Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30944 LG8 42723697 42725677 PREDICTED: transcription factor MYB3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 42724039 missense_variant p.Lys204Arg
G/T 42724079 missense_variant p.His191Asn
A/T 42724080 missense_variant p.Ser190Arg
G/A 42724243 missense_variant p.Ser136Leu
A/G 42724516 upstream_gene_variant
C/T 42724541 upstream_gene_variant
C/T 42724566 upstream_gene_variant
T/A 42725010 upstream_gene_variant
A/C 42725244 upstream_gene_variant
C/A 42725245 upstream_gene_variant
C/G,T 42725411 upstream_gene_variant
T/A 42725439 upstream_gene_variant
G/A 42725491 upstream_gene_variant
T/A 42725510 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30944.1
MGKAPCCEKHGVKRGAWTPEEDQALVDYIKEHGHGSWRTLPKHAGLLRCGKSCRLRWINYLRPGIKRGPFTSEEESTIVQLHGMLGNRWAAIASQLPGRTDNEIKNYWNTHLKKRLLRSCHSLREKQSCLVLDQTIVKSESPSTRHMVQWESVRVEAEARLSMESSFLNSWPKSSTCPDHFLHLWHSEVGKSFRMVKGKEGIVSQSPVSHPSSSSKLESCSDVSLQVKNSTSSLYPCIEDVNMVHEQISSYKPKLDDTAGSDSGNYEFLDTSDSALKHLLHISDDVGFLGQNDNFLNLLDATCDQDSFFHISSEKGNL*


CDS Sequence:
>Vu_30944.1
ATGGGTAAAGCACCTTGTTGTGAGAAACATGGAGTCAAAAGGGGAGCTTGGACTCCTGAAGAAGACCAAGCCTTGGTTGACTACATCAAGGAGCATGGTCATGGAAGTTGGCGTACACTTCCCAAACATGCAGGTCTCTTACGATGTGGAAAAAGTTGTCGGCTTCGGTGGATAAACTATCTTCGCCCTGGTATCAAGCGTGGCCCGTTTACCAGTGAAGAAGAAAGCACAATTGTTCAACTCCATGGCATGCTTGGCAACAGGTGGGCTGCTATAGCATCCCAATTACCTGGAAGAACAGACAATGAGATTAAGAACTATTGGAACACCCATCTAAAGAAGCGTCTCCTTCGATCATGTCATTCCCTAAGAGAAAAACAGTCGTGTCTGGTTCTGGATCAAACTATTGTCAAGTCTGAATCTCCTTCTACGCGTCACATGGTACAGTGGGAAAGTGTAAGAGTTGAGGCAGAGGCAAGGTTGTCAATGGAATCCTCGTTCCTCAATTCATGGCCGAAGAGTTCAACATGCCCTGATCATTTTCTTCATCTTTGGCATTCTGAGGTTGGAAAGTCATTTCGCATGGTCAAGGGAAAGGAAGGGATTGTGAGTCAAAGTCCTGTCTCACATCCTTCATCCTCATCTAAATTGGAGTCTTGTTCAGATGTGTCATTGCAGGTGAAAAACAGTACTAGTAGCCTCTATCCATGCATTGAGGATGTGAACATGGTTCATGAACAGATAAGTAGCTACAAACCAAAGCTTGATGACACGGCTGGGTCTGACTCAGGCAATTATGAATTTCTTGATACTTCAGATTCTGCATTAAAGCACCTACTACATATCTCTGATGATGTTGGATTCCTGGGACAGAATGATAATTTCTTGAATCTCCTTGATGCAACATGTGACCAAGATAGTTTCTTTCATATCTCTTCAGAGAAAGGCAATCTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_30944::LG8:42725677-42727677(-)
