Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31138 LG8 44735162 44735842 PREDICTED: agamous-like MADS-box protein AGL62
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 44735197 missense_variant p.Ala216Ser
G/A 44735229 missense_variant p.Ala205Val
A/G 44735255 synonymous_variant p.Tyr196Tyr
G/A 44735285 synonymous_variant p.Pro186Pro
T/A 44735456 missense_variant p.Lys129Asn
C/T 44735549 synonymous_variant p.Ala98Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31138.1
MSKNKKCSLGRQKIPIEKIPKKSHLQVTFSKRRSGVFKKASELCTLCGVEIAIVVFSPADKAFSFGHPEVESLIDRYTMRNPPQDSSAQHLVEAHRNANVRDLNMQLTQVFNLLEIEKKRGDELDHVRKARQKQFWWESPVDDLGLHELLQLKASTEELKNNIEKHASKFIIDRSTAISSSSILGPSNGFAAIERYDAFDNKPDAGIPMASSPPDAHYLAFRNWYL*


CDS Sequence:
>Vu_31138.1
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Promoter Sequence:
>Vu_31138::LG8:44735842-44737842(-)
TATAATAAATGACGATAAATATGTTTTCAATTAATATATTAATAAACATAAGTAATTTATCACACGTATTATATGAGAAAGGATGTAGTCACTTCAAGAATAATTTTAATAAATATAATATTGACTGTGATTTTTTTTTTCTTCAAATGCGACTGTGAATTTTTTTTATTGGAATTGGATTTAGAAAAAAAGAAATATGAGATTGGGAAATAAATTTGTTAATTCTATTGTTTTGGTAATTTGATTTGTCCTCGATATATATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATTTACGGTATATATATTATATAGTTATTACAAAAGTAAGTTTTATTAATATTTAATTAATTATTAATGTATTAACTTATCATAAATAAAAGAACAGTTGAATAGTTTGAATGATAATTATCAATTAACACTGGTCCTGTTGGACTAAAATCACACAGAAAGGCCCGTAAAAGAATACAGTGATTTTATATTGGGTTTGTAAAGAGTAGCCCGTAAAATATTGTGCTTACATAAAATATGTTTGTTAGCATTTCACCCCTTAGCTCTGCTAATTTTTCTTATTACTGGTCATCAATAATTTCAAGATGTATATTCTAATATAAAAGAATGAGACAACTAAAAGTATATTTTGATTTTACAACCCCTTCCTTTTCTAGCTATGTTCCCAAAACATTTGTATATGTAATTGTTTTTGTAATTTTAAAATTTAAATTACAAATTTTATTTGAAAAATTTACAAAAAAGAACTTATCTTTATGATATTTTTAACATTATGGAAAATTATGGGAAATAAGTGTATGTTTGAATTTCATCGGAAACTAATATTATTGTCAATCATAGTTTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCATAGAAATTTAAAATTATATATTAAATAATAATGAATTAAAAATTTGAATAAATTAAAATTAGTTCATACATCATCTAAGGGATAGAAATTTTCTCTTATAATTTTTCTAATTTTTATTGTAATCTTTGAACTGTTGTTTATAAAGACGGGTTTTTTCTCTTATTTTTTCTATCTTAAAATTTCTTATTAAAAAAATCCAAAAAATTATTTCTGAAAATTTACTTTTCTAACTTTACAAAGTTACCAAAGTATTTTTATGAATTTTCATAAACAAAGTCATAAATCAAGAAGAAAAAAATGTTAATTTTTAAACAAAAAACATTTTAATTTGTTCCAATTTTAATCCTAACACCCAACAACCAAACATATAGTTTTTATTGTTAGACTTTTCAGTGTACATATTCATCGTGATTTTGGACCCCTTCCCTTCGTATATAACTTCTCAAACTAATGAAAACAAAGTCAATACAGGTCTCTCTACCTTTTTATGTGTTGAACACTAATTAAAAATTTCGAGACATGGCATTTTACTTCGTGATACGTTTATCTTATTGGAAAATATTTTTTTTATACTATATGTATAACTTAACAACCTATTTTAAGAGTATTTTGATTATTAAAAAAGTTATTTTTTATATTTATAAGAACATAAAGAGAATTGAATAGTAAAATAGTAGATATATAACATATATAAAAATTTGTCAAGTGTAAAAATAACAGTACCGTATACTGTATTGTTACGCTGTGAGAAGGATAAATTATTTACATCAATGAGCAACGTAATATTAATTATTTTACGTCTTTTAATTAAAAAATCACAAACAAGTGTCTGTAATGTATATTATGTAAAAAAAAATCAAGAACAGAATATGGTAACCTGTGAATAATTTGGTCTGCAACAATGATGACATATTAAGAGCAAAGATTATATAACTTCCCGGTTAGGACTAATAATAAAAAGAAATAAAAGACATAAAAAGGAAAATTAATTGGGACAGGTGTAAAAGAAAGATTTAGTGATATAAAAGAGAGAGAGAATAGTTTCCCAGGAAGTATTGTCTCAGTGTTTTGTTTGTGGGAGC


Gene Sequence:
>Vu_31138(-)
ATGTCGAAGAATAAAAAGTGTAGTTTGGGTCGTCAAAAGATCCCAATAGAGAAAATACCCAAGAAGAGTCATTTGCAAGTGACTTTCTCTAAACGTCGTTCGGGAGTGTTCAAGAAAGCCAGCGAACTTTGCACCCTCTGTGGGGTAGAGATCGCCATCGTCGTTTTCTCTCCTGCAGACAAGGCCTTCTCTTTTGGCCATCCAGAAGTTGAGTCCCTCATCGATCGCTACACCATGCGGAACCCTCCACAAGATTCCAGTGCGCAGCACCTCGTTGAGGCTCATCGAAATGCGAATGTTCGTGATCTCAACATGCAACTCACTCAGGTTTTTAACCTTCTGGAGATTGAAAAGAAGCGAGGGGATGAACTGGATCATGTGAGGAAAGCCAGGCAGAAACAGTTTTGGTGGGAGAGCCCTGTCGATGACCTTGGATTGCATGAGCTTCTCCAGTTAAAGGCCTCCACTGAGGAACTCAAGAACAACATAGAAAAACATGCCAGCAAATTCATCATTGACCGCTCTACTGCTATATCTTCTTCGTCGATTCTTGGACCCAGTAATGGATTTGCTGCAATCGAACGCTATGACGCCTTTGATAACAAACCTGATGCTGGGATTCCCATGGCCTCATCACCTCCCGATGCTCATTATCTTGCTTTTCGAAATTGGTATCTTTGA