Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31127 LG8 44607430 44610453 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 44607457 missense_variant p.Ile10Val
G/A 44607485 missense_variant p.Gly19Asp
C/T 44607609 synonymous_variant p.Thr60Thr
G/C,A 44607736 missense_variant p.Glu103Lys
A/G 44608113 synonymous_variant p.Ser228Ser
C/T 44608231 missense_variant p.Pro268Ser
A/G 44608242 synonymous_variant p.Thr271Thr
C/A 44608321 intron_variant
T/A 44608332 intron_variant
G/A 44608418 missense_variant p.Cys296Tyr
A/T 44608453 stop_gained p.Lys308*
T/A 44608478 splice_region_variant&intron_variant
A/T 44608653 intron_variant
T/C,* 44608665 intron_variant
T/A 44609249 missense_variant p.Cys335Ser
C/A 44609449 intron_variant
A/G 44609569 intron_variant
C/A 44609768 upstream_gene_variant
T/C 44609778 upstream_gene_variant
C/A 44609873 missense_variant p.Gln408Lys
G/A 44609926 synonymous_variant p.Ala425Ala
A/T 44610144 synonymous_variant p.Val457Val
C/A 44610207 synonymous_variant p.Leu478Leu
G/A 44610233 missense_variant p.Arg487Lys
C/T 44610236 missense_variant p.Pro488Leu
G/T 44610269 missense_variant p.Ser499Ile
C/T 44610277 synonymous_variant p.Leu502Leu
G/A 44610279 synonymous_variant p.Leu502Leu
A/T 44610294 synonymous_variant p.Pro507Pro
G/A 44610295 missense_variant p.Ala508Thr
G/A 44610298 missense_variant p.Glu509Lys
C/T 44610337 missense_variant p.Pro522Ser
G/A 44610340 missense_variant p.Gly523Arg
G/A 44610390 synonymous_variant p.Pro539Pro
C/T 44610439 synonymous_variant p.Leu556Leu
T/A 44610447 synonymous_variant p.Pro558Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31127.1
MIIRKASVKIVGCSDYVMGAVSCMLLFFLCCLIPEASAQYLFLNCDNNNGNYTANGTYSTNLNTLLSTLSSNTEINYGFYNFSHGQNADRVNAIGLCRGDVEENPCRSCLKDAGGNITELCPNQKQAAIYYDNCMLRYSNDSIFGVLDISPHFYMSNSNNATGAAEFNQVLQNLLRELKDKAASGDSRRKYATDNDTTTNFQAIYGLVQCTPDLTQTECNDCLDEAISRIPTCCNDKRGGRVVGPSCNIRYEDYRFYEQTTIIDPETPPPTINTSTEESSNTTTIVIAVVVPTVVVVSLCLFICLRRRKARKNLEDPAMKAQLDWEKRYKIIRGIARGLLYLHEDSQLRIIHRDLKASNILLDEEMNPKIADFGMARLVLLDQTQANTSRIVGTYGYMAPEYAMHGQFSVKSDVFSFGVLILEIVSGQRNSGINNGENMEDLLSFAWRNWKEGKPLNIVDPSLNNNSRNEMLRCIHIGLLCVQENLVDRPTMATIILMLNSHSLSLPIPAEPAFYMNSRTRSFPGMQSWEYNSREMGSSEPILKSAQESENEASITELYPR*


CDS Sequence:
>Vu_31127.1
