Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30998 LG8 43357786 43365441 PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERL1 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 43357818 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/G 43358130 missense_variant p.Leu9Trp
G/A 43358335 intron_variant
T/A 43358413 intron_variant
C/A 43358508 intron_variant
C/T 43358757 intron_variant
A/T 43359071 intron_variant
T/A 43359486 intron_variant
T/A 43359492 intron_variant
C/G,* 43359822 intron_variant
T/A 43360069 intron_variant
G/A 43360442 splice_region_variant&synonymous_variant p.Leu160Leu
T/A 43360531 intron_variant
G/A 43360610 intron_variant
T/C 43360611 intron_variant
G/A 43361003 intron_variant
C/T 43361013 intron_variant
G/C 43361874 missense_variant&splice_region_variant p.Leu351Phe
T/C 43361876 missense_variant&splice_region_variant p.Ile352Thr
C/T 43362300 downstream_gene_variant
G/A 43362775 downstream_gene_variant
G/A 43363293 downstream_gene_variant
C/A 43363584 missense_variant p.Ser620Tyr
C/G 43364225 missense_variant p.Ser751Trp
G/A 43364815 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30998.1
MEDNGLAPLFNVGPHKLKLLMSLLLLMLFLLFPFALPLSEEGQALMAMKATFSNMADVLLDWDDVHNDDFCSWRGVSCDNGSLAVISLNLSSLNLGGEISPAIGDLRSLQSIDLQGNKLTGQIPDEIGNCAALFLLDLSDNHLYGDIPFSLSKLKQLEFLNLKSNQLTGPIPSTLTQIPNLKTLDLARNRLTGEIPRLLYWNEVLQYLGLRGNMLSGTLSPDICQLTGLSYFDVRDNNLTGTIPDSIGNCSSFEILDISYNQISGEIPYNIGFLQVATLSLQGNRLTGKIPEVIGLMQALVILDLSENELVGSIPPILGNLTFTGKLYLHGNMLTGPIPPELGNMSNLSYLILNDNHLVGKIPNEFGKLEHLFELNLANNHLDGTIPHDISSCTALNQFNVHGNQLSGSIPLSFRNLGSLTYLNLSANNFKGTIPVELGHIINLDTLDLSCNNFSGLVPASVGYLEHLLTLNLSHNHLGGSLPAEFGNLRSIQILDMSFNNLSGSIPPEIGQLQNLMSLIMNKNDLQGKIPDQLTNCFSLTLLNLSYNNLSGVIPSMKNFSRFSADSFLGNSLLCGDWVGSICRPYIPKSRVIFSRVAVVCLTLGIMILLAMVIVAFYRSSQSKQLMKGSSRTGQGPPRLVVLHMDMAIHTLDDIMRSTENLNEKYIIGYGASSTVYKCVLKNSRPIAIKRLYNQHPHNLREFETELETVGSIRHRNLVTLHGYALTPDGNLLFYDYMANGSLWDLLHGPSKVKLDWETRLRIAVGAAEGLAYLHHDCNPRIVHRDIKSSNILLDENFEAHLSDFGTAKCISTSRTHASTYVLGTIGYIDPEYARTSRLNEKSDVYSFGIVLLELLTGKKAVDNESNLHQLILAKADNNTVMEAVDAEVSITCIDLAHVKKTFQLALLCTKKNPSDRPTMHEVARVLVSLLPSPPSKILAPPAKKFDYAHFVIEKGQPRKVEAQPQQEDNNSTNAQWFVRFGDVISQST*


CDS Sequence:
>Vu_30998.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30998::LG8:43355786-43357786(+)
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Gene Sequence:
>Vu_30998(+)
