Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31132 LG8 44651125 44654612 PREDICTED: putative receptor-like protein kinase At4g00960 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 44651157 missense_variant p.Cys11Trp
A/G 44651170 missense_variant p.Ile16Val
T/C 44651198 missense_variant p.Phe25Ser
G/A 44651210 missense_variant p.Ser29Asn
G/A 44651236 missense_variant p.Ala38Thr
C/T 44651242 missense_variant p.His40Tyr
C/T 44651247 synonymous_variant p.Asn41Asn
A/G 44651289 synonymous_variant p.Gln55Gln
T/C 44651370 synonymous_variant p.Leu82Leu
T/A 44651646 synonymous_variant p.Ala174Ala
C/T 44651679 synonymous_variant p.Thr185Thr
C/T 44651691 synonymous_variant p.Tyr189Tyr
A/T 44651820 missense_variant p.Arg232Ser
A/G 44651907 synonymous_variant p.Leu261Leu
T/G 44651997 downstream_gene_variant
T/C 44652123 downstream_gene_variant
A/G 44652131 downstream_gene_variant
C/G 44652132 downstream_gene_variant
C/G 44652163 downstream_gene_variant
T/A 44652181 downstream_gene_variant
G/T 44652265 downstream_gene_variant
T/C 44652369 synonymous_variant p.Ser285Ser
T/C,A 44652508 downstream_gene_variant
T/C,* 44652577 downstream_gene_variant
A/G 44652635 downstream_gene_variant
T/G 44652685 downstream_gene_variant
A/T 44652841 downstream_gene_variant
T/A 44652852 downstream_gene_variant
T/A 44652854 downstream_gene_variant
T/C 44652858 downstream_gene_variant
G/T 44652859 downstream_gene_variant
A/G 44653042 splice_region_variant&intron_variant
A/G 44653170 downstream_gene_variant
G/A 44653206 downstream_gene_variant
C/A 44653243 downstream_gene_variant
T/C 44653378 downstream_gene_variant
G/A 44653441 downstream_gene_variant
A/G 44653444 downstream_gene_variant
T/A 44653450 downstream_gene_variant
C/T 44653459 downstream_gene_variant
C/T 44653468 downstream_gene_variant
T/A 44653480 downstream_gene_variant
T/A 44653529 downstream_gene_variant
G/A 44653590 downstream_gene_variant
C/A 44653601 downstream_gene_variant
T/C 44653602 downstream_gene_variant
T/G 44653625 downstream_gene_variant
A/G 44653631 downstream_gene_variant
A/G 44653958 downstream_gene_variant
G/A 44653987 splice_region_variant&stop_retained_variant p.Ter336Ter
G/A 44654053 missense_variant p.Met358Ile
G/A 44654366 downstream_gene_variant
A/G 44654385 missense_variant p.Thr389Ala
T/A 44654513 synonymous_variant p.Gly431Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31132.1
