Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31168 LG8 45001925 45003550 PREDICTED: transcription factor bHLH84-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 45001940 synonymous_variant p.Pro343Pro
T/C 45001988 synonymous_variant p.Pro327Pro
T/A 45002161 missense_variant p.Glu302Val
C/T 45002465 upstream_gene_variant
A/T 45002503 upstream_gene_variant
A/G 45002686 missense_variant p.Leu243Ser
C/T 45002787 synonymous_variant p.Ser209Ser
A/C 45002965 intron_variant
A/T 45002970 splice_region_variant&intron_variant
T/A 45003033 missense_variant p.Glu173Val
T/C 45003257 synonymous_variant p.Thr98Thr
T/G,* 45003259 missense_variant p.Thr98Pro
G/C 45003444 missense_variant p.Ser36Cys
A/G 45003446 synonymous_variant p.Cys35Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31168.1
MESSQQISEEWGSLCGLHTTEEADFMAQLFGGTHCSVTEKHHGNTTFGFWPAHESTTVTMKATNSNSYFLPNVTDINLCFSQGSSSSIDSGNSVLSTTSSGPYYCDPATNFDSVSMAFFLGDAQFSPHSFHCYDNSINENTDEESSLDPVALADNNLQAKREYEMMVSEYAHEDRSENLENLTKRLRNSKEVSKTLRNTKLKKNSKSASMNKNEDDRSLNLEGLGCFSQGDSNASLKPNGGALKDPAPPSLLRKSRATKGPATDPQSLYARKRRERINERLRILQNLVPNGTKVDISTMLDEAVQYVKFLQLQIKLLSSDDMWMYAPIAYNGINIGLDLSISPTKGR*


CDS Sequence:
>Vu_31168.1
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Promoter Sequence:
>Vu_31168::LG8:45003550-45005550(-)
GATAATGAAAAAGAAACATGACATTAATATTATTTGTGTAAAAAGTTTATAAAGATTCAAAACATACTGATTCAAGTCTCAGTATTATTTATTACTTTCAAAAATCCATCAATATATATATTTAAAATTTTATTCACATTAACAAAAAATTTCATTTTCTGTTTTCAATAATATAAAATTATTTATTTTTAAAAAATATTTGCTTTAATACTACATTTTATTTTATTTGTCGTGAAATATTTAAAAATAATTAGCTAAATATGTTTTTGTGCAAAAGATATATGAAATTATATATTTTTACTATTTATATTTACTAATTGGTCTAACATTTAGTGATAGAATTTAGTTGATATTTTTTACAATATTAAGATTAAAAATCATATTAAGTGGTACTGTCAAAACGGATAACCCAATTCGACCCAGTCTGGCCTACCATGAGTTGGTCACTTAGTAAGTCATCCAACTCAGCTCATTTATTAGCACGCTAAAAAAATTCCAACTCGACTCGACCCACCACAGGTTGGTGGATTAAACGGGTTGACTCATTGACTCACTTAATTATGAGTTTTTTTTAAATAAAAAAATAATTTTTTTAATTCAAATATAAATAAATTTCACTCTAAAATGATGTTAAAGTCCAAAGATAATTCAAAATAAAAAAAATGTTATACAATCGAACTGTAATCCAAAAACAAGTCCGAAAGACAAACAAATAAGTTTTTAATATTGATCATTTTTATATCTTTTGTCCATTTATAATATTAGAGTCATAAATCTATAATATTTTTCTCTTTTGAAACATTTTTTTATCCCCATCTACAATATAATAAAAAAAATACTAACTAATAATATTAAAACACAAAATAATAAATAATTAAATTATATTATGTGGGTTGGTGAGCCAACCCGGTTCACCAAGGATTCAATCCAGATGAGCCGGGTTCTAAGTAAGTCGGATTGAAAACTAACCCATATAAGAAAATTATATTTTTTTCAAACCCAACTCAACTCAAACATGTGGTGAGCGAGATTGACTCACGGATTAGAACCTATTTTAACAGCATTAGATATTATCAAAGTAAATACTATGAAAATTGATAAACTTCCTATACATAGAGTAAAAGAACTCAAAGCAATTTCTTAAGCTACTAAGATACATTCACTTGAGGGAGATGTTGAAATTAATTTAGGAGACTGGCATTTCCTGGTATAGATGTTGACGAATTATATATCAATCATGTTAATGATTTGCGAGAGAGCCATAGAAACGACTGCAACACAAAACATGGTAGTTAAATATAGATTCAAAAGTATTAAGAAAAGAAAAAACATGAGTTGAGGGAACTGAATGAGTTTTGGAGTGCTCGGGAGGGTACATGAATCCAGTTGGTAGACATCAAACAACACAGTCCGAATCAAAATTAAATTAGGAATTTAGAATGTTGGACAGACATGAGACACCCCTTCAATTTCCCCATATCAATGTCATTTTCGTTCTTTCTGTCCAACACAAATAGTTCTTGTTAAATTAATATCATATTCTGGGCCAGCAATCACATTTTTCATTCTTTTTTTTGTCTCTAACGAATCAACTCCCACACTAGTCTCATTCAGCAACACTTTGATCATTGCATTTCACCTGAGAGGGAAGTTATAAGCTCATTCGAGGGTTATTATTTTAATAAAAATCAATACCATTAGCCGAATCTTTTAATGTGTATATGGTCTGGTCAAGAACTAGTGGAAATAATTTCAGGGTATTAATTAGTACTTTGTCAGCGCTTAATTATTTCCAATGGTTTTGGGATCTTTTTCGATAGATGGAACCAATCCCATTTTGGCATTACCTGAGGTTGTTAGGTATAAATGTACCAGTACTGTCTTCTCACTTTTCACATCCCTTGAATACTGAAACAAAACCCAGTTTCTTCAGTTTTTGCATACTGTCACACTAAAACAAGAGAACCCTTCCTTCTCATAGATTTTAAACCAGAAGTAGA


Gene Sequence:
>Vu_31168(-)
ATGGAATCTTCTCAACAGATTTCCGAAGAATGGGGTTCTCTTTGTGGATTGCACACAACTGAAGAAGCTGACTTTATGGCTCAGTTGTTTGGTGGTACTCACTGTTCTGTCACAGAAAAGCACCACGGAAATACCACTTTTGGCTTTTGGCCGGCCCATGAATCCACAACAGTGACCATGAAAGCCACTAATAGCAACTCATACTTCCTTCCAAATGTTACAGACATTAATTTATGTTTCTCACAAGGGAGTAGCTCCAGCATTGACAGTGGTAATAGTGTATTGTCCACTACAAGTAGTGGACCCTACTACTGTGATCCAGCAACAAACTTTGACTCTGTGTCCATGGCCTTTTTCCTGGGAGATGCTCAATTCAGTCCCCATAGTTTTCACTGTTATGATAACTCAATAAATGAAAACACTGATGAAGAGTCAAGTCTAGACCCAGTAGCTCTTGCTGACAACAATTTGCAGGCTAAGAGGGAGTATGAGATGATGGTTTCTGAATATGCACACGAGGACAGAAGTGAAAACCTGGAGAATCTAACAAAAAGGCTTAGGAACTCAAAAGAGGTAGAGATAGAATAATTAATACCGAGCTAAAGTTCTGTTACCTAGTGCCATATTTCTACTCTCCTTTTTTCCCTTCAGAATATTGAGTTATGTTGTTTACTTGTGTTGGACTCTGATCATGATTGTATTATCTGTAGGTCTCAAAAACATTGAGGAATACCAAGTTGAAGAAAAATTCAAAATCTGCTTCGATGAACAAGAATGAAGATGACAGAAGCTTGAACCTCGAAGGGCTCGGCTGTTTTTCACAGGGTGACTCTAATGCTTCTCTGAAGCCAAATGGAGGAGCATTGAAAGATCCTGCACCTCCCAGTTTGCTTAGAAAATCAAGAGCAACTAAGGGTCCTGCTACTGATCCACAGAGCCTCTATGCAAGAGTAAGTCACCCATTAGAAGCACATTTCAATGAAATCACAATGACAATTGCAAATGTATGATCACTGTGCTAATAATAACAAGATTTTTAGAATTTATTCAACTGCATAAGGACTGTAATTATCGCTACATCAGTCGCATTCATTCTGATATCAGAGACTGTGATGAAATTACGATTTAAAAATCTCAACAAAAAATATGGTTTTTGTTCTTAATTAAATAAACATATTTTATTAAGCCTAAAAGGAAATTTTGTACTGGGTTGTGCAGAAGAGAAGAGAAAGAATAAATGAAAGGCTGAGAATACTGCAAAATCTTGTCCCCAACGGAACTAAGGTAACTCTCTCTGTTCATTGAACTGTTGCCCACAATTGGTCAGTGTTCAAATTCTCATGTTCTGTCTTCCTAAACTGTAGGTGGATATCAGCACCATGCTTGATGAAGCAGTGCAATACGTTAAGTTTTTACAGCTCCAAATCAAGGTAACGATTAGGAAAACCTTCTCATTACATTTTTTCAAAGATCTTCATTTTACATTAAGATTGTGATTATTAATTCATTTTGATTTGGATGAAACAGCTTCTGAGCTCTGACGATATGTGGATGTATGCCCCAATTGCTTACAATGGTATAAACATTGGACTTGACCTCAGTATTTCTCCGACCAAAGGAAGATGA