Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_31080 LG8 44230673 44235098 PREDICTED: putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g14440
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   chloroplast
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 44230783 downstream_gene_variant
A/T 44230943 downstream_gene_variant
G/T 44231187 downstream_gene_variant
G/T 44231191 downstream_gene_variant
T/A 44231430 downstream_gene_variant
C/T 44231513 downstream_gene_variant
T/G 44231708 downstream_gene_variant
T/C 44232048 downstream_gene_variant
C/T 44232059 downstream_gene_variant
A/T 44232116 downstream_gene_variant
G/T 44232415 downstream_gene_variant
A/T 44232425 downstream_gene_variant
A/T 44232460 downstream_gene_variant
A/T 44232475 downstream_gene_variant
G/T 44232596 synonymous_variant p.Pro371Pro
G/C 44233051 downstream_gene_variant
C/T 44233138 downstream_gene_variant
A/G 44233190 downstream_gene_variant
A/C 44233204 downstream_gene_variant
T/C 44233248 downstream_gene_variant
C/T 44233956 intron_variant
C/T 44234442 intron_variant
C/T 44234604 synonymous_variant p.Pro165Pro
A/C 44234612 missense_variant p.Ser163Ala
G/T 44234763 synonymous_variant p.Pro112Pro
G/T 44234916 synonymous_variant p.Pro61Pro
G/T 44235086 missense_variant p.Leu5Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_31080.1
MSLFLFLLLLLLFIPISLSQAPPRGLLINCGAQSEAQFDDRTWLPDWSFVSSGSPKTLTSPVLFPTLQTLRSFPRQVKKHCYNVPTYRGAKYLVRTTYFYGGVNGVDHPSPPVFDQILDGTLWSVVNTTGDYANGNSTFYEGVFMAQGKIMNLCIGSNTYTDSDPFISSLEFLILEDSLYNTTDFNSFGLALFARHSFGNSGSPIRYPDDQFDRIWVPFEQSSSAIASTDNVSVYGFWNLPPAKIFETHVGSEQLESLELRWPTALLPSSKYYIALYFADNTVGSRVFNISVNGITYYHNLIVIPSGSVVFASQWPLSGPTTITLTPDASSTRGPLINAGEVFYLLPLKGRTSTRDVIALEKVKESLRNPPPDWNGDPCMPQQYSWIGITCSEGPRIRVVTLNLTGMDLSGSLSPSVANMTALTNIWLGNNSLTGQIPDLSSLKMLETLHLEDNQFSGEIPSSLGNISSLQEVTSGNNFLSPPAS*


CDS Sequence:
>Vu_31080.1
ATGTCCCTCTTTCTCTTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCTTCATCCCCATCTCTCTCTCCCAAGCGCCCCCCAGAGGCCTACTCATAAACTGCGGGGCCCAATCAGAGGCCCAATTCGATGACCGAACATGGCTCCCCGATTGGAGCTTCGTCTCTTCGGGCTCGCCCAAAACCCTCACCTCTCCCGTTCTCTTCCCCACTCTGCAAACCCTTCGCTCCTTTCCTCGCCAAGTCAAGAAGCACTGCTACAATGTTCCCACGTACCGCGGCGCAAAGTACTTGGTGCGTACCACCTACTTCTACGGAGGAGTCAACGGCGTCGATCACCCTTCGCCACCCGTCTTTGACCAGATCCTCGATGGGACCCTCTGGAGCGTGGTCAACACCACTGGAGATTACGCCAACGGAAACTCCACGTTCTACGAAGGAGTTTTCATGGCCCAGGGGAAGATCATGAACCTCTGCATCGGTTCCAATACTTACACAGATTCTGACCCGTTTATCTCTTCTTTGGAATTCTTGATTCTCGAGGATTCTCTCTACAATACCACGGACTTCAATAGCTTTGGCCTTGCATTGTTTGCGCGTCACAGTTTTGGAAACTCCGGATCACCCATTCGGTATCCTGATGATCAGTTTGACCGTATATGGGTGCCTTTTGAGCAGAGTAGTTCTGCCATAGCAAGCACTGACAATGTTTCTGTTTATGGTTTTTGGAATCTTCCACCTGCAAAAATATTCGAGACGCACGTAGGATCTGAACAATTGGAATCCTTGGAACTGAGATGGCCTACAGCGCTACTTCCAAGCTCTAAATACTACATCGCACTATACTTTGCTGACAACACTGTTGGATCAAGAGTTTTTAACATAAGCGTAAATGGTATTACTTATTACCATAATTTGATTGTGATCCCATCAGGCAGTGTTGTATTTGCCAGCCAGTGGCCTCTTTCTGGTCCTACTACAATAACTTTGACCCCTGATGCAAGTTCAACTCGGGGCCCCTTAATCAATGCTGGTGAAGTTTTTTATCTGCTGCCACTTAAAGGAAGAACTTCAACTCGAGATGTTATTGCGTTGGAAAAAGTAAAAGAGAGCCTTCGAAATCCACCCCCGGATTGGAATGGTGATCCTTGTATGCCTCAGCAGTACTCATGGATTGGCATCACATGTTCTGAAGGACCACGTATCCGTGTAGTGACTTTAAACTTGACAGGTATGGATCTTTCTGGATCTTTATCGCCCTCTGTTGCCAATATGACAGCCCTGACTAACATCTGGCTTGGGAATAACAGTTTAACGGGGCAAATTCCTGACCTCAGTTCACTAAAGATGTTAGAAACACTGCACTTGGAAGACAATCAATTCAGTGGAGAAATTCCCTCATCCTTAGGGAACATCAGCAGCTTGCAAGAAGTAACTTCTGGAAATAATTTCTTATCCCCCCCGGCATCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_31080::LG8:44235098-44237098(-)
AGCGTGTTTTGTGATTCGCCCTGCAAAAGAGAGGACAAGAAGAAGAAAAAAAGAACTAGTGGTGGTGAGGTACACCACCTATTAAGAAAAGAAATAAAGGGAATTTCTTCTTTTCCATTTGAGATCCTTTTAGTTCTTCCCCATCCAGTATGATTTTCCTGAATCCTGTAATTTTTGAAATACTAATTATACCTTTATACGGAATTTAAGTTCCAGATGCATCATCGTAATTATTTTGGATTATACAATCTTAAATAAAAAAATCAAAATTTTTATATTTCAGATTATATATTCTAAAATCATAGAAGAAAATTGCATCTGATTATATAATTCAAAATATAAAATTCATATTTTAAATTGTAAAATATGTTTTTATATTTGGATTATAAGATTCGTAGTGCAAAATTTAAGTTACATTATAAGAAAAATTTGCAGGAGGATTTCACAAATCTTATCAGTGATTTTGTTGAGCTTGTTGGCCTTGTGGGCGATCTAAATATCCATTGGAATGTTGCAATTCCTATGTTCTTTGTCTCCCTGATTCTTGTAAAAAATTCGATCATGTTCTTGCTTGATTCAATGATCTATAAGCAAAATCATCCAGTACGTCGTATTGTAGAATTTTGATTTGATTTGTCGTTTAGTGGTGTTTGGTGAAGTTGTTTCACTGGTATTGGAAAAAATAATGACATTCTGGAACGAGCATGGGCTAAAAATTATGGGAAGGTGAGTTTGGTCACAAGATATAGTAAATGCTCGTCCATTATCACAGATGGAAAGGTAAAGAAAAAAATATTTTATTATAATTTTTTACAATATTTTCATACAGTCATTTTTATACTATTTTACTATTTATTGTTTGTTATGACGACGTATCTTAAACTTAATGAAAAAAATAACACGTATATTATATTAAAATATAATTTTTCTTAATTAAGCAGATATACAATTTGTAATATAATTTAGAAAGACAATTCCAAACATACATTACATTGCAAATTACACTGAAATTTAATATCTCATTCCCAGTTGTAAAATCCTAGATAAATGCGTTAGAAGTCAAGGGGAGGGAGCTTCTCACACCGTCTTAAGCCAATGGAAAACAACAGCATGAGATAAATCCAAAATGAAATTATAATTTTAAGCAATTTTTTAACAAGAGATAACTAAGTCGGTGAAGCAATGAATGCGCTAAGAAAACATGAAGAATCCCCCCTCATTCAATGAGTTTGTTTTTTATTCATTGAATGTAATAAACTGTACTTTAATTGAAAGTTATTGTGTACTTTTTTTTTGCATTAACATAAAAAAACCTTCGCTTTTACTTTTGTACAAACTACTTTAATGATAAATTAAATAGTATAGTTTCATATTATTCTATTATTTATGTGCTTTAGGAAATACAATACAGTCCTATAATTCACAATAATAGTCATCATATTCCTTATCAATATTATCTTTAAAAAAATAACTGTCTAACAAATAGTAATTATACAATTTTACGTATTGCCGGCACTGCACACGCACACAGCATCATTGAACCTTTAATGTAAACATGTCTAATCAATTCACTAAGGAAATTTCTTTTCTCAGGCTCTTAATCACATTGTCAAGATCATTTTGACATCTTCTGACTCCATTAAAAATGATACGAAAAGAAATTTAAAACATGTTTGTTTGAGTGAAAGAGAAAGAGTCAGAGGAAGAAAACGGCATCCCACTAATGTTTTGTTTGTGTATCTAATCCAACAAAACAACTAGAGTAGTGGTGTCTGACCGGTAAACTTTGTTTCCCGCGTTATCATTACCCGTTCCAACCAATAACCAATCCATATTCCATAGTCATATTCTTTTCTTCTCCATTCTTCTGTGTTTTCTTTCCTACCACTCCAACTCCAAGACCCTTTCAAACTCCACCACGAAAACATCACAATCTTAACTAACTACCTCATTTATTCATTCATTCATTCATTTTTCTCATTCCAACCACTTCAACCACC


Gene Sequence:
>Vu_31080(-)
ATGTCCCTCTTTCTCTTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCTTCATCCCCATCTCTCTCTCCCAAGCGCCCCCCAGAGGCCTACTCATAAACTGCGGGGCCCAATCAGAGGCCCAATTCGATGACCGAACATGGCTCCCCGATTGGAGCTTCGTCTCTTCGGGCTCGCCCAAAACCCTCACCTCTCCCGTTCTCTTCCCCACTCTGCAAACCCTTCGCTCCTTTCCTCGCCAAGTCAAGAAGCACTGCTACAATGTTCCCACGTACCGCGGCGCAAAGTACTTGGTGCGTACCACCTACTTCTACGGAGGAGTCAACGGCGTCGATCACCCTTCGCCACCCGTCTTTGACCAGATCCTCGATGGGACCCTCTGGAGCGTGGTCAACACCACTGGAGATTACGCCAACGGAAACTCCACGTTCTACGAAGGAGTTTTCATGGCCCAGGGGAAGATCATGAACCTCTGCATCGGTTCCAATACTTACACAGATTCTGACCCGTTTATCTCTTCTTTGGAATTCTTGATTCTCGAGGATTCTCTCTACAATACCACGGACTTCAATAGCTTTGGCCTTGCATTGTTTGCGCGTCACAGTTTTGGAAACTCCGGATCACCCATTCGGTTTGTTTATCCTTTTCATTGCCCTCCATGGTCAAACTCGGTGTCTTTTGTAGCTTTGTTCCTTTAGTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAAGTTAATGTTAAGTTTTTGTTTGCTTTTCTCTTTTCTCTTTTCTCTACGGTGAAAAAAGAGAGTAACCTTTAAGAGAAGGTTGCAATTCAACTTTCAAGGCAGCTAAGGAAGCTTATGGATTAAATTCCGAGTTGAATTTGACTTTTTCTTATGAATTTAATTAGAATTATAATTTAATTTAATGTAATTGTTTATTATAAAGTTATCCAGTTACAAATGAAAATGATAATTCAGGTAATTTTTTTTATACCCTGAAAAATGGAGCCGTTTCTTAATTTGATAGTTGAAAGAAATGTACGATATCTGATAAATTTAGGAGATTTGGTACAGTTAGTTCATGACGAGAAGTCATTCATCTAAAACTAACTGTACCAAAACCTCTAAATTTATCAGGTAGCATATGGACTCTCATTAATTAAACTATTTTCATATATAAGTAATCACGGATAATGTGTTGGACTCTACGAGTTCCCTTTTTACTATGAAACCATTACCTTCGTGTTCTTTTTAATTGTTGTTTCCCTGGTCTCTGATGCAGAATGGTGGGTTTTTCTGTTGTTGTTCAGGTATCCTGATGATCAGTTTGACCGTATATGGGTGCCTTTTGAGCAGAGTAGTTCTGCCATAGCAAGCACTGACAATGTTTCTGTTTATGGTTTTTGGAATCTTCCACCTGCAAAAATATTCGAGACGCACGTAGGATCTGAACAATTGGAATCCTTGGAACTGAGATGGCCTACAGCGCTACTTCCAAGCTCTAAATACTACATCGCACTATACTTTGCTGACAACACTGTTGGATCAAGAGTTTTTAACATAAGCGTAAATGGTATTACTTATTACCATAATTTGATTGTGATCCCATCAGGCAGTGTTGTATTTGCCAGCCAGTGGCCTCTTTCTGGTCCTACTACAATAACTTTGACCCCTGATGCAAGTTCAACTCGGGGCCCCTTAATCAATGCTGGTGAAGTTTTTTATCTGCTGCCACTTAAAGGAAGAACTTCAACTCGAGATGGTATAGCTTTTGATTTCATGTTTTTTTCTTAGCTCTGGGTCATTTCTGAAACAATCTTACGTTTGACATTATTTCTTCGCCAACAAGAAAATACAAGTTTCTACGCACAGGATGGAAAATATCTTCATCCAGTGCCACTGTCTAGCAATATATATCCTAAGGTTTTTTGTTTCACTAATCAAAATTGCAAATCTTAAAACGACTTTATATGAACAACGGCAACATATTAAGATACAGTTTTGAGTAAAGTTCTAGAGAAAAGGGATTAGAGGAGTTTTGTTTTGCACTTTTTTTAAGCGAGAAGGAGAGATAAATTTTTTTAACAGACGAGTTAAAGAATGATAGAGCTACGAATTTTTTTATGAATGATGGGAATGATTGAAGATAAGAATAGGTCAGTATACTGTCACTGTAATAGTATTTTTTTTCATTGTCATGCTTGCACCAGCTTAGTAAGAAAGGTTTTGAAATTGGACAAATCTGTAGTGAGAAGTGTAACGAATGCCATTACTACTCGACAATTACCTCTATTTTAACCCGAGTTCTGTTTTCCTTCTCACATATCAAAGAGAAATTCTCAATGCGTTTTTCTGGGGGTTGGGGGTTGATGGTAGCAAGCCATTGGCGGCCCAAAAAAAAAAACAGGATCTGCTGACTGGTTATTCTTTATTTTAAGTCGCAACATTTTCATCATAGTTGTAGTGCGTTAGTAATGGTAACTTGCTTTTGACAGTTATTGCGTTGGAAAAAGTAAAAGAGAGCCTTCGAAATCCACCCCCGGATTGGAATGGTGATCCTTGTATGCCTCAGCAGTACTCATGGATTGGCATCACATGTTCTGAAGGACCACGTATCCGTGTAGTGACTTTGTAAGACCAGACTTGAGTTGTTATAGCACATGGTATCCTGTCCTTTCTGTCCTATTCTGCTGTGTGAATGAATAGCTTACTTATGATTTCCTGTTTTCGTTCAGAAACTTGACAGGTATGGATCTTTCTGGATCTTTATCGCCCTCTGTTGCCAATATGACAGCCCTGACTAACATGTAGGCTCTTTAATTTACGTATATCACTTTATGAAATTTAGTATTTCAAATTTTATGATCAGTAAATCATTGCCTTTCTTGCAGCTGGCTTGGGAATAACAGTTTAACGGGGCAAATTCCTGACCTCAGTTCACTAAAGATGTTAGAAACACTGTAAGTTGATACTTGAAGTGTGTGTGTGTATTTTTAAGTATGACATGATAGTTTTTCTTTTTTCATATAATTTATCTCATCACTGGCTGTAGCTAGTCTACCATTTTTCATTTAATGGAAACAAACATATTTTTGCAAGTTATTTTTATCATAAAACAACTCATGTAGTCGTGTTCTATAGCAACTTTCACGATCGAAAAATGTTTGAAATCCAAGAAAACTTCAATGTATTCATGGAGCTCAGTATTTGCATATTGTTATTTTATTTTAAGGCACTTGGAAGACAATCAATTCAGTGGAGAAATTCCCTCATCCTTAGGGAACATCAGCAGCTTGCAAGAAGTGTAAGTTGTACCCTATTCTAGATTTACCAGAGGTTACAAGCAAATTGTGTTTTTTTTTTGGCTATTTCAATACCGGAAAATTTTCCCTACAAGCCGCCTCCTTTTTCCAGTTACATTTTGATACATTCAATTATGTCTAGAAAATTAAGTCAACTTGTAAAACTATATTGATTATGATCATTATGAGTTTAGTTATATAACTAATCTCTGCTCATTATTTTGTGATGCTTGATTAGATTGGTAAGAATCAGAACAGACATTTGTTCAAAGCTAATTGAGTTTTGGCTTTGGCCTGATAAATAAACATGCCGAGGAAAAAGCAAAGTGAATTTGATGTCTAATGAAAAAATAAGAGATTTGATTGTTCAATCCTCGCATACTTTGATTTCGATCAATCTATGAAATTTCACTTGCGAGTAGACTTTACTTATTAATATTTGTAGACTTTAGTTGCAATTATGCCTGACTACGTCTTTCATGCACCTCTCTAGCTATCATTGCAATTAGAAATTATATTTACAACTCATGTCCTGGAGAATTTAAAAGATTTATTTCACTACAATTATTTTCTGTCTACACTGTGCCACTCCAATTTTACCATCCCTGGCCCCCCAGGCACCTCGTCAAATTACAACTTTTTGCTTTCTTGTTGGAAAATTTTTATTTCTCATGATCGAATGCCAAAGTTAGCACGAGGATAACTTGGAGTGAGGGAATGATTACCAAGCAATACTGTAGTGTCCTTTTAAATAAAATAGGATTTTCTTATATAGTGACACAAACTTAGTAGTATCGCTCATGTACTTGGTATTTGTAAATTATGTATCTTTGAATTCTGGCTGTCATTCCTTCTTAAGATCTGCGAGTTACTCTTCAATTCCATTACTTGTCCCTATAATTGTCTTCTTTTCCATATTTGTTTTATGTTAACTGATGATTGCCCCCCGTCCCCCATTTTGTTGCAGATTTTTACAGAACAACAATTTGACTGGTCCAATTCCAGCAAATCTCATTGGAAAACCAGGACTGGATGTCAGGTAAGTAAAGACCTATCTCTTATTATTGTCAGCATCAACCACAGTTGTTGTTTTACTGACATGCGCTTATTTATTACCAACAGAACTTCTGGAAATAATTTCTTATCCCCCCCGGCATCTTGA