ATGATAATACGCAAAGCTTCAGTTAAGATTGTTGGTTGTTCTGATTATGTGATGGGTGCCGTTTCTTGCATGCTTCTTTTCTTTCTCTGTTGTCTAATACCTGAAGCCAGTGCCCAGTATCTCTTCCTAAACTGTGATAACAACAACGGGAACTACACAGCTAATGGCACCTATAGCACCAATCTCAACACCCTTTTATCCACTCTTTCTTCCAACACAGAAATCAACTATGGTTTCTACAACTTCTCCCATGGTCAAAACGCAGACAGAGTCAACGCCATTGGGCTGTGCAGGGGAGATGTGGAGGAAAATCCGTGCCGCAGTTGCCTCAAAGATGCCGGAGGCAATATCACAGAGCTTTGTCCAAACCAGAAACAGGCTGCTATATATTATGACAACTGCATGTTGCGCTACTCAAACGACTCAATATTTGGGGTCTTGGATATTTCTCCCCACTTTTATATGTCGAACTCAAATAATGCAACAGGAGCGGCTGAGTTCAATCAAGTGCTTCAAAACTTATTAAGGGAACTCAAAGATAAAGCAGCATCCGGTGACTCCCGTCGTAAGTATGCTACGGATAATGACACAACTACCAATTTTCAAGCCATATATGGTCTTGTGCAATGCACCCCTGATTTGACTCAGACAGAGTGCAACGATTGCTTGGATGAGGCTATCTCACGAATCCCAACTTGCTGCAACGACAAGAGAGGTGGTAGAGTTGTTGGACCCAGCTGCAATATTAGATATGAAGATTATCGCTTCTATGAACAGACAACGATAATAGACCCAGAGACACCACCACCCACAATTAACACTTCCACGGAAGAAAGTAGCAACACAACAACAATTGTCATTGCCGTAGTTGTGCCTACTGTTGTTGTTGTTTCGCTATGTCTCTTCATTTGTTTAAGGAGGAGAAAGGCAAGGAAAAATCTTGAAGATCCAGCCATGAAAGCACAATTGGATTGGGAAAAGCGCTACAAAATCATTAGAGGTATTGCTCGAGGTCTTCTCTACCTTCACGAAGATTCTCAACTACGAATTATCCATCGTGATCTCAAAGCAAGCAACATTCTCTTAGATGAAGAGATGAATCCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGGTTTTATTGGATCAAACTCAAGCAAACACAAGTAGAATTGTTGGAACCTATGGATATATGGCACCAGAATATGCAATGCATGGACAGTTTTCAGTGAAATCAGACGTCTTCAGTTTTGGTGTACTGATTCTTGAGATTGTAAGCGGCCAGAGAAACAGTGGAATTAATAATGGGGAGAATATGGAGGATCTACTAAGCTTCGCTTGGAGAAACTGGAAGGAGGGGAAGCCATTAAATATTGTAGATCCATCACTCAACAACAATTCACGGAATGAAATGCTGAGATGCATCCATATTGGGTTACTCTGTGTTCAAGAAAATTTAGTTGACAGACCGACCATGGCTACCATTATCCTGATGCTTAATAGCCATTCTCTGAGTCTCCCTATTCCAGCCGAACCTGCATTTTATATGAACAGTAGAACTAGAAGCTTTCCAGGGATGCAGTCATGGGAGTATAATTCAAGGGAAATGGGATCAAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAAGAATCAGAAAATGAAGCTTCAATTACTGAGCTATACCCTCGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_31127::LG8:44605430-44607430(+)
AGGCCACCCGTAATATATGGAAATTAAACAAAACTAATGCCAACATGTCGAAGACGAATACTTTAGCAACCAGCAAACAAAATCTTCATTTTTTTTTATATTGGAAAACTGAAGAAACTTTTATGATTGAAACAGATACTTTGTAATAATAATTGAAAAATAGTATGATATATTAACAAAAACAACAATAAGTGACATCAGTTGATAAATAACAATAATTTCAATGATCGTCAATAAGAAAAATAACTATAATAGACGTTAACTTGAAAGAAAATTCATTGAAATGACTTAAAAAAAAGGATATTGAGCCGACAATTACGTACCTAATTAAGTCAATGACGTTTTGAATCTGTAAACTTAAACGCGGCAGTTCCGTCTCTATCAGGCAACCTTCTAAGAAGGTGTCAGTCCTTTCATATACATTTTTTATACCATCAAAATTAATGGTCCTATAGCTACCCCTCATGTCAAAGCCAAATAAAATATTTGTATCATGAATGACTTTTAGATAACTTCTTTACATCATCTATTTCAACTTTCTACTTTCCCTTCCGAATCTTTCAAAAATGGCACCTATTAAAAACTACATAAATAATATTTTAAATAAAAAATTCTATTCTAGTTTTCTTTATTTTTTAATTTGTATTTTTCAGATACTGACTAATATATACCTTTTACTAAAAATTAGAATTAGATTCGACCATCAAACATTATTTTTCACAACATTTACTGTAGTTATTTAAAGTGATGATGGATAAACTAATTAATACAACTAATACTTTATCTTACTATCGTTTTGAATGTTTCAACATGTTATTATTTACGTCCATTTTATATAGCCTTCATTCTCCACAACAATAATCTATTCTAAACTTAAAAAATTATCTTTAATTCTTCTATTTTTAACACAAGTCAATTTATGTAAAATATGAAAATTTATAATATATATATATATAATTTGAATTGAGTTATTTACACTACTTTTTCTTTTAAAAGATTTTATGTACCAATAAAGAACAATAAAATGAAATGATTTATAGTGTCTGAAAATTTTAAAACAGCAAAGTCGCTGTTTTACAGTCTTGGTATACCTCCAAAAATAATTTTGTGAATTATATATAATATCAAAGGAGCTTGTTCAAAATGAGTCTTTTTCATGAAACATTTTTACCTTTTAACAAAAAAAAAGTCGTATTATTTACTAGCAAGAACAATTTTTTTTTAATATCATATCATTTGAAAAAATAATCTAGACGTGTGAATATAAAAATTAAAAAAGGTTCGAAATTGATTAACTTATTCTTTCAGGAATTTTTTCTTTCACGTTTAATTTTTTAATTTTAAAAATGTGCGAATTTAATTTTTTTAATTAAATTAAAAATATTAATTAAATTTAATAAAATTTAATTAAAATAACTAAATTTACTTATTTTTAAAGTTAAACGAATAAATTAGACCAAAGAAACTAATTTTAATTTTATTTAAAATTAAAAAAATTAAAGACATATTTAAAAGGAAATGTCGTCTAGTAGACGAAGAGTTCCAATAAATGAGATTTTTTAAAGAATTGAAAATGGTGAAAATCCAAATAATTCAAGGCATTTAAATTATATTTGTTAAGAGTTGGCTTTTTTTTTGTTTCACCGCATATATGAGCTGATTGAAAACTTCATATTTCACAGTATTCCGTGTCTGTATCAGTCACTTCTGTCCTAATCAGCTCGACGAGGCTACGCTTTCAAACCTTTTAATTTTGACTACAGAAAATGTGAGTTTTTCGTTGAATACTCTTGCTTCTAGACTACGTACTTTTCAGTGTAAGCAACTCACGATTATAAGGACAAATATTAATCATAAGTCTCTTTGACTTAGTAACATTTAAAAAGAAAAGCTATTAAAAACGATATAAAAAGAGATGTAATATGTTAAATGAAAACTAGAAACCAAAAGTACGAAACTTACTGAAGGAAATTCTGGTTATCAAGTGACAGCACCAATCA


Gene Sequence:
>Vu_31127(+)
ATGATAATACGCAAAGCTTCAGTTAAGATTGTTGGTTGTTCTGATTATGTGATGGGTGCCGTTTCTTGCATGCTTCTTTTCTTTCTCTGTTGTCTAATACCTGAAGCCAGTGCCCAGTATCTCTTCCTAAACTGTGATAACAACAACGGGAACTACACAGCTAATGGCACCTATAGCACCAATCTCAACACCCTTTTATCCACTCTTTCTTCCAACACAGAAATCAACTATGGTTTCTACAACTTCTCCCATGGTCAAAACGCAGACAGAGTCAACGCCATTGGGCTGTGCAGGGGAGATGTGGAGGAAAATCCGTGCCGCAGTTGCCTCAAAGATGCCGGAGGCAATATCACAGAGCTTTGTCCAAACCAGAAACAGGCTGCTATATATTATGACAACTGCATGTTGCGCTACTCAAACGACTCAATATTTGGGGTCTTGGATATTTCTCCCCACTTTTATATGTCGAACTCAAATAATGCAACAGGAGCGGCTGAGTTCAATCAAGTGCTTCAAAACTTATTAAGGGAACTCAAAGATAAAGCAGCATCCGGTGACTCCCGTCGTAAGTATGCTACGGATAATGACACAACTACCAATTTTCAAGCCATATATGGTCTTGTGCAATGCACCCCTGATTTGACTCAGACAGAGTGCAACGATTGCTTGGATGAGGCTATCTCACGAATCCCAACTTGCTGCAACGACAAGAGAGGTGGTAGAGTTGTTGGACCCAGCTGCAATATTAGATATGAAGATTATCGCTTCTATGAACAGACAACGATAATAGACCCAGAGACACCACCACCCACAATTAACACTTCCACGGAAGGTACTTATCATTATATTTTGCTTCTCAATAGCCTAATAATTACAGTTGAGTTCATGATCCTCCAAGTGCCTAACCCAGCAGAGGGTTCTTGTTTTTTCAGAAAGTAGCAACACAACAACAATTGTCATTGCCGTAGTTGTGCCTACTGTTGTTGTTGTTTCGCTATGTCTCTTCATTTGTTTAAGGAGGAGAAAGGCAAGGAAAAATCTTGAAGGTTAGTCCACTTATCAATTTATTGTGATATTTATGTCCAATTCACTCCTACACTGTTACAATAAATTATCAACAGACAAAATTTCCCGAACACCGACAGCGGTATTGTTCTTTGAACGTATGAAAAAAACTAACTAGTTTAAATCCGTTCCCCATGTAAAGTTAAAAAAGAAGAAAGAGAAGAAGAAGATGAAGATGAGGATGAAATTAAAATTGCCGACTCGTTGCAATTCAACTTTGACACAATACGAGTTGCTACCGAGGACTTCTCTGATTCTAATAAACTTGGACAAGGCGGATTTGGAGCTGTTTACCGGGTAAGTAACTCAGTTGAATTCAGACACGCATCATCAAAACATGCTATAACAGCCGTTTGCAAATTATTTACTGTACCTGACAGAGGTATATTTCCAGGGTAAACTCTCCAATGGACAGATAATTGCAGTGAAAAGGTTGTCAAGAGATTCTGGACAAGGAGATGTTGAATTTAAGAATGAAGTGCTTTTAGTGGTGAAGCTTCAGCACCGAAATTTAGTTCGGCTACTTGGTTTCTGCTTGGAAGGAAGAGAAAGACTACTTGTCTATGAATTTGTTCCCAATAAAAGCCTTGATTATTTCATATTTGGTACTTTTTATCACTGCATAAATACAATCCTGTTCTATCGTTACAAACCTAATTATTCAGAGTTAAAAACTATTGGCGGCTATATATGCAGATCCAGCCATGAAAGCACAATTGGATTGGGAAAAGCGCTACAAAATCATTAGAGGTATTGCTCGAGGTCTTCTCTACCTTCACGAAGATTCTCAACTACGAATTATCCATCGTGATCTCAAAGCAAGCAACATTCTCTTAGATGAAGAGATGAATCCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGGTTTTATTGGATCAAACTCAAGCAAACACAAGTAGAATTGTTGGAACCTAGTAAGTATTAAAATATGTTACACCTTGTTAGTGGTTGAGAGTTTAATGTCAATCGACCGTCTAAGAAAATTTATTGGAGTACAATAACTCAACTCAAATAAAAGATAAAATTAAGATAATAATATAATTTTAGTAAAAAGAAAAAAAAATGGTTTATAAATGATATTCTTATTTTACTTCTATCTTATCTTAGATCCTAATAGTTTTATCGTTACTCTTCACAAACCATGAACTAGTAACTGTTGAAAGAGTTTGAGTCTTAGACAGTTGTTAGAATCTATCTGTTTCATATGGCTGGGTGATACCTAAAAAACCTTTAACAGTAATTCAGAACCAAAGCTGCCAATGGTATTAGAAACTGAAACAAAACGAAATTAATAATCCTTTTCATATTGGTCTGCAGTGGATATATGGCACCAGAATATGCAATGCATGGACAGTTTTCAGTGAAATCAGACGTCTTCAGTTTTGGTGTACTGATTCTTGAGATTGTAAGCGGCCAGAGAAACAGTGGAATTAATAATGGGGAGAATATGGAGGATCTACTAAGCTTCGTAAGACTTTCTTTTGTCACTGTTGCTTCTTCTTTACCACCTAAAATATGGATTAGAAGATTAGATGGTCCAAAACGTTAATGTAGAAGTGAATCCTTGATCTGATAACAAATTTTGCAGGCTTGGAGAAACTGGAAGGAGGGGAAGCCATTAAATATTGTAGATCCATCACTCAACAACAATTCACGGAATGAAATGCTGAGATGCATCCATATTGGGTTACTCTGTGTTCAAGAAAATTTAGTTGACAGACCGACCATGGCTACCATTATCCTGATGCTTAATAGCCATTCTCTGAGTCTCCCTATTCCAGCCGAACCTGCATTTTATATGAACAGTAGAACTAGAAGCTTTCCAGGGATGCAGTCATGGGAGTATAATTCAAGGGAAATGGGATCAAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAAGAATCAGAAAATGAAGCTTCAATTACTGAGCTATACCCTCGCTAG