GAGAAAACAAAAGGAAATTAAGGCTCACGCCAAGAGAGGCGCGTAAGTTGAGAAGAAAGAGATAGCTGTCAAATACGCTGGGAAACGGCGAGTACGAATGACGGCGGCTACCACCCTTATATACAGTGACAGTCTCCTATGCTAACGTCGCTTCACCGCCGTTTCCCATTATCTCTCATCATAACACTGTATTTTAAGGCTCACGCCTTAAGCCTGCAATCTCTCTTTCTCTCTCTACCAAGAAACCATTGTCGTTGTAATAATATTAACTGCATTCCATCATACTTGGTCTTTTCGCTACGTGCTGTGGTTGGCGACCATGGAAGATAATGGCCTGGCGCCGTTGTTCAATGTTGGCCCCCACAAGTTGAAGCTTCTCATGTCTCTTCTTCTGCTCATGCTCTTCCTTCTCTTTCCATTTGCTTTGCCCCTCAGCGAAGAAGGTTTGTGTTTTGTGGGTGCATTGCCATTTTGACTCACCCCTTCGGTTCTTTTTTGGTTTATTCGTTTGCTTCATCCGTCAAATCTTTGTGCATGTCTTTTTTTTTTGTCTGTTGTTCCTATGGGTAGTTGTTGCGGTTGTGGTGATTCCTTTTCCTCGTATCTTTTCCACCCCCTTTGTGGCTCTCCTCAAACAGTATTATTCTTTTTTTTTTTCGTTAGTGTTGCTTTATACATACTTGAAAAGCATTCTAGTGGAATGTTGTTTTTTGTTTGTTGCCCCACGTCAAATGCAGTTTTAGCTTCTCTTTATTTCGTTTGCGCTGTTCTCTTTAGACATTCGACTCCACGGTGTTTTTGTCGGGGTGTTAGATATTTACGATGCTGAATTTAGTGAAACAACCCTGGGTGTGTTTTATTTTAGTTGTGGGGGGAGGGGGGTGGGGGTCCTGGAATTAAGTGCCTTTTCCGTTCCAAGAAAGTGTTCACGTGTTTTGAGATTTTCCTTCATAACTGAGGTTGCTGCGTTACTTGGTTGAACCATGAAAGAATCCGAATTTGGTATGGCATACCTTTTATACCTTTTTGATCTCTTTTCCGGTGGATATTTCAAGCCATACCGGGCCAAACGAAGAAACTTTTTGAATAGATTCGAAACTGTAATGAGATGTTGATTTCTTTGTTGACCTGTTTTACGGACATTATTACATCAATGTGATTTATATAAGAGTGATGATACAGATTAAGGACATCTTAATTTCTAGTCGTTTTAATTTTTGGGTAAATGCATTACTGGTTAATTGTTTAGTGTGGAACAGTTTTGTCAATATTTTAATATGTATGGAAATTTGTTTACTTTGGGTTTGGCACTTGGACCGTTGTTCTACTGTTTCAGGGTATTCCGGTTCTGCTTTTTTATTTGGACGCCTTTCTGCATTTGAGTGCCTTTTTAGATTTTTTATCCTTTACAATTACAACTTTGACATTATAATATTGAAATTTATGTAAACTAGACCACATGGATAAATTGAGTTCTTTCACTGCCACACTCTTACTCGTGTTCTTCCATTAAATAATTTCTTGAATAGGAAATTGGTATATCTCAATCTCGGTACTTGCTTGACTATTGCTTACAGAGATTGGATACTCGCTTTAAAAAAGAACTATGTTGCCCATGAAATGTTTTGTTATTTTCTGAACAACGTTTTCCCCCATTGCCGTGGTTTGATGATTGCAATTTTTTGCCGTAGGTCAATTAATTGTTTTTTTTGGAAGTATTTTGTAGTTTGTTTTACAATGTTTTTTGTTGCATGATCTGTCCATATAATTACTAATCGTAGACGATGGAACACTATGTACTACTATGGAATTGATAATTGATAGATTTGTACGGTACTGAGCTCTGGAGATGCTTGAGTGTTGAACGGCCTTGAAAATGTGCAGGACAAGCATTAATGGCGATGAAGGCCACTTTCAGCAATATGGCAGACGTGCTTCTTGACTGGGATGACGTCCACAATGACGATTTTTGCTCTTGGCGTGGAGTTTCCTGCGATAATGGCAGCCTTGCTGTGATTTCTCTGTGAGCTTATTATCCTTTTGTGATTATTTGCTTCGTTTGTATTAATCTTTCTAATTAACAACCATTCGTGTTAATTAACTGTTTGTGTTGATTTAAAGTTCTTTGCTCTGTTCTTCTAGGAACTTGTCCAGCTTGAACCTCGGCGGGGAGATATCCCCAGCCATTGGTGACTTGAGAAGCTTGCAGTCCATGTATGTTTACGCTTAAATGATTTATCATTCTCATCTGAAATGGATGTGTGTTTAAGCTTGACCTTTGATTTATTTCTGAGATGTTTGCTTGTTTTTTCAACCAGAGACTTGCAAGGGAATAAATTAACGGGGCAAATCCCAGATGAAATTGGAAACTGTGCAGCACTTTTTCTTTTGTAGGACTCTATTCTTGCTTCTCGTATTACCTACTTCCATGTTGATCTTGTTTTACTGGGAAATATTTCTTTATATATTTGCTTATTTCATTTTTTTCTCTTTCAATTGAAGGGATTTGTCTGATAATCACCTTTATGGTGATATACCTTTCTCCCTGTCAAAGCTAAAGCAACTTGAGTTTTTGTAAGTTTGAAAGCAGAAGTGACGCTTTATTTTGTTGTTCGGCTTTAATTGAATGACGCTTAAATTGTATTGATGGATACAGGAATTTAAAGAGTAATCAGTTAACTGGTCCTATCCCTTCAACCCTAACCCAAATTCCAAATCTTAAGACTCTGTAAGTTCGGTTTCTCTTCTCAATACTAAATTTTATTGTATTGGTATTTTTTAAAATGACACTTATCCATTCTAATAAAACGAGTAAATGACAGAAGTTTCTGTCACCTTAGTGTTTTAACGATCTGTTGCTTTAGCTGCCTCTAAATAAGTGCAATTACTGTTCTGTTATGTTTGCAGTGATCTTGCTCGAAATAGGCTCACTGGAGAGATCCCAAGATTACTCTATTGGAACGAAGTCTTGCAGTACCTGTGGGTTTTATCTTTTCTTTGTGTATTTTACTTTTACGTCTGGCTGTATCTTAGTAGTTCTTTAACTTTGGGAGTTTTTATTTGGGATTGTTCGTTGATGCAGTGGATTACGAGGGAACATGTTGAGTGGTACTCTGTCTCCTGATATATGTCAATTAACTGGATTGTCGTATTTGTGAGTAATCCAACCCAAGCACGATGAAGCTTCACATTGGATCTTTCGTGTAACCTTACATCTGTTTTTACCTCTCTTTTTTTCTGTTGTTTTCCATGATTTCTAAGTGATGTGAGAGACAACAATTTGACTGGTACTATACCTGACAGCATAGGGAACTGTTCAAGTTTTGAAATCTTGTAAGCCAAGAAACTGGTGTTTGGTATGTTCTATATTTCATTTTCGATATTTGTCTCATCGTTGCCACCCTATTATTTCATTGAATTTCAGAGACATATCATATAATCAGATTAGTGGAGAGATTCCATATAATATTGGGTTTCTGCAAGTTGCTACGTTGTGAGTATTTTCACTGTGAGATTATTGTTATATTGTTGTGAATTGACAAGTCACAATTAAAGGATATGTATATAAGCGAGTATTACTGTGATTTCTGCCCAGGTCACTTCAAGGAAATAGATTAACTGGGAAGATTCCGGAAGTGATTGGTTTGATGCAAGCCCTTGTAATATTGTAAGTATACTTCTTTATCATTATTCTAATTTGAAGATTATACTAATAATTTGACGCTCTGAGTAAGGCAATTACTTCTATATTTGTAATTTCTAAACATGTCTTTTGTACCTTAACGTGACATTGTTGTAGGGATTTGAGTGAGAATGAGTTAGTGGGATCAATTCCCCCAATACTTGGGAATCTGACTTTCACTGGAAAGCTGTGAGTGTAACTATACATTGACTTAAACTTTTAGCTATTCTGGTTTTCGTCTGAGAAATTTAATTGGTCAGGTACCTTCATGGAAACATGCTTACTGGCCCGATACCTCCTGAACTAGGCAATATGTCCAACCTGAGCTACTTGTGAGTTAACCTATATATTTGTATCAGAAGTGTATGTAATTTGTGAATGCACTTACGGATTGTCTTTTCTTCAGGATATTGAATGACAACCACCTAGTTGGAAAAATTCCAAATGAGTTTGGGAAGCTAGAACATCTTTTTGAATTGTAAGTTATAGTCAATCGGTTACACTGTCAAAACCTGTTGCTGTGTCTTGTGTAAAGTAGCTTCATTTACTATTTTCAGGAATCTTGCCAATAATCATCTTGATGGAACTATTCCACATGACATAAGCTCCTGCACAGCCTTAAATCAGTTGTAAGATTTCCCATTGCTACCCGCAAGTTCTGTTGAGCTAGTTAGAATATCATGTTGTTTTCAATACCGTAGCACGACTTTTCAATGATTTGCTTAGTTTTATTTTCAGTAATGTGCATGGTAATCAATTGAGTGGTTCCATTCCATTGAGCTTCCGCAACCTTGGTAGTTTGACATACTTGTACGTTATCTAAAACTTGTTTCGTTATATTCCTACCAGATTTCTTTGTTTTTACTAATTTAACAGTAAAAATTTTCACGTCCAGAAACCTCTCTGCGAACAACTTCAAGGGGACCATACCTGTCGAGTTGGGGCATATTATTAATCTAGATACATTGTATGTTTCCTCAGAAGAACATATATAACCTGATGAATGTCAATGTGTGTGGAAGATAACCTTTAATTATTTTATACCTTGTTTCAGGGATCTATCTTGCAATAACTTTTCAGGACTTGTTCCAGCCTCTGTTGGTTATCTGGAACATCTCTTGACCCTGTAAGAAAGAAATTGTAATGAACACTGATAATTGTTTTAATTTTGTATTATTGCTTTCCTCAATAATATTTTCACGTTACAAATGCAGCAACTTAAGTCACAACCACCTTGGAGGTTCTTTGCCAGCTGAATTTGGGAATCTCAGAAGCATTCAAATTCTGTGAGTCTTGTATACTTCTGTGGAAGTATAAA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