Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30915 LG8 42418034 42424404 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108326484
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 42418164 3_prime_UTR_variant
T/A 42418227 3_prime_UTR_variant
T/A 42418314 3_prime_UTR_variant
T/A 42418320 3_prime_UTR_variant
T/G 42418324 3_prime_UTR_variant
C/A 42418325 3_prime_UTR_variant
T/A 42418331 stop_lost p.Ter682Leuext*?
G/C 42418333 synonymous_variant p.Ala681Ala
G/C 42418334 missense_variant p.Ala681Gly
A/G 42418916 synonymous_variant p.Cys559Cys
C/T 42420570 intron_variant
G/A 42420653 intron_variant
A/T 42421185 intron_variant
T/C 42421193 intron_variant
T/C 42421284 intron_variant
T/C 42421465 intron_variant
T/A 42422148 intron_variant
T/C 42422180 intron_variant
A/G 42422372 intron_variant
T/G 42422374 intron_variant
G/T 42422521 intron_variant
T/A 42422612 stop_gained p.Lys134*
C/T 42422711 intron_variant
T/A 42422732 missense_variant&splice_region_variant p.Lys121Met
C/A 42422747 missense_variant p.Gly116Val
C/T 42422866 intron_variant
G/T 42422947 synonymous_variant p.Arg100Arg
A/T 42423272 intron_variant
T/C 42424039 intron_variant
G/T 42424199 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30915.1
MPVAKLPASGTTGFTKTDDGNDSLDTIFRQAIGKEPLLSFPRAGDSPVQWIQLLHALDQQELPGWPLLSPVKVQLQKCNKCSREFCSPINYRRHIRVQHRLKKLDKDSKKNRELLGAYWDKLSIEEAKEVVSFKNVMLEEVPGSSILEALTTLRKQGFSSLPQYYLRAGSALLNIVQSRPSSFPISSQELFSILDDSSEKTFLVGSAVSMQRYVFDGEAGKIGLEQKNLVACTSFLLEQKLVKSWLADKDAEALRCQKLLVEEEEAAQKRKAEILERKRQKKLRQKEHKAKEQLENDTETKGNISSAGEDVSPGEASLGTCDFDAHNPDIFADHSPPPPHVTSHCLDTNDVIEKDTLAGYDDCDTDQYIERQTLPAHNRPGTVPARWQGLPKSQWARANGLNAGQNSQLTKLGVIQKHRTSHDLRAAPINNGSKVWSRKPKAESNDLVVKNKLLKEPDKVKNHEVLIGSVSVSLGNSCHSRGNFMAPQRDCSAAGNLSKLNTAQEKPGSNGRLTAKFWRPVSQHGTKDPFPLQNGGTEADAINGKIDENSSGQSSLRLCSVEGNDDIDFGDNFSHNVAKVDTESLRLSSHAAESFLAQRWKEAISSDHVKLVFTPDSEPRGGQSVQDCELAADASDADRCGVLASTENLLPATSGVARSKPKTKPEKGMKIKYIPKQKTAA*


CDS Sequence:
>Vu_30915.1