MTAIFCLLGLCATIIISHASAQTPFCDNSKGNYTVNSAYHNNLNTLLSSFSTHAQVNYGFYNFSHGQGLDKAYAIGICRGDLTPEECLKCLNENGAALTKNCPNQKEAIVWDGECSLRYSNRSIFGLMDNQPTVLLYYTLEVRGSIEQFNAKLESLMRNLTRIAASGDSRRKYATGSAPAPDFQTIYGYTQCSPDLSSEDCSKCLEESISKIPDCCKGKAGGNVLKPSCRIRFDPYIFFGPTLKLDPDAPPPPTTPPPSRLANNTSLHSKGNSNTSRTIIAVAVPVAGVVLALSLFCIYLIVRKPRKQIEIGKEEDSEDEDEVDQTQANTHRVVGTYGYMAPEYAVYGHFSAKSDVFSYGVMVLEIVSGRKSIGARHGETVEDLLSFEDMTSRPTMASVVLMLNSYSISLPIPSEPAFVVNSSTRSYPNMLSGELNSEKTGSTESTNKPAQSSVNEVSITELYPR*


CDS Sequence:
>Vu_31132.1
ATGACTGCAATTTTCTGTTTGCTTGGTCTCTGTGCCACCATAATCATATCGCATGCAAGCGCTCAGACACCATTCTGTGATAACAGCAAAGGCAACTACACAGTCAACAGCGCTTATCACAACAACCTCAACACCCTCCTATCCAGTTTCTCTACCCACGCCCAAGTGAACTACGGTTTCTACAATTTCTCACATGGCCAAGGCCTAGACAAAGCATACGCCATTGGGATCTGCAGAGGGGACCTTACACCGGAAGAATGCCTCAAATGCCTCAACGAAAACGGAGCGGCTCTCACAAAAAACTGTCCAAACCAAAAAGAGGCAATTGTGTGGGATGGTGAATGCTCCTTGCGTTACTCTAACCGCTCCATATTTGGCCTCATGGATAATCAACCTACGGTGCTACTCTATTACACGTTGGAGGTAAGGGGTTCGATTGAGCAATTCAACGCAAAGCTTGAAAGCTTGATGAGGAATCTAACACGCATAGCTGCGTCTGGTGACTCTCGTCGTAAGTATGCTACAGGCAGTGCACCTGCTCCAGATTTTCAAACCATATACGGTTACACGCAGTGCTCGCCTGATTTGTCTTCCGAGGATTGCTCTAAGTGTTTGGAAGAATCTATCTCAAAAATCCCAGATTGCTGTAAGGGCAAGGCTGGAGGCAATGTTTTGAAGCCCAGTTGTAGAATTAGATTTGACCCTTATATATTCTTTGGACCTACACTCAAGTTAGACCCAGATGCACCACCACCACCAACCACCCCACCACCCTCTCGCTTAGCCAACAACACTTCTTTACATTCCAAAGGAAACAGCAACACGTCACGAACCATCATCGCTGTAGCAGTGCCAGTTGCTGGTGTTGTTTTAGCGCTCAGTCTTTTTTGCATATATCTGATAGTTAGGAAGCCAAGAAAACAAATTGAAATTGGAAAAGAAGAGGACAGTGAGGATGAAGATGAAGTGGATCAGACTCAAGCAAATACACACAGAGTTGTTGGAACCTATGGATATATGGCTCCTGAGTATGCAGTATATGGTCATTTTTCAGCAAAATCAGATGTTTTTAGTTATGGTGTAATGGTTCTTGAGATTGTAAGTGGGCGAAAAAGCATTGGTGCTCGTCATGGGGAGACAGTGGAGGATCTATTGAGCTTTGAAGATATGACCAGCAGACCAACCATGGCTTCTGTAGTACTCATGCTTAATAGTTATTCTATCTCTCTCCCAATACCTTCAGAACCTGCATTTGTTGTCAATAGTAGCACAAGAAGCTATCCAAACATGTTGTCGGGTGAGCTTAATTCAGAGAAAACAGGATCGACTGAATCCACGAATAAACCAGCTCAATCTTCGGTAAATGAGGTTTCAATTACTGAGTTATACCCTCGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31132::LG8:44649125-44651125(+)
ATCACTCAACAGCAATTCACGGAATGAAATGCTGAGATGTATCCATATTGGTTTACTCTGTGTTCAAGAAAATTTAGTTGACAGACCAACCATGGCTACCATTGTACTGATGCTTAATAGCCATTCTCTGAGTCTCCCTATTCCTGCAGAACCTGCATTTTATATGAACAGCAGAACTAGAAGCTTTCCAGAGATGCAGTCATGGGAGTATAATTCAAGGGAAAGAGGATCGAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAAGAATCAGAAAATGAAGCTTCAATTACTGAGCTATACCCTCGCTAGATGTTGTTCATGAGAGTGGATCTTTCATCATTCATTTTGCTTCTCTTAAACCAAAATACAATGTATTGGAAAGTGGAGTAAAATGTGGGTGCAGTATCTTGTTTAAATATGTACACCGCACCTACTTTCTCTAAACCGAGACTGAAACCTGTGATATAACATGAAGTGTGTGTTACTATTATTCTGCTCTCTCTCTACACTAACATTTCTGTAATATTGATCTTCAAAATCTGGTTTCCGAATTTCCGTAGCATTTTTTCTGTTCTGTATATACCCTACATCAAACTACCGCCCAAATTCTTTATGTTGGAATCACTTAAATCTTAAGATCAAAAGTTCTAACAACTAATTAAAAGAAGGAACATGTGATATTAAAATAGAAAACTAGAAGTATTTATTTAAGGAGGAATAAAATTGAAATGTGAAGAGAAAACATAATGGTGAATAAAGACAATTAAAAAAGAAATTTATTATTTTAAAATTATTCTTACTCTCCCTTCTTCAACCAAACAATAGAAATTACATTTAATTATTAATATTTTAAAATATATTAAACAAACTAATTTTTAAAAAACATATGTATTAATATAATATTTAATGTTTTCGAAAATCAGATGAATCGATAAACCAAATGAAGAATTTTCAATAATTCCATCGCATTTGGATTGCAATCAAACAAACTAATAATAATAATAATAATTAAATGGTATAAAAATAATATTAAAAAAAAATAAAATCATAACTTTATAACACTGAAATATAAATAAAGCATAACTTTATGAGTTCTAGATTTGCAAAATATTAATTAAAATTCAAAATAAATATAGCAAATTAAAATTTAATAAAATACGATAGTGTCAATTAACGATAGAAGTTTTGCATCTAAATTAAGTCAAATATTAATATCAATAATATTAAGGTATAAATATTACATAAAAATATAAATGACTAAATTAGATGTTTTTTTAAAAAATAATAATAGTTGTTAAATAATATATACTTAGTTCTAATCCTTATCAAATAGATGTGTTTTATATTTTTTAAAGTAATTTTGTGGTTGGATTTTTACGTGTTTTGGGACCAATCGACGCGGGAGCAGACTGACTTAATCAACGCCAAAAGCTGACGGGCTTTTTCAGTATCGGCATTCAATTTTGCCAGTAATTCCGTTCTATCTCAATCAAGTTTCAGCCTGCTGGAGCTAAACGTGGTAGCGTATTTTACATTGGGAAATATTTTTTTAACAAATTTTTTTATAATTTTTTTACAACATGATTAATTCGTTTCAAATATTTTTTTAAAAATAAATTTAAATAAACCAATAAAATAATAACATACATTTACTAAAAATATTTATATTTTAAATTTGCTTCACTCTTCTAACGAGTCTGAATAATAGATTATATCTATATAATTCTCCTAACTTTTTAACTTGTATTAAAAAACTAAATAATCACATTAAAAAAAGTTTATTAAAAAGGCATATTCTACTATGATAAAAAAAAATTATCAATATTGTTTTAAAATTAAGATAAGATATTTACGTGACCGACACGGCGTGCATAACCTTTAGTTTGTATTGAGAGGTAAACTTTGGTTGTGACTGAGTCAAACAGTTCACACTCTGTGAAAGTAAAGCTGCTTAGGTAAGCTTGAATCCTCATTCTTGGTTCCATATGTTACTCCTGAATCAGAA


Gene Sequence:
>Vu_31132(+)
ATGACTGCAATTTTCTGTTTGCTTGGTCTCTGTGCCACCATAATCATATCGCATGCAAGCGCTCAGACACCATTCTGTGATAACAGCAAAGGCAACTACACAGTCAACAGCGCTTATCACAACAACCTCAACACCCTCCTATCCAGTTTCTCTACCCACGCCCAAGTGAACTACGGTTTCTACAATTTCTCACATGGCCAAGGCCTAGACAAAGCATACGCCATTGGGATCTGCAGAGGGGACCTTACACCGGAAGAATGCCTCAAATGCCTCAACGAAAACGGAGCGGCTCTCACAAAAAACTGTCCAAACCAAAAAGAGGCAATTGTGTGGGATGGTGAATGCTCCTTGCGTTACTCTAACCGCTCCATATTTGGCCTCATGGATAATCAACCTACGGTGCTACTCTATTACACGTTGGAGGTAAGGGGTTCGATTGAGCAATTCAACGCAAAGCTTGAAAGCTTGATGAGGAATCTAACACGCATAGCTGCGTCTGGTGACTCTCGTCGTAAGTATGCTACAGGCAGTGCACCTGCTCCAGATTTTCAAACCATATACGGTTACACGCAGTGCTCGCCTGATTTGTCTTCCGAGGATTGCTCTAAGTGTTTGGAAGAATCTATCTCAAAAATCCCAGATTGCTGTAAGGGCAAGGCTGGAGGCAATGTTTTGAAGCCCAGTTGTAGAATTAGATTTGACCCTTATATATTCTTTGGACCTACACTCAAGTTAGACCCAGATGCACCACCACCACCAACCACCCCACCACCCTCTCGCTTAGCCAACAACACTTCTTTACATTCCAAAGGTATTCTTCTTCTCTATTCACAACTTATTCCTCATCCAATACAATAAAACAGCACAAAAATTCTCCCAAGTTCACTTAAAGGGGTTTAACCAAAAGCATATGCATAAAAGTTTGTACGTAAAATAAATCAATTTTTTATAAATTAAATTGACGTACTTATAGATAATTTTTTATTCAATTTTTAGTGTACTGAGAACTTGGTTTTATTAATTTATTTATTTTTTAAGCTTTATGGAAAAGTTTTCTTCCACAACACTTTTGACTTTGTTTCAACACTTTTTCCTCTCTCTTAACTGCTGTTTTATTTTTATATTAAAATTTAGGCTCATGTTGGACTTTGGATATTTTATTATTCTAAATTCGTGACCGAGGATTCTGGTTTCTACAGGAAACAGCAACACGTCACGAACCATCATCGCTGTAGCAGTGCCAGTTGCTGGTGTTGTTTTAGCGCTCAGTCTTTTTTGCATATATCTGATAGTTAGGAAGCCAAGAAAACAAATTGAAAGTAAGTCTCTAATGCTCCAAAAATCGATTTCCTGTCATATTAAAAAAGAAAATTAATTAGTTATTTGGTCCATGTTTTAATACAAAAGACAGAATTTAGTTCTTCTGATTTTTTATTTTTAATTTGTCATCCATTTTTTAAAATTGATGTAATTTGGTCTATATTAACAATACAAAAATGTTAATTATATCAATAAAATAAATTATTTTTATTAACAACTTCAATTTTAATGAAAAATCTTTGATCTGTTTCAAGAAATTTAACAAGAAAAACCAAATTACATAAAATTTTCACAAATAAAAAACAAATTGCATTAATTGTTCACAAATTAAAACTAAAAAAAAGGATTAGCTTGATATTTTTTTTTTTATGATAACATGATTAAATAACTAATTAAACTAAAAAAAATATAAATGATTCCTTTCTTCAAATTTTGTTTAGTTCATCAAATTATTTCTGACCAGGTAACAGGGAAAATATATTTAGCCATTTCCTGTTAATTTTCATTATTGGAAAATTATCTCTTTCTGTTATTTTTTTTTTCTTGTATTCACTTATTATATTCAAATACTCACTAATATTACCCCTGTCCTCATGCATGTGAAGTTGGAAAAGAAGAGGACAGTGAGGATGAAGATGAAGTTACATTTACTGAGTCATTGCAATTCAAATTTGAAACCATCCGAATTGCCACAAATGAATTTGCTGATTCTAATAAGCTTGGACAGGGCGGGTTTGGAGCTGTATACAAAGTAAGATCATGATTTGATTCGGTTAAAACCATCATCAAAATATAATACATCATGATTTTTCTCCCACAGATATTTTACCATCCTTCACTGATATATTTTCAGGGTCAGCTTTCCAATGGACAAGGAATTGCTGTGAAAAGGTTGTCAAGTAATTCTGGGCAAGGAGATACGGAGTTCAAGAATGAAGTGCTTTTATTGGCCAAACTTCAACACCGAAATTTAGTGAGGCTGATTGGTTTCTGTTTGGAAGGAAGTGAAAGGCTCCTTATCTACGAATTTGTTCCTAATAAAAGTCTTGATTACTTCATATTTGGTAAGCTCGAACAACTGCATTATTAGACTGTTACTCTATTGTTCTAGTTTTGATTTAAGGACTCAACTAAAATATTGCTTTGTAATATTCATCTGGTTTCCGTATGTATATATAGATCCAATAAAGAAAACACAGTTGGATTGGCAAATGCGCTACCAAATAATTAGAGGTATTACAAAAGGCATTCTCTATCTCCATGAGGATTCTCAACTACGAATTATACATCGAGATCTAAAAGCAAGCAACATTCTCTTGGACGAAAACATGTATCCTAAGATATCAGATTTTGGGATGGCAAGATTGTTTCAGGTGGATCAGACTCAAGCAAATACACACAGAGTTGTTGGAACCTAGTAAGTGAGAGAATATAATGTAATTGTTGTACAAACTTAATTTCAATCAACTGTAAAGTAAAATAATTTACATTGAAGTTTCATAAATTTTGAGTAATTAAATGTGCATTTGGTTGGCACGCAGTGGATATATGGCTCCTGAGTATGCAGTATATGGTCATTTTTCAGCAAAATCAGATGTTTTTAGTTATGGTGTAATGGTTCTTGAGATTGTAAGTGGGCGAAAAAGCATTGGTGCTCGTCATGGGGAGACAGTGGAGGATCTATTGAGCTTTGTAAGTCTTTTTGTTCTTCTCACTGTATTTTCCCTCTCCTTTATCAGAAAATTATTTGTTTCTTCAGATAACTGTACAAATGAAACGTGTGAAGTAACGAACATGCATTTGAGGAATTAATGCAGACATGGAAAAACTGGAAGAATGGAAATATTACAAATATTGTAGACCCCACATTAATGAAGGGTTCTCGAAATGAAATGATAAGATGTATCCACATTGGGTTACTGTGTGTTCAGGAAGATATGACCAGCAGACCAACCATGGCTTCTGTAGTACTCATGCTTAATAGTTATTCTATCTCTCTCCCAATACCTTCAGAACCTGCATTTGTTGTCAATAGTAGCACAAGAAGCTATCCAAACATGTTGTCGGGTGAGCTTAATTCAGAGAAAACAGGATCGACTGAATCCACGAATAAACCAGCTCAATCTTCGGTAAATGAGGTTTCAATTACTGAGTTATACCCTCGCTAG