Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30960 LG8 42884443 42887494 Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 42884588 intron_variant
G/T 42884612 intron_variant
C/T 42884761 intron_variant
C/A 42884771 intron_variant
G/T 42884798 missense_variant&splice_region_variant p.Gln369Lys
A/G 42884873 missense_variant p.Ser344Pro
T/A 42884909 missense_variant p.Met332Leu
G/C 42884991 intron_variant
T/C 42885006 intron_variant
C/G 42885050 intron_variant
A/T 42885122 intron_variant
T/C 42885194 missense_variant p.Lys300Glu
T/C 42885234 synonymous_variant p.Glu286Glu
T/G 42885384 stop_lost p.Ter236Cysext*?
C/T 42885387 synonymous_variant p.Lys235Lys
A/G 42885503 missense_variant p.Ser197Pro
T/G 42885504 missense_variant p.Leu196Phe
C/T 42885508 missense_variant p.Ser195Asn
C/A 42885511 missense_variant p.Gly194Val
T/C 42885532 intron_variant
C/T 42885604 intron_variant
A/T 42885757 intron_variant
A/G 42885767 intron_variant
T/A 42885823 intron_variant
C/T 42885829 intron_variant
A/G 42886160 intron_variant
C/T 42886322 intron_variant
A/T 42886325 intron_variant
G/A 42886346 intron_variant
C/A 42886613 intron_variant
A/G 42886673 intron_variant
C/T 42886742 intron_variant
C/A 42886907 intron_variant
A/G 42886936 missense_variant p.Ser187Pro
G/A 42887001 missense_variant p.Pro165Leu
A/G 42887090 synonymous_variant p.Cys135Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30960.1
MDGNRNGLGILHEGGVDVGPEMSNNLDLNVEQNCCSPNIAHASDNQSCPPSKSVHSTNTVLGIGAEFESDDHAYRFYNKYATLVGFNVRKDWINRSKVHGQVVSRKFTCSKEGYRRKDKRDVNVKKHRKETRTGCLAHMIVTRQPNGKYQVTHFEAQHNHDNVNPNNANVVNLLNEFSVAQAMEAESNNTSESEEAYQFAMRQLDEVMVGVEKILTPKAEGEVVTSRNSDVDASESEPAKIFPNEHIIEDQDEINSANGGKDRRATSDRGHLITMTCNGADSDRILNVEESPQNTVVCISSPPSTYVSSQPAAPNPIVQGLYSFEANQVVNCMYEQTNLMVDSQSNSSMMQPQNIFSNPQDSPGQSQLLQEPIIQSTYLESMPINNQMRQGMDLDIQNPHSSSFLLYDHRYRSSESA*


CDS Sequence:
>Vu_30960.1