TTATGTGATGTGAATATATATCAAGATTAAGAATGCGTTTTCTATTTTAAAAATAAAAAATAGTTTAATAATTATAGCTTCAAAACTAGTGTTGTCAAAATAGGTTAGAACTTGTGGATCAATCCGGTCCACCACGAGTTCGGTCGAGTTGAATTTGAAAAAATGATTTTTTTACACAAGTCAATTTTCAACTCAGCTCACTTAAAACCCGGCTTACCACAGACTTATCTGGATTAAACCCGTGGTGAGCCATGTTGTTCACTAACTCACCTAGTTTAATTTAATTATTTATTATTTTGTGTTTTAATATTATTAGTTAACATTTTTTTATTATATATTGTAATTAGGAATTAAGAAAAAGATGTTTTTCCAAGATAGCAAAATTTTATAAATTTATCAATTCAAGACTCTAATCTTATAAATGACAATATTATAAACTTATTTATCCATTTTTTGGATTTGCTTTTGGATTAAATTTGACTTGTATAATTTTTTGATTTTGAATTATTTTTGGAGTTTAATGTTGAAAGTCCCACATCGACAGATAAGGCCAATTCATAGTTCATAAGTGGGTGCAAACCTCATTCTACAAGTCCATTTTGTGGGGTTGAGTTAGACTTAAAGTACACTTCTAACATTTAACATCATTTTAGAGTAAAATTATTTAAATTTAAATATTTTTTTTGGATTTTGAAAAATACTTGTAATTAAATGAATTAGTAAATCAGTCTGTTTAATCCATCAACTTATGATAAACCGAGTCAAATTCGAATTTTTCGATTTTTTAATAAATAAATCGGATTAGATTAACTCATTAAGTGACTAACCAGTGAATCAAACCAGATTCCGTTTGTGTTCAAAAAATTAACTTAAAAAAAGTTATTGAAAAACTCAAAATATATCAAGAATAAAATGATATAATGAAACTTATTTATAATAAACTAATATTATTGTACTTTTTTGTCTTTGTTTTCTTATATATATTTTATTATTTTGAAAAAGTAATCAATATAATAAGTTTTAAATTTTAATAAAAGAAATGCGTATCTATGTGATCATTATTTAAAGATTAAAAATGCAGGAATATAATTTTAAATTTTATAAATAAACTAATAAAAAATAAAGAAAGAAAATGGTACAAGAAGAAGAAGATGGAAGAGGATGTTGACCAAGGTTTAACTCATGGGCAGTTAGGAACATAAATGCACCTCGTTCCCACCATCATCTTCACCTTAACCAATAAACGTTCATTGGATATGGTTTTTATTATGCCCTTTCAGTTCCATCCATCACTCCCTCATATCTTCTCTTGTCTTTTCTTCCACCGCCTCCATCTTTTCTAGTCTTTCAACACAATCACAAAAAACCTCTCTTTCTTTCTGCTTTTCTTGAGTTGTGCAGAAAGAAATGACCTTCAGCTCACCCCACAGCTGCATTGCACTCAAGGTGATGATGCATTTCTATTCTCATATTTAAGTGCACCCTTTTGTTTTCCATCATCACTTCCCTCGTTTTCTGCATCACTTTTACACCGTCAAAACACCAGTAAAATCTGACCCCTCAGTGGGGCTTCCTGCGACCCTTACTCTCCGCACACCCCCTTCTCTCTTCTTCACATTCTCACTTTCTTATCTCTATTTCATGCCATTAAGAACCACACCACTTTGCTTTACAAGGGTATGTATGTTCTTTTTACTTATAAATGCGACCCTCTCTGTGTGCTGGACCTCTCTAAAGCCACCCCATTGTCCTATTATGCACACATGCATTTAATATTTAGCCTTTTCTTTCCTTTCCTTCTGCAACACTTTTCTTCTCATTTTTTACATCCCCTCTCTCTCTCTTCCTTTTTTTGGTCATTATGAGTAGACCCTGACCGACCCAATTGTTGTTGTCATCAGTGTGCAAGTGCAAGCTTATTATTAGCAGCACAAGGTAAAAAAAAAAATACAAAGCGGTGGTGTTAATTATTGTTGTGGGTGTGGTAATGAGTGGTGAAG