ATGCCAGTTGCAAAACTACCGGCCTCAGGCACAACCGGTTTCACAAAAACAGATGATGGAAATGATTCTTTAGATACAATATTCAGACAAGCAATTGGAAAAGAACCGTTGCTTTCCTTTCCTAGGGCCGGTGACAGCCCAGTACAGTGGATTCAATTACTTCATGCTTTAGATCAGCAAGAACTTCCAGGGTGGCCTTTGCTCTCTCCTGTGAAGGTTCAGTTACAAAAGTGCAACAAGTGTTCTCGAGAATTTTGCTCTCCCATTAACTATAGAAGACATATACGTGTGCAGCACCGGTTGAAAAAGCTTGATAAGGATTCTAAAAAGAATAGGGAACTTTTAGGGGCATATTGGGATAAGCTCTCCATAGAAGAGGCAAAGGAAGTTGTTTCATTCAAGAATGTGATGCTGGAGGAAGTTCCAGGGTCTTCAATTTTAGAAGCTTTGACAACTCTTAGAAAACAAGGATTTTCTTCTCTTCCGCAATATTATCTGAGGGCTGGTTCTGCCCTTTTGAATATTGTTCAATCCAGGCCATCTAGTTTTCCTATATCTTCCCAAGAGTTGTTCAGTATCCTAGATGATTCTAGTGAAAAAACATTTTTGGTCGGATCAGCAGTGTCGATGCAAAGATATGTTTTTGATGGAGAGGCTGGAAAGATTGGTCTTGAACAAAAAAACCTAGTTGCTTGCACAAGTTTCTTGCTAGAGCAGAAACTGGTGAAGTCTTGGCTTGCGGACAAGGATGCTGAAGCATTGAGATGCCAAAAGTTACTTGTGGAAGAGGAAGAAGCTGCTCAGAAAAGAAAAGCTGAGATTTTAGAGAGGAAACGGCAGAAAAAGCTCAGACAGAAAGAACACAAGGCAAAGGAGCAACTTGAAAACGACACAGAAACTAAAGGAAACATAAGCAGCGCAGGAGAGGATGTATCACCAGGAGAAGCATCTTTGGGTACATGCGACTTCGATGCACATAATCCAGATATTTTTGCGGATCATTCTCCTCCACCACCACATGTAACTTCTCACTGCCTAGACACTAATGATGTTATAGAAAAGGATACGCTGGCAGGGTATGATGATTGTGACACTGATCAGTATATAGAGCGGCAGACACTACCAGCACATAATCGCCCGGGCACAGTGCCTGCCAGATGGCAAGGGCTACCAAAATCACAATGGGCTAGAGCCAATGGTTTGAATGCAGGCCAGAATTCTCAACTGACGAAGCTTGGAGTTATTCAAAAGCATAGAACCAGCCATGATCTTAGGGCAGCTCCTATAAACAATGGCAGTAAGGTTTGGAGTCGAAAACCTAAAGCAGAATCTAATGATTTGGTTGTAAAAAACAAACTGCTGAAAGAACCAGACAAAGTTAAAAATCATGAAGTTTTGATAGGATCTGTATCAGTTAGTCTGGGTAATTCTTGCCATTCCAGAGGTAATTTTATGGCACCCCAGCGGGATTGCTCGGCGGCAGGGAATCTGTCCAAGCTCAATACTGCTCAGGAGAAACCAGGAAGCAACGGTCGTTTAACAGCTAAGTTTTGGAGGCCTGTTAGCCAGCATGGAACTAAAGACCCATTTCCACTTCAAAATGGTGGGACAGAAGCTGATGCTATTAATGGAAAAATTGATGAAAATTCGTCTGGTCAAAGTAGTTTAAGGTTGTGTAGTGTAGAGGGTAATGATGATATTGATTTTGGGGACAATTTTTCCCATAATGTGGCAAAAGTAGATACAGAAAGCTTACGTCTATCCAGCCATGCTGCAGAATCCTTTCTTGCCCAAAGATGGAAAGAAGCTATCTCATCGGACCATGTAAAATTGGTTTTCACACCTGATTCTGAGCCTCGTGGAGGACAGTCTGTCCAGGATTGTGAACTAGCAGCAGATGCTTCTGATGCGGACAGATGTGGCGTTCTTGCAAGTACAGAGAACCTGTTGCCTGCAACCTCTGGAGTAGCAAGATCTAAACCCAAAACGAAGCCTGAAAAAGGAATGAAGATAAAGTACATTCCCAAACAAAAAACAGCAGCCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_30915::LG8:42424404-42426404(-)
