Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31128 LG8 44614639 44617648 hypothetical protein TSUD_47360
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 44614742 missense_variant p.His35Leu
G/A 44615394 synonymous_variant p.Pro252Pro
T/A 44615503 intron_variant
T/A 44617423 synonymous_variant p.Ile480Ile
A/G 44617433 missense_variant p.Thr484Ala
T/A 44617449 missense_variant p.Ile489Lys
T/A 44617455 missense_variant p.Met491Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31128.1
MRVAAISRMFILFLCFPFLKFISLGSAQNVCDNGHGNYTANSTYSTNLNTLLSSLSSDTQIDYGFYNFSYGENSNIVNAIGLCRGDLEPEECRSCLNDSRVDITQACPNQKKAILWSEKCMLRYSNDTIFHKMETSPGYYMWNANNVTEPDQFSAVLDDLMKNVTGRAASGDSRRKYATAENSTAINFQTVYGLVQCTPDLSQQECNQCLEGAISEIPTCCNGKQGGRVLRPSCNIRFETYSFYETATTLDPDPEAPPPSTNTTSSEESGNTTIIVIAIVVATVVVVILLICLLLYLRRRKARKDLAGKSNPAMKAQLDWEKRYQIIRGIARGLLYLHEDSQLRIIHRDLKASNILLDEEMNPKIADFGMARLVLLDQTQANTSRIVGTYGYMAPEYAMHGQFSVKSDVFSFGVLILEIVSGQKNSGINNGENMEDLLSFAWRNWKEGKALNIIDPSLNNNSRNEILRCIHIGLLCVQENLIDRPTMATIILMLNSYSLSLPIPAEPAFYMNSRTRSFPEMQSWEYNSRERGSSEPILKSAQESENEASITELYPR*


CDS Sequence:
>Vu_31128.1
ATGAGAGTGGCAGCAATCTCCCGCATGTTTATTCTATTTCTTTGTTTTCCATTTCTAAAATTTATATCTCTAGGCAGCGCCCAGAATGTTTGTGACAACGGCCACGGCAACTACACAGCCAACAGCACCTACAGCACCAACCTCAACACCCTTTTATCCAGTCTGTCTTCCGACACACAAATTGACTACGGTTTCTACAACTTTTCATACGGGGAAAACAGTAACATAGTAAACGCCATAGGGCTGTGTAGAGGAGATCTTGAGCCAGAGGAGTGCCGCAGCTGCCTCAACGATTCCAGAGTCGATATAACACAGGCTTGTCCAAACCAGAAAAAGGCAATTCTGTGGTCCGAGAAATGCATGTTGCGCTACTCTAACGACACAATATTCCACAAGATGGAAACTTCTCCTGGTTATTACATGTGGAACGCAAACAATGTAACAGAACCGGATCAGTTCAGCGCAGTGCTCGATGACTTAATGAAGAACGTAACAGGCAGAGCTGCATCAGGTGACTCTCGCCGTAAGTATGCTACGGCGGAAAATTCAACTGCTATAAATTTTCAAACCGTATACGGTCTTGTGCAGTGCACCCCTGATTTGTCTCAGCAAGAATGTAATCAATGTTTAGAAGGGGCTATCTCAGAAATTCCAACTTGCTGCAATGGCAAGCAAGGTGGTAGAGTTCTTAGACCAAGTTGTAATATTAGATTTGAAACTTACAGCTTCTACGAAACTGCAACAACGTTAGACCCGGATCCGGAGGCACCTCCTCCGTCCACCAATACCACTTCCTCAGAAGAAAGTGGCAACACAACAATAATTGTCATCGCCATAGTTGTGGCTACTGTTGTTGTCGTTATTTTGCTCATTTGTCTCCTCCTATATCTAAGGAGGAGGAAGGCAAGGAAAGATCTTGCAGGCAAGTCCAATCCAGCCATGAAAGCACAATTGGATTGGGAAAAGCGCTACCAAATCATTAGAGGTATTGCTCGAGGTCTTCTCTACCTTCACGAAGATTCTCAACTACGAATTATCCATCGTGATCTCAAAGCAAGCAACATTCTCTTAGATGAAGAGATGAATCCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGGTTTTATTGGATCAAACTCAAGCAAACACAAGTAGAATTGTTGGAACCTATGGATATATGGCACCAGAGTATGCAATGCATGGACAGTTTTCGGTGAAATCAGACGTCTTCAGTTTTGGTGTACTGATTCTTGAGATTGTAAGCGGCCAGAAAAACAGTGGAATCAATAATGGAGAGAATATGGAGGATCTGCTAAGCTTCGCTTGGAGAAACTGGAAGGAGGGGAAGGCATTAAATATTATAGATCCATCACTCAACAACAATTCACGGAATGAAATTCTGAGATGCATCCATATTGGTTTACTCTGTGTTCAAGAAAATTTAATTGACAGACCGACCATGGCTACCATTATACTGATGCTTAACAGCTATTCTCTGAGTCTCCCTATTCCTGCAGAACCTGCATTTTATATGAACAGTAGAACTAGAAGCTTTCCAGAGATGCAGTCATGGGAGTATAATTCAAGAGAAAGAGGATCAAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAAGAATCAGAAAATGAAGCTTCAATTACTGAGCTATACCCTCGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31128::LG8:44612639-44614639(+)
CTGGAGACCATCCAAATAATTAAGTCTTAAATAAACCTAAACAAGATAATATGGTATATTAATTATTACAATCAAATTACAAAACCTAATAATTCTTTTTTAAAAGTTATTATAAAATTGATTACTATAGATATGTAATAATATATCAACTACTGAATTATATTTTATTTATTCATTACCGAATTGTTAAAATAATTTATAATTTTTCTAATTAACTTTAACTTATAATTGATCTATGAATTGTTATTTATAATTGAGCAGGTAAAATAGCTTATAATATTATTTACATGAAAAAATAAAATGAAAAAATAAAATAAAATAGAATAAAAGGGTTTTTAGTTTTAGAACAATAGAAGGGAAGTAAAAGAAAGTAAAACTATAACGAGTATTTGGTTTAAAAAGAATATTTGAATAAAAATATTATTTATCCTTGCAACATTTTGTCTTAATTCGCATCGTGCAAAAGTGGTCCTGATAAAGAGTTCCAAATTCCTAATTGAACACGTCACAATGGATCATGATTACCCTCGTTTCAAATTATTAACGTAATCACAGTTGATTCTTCCTTACTTCCTTTTTTTTTTTATATAAATATTACTTAGATGGACTTAACAGGTTGACTTTTAATAACATTTTCCTTCTATGTTTCAAAGAAGGCTTTATTAAATCCTATGGATGTAAAAGTAGTGTAAGTCTTGGAGATAGGAATAGTAGTGAAATGAGGTTTGAATTTAAATCCTTGAAAAAAAAAAAGCTTTGAATAATAGTAAAGGGATATGTTTATATTGAATAAGAGATTTATATATATATTTTTTAAATTGCTATAAGGAAAATCTCAGAAACAAAAAAAAACTAAAAGATAGATAATTTTAAATTTAACAAAAATAGGAAAAGAAAATACACAATGTTGCTTTCAGTATTCAACCTTTTCTTTATTACATTAAAATAAATTTAAGGAACCACGCTTTTAAAATACAGGAAAAACTGTCAACCGAAAGAAAATGAAAGACAAACTATCAAAATAAATTAGTTACATAAAGATATATGTCATTTTTATGATTAACATAAAATTAATTTAAAATAAAGTTCATTAAAATTACATTAATATTAAAGTAAATGTTGTATACAGATCAAAACAAAAATCATGGATGACATTTTGCATAGACTTTTTGTAAATTCAATGAATGAGCAGTTGGACACATGAAAAACATCAAAACAATTCGACGCACTTTGCTTCTAAACATTATATTTTAACTTTGATTACATTTTTAGTCTTCAAAATTTGAAATAAACAGATTTAAGTTTTTCAATTTTTAAACAATATTTTATTATTTATTTATTTTTGAATATTTCACGTTTCAAAATACTAACTTTAAAATATAAAATTATTTTTTATTTTCAACAATTAATTTAAAGAACAAAATCAGTATGTTTTTAAATTTGAGATTTAAAAAAAAATGAGATCAAAATCATATTTATCCAATTTTGATAAACTTAAAACAAAATTAAACAAACATAATTATATTTTTTATTTTTAGTGACATTTTGTCACAATAGCCAATTACTAGTAAACAAAATAATAGAAATTTCCTTTTTAACTGTTGAGTTTATTTTACTATTAATTTATAAATTTGTAATTTCTAACCAAAAGAAAAGTTTTGGTTCTCCTATTGAAAACCGTGTATTTGTTTGTTAGTCTTTTTCTGCAAGCCACTTTCTTTCAAAGTTCCGAAATTTTGAATGCCAGATACCAAAAAAACTGAAATTTTTGATTGACCCAGTGATTTTTCTTTCAATTATAGATATAAACATTAATTCAATAAAATAGAAACTAAAAGCTACCATATTACGAAACAAAAATTTCAAATGACTAGTATGATTAATGATTATGACTTAAGGGAAGTTAGGCTATAAAAAGATAGCAGCATCCTATGGGCATTCATCATCATACGCCCAAAGCTTCAATATTCTGTTTGCTATTCTGATTACAGAGACAAAGA


Gene Sequence:
>Vu_31128(+)
ATGAGAGTGGCAGCAATCTCCCGCATGTTTATTCTATTTCTTTGTTTTCCATTTCTAAAATTTATATCTCTAGGCAGCGCCCAGAATGTTTGTGACAACGGCCACGGCAACTACACAGCCAACAGCACCTACAGCACCAACCTCAACACCCTTTTATCCAGTCTGTCTTCCGACACACAAATTGACTACGGTTTCTACAACTTTTCATACGGGGAAAACAGTAACATAGTAAACGCCATAGGGCTGTGTAGAGGAGATCTTGAGCCAGAGGAGTGCCGCAGCTGCCTCAACGATTCCAGAGTCGATATAACACAGGCTTGTCCAAACCAGAAAAAGGCAATTCTGTGGTCCGAGAAATGCATGTTGCGCTACTCTAACGACACAATATTCCACAAGATGGAAACTTCTCCTGGTTATTACATGTGGAACGCAAACAATGTAACAGAACCGGATCAGTTCAGCGCAGTGCTCGATGACTTAATGAAGAACGTAACAGGCAGAGCTGCATCAGGTGACTCTCGCCGTAAGTATGCTACGGCGGAAAATTCAACTGCTATAAATTTTCAAACCGTATACGGTCTTGTGCAGTGCACCCCTGATTTGTCTCAGCAAGAATGTAATCAATGTTTAGAAGGGGCTATCTCAGAAATTCCAACTTGCTGCAATGGCAAGCAAGGTGGTAGAGTTCTTAGACCAAGTTGTAATATTAGATTTGAAACTTACAGCTTCTACGAAACTGCAACAACGTTAGACCCGGATCCGGAGGCACCTCCTCCGTCCACCAATACCACTTCCTCAGAAGGTACTTCTTTTTCTTCTCAATTTTCCTAACCTAAAGTTCACCCAAACAAATAGGAACCCAAATCTCACTTTTAACACGTTTTCTTCTTTCTCGAGTTTTGTTTTCCTTATTCATCCGATGGAGTTTAAATTTTAGTCGGGAATGACAGGTGCTTATATGCACTGCCAACTTCTTCTGTAACTAGTAATTAGGCTTTTTGGTATTTTACAATCCTTAATCCCTGAAATGTCTCACCGGGCAGAGGATTCTTGTTTCTGCAGAAAGTGGCAACACAACAATAATTGTCATCGCCATAGTTGTGGCTACTGTTGTTGTCGTTATTTTGCTCATTTGTCTCCTCCTATATCTAAGGAGGAGGAAGGCAAGGAAAGATCTTGCAGGCAAGTCCAGTTATCAATTTATTGTGATATTTTAGTTTTCAATTTACGAACTCCTATATTGTTACGATAAACAGACAAACACCCCGAATGCTCTGACAGCAGTATTTTTCTTCGGACGTATTCGCAAAACTAACTAGTTTAAATCCGTTTCTCACATGAAGTTAAAGAAGAAGATGAAGATGAGGATGGAATTAAAATTGCCGAGTCATTGCAATTCAACTTTGACACAATACGAGTAGCCACAGAAGACTTCTCTGATTCCAATAAACTTGGACAAGGTGGATTTGGAGCTGTTTACCGAGTAAGTAACCCTGTTGAATTCAGACACGCATAATCAAAACATACTATAACAGCAGTTAGCAAATTAGTTACTGTACCTGACAGAGATATATTTTCAGGGTAGGCTGTCCAATGGACAGATGATTGCAGTGAAAAGGTTGTCCAGAGATTCTGGGCAAGGAGACGTGGAATTTAAGAATGAAGTGGTTTTAGTGGTGAAACTTCAACACCGAAATTTAGTTAGACTACTTGGTTTCTGCTTGGAAGGAAGAGAAAGACTACTTGTCTATGAATTTGTTCCCAATAAAAGCCTTGATTATTTCATATTTGGTACCTTTTATCACCGCATAATTACACTCCTGTTCTATTTATCACTTTTTGCTCAATACAAACCTATTTATCAATAGAGCTAAAACTGTTGGCGCTCTACATATGCAGATCCAGCCATGAAAGCACAATTGGATTGGGAAAAGCGCTACCAAATCATTAGAGGTATTGCTCGAGGTCTTCTCTACCTTCACGAAGATTCTCAACTACGAATTATCCATCGTGATCTCAAAGCAAGCAACATTCTCTTAGATGAAGAGATGAATCCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGGTTTTATTGGATCAAACTCAAGCAAACACAAGTAGAATTGTTGGAACCTAGTAAGTATTAGAATATTTTATAGCTTGTTGATGGTTGAGAGTTTAATTTCAATCAATCATCAAAGAGAACTTTTATCATTAATTTTCACCAAATCATGAATTAGTTACTATTCAAAGAGCTTGAGGCTTAGGAAGTTGTTAGAATGTATCGATTTCATATGGCCGAGTGATACCTAAAAGCTTTTAACAGTAATTCAGAATTAAAGCTGCCAATGGCATTAGAAACTGACGACCTTTCCATATTGGTCTGTAGTGGATATATGGCACCAGAGTATGCAATGCATGGACAGTTTTCGGTGAAATCAGACGTCTTCAGTTTTGGTGTACTGATTCTTGAGATTGTAAGCGGCCAGAAAAACAGTGGAATCAATAATGGAGAGAATATGGAGGATCTGCTAAGCTTCGTAAGTCTTTTTTTGGTCACTTGCTTCTTCTTTGCCACCTAAATTATGGATTAGAAGATTACATGGTCCAAAACGTTAATGTAGAAGTGAATCCATGATCTGATATCAAATTTTTCAGGCTTGGAGAAACTGGAAGGAGGGGAAGGCATTAAATATTATAGATCCATCACTCAACAACAATTCACGGAATGAAATTCTGAGATGCATCCATATTGGTTTACTCTGTGTTCAAGAAAATTTAATTGACAGACCGACCATGGCTACCATTATACTGATGCTTAACAGCTATTCTCTGAGTCTCCCTATTCCTGCAGAACCTGCATTTTATATGAACAGTAGAACTAGAAGCTTTCCAGAGATGCAGTCATGGGAGTATAATTCAAGAGAAAGAGGATCAAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAAGAATCAGAAAATGAAGCTTCAATTACTGAGCTATACCCTCGCTAG