ATGGATGGGAATCGAAATGGGTTGGGTATTTTGCATGAAGGTGGTGTTGATGTTGGACCTGAGATGTCCAATAACTTGGACTTGAATGTGGAACAGAACTGTTGTAGTCCAAACATTGCTCATGCTAGTGACAATCAATCTTGTCCTCCATCAAAAAGTGTACACAGCACAAATACTGTTTTGGGAATTGGTGCAGAATTCGAGTCTGATGATCATGCATACCGATTCTATAATAAGTATGCGACTTTGGTGGGTTTCAATGTTAGAAAAGATTGGATAAATAGGAGTAAGGTGCATGGTCAGGTGGTGTCTAGAAAGTTTACCTGCTCCAAAGAGGGGTACCGCAGGAAAGACAAAAGAGATGTCAATGTGAAGAAGCATAGGAAGGAAACGAGAACTGGCTGTTTGGCACATATGATCGTCACTCGGCAGCCAAATGGAAAATACCAGGTCACCCATTTTGAAGCACAACATAATCATGACAATGTAAACCCTAACAATGCTAACGTGGTAAACTTGCTAAATGAATTTAGTGTTGCTCAAGCTATGGAAGCTGAATCAAACAATACGTCTGAATCCGAGGAAGCTTATCAATTTGCTATGAGGCAACTTGATGAAGTGATGGTAGGAGTGGAGAAAATCTTGACACCGAAAGCTGAAGGTGAAGTTGTCACCTCACGTAATTCTGATGTAGATGCTTCAGAAAGTGAGCCTGCAAAGATCTTTCCGAATGAGCATATAATTGAGGATCAGGATGAAATTAACAGCGCAAATGGTGGAAAAGACAGGAGAGCCACGTCAGACAGGGGGCACTTAATAACCATGACATGTAATGGAGCCGATTCTGACAGGATTTTGAATGTAGAAGAGTCACCGCAAAATACTGTTGTCTGTATTTCAAGCCCCCCCTCTACATATGTTTCATCTCAGCCTGCAGCACCGAATCCGATTGTGCAGGGTTTGTACAGTTTTGAAGCCAATCAAGTGGTTAACTGCATGTATGAGCAGACTAATCTTATGGTGGACAGTCAATCTAATTCTAGCATGATGCAACCGCAAAACATCTTTTCTAACCCACAGGATTCTCCTGGTCAATCTCAACTATTGCAGGAGCCTATAATCCAGAGCACTTACCTTGAGTCCATGCCAATCAATAATCAGATGCGGCAGGGAATGGATCTTGACATCCAAAATCCTCATTCGTCGTCGTTCTTGCTGTATGACCATAGATACAGAAGTTCTGAGTCTGCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_30960::LG8:42887494-42889494(-)
TTATTCAACAATAATAAATTTTATCAATATTTTAAACCATATATAAAATATCATCAGATAATATAAAAAAAGTTAGTTTGTAAAATTTAGTATTACATAAATCAATTATACGATAACTCAATAACATTTTCTTATTTATATATAATACAGCATAAGATAAGAGGAGAGAAAAAAAAATCAAATTACATCTGTATAACTTTAATCAAAGCATGATTCGACACCTTTTCGATTGATTATGCTTTTTTACGTTTTGAAATTTCGTTTCAAATATTATACATACAAAAATTTATATTAATATAAAATTATTTAACACTTTACTCGTAAAGATTAAAATGTACCTAACTTAAAAAATGTATTAAAATATAAATGATTTGATAATTATAAATTTTTATTTAAGATTTAACAAAATAAAAAAGAATAAATTACAATGATATAAAATTGTAATTGAAATGTAGAATTAAAATAATCAGTTATTAACAACCTAACATATAATATTAATAAAATAAATTACAAATCTATAAAATTGATAAAATTTTATTTATTTTAACTATGTTTTTTTATATACAAATTATTATCATTTTATTCCTAAGCAATTGTTCTTTTAAACTTAAGTAACCATTTATAATAAAAAAGAATCACTTACAAAATAAAATAATTGATCACAAAAAATTATAAGAATGATTTTTTGTTTATAATTTTAATAATTTTTTTAATAAATTTAATATGGATTTTATTACATCATATTTCCACCAGTTTTAAATAAAATTTATTCCGGTATAATTTGAATTTTTAATAAAAGGATACTATATTATTATATTTTCTCCAATTGTAAATATATGAAAAATTTTATATTTAATTATTTAAAATGTGTATTTAATGTTTATATTATATATATATTTTTAAAAAAATTGTATATAAAACTTTGTCTTTCGATGCATTTTATATTATTCTAATATTTATATAAATAAAGTAATCACACATTAAATTTATATTATATATAAAATATAATCGTTATTATATCATATTTATTTAGCATTGTTTTTTAAACGAATTATGTAAAAGTCAATTCCTAAAATGTAAAAGTGATATAGCTTAAATGAAAAATATATTCCAAAAATTACAATGACAGTATATAAAATTTACATTTAATGTAAGAAGAGAGGAGACCAAGAATAATCTAATAAAAATCTTTTAGAGGAGGCAAAAGCAATTTACTGTAAAGAACATTACATGTTATAATTACTCTTAAAAAATTTAACTGTCACTTTGAGTTTTAACTGTAAATTTTGTATGAAGAGAATCAGAAGGGTTTCTCGTCTTCTCCAATCTTCATCTTGCTAGGGTTTGCAGAGTTGCCATTTCAGGTCTTTCTTCGAGCTCACCAACTCTCAGGGATGGAAGCACCTATAATTCACATATTTCTGCAATTATCTATATTTGAATGCATCCTACGATTCAACACATAAAGTTCTCCGATTTGATTATATCCCAAAGGTCATGGACGGTGTTGGTATCTTGTTCCTTCCAAGGATTACTTGCTCTGTCTCAAACCCTAATTGTGCTACATCGTCTTAGATTCCTTGGCTACTTTGTTCCTCTCTATAACTACCGGTAAGGTTGTTTGCACTGGAATAACAATAGCTGCATAATGTTTACTAGCACTGATTGATGATAAATTGTTATCCTCTAAAAAAATTACAGTACCACCTTTTGATCTTGATTCAGGATAAATTGCACATTGCGCAAATTGCAAAGTGAAACTAAGTGGATTTTGAAACAATTATTTGTTGATTTAGTATGAACTTAATTCTCAGCAATTGTTGGGTTTAATTTCTGATCCATATTTTTTTATGAGTTAAGCAAATTGAGTTAAAAATCAATTATATATGCATTTTTTACACTATCATTCAATCAGAATGAGTGAGTATGGTGAGTTAGTAGACTTTTTTATAAATGTTTATCATTAATTTGCTCGTCTCCCAATTGGGTGAAGGTTATCA


Gene Sequence:
>Vu_30960(-)
ATGGATGGGAATCGAAATGGGTTGGGTATTTTGCATGAAGGTGGTGTTGATGTTGGACCTGAGATGTCCAATAACTTGGACTTGAATGTGGAACAGAACTGTTGTAGTCCAAACATTGCTCATGCTAGTGACAATCAATCTTGTCCTCCATCAAAAAGTGTACACAGCACAAATACTGTTTTGGGAATTGGTGCAGAATTCGAGTCTGATGATCATGCATACCGATTCTATAATAAGTATGCGACTTTGGTGGGTTTCAATGTTAGAAAAGATTGGATAAATAGGAGTAAGGTGCATGGTCAGGTGGTGTCTAGAAAGTTTACCTGCTCCAAAGAGGGGTACCGCAGGAAAGACAAAAGAGATGTCAATGTGAAGAAGCATAGGAAGGAAACGAGAACTGGCTGTTTGGCACATATGATCGTCACTCGGCAGCCAAATGGAAAATACCAGGTCACCCATTTTGAAGCACAACATAATCATGACAATGTAAACCCTAACAATGCTAACGTGGTAAACTTGCTAAATGAATTTAGTGTTGCTCAAGCTATGGAAGCTGAATCAAACAATAGTTTGGGACCTAAATCAGAGTCAGCATTGGATATGTTGAATAAAAAAATAAGTGCACACGAATCTCTTGATATACTTTCAATGAATTATGACAACTATCTTCATTGTGCAAGGGAAAGAGATATGAGGGAAGGAGAAGCAGGGCGTTTGCTTTGTTACTTCCAAAGGCAGCACTTCGAAAATCCGGCATTTTTTTATGCCATACAGCTTGATGTTGATGACAAGGTTAGCAATATGTTTTGGTCTGACGACAGTATGGTCGTGGATTTTGATCACTTTGGAGATGTCATTTGTTTGGATACAATTTGCAGAACGAATGAAGATCTTCGGCCACTTGTACAGTTTTTAGGTGTTAACCATCACAGACAAGTTTTAATATTTGCTGCTGCTTTTTTGTATGATGATTCCATTGAATCATTTACTTGGTTATTTCGAACTTTCATTAATGCTATGTCCGGGAAAAAGCCAAAGGCCATTCTCACAGAACAAGAAGCTGTAATCATTGAAGCAGTCAATACAGTTTTACCTGACACAAATCATTGTACATGTGTATGGCAGTTGTATGAGAACACTTTGAAACACCTCAGTCATGTTGTAAAGGATGCGGAATCTCTTGCAAATGATCTGCGGAGCACTCTTTACGACCCCAAGGATGAGGAGGAATTTACTCATTCTTGGGAAACTGTGATAGAGAAGTATAATCTGCAGCAAAATGAATGGCTGAGATGGATGTATAGAGAAAGAGAGAAATGGGCTGTTGTCTTTGGTCGAAATACATTTTTTGTAGACATCAAAGGCTTTCATTTAGCTGAGATTTTGTCTCATAAGTTTAGAAGTTATCTAAATCCTGAAATTGATGTAGTTCAATTTTTTAAGCATTTTGAAAGGGTAGTAGGTGAACAGCGTTATAAAGAAATAGAAGCTAGTGATGAAATGAGCAGGTGTTTGCCAAGACTAATGGGTAATGTGGTTCTGTTGAAGCATGCAAGTAATATTTATACACCAAGAGCATTTGAAGTATTTCAGCGAGCATATGAGAAGTCTTTGAATGTTATTGTTAATCAATACAGTAGAAATGGATCATTGTTTCAGTACAAAGCAAATACATTTGGGCATAATAGACAATACAATGTCACCTTCAATTCCTCTGATGACACAGTTGTCTGCAGTTGTATGAAGTTTGACCGTGTTGGATTTCTGTGTGATCATGCGCTTAAAGTTCTTGATCAAAGAAACATAAAAGTAGTTCCACCTCAGTACATCTTGGAGAGATGGACTGAAGATGCGAGGATGAGAAATCTTAGAGAGATTAGGCAATGTAAGGTGCAAGATAATCCTAAAAGGGTTGTTGCTAGCTGTTACAAAGACTTGTGCCACAAATTGCTCAAGTTGTCAACAATAGCGTCTGAATCCGAGGAAGCTTATCAATTTGCTATGAGGCAACTTGATGAAGTGATGGTAGGAGTGGAGAAAATCTTGACACCGAAAGCTGAAGGTGAAGTTGTCACCTCACGTAATTCTGATGTAGATGCTTCAGAAAGTGAGCCTGCAAAGATCTTTCCGAATGAGCATATAATTGAGGATCAGGATGAAATTAACAGCGCAAATGGTGGAAAAGACAGGAGAGCCACGTCAGACAGGGGGCACTTAATAACCATGACATGTAATGGAGCCGATTCTGACAGGATTTTGAATGTAGAAGAGTCACCGCAAAATACTGTTGTCTGTATTTCAAGCCCCCCCTCTACATATGTTTCATCTCAGCCTGCAGCACCGAATCCGATTGTGCAGGTCATCTTTTATCATTTATCAGATATGACAGTTTATACTGTGATCAATTATTTATTTACAATTATCAACATACTCAGTGCTCATAAGTCAACTTTTTGAGATAATAAGTTCTATCTTTTTATATCTGTGTATATACATACACGCGCCAAAGAGACTGACATTTGTTGATTCTTTCATTTGTGATACAGGGTTTGTACAGTTTTGAAGCCAATCAAGTGGTTAACTGCATGTATGAGCAGACTAATCTTATGGTGGACAGTCAATCTAATTCTAGCATGATGCAACCGCAAAACATCTTTTCTAACCCACAGGATTCTCCTGGTCAATCTCAACTATTGCAGGTGTTCAATTTTCTAGTCATCTAGGGTTTTTATCGTATGCGGAACATGCATGTGTATGTAATATAACACTTTAAGAAATTTTTACTCAGGAGCCTATAATCCAGAGCACTTACCTTGAGTCCATGCCAATCAATAATCAGATGCGGCAGGTAAACACCTCTTGGTCCAAAACACTCAGTATCACCCCAACCCTGAAAAAATAAAAAGATTTTTGGTGGAAGATTCATGTCGCTAACTTTTTAAATCTGCTCTGGGTATATTGGTTGCAGGGAATGGATCTTGACATCCAAAATCCTCATTCGTCGTCGTTCTTGCTGTATGACCATAGATACAGAAGTTCTGAGTCTGCATGA