Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30957 LG8 42845481 42851647 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein ANTHOCYANINLESS 2 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   maintenance of floral organ identity, maintenance of floral organ identity, maintenance of floral organ identity, maintenance of floral organ identity, maintenance of floral organ identity, maintenance of floral organ identity
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   transcription cis-regulatory region binding, lipid binding, DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific, DNA-binding transcription factor activity, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding, transcription cis-regulatory region binding
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 42845558 3_prime_UTR_variant
A/C 42845560 3_prime_UTR_variant
T/C 42845561 3_prime_UTR_variant
A/T 42845567 3_prime_UTR_variant
C/T 42846299 intron_variant
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C/T 42846470 missense_variant p.Glu602Lys
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A/G 42846930 missense_variant p.Val484Ala
A/T 42846932 synonymous_variant p.Gly483Gly
T/A 42847048 intron_variant
A/T 42847053 intron_variant
A/T 42847149 intron_variant
A/T 42847155 intron_variant
C/G 42847358 intron_variant
C/T 42847488 intron_variant
G/A 42847567 intron_variant
T/C 42847653 intron_variant
G/C 42847847 intron_variant
A/T 42847992 intron_variant
A/C 42847997 intron_variant
G/A 42848310 missense_variant p.Arg408Trp
T/G 42848323 missense_variant p.Gln403His
G/A 42848326 synonymous_variant p.Arg402Arg
G/A 42848328 missense_variant p.Arg402Cys
G/T 42848332 synonymous_variant p.Pro400Pro
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G/T 42848580 intron_variant
T/A 42848652 intron_variant
T/G 42848671 intron_variant
C/T 42848674 intron_variant
C/T 42848681 intron_variant
C/T 42848742 intron_variant
C/A 42848749 intron_variant
T/C 42849017 synonymous_variant p.Arg272Arg
T/A 42849505 intron_variant
G/A 42849571 stop_gained p.Gln121*
T/A 42849574 missense_variant p.Thr120Ser
T/A 42849755 5_prime_UTR_variant
A/G 42849975 missense_variant p.Phe28Ser
T/A 42849999 missense_variant p.Glu20Val
C/T 42850147 intron_variant
A/G 42850280 5_prime_UTR_variant
C/T 42850393 5_prime_UTR_variant
T/A 42850445 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 42850516 5_prime_UTR_variant
A/C 42851289 upstream_gene_variant
G/T 42851348 upstream_gene_variant
C/T 42851410 upstream_gene_variant