Gene Sequence:
>Vu_30944(-)
ATGGGTAAAGCACCTTGTTGTGAGAAACATGGAGTCAAAAGGGGAGCTTGGACTCCTGAAGAAGACCAAGCCTTGGTTGACTACATCAAGGAGCATGGTCATGGAAGTTGGCGTACACTTCCCAAACATGCAGGTGCACTTTCTTATCATTCCTTCTTTTTTTCTTTATTTCTTTTATCACTTTCTCCTTCCTTACTTTTGCATTTCTTGTAAAGTAGGAGAACTTTTATTTATCTTTATGAAAGTTTTGAAGATAGGGAAGAATAGAGCTCGTTTTCTTATGCCTGAAGTTTTCATTTTTCTCTTGGATAAACTCCAATCTCAGTGTGACTTGTTTTCAGAATGAAGAGAATCCGATGGTTGTTTTTCTATTGCTGTATTTTCGTGACACCAATTTCTGCATGTTATGGTACTTTTATGTTCTGCGCGTGCGTGGGTGGGGGTCGGTAAGTACAGTCCTTCTTAGAAATGGACCATTGAAAACAGTAGAAATCGTGTTATCATCCAGTACTTGTCATAACCTAATTTGTTGGCATATGCATAAAACTTTATCTTGATCCAATTGTACTTTGCCCTTGAAAATTGTTTTGGAAATTTGTGTTTGCCGAGGGTTTTGAAGCTTGCTATGCAGAGGGTGTAAAATATTGGCACACTGAAAGGAGAAAGGAGCAGACATGGTTATGACTTATAAAGATGGATAAAATTAGTCTATGAAAAATCATTTAATTGACCTTTGCTTACAACTAGGTCTCTTACGATGTGGAAAAAGTTGTCGGCTTCGGTGGATAAACTATCTTCGCCCTGGTATCAAGCGTGGCCCGTTTACCAGTGAAGAAGAAAGCACAATTGTTCAACTCCATGGCATGCTTGGCAACAGGTACCATATTGTTCCATTTGCTTGTTAAATTCAACATGTAGGCAGTAGTACTATACACATGCGTATACCCAAACCCTCTTGGTCCTAAAGTCTTATTTTACTCATAAGCTGCTTAATAATTAGTAAACATGTTGCATCTTCAAAAAATGTGTCACTTTACTCCCAATGGATATTGTTTCTGTTTCATTGCTTAATGTTCTCATCCTGTTACCCTTTTGCAATTATGGATCCTTAGTGTACGAATTAAAAACTTAAGGAAGCTGAGGAGTTTCAAGTTTTCGACATGATAATGATAATGTAACCTAAGACCTACATTCTCATGCTTATAATTTTTTATATATGGTTGGATTAGTCTGTGATATTACATTCACTTGTTTGTATAAACTGGAAGTAACCATGCATTCTCTTAGGTGGGCTGCTATAGCATCCCAATTACCTGGAAGAACAGACAATGAGATTAAGAACTATTGGAACACCCATCTAAAGAAGCGTCTCCTTCGATCATGTCATTCCCTAAGAGAAAAACAGTCGTGTCTGGTTCTGGATCAAACTATTGTCAAGTCTGAATCTCCTTCTACGCGTCACATGGTACAGTGGGAAAGTGTAAGAGTTGAGGCAGAGGCAAGGTTGTCAATGGAATCCTCGTTCCTCAATTCATGGCCGAAGAGTTCAACATGCCCTGATCATTTTCTTCATCTTTGGCATTCTGAGGTTGGAAAGTCATTTCGCATGGTCAAGGGAAAGGAAGGGATTGTGAGTCAAAGTCCTGTCTCACATCCTTCATCCTCATCTAAATTGGAGTCTTGTTCAGATGTGTCATTGCAGGTGAAAAACAGTACTAGTAGCCTCTATCCATGCATTGAGGATGTGAACATGGTTCATGAACAGATAAGTAGCTACAAACCAAAGCTTGATGACACGGCTGGGTCTGACTCAGGCAATTATGAATTTCTTGATACTTCAGATTCTGCATTAAAGCACCTACTACATATCTCTGATGATGTTGGATTCCTGGGACAGAATGATAATTTCTTGAATCTCCTTGATGCAACATGTGACCAAGATAGTTTCTTTCATATCTCTTCAGAGAAAGGCAATCTTTGA