTGGGTATCTACAAAACTCCATGAACTCCCTCGCCAAACTCCGCAGACTCGATCTCAGCTTCAACAATCTAACGGGTTCAATCCCAAAACTCCCACCCAACTTGCTCGAACTTGCGATCAAGGCCAATTCTCTATCTGGGTCTCTCCAAAAACAGAGTTTTGAAGGGATGAACCAGTTAGAAGTGGTGGAGCTAAGCGATAACGCCCTCACCGGTACCGTGGAATCGTGGTTCTTCTCTCTACCGTCCCTGCAGCAGGTAAATTTGGCCAACAACACCTTCACAGCGGCGCAGATCTCAGGACCACACCCGGACCGTGGGGGAATCACCAGCCGCAGTAACCTCGTGGCACTCGACCTTGGGTTTAACAGAATCCAAGGCTACGCACCCGCGAATCTCGCTTCGTTTCCCACACTGTCATTCCTGTCGCTTCGGTACAACGCCTTACGTGGCACGATCCCTCTGGAGTACGGCCAAATCAAGTCCATAAGGAGGCTCTTCCTCGACGGAAACTTCCTCTTCGGAAAGCCACCACCCGGGCTTGTCGCTTCCGGCACGGAGGTTACCGGAAGTCTGGGGGACAATTGTCTGCAGGAGTGCCCAACCTCGTCGCAGCTGTGCTCGCCCGCGCAGAAACCAATCTCAGTTTGCAAGCGAGCCTACAGTGGTAGACCAACATCGATACCTGTTGTCGGTTAA