C/T 42851533 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30957.2
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>Vu_30957.1
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>Vu_30957.3
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CDS Sequence:
>Vu_30957.2
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>Vu_30957.1
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>Vu_30957.3
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Promoter Sequence:
>Vu_30957::LG8:42851647-42853647(-)
TTTTCAATTAGTGAAATGAAATAGCAAAGAAATGGTATTTTTATATTTACTTAAAAGACATGGTCCCGTGAAGGGACGCAGTGGGGTAAATAAAAAAAAATACAGTTTTGATTCCCAAGTATTGAATTTTGTTAATGCCTGATTGTCTAAAATTATATTTGACCCAACCACAACAATAAGTTAACACATAGCCTCATTCTCTTTTTCACCCTTCATTTTATTTATTTATATTTATACAAATCATACGAAATATTTTTAAATAAAAAAGTCTTTACATGTATAACTACTACATACTGAATTTTCAAAATCAATATTATTAATCCAATTCAATTATTTCCATTTTTTAAATTATGAAGTATGGAACACAGGATTTGTTAGATTTGTTGTGATACACCGGATTCAAATCCCTTCCATCCTTCGGTCACGCATCTCATTTTCTAGGAAATTAAGAAAACAAAAAACCTCATTTACTAAGATAGCAAGCACCTCATATAGCATCAAAACTATTAAAAGAAGATAATACGGATCTAATAATTCAAAACATCTCCTATATTTCTAAACTAGTGTATAGACATATGCTTCGTCATTAAAAAAAATGTGATCATCAAAAGAATAATACTAGAAAACCGGATAAACTAATTTATAAAAAAAATATAATTCGAGTTATAAAATTTTACAAGTACATAAGATTCACAGTATAATATTATTCTAGCAAATAGTATGCAAGAGCAGGTCAACGTTCAAGTTAAGTTGTCCGTATGGTAAAAATTATTATTAATGATAACTACACCTTTTTAACCCTTTAGGAGAAAAACAAGGGTTAAACATGCTTCAAAAACATCTTCAATTTATATTTATATCTTTATCAACCAGTTTGTTGATCTTCTAAAGGTGTTAACAGTTTTTTTTTTCATATTCCAACTTTTGATTACTCCGATGTTGATAACTTTATGACAACATGACCTCTATTAGAGTATTTTCTTCTAAATTATATATTCAGAATTTGTAAGTAACTCTTATACATTGACATAAATTGATAAATATTTGAACAAACTTCAATAAAAAATTGATAATTTCTATAGTCATTATGCAATATAAAAATTCCTAATCTTTATGAATAATTTTCATTGAGTTGCTTTGATTTACAATTTGAATTTTGTAATTAATAATCTTCTAACATTGACTCCCAATCAGAATACTACCATGCATTTAGCTCAAACATTTTTCAATCATAAATATTTTTCCTTTATTTGAGTTACACAAATTAAAAGTCTGCCTAACAAGATAACTTAAGATAACACTTTTAAAAATTAATATAGCAAATTCCCTTTTTTATGATAAAAAATAGTCACTATGGGAAATAAAATAACAAAAGTAGTAACGTCAATAATTTTAAAATAAAAGCAAAAATTAATTATGATATTTAATTTAGTAAAAACAATGAAAATGAGAATGCAAATAGTCTCTATTTTGATCTCTCAAATTACCAATTATCTACCGGTTTTCATAATTTGTAGTGAAAATATACTTTTTCTTTATTTTAAAGAAGATTCTTAACCTATATATGAAATAAAATAATTCCCTTATTTACAGAAGATGAAGTTTTTGTTAAGAGAGATATTCTTATTTATAGAATAAATATATATAACTTCTCACAAATATTCATTACTTTTTCATGAGAAACGAAGGAAGTCTAAGTCATTCATAGTCTTGGATCCAGAAACAGCCTTAGTATCAATGAAATGGCATTATAGTCCTTAACCCTTGACATTCTTATTGGCTGTTTCGGGTCTTATGGTGGACTGGCACACATCGGAAAAAAAACCATTCAAAAGGACAACGCGAGTAGATTGTAGTTGACAACAGTAATAGCGGAAGCAGACGCGTGTGCACGCGCTCCATGTTGAGTTGTGATTGGTGGCGGACATCACGAACCCCTCTTTCTAGCATGGACCCCACACTCGTATGCTATACATTGAAGATAGAAAAATAATAAGTGT


Gene Sequence:
>Vu_30957(-)
GTGCAGAGAGTAACCAGAGAGAAAGATCTGGTTGAAGAAGCAGCTATGTTATTAACAGGAACAGGTACAAAGGGGTTTGGAATCTAACTTGGATTCGATTTCAAAGAAAAAGCCGAAAGGGTTTGTTTCATTTAGGAAAAACGCAATTATCTTAGTGCAGAAAACCATTGACTTTCTCATTACCCCCATAGTCACTGTAAGTCAGCTCCATCTTCTTTTTTTAATTCTTAATCAATCGGCATTTTATATAATTATAAACCATTTTATTTTATTTATCTGTCCCTTTCTCTTCCACTAATCTCAATAGACGCAGCATGTTTCAATCTTTAAGAAAAAAAAAAACAGTAAGAGAAAGAGATTTTAACCTTTTAAGATTTAATGTTCTGGCTGTCAAATTTATCAACCACGAATTGGATTATTTAATTTAAAAGAGAAATCATAACTTTCTAGGCTGTGGAACCCAGCGGCTCTGTTTGTTTTTTTGGCTCTTTTACTTTGCACACTGTCAAATTAAAAGGTATCGTTTTCGCCGTACCATGGTTGGTTTGTATACCATCTAACTTTCTCCATTTCTCAGTTTCTCACTTATATCAACAGTGCCGGGGTGGAGAGAGAAGAGAGAGAATGACGGGGGTGGTGTCAACCGGTTTTTTTAGCTTAGGTTTGGTGTGATGCATTTGAAAAGTCAGGGTGGTGTGTGAATATGACCGAGATAAGATACTTATGAGAGAAGTTTTTGTATTTGTTGTTGTCCTTTTTTATATTTGTGTGAAAAGATTCTCAATCTTTGTTTTTTATTCTTTTTTTCCCGAGGGACGTTTTGGCTTAGACTTCTTTGGATTTTCTTCTTGCTGGGGTCTTTTTCAAAATTCTCTATACTGACAAAGAATCGGTCAAGTGTGAAATATAGAAAAACAAGAGTTCTTCTTCTCATGTCACTGTTTTGTGTTATTTCTGCTGTTGGGGTTGCAGACATGATATGCAGGTGTGAACCTTGGATCAGAAAGGAAGGGGATTTTTCTTTGTCTTCTTGCTCTTTCCATCTGTTTTAGGATAGCCTTTTGGCTTTCTGCTGGAGAGAGAAAGGGGTGTCGACAAGGAAACAACTTTTTGGCCTTGTCTACTTTTTCACAAAAAAAAAATTTCAATCTTGTCAGTGCTTAGCTCAATCTGGTTTAAAGGTCAAAAAGTTAAGCGTAATAAGGAGTCAAAAAACTGAAAAAGCTTCTTGACAAAAGTGATAGTGACAATTTCGGGTATAAAATAGAAACAAAAGGAGAGAAGAACATGAGAGTCAGCGTGGGAGGGAGAGAAGCACAGAATTTTTTGGGAGATAAAAGGTAGAGGGTCAGTCCAATTTTTTAAAATCTTTTGTGGGGATTGAGCCTTGAGGGTTAGCATTTGGGGTGCAAGAGTTGTTGTGACTGATAATTATTTCTCAATCCATTTCCTCTTCAATGCAAAATTCATCTTCCTTCTCCTACTCAAATGTATGGTTTCGGTCTCCATCTCCAGACCTCTTATTTTTTGTTTATTTCTCTCTGTTGGCATTGAATTTCATTTATGCATCTTATTGTTCATCCCCCTTCTCGTTGCTGATGAAGCTATTATTATGTTCTACAGCAAAGGAAAATGGAGGGCCCCAGTGAGATGGGTCTCATTGGGGAAAATTTTGATGCTGGTTTGATGGGGAGGATGAGGGATGATGAGTATGAAAGCCGCTCTGGAAGTGATAACTTCGATGGTGTATCTGGTGATGATCAGGACGGTGGTGATGATCAGCCACAGAGGAAGAAAAGATACCACAGACATACTCCTCACCAAATTCAAGAGCTTGAGTCGTATGACTTAATAAAACTTAGTCGCTTTTTAATTATTTACTTTTTTTTTCTAATTTTCTTCTGTAATTGAGTTACGTGGTAAGATTGGTTTGTGGTTTTTGGGTTTTTGATTTTATTGGTTTTTAGTTTCTTCAAGGAGTGTCCTCATCCTGATGAGAAGCAAAGGTTGGATCTCAGTAAGAGGCTTGGGTTGGAGAATAAGCAAGTCAAGTTCTGGTTTCAGAACCGACGAACCCAAATGAAGGTGAATTTAAGGACAGTAATGTAGAATTATTGCACTTGAATGCAGTTTGGCGATTCAATTTAGATATTGTGCTAATTGAAGTGATTTTCCTTGAATCAGACCCAACTGGAACGCCATGAGAACATAATGCTTAGACAGGAGAATGATAAGCTCAGAGCTGAGAACAGTCTGATGAAGGAAGCAATGTCAAATCCAGTGTGTAACAGCTGTGGTGGGCCAGCGATTCCTGGTCAAATTTCATTTGAGGAGCACCAGATTAGAATTGAGAATGCTCGACTAAAAGATGAGTTGAACCGTATATGTGCCTTAGCAAACAAGTTCCTTGGCAAGCCAATCTCATCAATGACCGGTCCCATGGCTCTACCAACCTCAAATTCTGGTCTGGAACTTGGTATTGGAAGGAGTGGGCTTGGTGGTTCAAGCACTCTCGGCACTCCCTTACCAATGGGACTTGACTTGGGAGATGGAGTATTGGGCACTCAAACTGGAATGCCTGGGATTAGACCATCATTGGGGTTGATGGGAAACGAAGTTCAGCTAGAGAGATCTATGCTTATAGATCTTGCGTTGGCTGCTATGGAGGAATTGCTAAAGATGACTCAGGCAGAGAGCCCTCTTTGGATTAAGAGTTTGGATGGTGAGAAGGAAGTGTTTAATCATGAGGAGTATGCAAGGTTGTTTTCTCCTTGTATTGGTCCAAAACCCACTGGTTATGTAACCGAAGCTACAAGAGAAACTGGGATAGTAATCATCAACAGTTTAGCCCTTGTGGAAACTTTGATGGACGCGGTATGTCTATGATGATTAACTTCCGAGCTTGGCTTCAGTGAAGTTAAACCAATTTTAGTTTTCTGTAGTGAGTGAATTGCCCATGATGCAGGGATCAGAGCAACGTAGTACTTGTTAGGATAACACTTTGATTTGGTGCTTTTGATCTTAATTAATGGACCTTTGATATCCTCCTGTTTAATATGTTTAATATCTTATTTTAATTGGTTATTTCTTTGAATAGAATCGATGGGCAGAGATGTTTCCTTCTATGATTGCTAGAGCTATCAACCTCGATGTTATATCCAATGGCATGGGTGGAACAAGAAATGGTGCTCTACAAGTGGTGCGTTTCTTTGCTGTATATATGCTTGACTTTGTCTTAATAATTGCTGGAACTGATGACCAGGATTATTCATTTCAGATGCATGCTGAGGTACAATTGCTTTCACCACTAGTCCCCGTTCGCCAAGTGAGATTCATCCGGTTCTGTAAGCAACATGCAGAAGGTGTATGGGCTGTGGTTGATGTTTCTATTGATGTTGGTCACGATGCTGCTAATGCACAGCCATTCATGAGCTGTAGGAGGCTTCCTTCTGGCTGTATTGTGCAGGATATGCCCAATGGTTACTCCAAGGTAAGTGCTGATCTAAGTTCTTTTTAAGACCATTTTCTTTTCTCTTAATCTTTGCTTCAATCTGTTTATTGCTTTTTTTATAGCATTCGTAGTTTTAAAAAAAGGTTTATGATATCTTCGTTCCCTTTTTTTTAATGAACGGGTGTTTTGATATATCTGATGTAATACTTTTGCAAGAAGTTTCACTTGACTTCTTTGTCAAGTGAACTTTGTTTTGACTGATATAAATAGAATAAGGTTGAACTTTGCCTGCGAAATCAGTCACGTTGAGTAGTTTTTTTAATTTGGGAGATGCTTCCTTTGTTAAATTCTATATAATCTTGAAACTTCAGTGAAAGGGTTTCCTGTTGTCTGTATTTAATTTGTCCAGTGCTACTCCTAGAGAATAGTGAATCAAGGCTTATATTGTTTAGCAATATCTTGAAACTTCGTTTCTGTTTCGCATCTTTTACCATCTATAAGTGTATGAAAATTTTAAATCTTGGATTCTTCAGTCTTTGTCGTATAAAAAAGTACACTTGATGCTTCTATTCCTATCTCCTTTGATATAGAACGAACTATTTTTTTACTGCATACGAGACATTGATGATCTGGATCCAGTCGTATATTATAATGTTGACAGGTGATGTGTTAATCCGTGCCCTTTAATATATTCATATCGGTTTTATAGTATTAAAAAAAATTCCATGATCTGCTAACTTTGTTGGGATTCTCCTATGGCGTTGACATCTGCTCCGATTTTTATATTTTACATAATCCTCTACATATACTTCTTAGCTGAGGTATTAATTTATAATTAGGCTAGGGTTTTATGTCAAACGTTTTTTATTTATGTGGAGTTTTACGTAAATTCAATAATAACCCAACCTTCTAATTTTATCCATGACCACGTCAGAGAAGTTTGATTCTTATAGTTATGTTCGGATAAAAGTTAGAAACGTATTTTGTATGAATTGCAATGCACATCTGAATTCTAAAACACAAAAATAAAGGAAGGAAAAATTGTTATTTTTTTATTTTGTGCTCCTCAACTGGCATGCAAACATTTACTACATTGCCTTGGGAATCTTTATATGACAGAACCTCTGCTAGTTTTAAAAAAAATATATATTTTTTTGGGTTTGATAGAAGATAAGTTGCACTGTTTGTAGGTTACTTGGCTTGAGCATTGGGAGTATGATGAGAGTGGTGTTCACCAACTTTATCGCCCATTGCTTAGTTCTGGTGTTGGATTTGGTGCTCATAGATGGATCGCCACTCTCCAGAGGCAGTGTGAATGCTTGGCTATCCTCATGTCGTCTTCCATTTCAAGTGATGATCACACAGGTGCACATGCATGCCACATTTTGTTTACCCTTTTATCTCATGTACTGTAATGTAATGTAATGATGTCACAGTATCATTGTGTAAACTTTGGCACTATGGTTTTGCAGCATTGAGCCAAGCTGGTCGGAGGAGCATGTTGAAATTGGCACAACGCATGACTAGTAACTTCTGTTCGGGGGTTTGT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