Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30988 LG8 43256766 43257730 PREDICTED: transcription factor bHLH118-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 43256798 synonymous_variant p.Val11Val
T/C 43256815 missense_variant p.Val17Ala
A/T 43257016 missense_variant p.Gln84Leu
G/T 43257198 missense_variant p.Arg109Met
A/T 43257269 missense_variant p.Ser133Cys
C/T 43257382 synonymous_variant p.Ala170Ala
T/A 43257395 missense_variant p.Phe175Ile
A/G 43257537 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30988.1
MFPLQRGNELVIQFSNVLQPQHKISKDLILDDHNSDNSPLVAYSDKKVRTSPPNKLFYAPETSHANSAEEEYAKKMVHREIERQRRQEMATLHASLRSLLPLPFIKGKRSMSDQMNEAVNYINHLQKNIKELSEKRDKLKKKVAINSSLESRENKHESCGFTVRQTSSGAVGIEFSGLSEEGVSLSKLLELLLEEGLEVVCCLSTKVNGRLLHSLQCEVVNSDTVDLSELRRKFSNVVPSFRVSE*


CDS Sequence:
>Vu_30988.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30988::LG8:43254766-43256766(+)
ATAATCCTTAAAAATATCTATTTTATTATATAAATCCATGTGTGATCTTTTTAATCTATTTTATTTGAATGAACAATTTATTAAATAATATAAAGTACGATGATGTTGTTACGATAAGAACTTTTTTGTCTGAATTAACATTCTTTAATTTCAAATAATTTATTTATTTTTTATCTGTTGATGGTATGATAATATTTTGTGATTGTATTATTTACATGAGTAAATTGATATAGCTGCGAGTTTCAAAGAGAATGATGCCGATTCAAGTTACGTTTGAGATACTTTTGAATGAATGCATATATAGTTATCTAAGTTATCCTAAAATATGTGTAGAAATAATAGGAGATGAAGATTTACATAGTATTTCTAGTAGATAGAATTTATGGTGTCTTACACAATATCCATGCTTGCCCTGGCAATAATTCTTATTTTTTTTATTTGAATAGATGAAATATAAAACTTCCCCAAATAAAAGAGATAAAATAAATTACAAATAAATAAAGAGTTACATATACTAAAATTTTGATCTAACCAATCTTGATTATTTAATTATTATTGTGTACTTTATGGGTATAGTTTGATTATAGAAAGATATCCGGTAAATTTATAATTTAAAAAAGATACGTTATCTATAAAAATTTTAAAAGATGAACTTTTAAATAAGTAAAAATAATTACTTTAAATATGCTTATTAGCATTGTTTAAAAGATGTTCTTTATTTTTATTTAATTTAAAATTATAGCTTTTAATTGGTCGGAGGAATAAAAGTAAAATATCAAATGTAAAGATATCCAATCAATAAAAAGTCATACAGAATGGGAGTTGCGGCGATATTCATTAAAGAGTTTTTACAGAGAAATTGCCAGCAGGTTGTGACCATGAAGCATTATATTAATCTCCACTGGTTTTGTATTTCAAATATTAAAAGAATCTTATTGAATATATAACAGTAAATAATAACTAATAATCCGGGTATATTCTTAAAAAGAATTACTAAAATTTTAGCAGAAAATAAAGAAAAAACAGACAAATTTAATATCTTTTAATACTTGAAAGCTGGGCACGTAAAGAAAGACATATTGATTAATATTTGGTAAACAACTAAACCTACTTATTTTATCGAGTTATTCAAATTAATAAAAAATAATAATAATTTTTTGTCAATATTTTAACATTATTTACATATTATTTTTTAATTGATTTAAAATTATTTTACAATCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATATAAATATAAATATAAATATAAATATAAATATCAACGTACAACCATCACAAAATAACAACGTGTAAATAATATTAAAATGTTATAAAACAATTATTGTGAAATATCGTTATCCTAAAATAAACGTGTTACACTTTGATAGACCAGCATAGGTAGGGTGTACGAATTCACCAAACCCTACCCGCCACCCCCAACATTTTAAATTTTTCTTTTAAATGGATGAAAAAGTCTAAATAAATAAAAGGATAAACATATCCCCATGCCAAATGAAAACGTTTCCTTAATTAACTCAAGCTTTCTCTCTGTAAAAATTAAAAAGGAAAGATTTTACAAAAACCGACTAATTTTATGATAGAAAAAAAAACATCTTTCTTTCAAAGAAAGTTAGTATTAATTGAAGTCATGGTGCTTAATTAAGTAGCATTTATATTCTTATGTGAAGGTCATAAGGTGGGGTTGTGTTATGAACAGTAGCCTCAAATAATTAGTCGGAAAGTGAGGTCAGTGTTCACATACTATCACTTCCCTCCGTGAAAGGATAGCTATATATGGAGGAGGAATCTTTGGCATATAAGGCCACTCCTCTCTCAAACAAAACATCACATTAATTACATCAAACTACAATGTTTCTGTTTCCTTAACCAGGATAATAATTTGGAACAGTACTGTTGATCAAGCTGACCAACCA


Gene Sequence:
>Vu_30988(+)
ATGTTTCCTTTACAACGCGGCAATGAGCTGGTGATCCAATTTTCTAATGTCCTCCAACCGCAACACAAAATCTCTAAAGATCTCATCCTGGATGATCACAACAGCGATAATTCTCCCCTTGTCGCTTATTCAGACAAAAAAGTGCGTACTAGCCCCCCCAATAAACTCTTTTATGCGCCTGAAACCAGTCACGCTAATTCTGCAGAAGAAGAATACGCAAAGAAGATGGTTCACAGAGAGATTGAGAGGCAAAGGAGGCAAGAAATGGCAACCCTTCATGCCTCTCTTAGATCCCTTCTCCCTCTTCCCTTCATCAAGGTCAGACAATTAATTATATATATCTCTACTTTTTCATTTCTTTTTCTTTTCCTGATTGTGTTCTGGTTAGGGTTATTAGTATAATTCTTATTCTACTGGAGTTTCAGGGAAAGAGGTCGATGTCTGATCAAATGAACGAGGCGGTGAATTACATAAACCACCTGCAGAAGAATATTAAAGAATTGAGTGAGAAGAGGGATAAGCTGAAGAAGAAAGTTGCCATAAATTCCAGCCTCGAAAGCCGTGAGAACAAGCATGAATCATGTGGTTTCACTGTCCGCCAAACTAGTAGTGGAGCCGTGGGAATCGAATTCAGTGGATTGAGTGAGGAAGGGGTTTCACTTTCTAAACTGTTGGAACTGTTGTTAGAAGAGGGACTTGAAGTTGTTTGTTGTCTTTCAACTAAAGTCAATGGCAGACTACTCCACAGTTTGCAGTGTGAGGTATGTACACATTCTTGTCTTTCTTTATGGTGTTACACGTTTTTTATCTTGTTAGGAAGTATGCATATACTAATATTTTACGTTTCCCTTCTATTATTGGTGAAATGTGTTCACTCACAGGTTGTCAATTCCGACACTGTAGATCTGTCTGAGCTGAGAAGAAAATTCTCCAATGTAGTTCCATCATTTAGAGTTTCTGAATAA