Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30921 LG8 42459514 42464051 PREDICTED: protein NLP6-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 42459928 synonymous_variant p.Leu911Leu
T/C 42460001 synonymous_variant p.Ala886Ala
A/G 42460287 missense_variant p.Leu791Pro
T/A 42460526 synonymous_variant p.Ala711Ala
T/A 42460626 missense_variant p.Lys678Met
G/A 42460807 stop_gained p.Gln618*
T/C 42461200 missense_variant p.Asn546Asp
T/G 42461289 missense_variant p.His516Pro
C/T 42461356 missense_variant p.Glu494Lys
A/T 42461589 stop_gained p.Leu416*
G/T 42462213 upstream_gene_variant
A/T 42462488 missense_variant p.Val190Glu
C/T 42462489 missense_variant p.Val190Met
A/T 42462551 missense_variant p.Leu169His
A/G 42462775 synonymous_variant p.Ala94Ala
C/G 42462822 intron_variant
A/T 42462837 intron_variant
G/A 42462870 intron_variant
C/T 42462906 intron_variant
A/G 42462911 intron_variant
C/T 42463305 intron_variant
G/A 42463306 intron_variant
A/G 42463335 intron_variant
G/C 42463345 intron_variant
G/A 42463577 synonymous_variant p.Phe66Phe
G/T 42463590 missense_variant p.Pro62His
G/A 42463744 missense_variant p.Arg11Cys
T/C 42463753 missense_variant p.Asn8Asp
C/T 42463768 missense_variant p.Glu3Lys
T/C 42463866 5_prime_UTR_variant
T/A 42463943 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30921.1
MSESEEENTDRVPRSKPAEEVGCTMDFDLDLETSWPLDHMSFGSNPMSPFLFSSNSDQPYSPLWAFSDGEDAKFPASAFSDCHKIFPCDSNSIAEKPEENDDNKKLLPPLAPMPPLENVGGYCVIKERMTQALRYFKELTELNVLAQVWAPVRNGNRYVLTTSGQPFVLDPHSNGLHQYRTVSLMYMFAVDGENDGSLGLPGRVFQQKLPEWTPNVLYYSSKEYPRRDHAQHYNVRGSLALPVFEPALQSCVGVLELIMTSQKINYAPEVDKICKALETVNLRSSEILDHPYTQICNEGRQNALSEILEILTVVCETHNLPLAQTWIPCKHRSVLAQGGGVKKICSSFDGSCMGKVCMSTTDVAFYIIDAHLWGFREACVEHHLQQSQGVAGRAFLSHSMCFCSSITQFCKTDYPLVHYALMFGLTSCFAICLRSSHTGTDDYVLEFFLPPRVTDFHEQKTLLASILATMKQHFQSLKIASGVELEDGSIEIIEATIERIHTRHESIPIAPSIRSHPRPDTSPYMEEEVSLDPSEQHILMYCNGTNHGANLSDKAGGKIDHMITLETKTSKKPLERKRGKTEKSISLEVLQRYFAGSLKDAAKSLGVCPTTMKRICRQHGISRWPSRKINKVNRSLSKLKRVIESVQGAEGAFGLNSLSTSPLPIAVGSLPEPSTPNKFSQPVSMSIRPSEPQMKVNELNASKELETNREAGMEDQLVGGRIHNLERVTNDKGGSTQEIGKEPKRTRTGSGSSEDSTNPTSHGSWHDSIPNESSPVKDIFITSNHDQCAVLRRSPESTLQPATNTPNQATPFCMPEFVAAELQEPFGGMLIEDAGSSKDLRNLCPSVAEAILEDLVPEACGTNPPALDLSPKQSMGTPNKAVTPFAATKEMKTVTIKATYREDIIRFRVSLTCGIVELKEEVAKRLKLEVGTFDIKYLDDDHEWVLIACDADLQECMDVSRSPGSNIIRVLVHDITSNLGSSCESSGE*


CDS Sequence:
>Vu_30921.1
ATGTCAGAATCTGAGGAAGAAAATACAGACCGTGTTCCAAGGTCAAAGCCCGCAGAGGAAGTTGGCTGCACCATGGACTTCGATCTTGACTTAGAAACTTCATGGCCTTTGGATCACATGTCCTTTGGCTCCAATCCCATGTCACCTTTTCTGTTCTCCTCCAACTCTGACCAGCCTTACTCTCCTCTGTGGGCTTTCTCTGATGGAGAAGACGCCAAGTTTCCAGCTTCTGCCTTCTCTGATTGCCACAAGATCTTCCCTTGTGATTCAAATTCAATTGCTGAAAAGCCAGAGGAGAATGATGACAACAAGAAGCTTTTGCCACCACTTGCGCCTATGCCACCACTGGAAAATGTGGGCGGATACTGTGTAATTAAGGAAAGGATGACACAAGCGCTTCGATACTTCAAAGAGTTGACTGAATTGAATGTTCTGGCTCAAGTTTGGGCACCTGTGCGGAATGGTAATCGGTATGTGCTTACAACTTCAGGTCAACCATTTGTTCTTGATCCACACAGTAATGGGCTGCATCAGTATAGAACGGTCTCTCTGATGTACATGTTTGCTGTGGATGGGGAGAACGATGGAAGTTTGGGACTCCCTGGTCGGGTTTTTCAGCAGAAATTACCAGAATGGACTCCCAATGTTCTGTATTATTCCAGTAAAGAGTATCCACGCCGAGATCATGCTCAACATTACAATGTTCGTGGATCTTTGGCTCTGCCCGTGTTTGAACCTGCATTGCAGTCATGTGTTGGTGTACTGGAGTTGATAATGACTTCTCAGAAGATTAACTATGCTCCCGAGGTTGATAAAATCTGCAAAGCCCTTGAGACAGTAAATTTGAGGAGTTCGGAAATTTTGGACCATCCATACACTCAGATATGTAATGAAGGCCGTCAGAATGCTTTATCAGAGATCTTGGAGATACTGACAGTGGTTTGTGAAACTCATAATTTACCTCTGGCGCAAACATGGATTCCTTGTAAGCATCGGAGTGTCTTGGCCCAAGGTGGTGGTGTGAAGAAAATTTGTTCTAGTTTTGATGGTAGCTGCATGGGGAAAGTTTGCATGTCTACAACTGACGTAGCATTCTATATTATAGATGCCCATTTATGGGGTTTCCGTGAGGCCTGTGTTGAGCATCACTTACAACAAAGTCAAGGGGTTGCTGGGAGGGCTTTTTTGTCCCACAGCATGTGCTTCTGTTCAAGCATTACCCAATTCTGCAAGACTGATTACCCCTTAGTTCATTATGCTCTCATGTTTGGATTAACAAGCTGTTTTGCAATATGTTTACGAAGCTCTCATACAGGAACTGATGATTATGTATTAGAGTTTTTTCTGCCTCCTAGGGTCACAGACTTTCACGAACAAAAGACTTTGTTGGCGTCCATATTGGCAACAATGAAACAGCATTTCCAGAGTCTTAAGATTGCTTCTGGTGTTGAACTTGAGGATGGTTCAATTGAAATTATCGAAGCAACAATTGAAAGAATTCACACGAGGCATGAATCCATTCCAATTGCCCCATCTATTAGATCACATCCTAGACCTGATACTTCACCATATATGGAGGAGGAAGTTTCACTTGATCCATCAGAGCAACACATATTGATGTACTGTAATGGTACCAATCATGGAGCGAATCTCAGTGATAAAGCAGGTGGGAAAATTGATCATATGATTACTTTAGAGACTAAAACCTCAAAGAAACCCTTAGAGAGGAAGCGTGGAAAAACTGAGAAATCAATCAGTCTTGAAGTCTTGCAACGATATTTTGCTGGGAGTCTAAAAGATGCTGCAAAGAGCCTTGGTGTTTGTCCTACCACAATGAAGCGCATCTGTAGGCAGCATGGGATATCACGATGGCCATCTCGAAAGATCAACAAGGTTAATCGTTCCCTGTCCAAGCTGAAGCGTGTTATTGAATCTGTCCAGGGTGCTGAAGGAGCATTTGGTTTGAATTCTCTCAGCACAAGTCCACTTCCCATTGCTGTTGGTTCCCTTCCTGAACCATCTACTCCAAACAAGTTCAGCCAGCCAGTCTCAATGAGCATTAGACCATCAGAACCTCAGATGAAAGTGAATGAATTGAATGCCTCCAAAGAACTAGAAACAAACAGAGAAGCAGGAATGGAAGATCAATTGGTAGGAGGAAGAATACATAATCTTGAGAGAGTTACCAATGATAAAGGAGGTTCTACTCAGGAGATTGGGAAAGAACCGAAAAGGACTAGAACTGGAAGTGGCTCAAGTGAGGATAGCACAAACCCTACTTCTCACGGTTCATGGCATGACAGTATCCCAAATGAAAGTTCACCTGTAAAAGATATATTCATTACTTCCAACCATGACCAATGTGCAGTGCTAAGGAGATCACCAGAGTCAACACTGCAGCCAGCCACTAATACACCGAACCAGGCCACTCCTTTCTGTATGCCAGAATTTGTGGCTGCAGAACTTCAAGAGCCATTTGGAGGGATGCTAATAGAGGATGCTGGTAGTTCTAAAGACTTAAGAAATTTGTGTCCTTCAGTAGCTGAGGCCATTTTGGAGGACCTTGTTCCTGAAGCTTGTGGGACTAATCCTCCAGCCTTAGATTTGTCTCCCAAGCAAAGCATGGGTACTCCTAATAAAGCAGTGACACCTTTTGCAGCAACGAAAGAAATGAAGACTGTGACTATCAAGGCAACATACAGAGAAGATATCATAAGATTCCGGGTCTCATTGACATGTGGCATTGTGGAACTGAAAGAAGAAGTTGCCAAAAGATTGAAACTTGAGGTGGGTACGTTTGATATCAAGTACCTTGATGATGATCATGAATGGGTTTTGATAGCCTGTGATGCAGACCTGCAGGAGTGCATGGATGTGTCAAGATCACCAGGAAGCAACATAATCAGGGTTTTGGTGCATGACATAACGTCCAATCTTGGAAGCTCATGTGAGAGCTCGGGAGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_30921::LG8:42464051-42466051(-)
AAAGCAATTTAATATAGTATATCATACAAATATTGTTTATAATTATACTGTAAATATATGTTTTTCTATTTTTTTTCTCTTACAAGTGATCATTAGATACGATACGTAAATATTATTTTCACTTTCTTACAAATTTTGAAATATAATAAGTATTGTTTTTATTACATCAAATAGTTTCGTATCATTTAAAAGTTAAATCTTAAAACAGTTTAAATATTTTTTTCTTTTTTTACTTTTTCACATATGAAGTTTCAGTTTTTAAAACTAACAGCACTCTATAAGGATGATGTACCTATATTAAAATAATTCGTAGATAAGAGATACTTTTTAATTAAAAAAAAACAAATTCACATGATTCTATTACATTTAATTAGATTTGATTGAAGATAGTGAGATCTTTTGAAAAAAATAATATTTAACACCAATAAATAAATAATGAACAAATTTATGTAAAATATGAAAATATCACTTTGAACTTAAAATTTTAAATTGATGTCTAACAACTCTAATACTATTATAAAGATTTTTTTTAAATAAATATTGAAAATAATCAACATGTGAACAAACTCATAATAAAGATAAAAGGTTATTTTCCACTCAAAATATTATTTTTTTTTTATGTTTTTTACTTTTATATAATTCATTTTATATAAAAGAAAACTTGGTTTTGAATTGGACAGATTTTGAGGAGTATGGTCACCACCCATCTTCTGAATGACAAAGAAAATCGAACTTCTTTCATGTCGCAAACAAACAAGTACCAACGCTGTTATCCACACAACATACTTTTCATTTTTCTTTCCATATCTTTCTCACCAGTCGTACACAACTTCTCCTTTGCTTTCAATTCCCAAAATATATCATAAATTATAATATTTAAGAAAATCAATATTTTATTTCATATATCTAGTTTCATGTTTCAGACGATAAAGTTGATTAGAACTTTCATATTTAACTAAAAATAAAATAAAACTCTAATATATAAATATTGTAAAAATCTTATCCTTTTCATACTAAACATATAATTTTCTTAGATTGTACCAGTAATATTTATTAAGAGCAATGCAATAAAAAAATTTAGACCAATATATCTTAAAATATAAATTCCATTTATATTATAATAATTGTTGTATTCTTCTATTCCAGAGAATTAATTGTTTTTAAATAATAGGATTAAAGTTTGGGTGAGGATAGTAATTTTTATATGACTGAGTCTTCGGCATGTATTATCAAATGTTACATATTATATTGTTTCTTTTGTTTTATACAAACACACAACACCACCAAATTAGTCTATAAATTTATTTCCAGTAATTTTAGTGGACTAATCCACCTCAACCAATAGTGTATTAGGGCTGGATAAACATTTTTAATCCATTTTCTTAAACAATTCCAATCGTTTTTTTTTTTGTGTGGATTGGCATAAATTAACTCAAATTGGCCTATTTTATTATTTGTTCACGCTTTTAAGAAGATATTTACAGACTGACATGATAACAACATTAATGTTATATATATATGGACTACGTTCACTTTATAATTATAATCACATATTATTTTGAGACTGTATTTAGGAATTTCAAAACAAATACGAAAGTGAAAACCACGTGCTTTTTTCTCCATCTTGTTTCATTAGATATTTTGGAAAAAAATATGCTTCGCTTGATTTTTTTATTAGATTCTCAATCTTTATTGTAAAGAGAGGAAAATCAATAAAAAAATGTAATTAATATGGAAGAAAAATGAACATACTATTAAAATATAAATATCTGTAAGATTTAAAATATCAATTATATTTTTGAATTCTCGTGTCAAAACTTAAATACAAAACAAAATGTGATGGGGAGACCAGTTAATAAATTTCCAACAGTGAAAGTTATAATGCAAACCAACGAAAAGAAAACATAATAAAAATTGTCAAGAACTAAATTATTATTTTTTCTGTATGGAAGCTTTGAAAACCTTGCAAATGAATAAAAAGAGAAAAGACAGAGACAGGT


Gene Sequence:
>Vu_30921(-)
GCAAGTGCCCTTCTTTTGGTAGTTGGTGCCACAACAAGAATTTTTTTCTCCTTTTAATTTCATTTTATTGAATAATTAATTGTCACTTTGTCGCAACTTGCAAGTGGAAGGGAGTTGTAAAAATTTTCACATGGAATCACAAACTCTATGCATTCACCTGAAGTTTACCCATCATCATCATCATCATCATCGTCATCATCTATTCTACGCTGCCCTTAAACTTCTCTTCACAAAGTTTCAATCTTCACCGCAAACTCTTTAGCACTCTGAGAAGAAAATGTCAGAATCTGAGGAAGAAAATACAGACCGTGTTCCAAGGTCAAAGCCCGCAGAGGAAGTTGGCTGCACCATGGACTTCGATCTTGACTTAGAAACTTCATGGCCTTTGGATCACATGTCCTTTGGCTCCAATCCCATGTCACCTTTTCTGTTCTCCTCCAACTCTGACCAGCCTTACTCTCCTCTGTGGGCTTTCTCTGATGGAGAAGACGCCAAGTTTCCAGCTTCTGCCTTCTCTGATTGCCACAAGATCTTCCCTTGTATGGTTTCAGATTGGTTTTCTTTGGACTTCAGTTTTGGAATTTGCATCCTTCTTTTTGGACCTGCTCACACCCTTTGGAATGTAACTTGAATAGATGCACCAGAATTTTATTTTATAGATTTATAAATGTAATATGGGGTGGAATTAGTTTCTGTAGTGTATGTTCTTTTGGTGTTAGGAGTTTCGTTTTGCCAATTTTTAGCTCGAAGTTTATGCGAATTGGAAAAAAAAAATACATTTTATTAGAACAACCATTTTAATAGCCAATTACTTTGGTTGAAGCCCTTTTTTATTGCTGAGGAACTTGGTTATTAGGCACAGGTAATATATGGATGGAACTTATGGGATTGAAATTGAATTTCTTTTATCACCTATTCTGAACGCACCAGCTGAAATTTCATGGCTTGACATGGTTGTACTCTTTTGAGTGTAGTTTGTTCAAGCAAGCTAATGTTTTCAGGCCGGAGTTTTGTCTGTAATATGCTTCCCTTGGATTTTACCTTTGCCACTGTAAGCTACATTTTTTTATATGATTCTTGGAGTATTTGAGGTTTGGAGGTTGTAGATATGTTGTGAAGTTGAGCTCAGAGGTGTTATTATCACCGTAACTGTTAAGCTTTCATTGCCTACTATCTCTGTGCCCTTTGGTGCTAAACGTGAATTTTATTGTTTCTTCAGGGATCTGCAAGTATTCTAACCGAAGCAACTGTTTTCAGGTGATTCAAATTCAATTGCTGAAAAGCCAGAGGAGAATGATGACAACAAGAAGCTTTTGCCACCACTTGCGCCTATGCCACCACTGGAAAATGTGGGCGGATACTGTGTAATTAAGGAAAGGATGACACAAGCGCTTCGATACTTCAAAGAGTTGACTGAATTGAATGTTCTGGCTCAAGTTTGGGCACCTGTGCGGAATGGTAATCGGTATGTGCTTACAACTTCAGGTCAACCATTTGTTCTTGATCCACACAGTAATGGGCTGCATCAGTATAGAACGGTCTCTCTGATGTACATGTTTGCTGTGGATGGGGAGAACGATGGAAGTTTGGGACTCCCTGGTCGGGTTTTTCAGCAGAAATTACCAGAATGGACTCCCAATGTTCTGTATTATTCCAGTAAAGAGTATCCACGCCGAGATCATGCTCAACATTACAATGTTCGTGGATCTTTGGCTCTGCCCGTGTTTGAACCTGCATTGCAGTCATGTGTTGGTGTACTGGAGTTGATAATGACTTCTCAGAAGATTAACTATGCTCCCGAGGTTGATAAAATCTGCAAAGCCCTTGAGGTTGGGTTTCTTCTAACTTGGCTAATTATGCCCATAATTTGCTCATGTTTGACAAATATCATGTGATGGTTACATGTAATAGTATACCAACATCGATCGTATGTTTCCTTGCAGACAGTAAATTTGAGGAGTTCGGAAATTTTGGACCATCCATACACTCAGGTGATTTAACCATCAGACATGATGCATCCACATCTGTTATATTTCTGTTGTTCTTTATCTTAACCCTTTGTTCCCACAGATATAACTTGGCAATGCTTTTAAACCAGATATGTAATGAAGGCCGTCAGAATGCTTTATCAGAGATCTTGGAGATACTGACAGTGGTTTGTGAAACTCATAATTTACCTCTGGCGCAAACATGGATTCCTTGTAAGCATCGGAGTGTCTTGGCCCAAGGTGGTGGTGTGAAGAAAATTTGTTCTAGTTTTGATGGTAGCTGCATGGGGAAAGTTTGCATGTCTACAACTGACGTAGCATTCTATATTATAGATGCCCATTTATGGGGTTTCCGTGAGGCCTGTGTTGAGCATCACTTACAACAAAGTCAAGGGGTTGCTGGGAGGGCTTTTTTGTCCCACAGCATGTGCTTCTGTTCAAGCATTACCCAATTCTGCAAGACTGATTACCCCTTAGTTCATTATGCTCTCATGTTTGGATTAACAAGCTGTTTTGCAATATGTTTACGAAGCTCTCATACAGGAACTGATGATTATGTATTAGAGTTTTTTCTGCCTCCTAGGGTCACAGACTTTCACGAACAAAAGACTTTGTTGGCGTCCATATTGGCAACAATGAAACAGCATTTCCAGAGTCTTAAGATTGCTTCTGGTGTTGAACTTGAGGATGGTTCAATTGAAATTATCGAAGCAACAATTGAAAGAATTCACACGAGGCATGAATCCATTCCAATTGCCCCATCTATTAGATCACATCCTAGACCTGATACTTCACCATATATGGAGGAGGAAGTTTCACTTGATCCATCAGAGCAACACATATTGATGTACTGTAATGGTACCAATCATGGAGCGAATCTCAGTGATAAAGCAGGTGGGAAAATTGATCATATGATTACTTTAGAGACTAAAACCTCAAAGAAACCCTTAGAGAGGAAGCGTGGAAAAACTGAGAAATCAATCAGTCTTGAAGTCTTGCAACGATATTTTGCTGGGAGTCTAAAAGATGCTGCAAAGAGCCTTGGTGGTATGTTCACACTCCTGAAACATATCGATAATGAATAGTTTTGTTTGTTATCTTCACAATATACATCTAGCAGGAATCACACATTTATCTAAGAATAATATTTATATTTGTCTATGAATACAAATTTTACTTTAGCACAATGAATTTTATCTCTACGAGCCTTTTCTTGGTGTACAGTTTGTCCTACCACAATGAAGCGCATCTGTAGGCAGCATGGGATATCACGATGGCCATCTCGAAAGATCAACAAGGTTAATCGTTCCCTGTCCAAGCTGAAGCGTGTTATTGAATCTGTCCAGGGTGCTGAAGGAGCATTTGGTTTGAATTCTCTCAGCACAAGTCCACTTCCCATTGCTGTTGGTTCCCTTCCTGAACCATCTACTCCAAACAAGTTCAGCCAGCCAGTCTCAATGAGCATTAGACCATCAGAACCTCAGATGAAAGTGAATGAATTGAATGCCTCCAAAGAACTAGAAACAAACAGAGAAGCAGGAATGGAAGATCAATTGGTAGGAGGAAGAATACATAATCTTGAGAGAGTTACCAATGATAAAGGAGGTTCTACTCAGGAGATTGGGAAAGAACCGAAAAGGACTAGAACTGGAAGTGGCTCAAGTGAGGATAGCACAAACCCTACTTCTCACGGTTCATGGCATGACAGTATCCCAAATGAAAGTTCACCTGTAAAAGATATATTCATTACTTCCAACCATGACCAATGTGCAGTGCTAAGGAGATCACCAGAGTCAACACTGCAGCCAGCCACTAATACACCGAACCAGGCCACTCCTTTCTGTATGCCAGAATTTGTGGCTGCAGAACTTCAAGAGCCATTTGGAGGGATGCTAATAGAGGATGCTGGTAGTTCTAAAGACTTAAGAAATTTGTGTCCTTCAGTAGCTGAGGCCATTTTGGAGGACCTTGTTCCTGAAGCTTGTGGGACTAATCCTCCAGCCTTAGATTTGTCTCCCAAGCAAAGCATGGGTACTCCTAATAAAGCAGTGACACCTTTTGCAGCAACGAAAGAAATGAAGACTGTGACTATCAAGGCAACATACAGAGAAGATATCATAAGATTCCGGGTCTCATTGACATGTGGCATTGTGGAACTGAAAGAAGAAGTTGCCAAAAGATTGAAACTTGAGGTGGGTACGTTTGATATCAAGTACCTTGATGATGATCATGAATGGGTTTTGATAGCCTGTGATGCAGACCTGCAGGAGTGCATGGATGTGTCAAGATCACCAGGAAGCAACATAATCAGGGTTTTGGTGCATGACATAACGTCCAATCTTGGAAGCTCATGTGAGAGCTCGGGAGAGTGAGAAGTGTGTGTACATAGGTTTAGTTTGTACTCTAATTATGTAGGTCCTTTCTCGTTTTTAGGATAAAAACACGGAAACAAAATAGTTTTTGGTTATCATTCAGATAAAAGGAGTTGAATATTTGTTGTCTAAGAATTAAAGAGAGGAAGATATGATTCAACAAGTTATTTCCTCTGAT