GTTTGTCATTTTCATTTTCGAATTACATCCACGTCCAAATAGGAATGCCCAAATAGAAGTTGTTTGAGTGTTTCATCCTACACCTCCAACATCTCATCCTGCACCTCCAAAAATTCCATTTTTAACCTTCTGACATATGTACCTCCAACTTTTCTAAAAATTTTATTTTTTAATAAATATATTTTTATTTTCTTCTCTCTCTTATTAAAGACACTTTAATGAATACATTTTTATTTTTTTCTCTTTCTTATTAAAGTTTCTCTGCACCATTTTAATAATAATCTAATTTAATTTAAAATTTAAATGTTATTTAATATAATTTTATATTTTAATAATTATTAAAATATGATTTATATCATAATAATATTTATATTAAATATATAGAAATCAAATAACTAAAATAAAAGTAATAATGATAAAAATAAAAAATAAAATAATAATAACAATAATATAAAATTTGCTTTAATATATTCAAATATATTAAATTATATTAAAATATTACAATAAATTAAACAATTATTAAATTTTAAATAAAAACAAAATTTTTAAAAACTTATTTATTGGATACCGTAAAATATGTTAATAGTTTTTTTTAATTTAATAAATATTTAATTTAATTAAAAATAATAATATTATTTATTATATTTTTTTAATTTAATAATTATTAAAATATTATTTATATTTTATAATAATTTTATTAAAAAAGTAAAATAAAATAACTAAAATAAATTAATAATAATGAAAATAAAAATAGTATTGAAAATCACATAAAAGATATTTAAATATATTATATTATATTAAAATGTTAATTTAATTAAATAATTATTAAAGTTTAAATGAAAAATAAATTTAAAATTTGTTAATCGGATATAGAAATTCGATAATGTATGAATCGGATATGGGTATCCGATTAAGAATTTTTCAAAATTTTATTTTTTATTTAATTTTAATAATTATTTAATTTAATTTAATATAATTTAACATATTTAAATATATTAAATGTGATTTTAAATATTATTTTTATTATTATTATTATTATTAGTAATTTTAATAAAATTATTATAAAAATATATATTATATTTTAATAATTATTAAAATATAAAAATATAATAAATATATTGTAATTTTCAATTAAATTAAATATTTATTAAATTTTAAATAAAAAACTATTAACATATTTTACGGTATCCAATAAATAAGTTTTTAAAAATTTTGTTTTTATTTAAAATTTAATAACTCTTTAATTTATTATATAATTTAGTATATTTGAATATATTAAAGTAAATTTTATATTATTGTTATTATTATTTTATTTTTATCATTATTACTTTTATTTTAGTTATTTGATTTTTATATATTTAATATAACTATTATTATGATATAAATCATATTTTAATAATTATTAAAATATAAAATTATATTAAATAATATTTAAATTTTAAATTAAATTAAATTATTATTAAGATGGTGGAGAGAAATTTTAATAAGAAAGAGAAAAAAATAAAAATGTATTTATTTAAGTGGCTTTAATAAGAAAGAGAAGAAAATAAAAATATATTTATTAAAAAATAAAATTTTTAGAAAAGTTGGAGGTACATATGTCAGAAGGTTAAAAATGGAATTTTTGGAGGTGCAGGATGAGATGATAGAGGTGTAGGATGAAACACTCAAGTTGTTTTTGGAGTGGACAAGACCAAGCCCAAACTTTTTCTACCTTATGTTGTTTCTGTTTAATTCCTCCCTGAAATGACTAAAAGGACACCAACTTTATATGTAAACCACGTGCAGTCCTGAAAACAGGCACGTGCGTCCACTCACTCCTTCCTCGGAATGTAAGTGGTTGGTTATGCTGTGAGTGTAAAACCAAACCACAATTCCATACCATGTTTTTTCACGCGCTATGAGAGAGCGTGGATAGAAATCTTAGCGGTGAAAAAAGAGAGTGAAAGAGTAATTAATTCAATATATTTTATTATTTGTTTTAATCAATTTCCTTTTTT


Gene Sequence:
>Vu_30915(-)
ATGTTTTTGAAGTTGTTTCTTGTTAGAAACGTTTTTCTTTCGCCCTACTACAACTGCAGCCTGCAGGAACGACAGAGAGAGTTCTCTTTCATATGCTATTTTCTCGCGTTTTCTCTCACGATTTTCTTTCCATCCAAATCCAAACACTCTCAATCCCTTCAAAGCCGTTTCGCTTCCGTTTCGGATCGTCACGACAGAGTTCGTTCGTCCTCCAAGCGATCTCTTCTTCCCTGGTACGTGATCTGCTGTCACTCCACTTAATTTTTTCACTCCCGATCTTAGATCACGTTCTTTGAATTCATTATATTATAGTTTTTTGGGAAAGTAAATTTGCCTTTCAGTGTCCTCTCCTTAGTCGAGGATGAAAATGAAGGTTGAATATAGGAGGTCGTATGTTTATGATAGATCGTGTTTATGATAAATTGTGTTAGGTTTGGTGAATCGTAATTTAATTGTTAAAGCTATGGTTGTCGAGTGCTTACCAATGGATAATGCAAGAATATAAGTCTCTTTGATAATGGAGTCACCCAACAAGGTTGTAGTGTAGATTCTACATCGATCTATTTTGCTCTAGGTTGAGTTTTGAAATGTTTTTTTATTTCTCATCGATCTAATGTGTTGAGAGATTCGGTGTTTTGTTTTATATGATGTGACAATTTTCTTATCACTTTGGCATTGGTCTAGCAATATGTTATGTCTTGATTTTTTATTAGTTTCTTTGACATTCAATTTGTTGAATGAGTAACTTTCATCATCTTTTTCATTTCTCTTTGAATTTAAATTTATTCCCATGGTTACGAGTATAATTTTATACTTTGTGCAGTGCAATCTAGCAAAATTTCCTGGTAAGATTTTTGTCTGAATAGATGCCAGTTGCAAAACTACCGGCCTCAGGCACAACCGGTTTCACAAAAACAGATGATGGAAATGATTCTTTAGATACAATATTCAGACAAGCAATTGGAAAAGAACCGTTGCTTTCCTTTCCTAGGGCCGGTGACAGCCCAGTACAGTGGATTCAATTACTTCATGCTTTAGATCAGCAAGGTATTTGCAATAAAGAATTAAGGGTTCATTTTAAAGGCATTTATATGCTGCCTGTGGTTATATGCAATTCCCATGATATGCAGCCTTCCTCCAACAGCAAAACATAAAAGTCAATAAAAAGAGGAAAAATAGAATTCAAATTTTAAAATTGCTAGACTGGTATTGCCTTTTCTGTGACCTATCGCAGGCTTGCTGACTAGTATATAAAAGTACCACACGTAGATTTTGAGCTTGTTTCTGATGCCATTGATTTAAACCTTGACATTATGATAAAACCTTTCATCCATTTTACAGAACTTCCAGGGTGGCCTTTGCTCTCTCCTGTGAAGGTTCAGTTACAAAAGTGCAACAAGTGTTCTCGAGAATTTTGCTCTCCCATTAACTATAGAAGACATATACGTGTGCAGCACCGGTTGAAAAAGCTTGATAAGGTTATCTTTGTATTTATAATGAGTAGAAGCAATTATGTAACACATTGATGCTTGTAGTTCGTGTTTTTGACCCCTTGAGATTATTTTCTTTTTTTTATCTTTCTTTTCCAAATCTTCCTCACTTTTTCCTAATGCTTCTTACACATTGTAGGATTCTAAAAAGAATAGGGAACTTTTAGGGGCATATTGGGATAAGGTAACCTTTGATCGTTGTGGATTTCAGTTATATGTAGAATACATCTTGTTTTATGCATGCTGATATTCAATAACATGTGTAGCTCTCCATAGAAGAGGCAAAGGAAGTTGTTTCATTCAAGAATGTGATGCTGGAGGTAATATCTTTTTGCCTATTGACTAATTTATTTTTATATGATGTTATTTTAATGGGGTTTGCCTTCTCGAGTTCTGGGGATATGCCAAATATGTTAAGCTATGATTAGTAGAAATGACAGTGTGAGCGGTTGAGTGACACGAGCTTCTCCATCTATTTCCCATTTTCACCTCAATTAAGATAAAATCTTGTTGGTTTGTCATATTATAAGATTTTCTAGAAATGAAATCCTTTCAGAAATTTACTTTTCCACTTAGACTATTGTTCAGTGTGCTGTATTTTTTGGACTGGTAAAAGCTCTTTTGATTGCCATATTGGTTAGGAAACTTTCCTGTGATTGTTGAAGGTTGTAGGTGCCTTTTCAAATGTGAATATAATTTTTTAAGCCTTTTCCCTGTTCTCGTTTGGAAATATCATTGTCTTTTTTATATTGATAATTGATTGCAGACAACACTAATTTTTGTAGGCTAAATGGATAAGAAGCATAGCTACAAATACAATGACACACTAGTCTCTTATGCTTGTCTTCTTTTCAGCTCTTGTTTTTATTTTAACCTGAATTAGTCAAAGTATCTTTTATTCTTTTTTTCGCTTCCATTTTAAAATGCATTCCAGGAAGTTCCAGGGTCTTCAATTTTAGAAGCTTTGACAACTCTTAGAAAACAAGGATTTTCTTCTCTTCCGCAATATTATCTGAGGGCTGGTTCTGCCCTTTTGGTAAGAAACATTACATGATCTTGCTTATCAATTATTCACTCAGGCTACCTTTTTCTGGTACATTCCTTTGATATATTAACACAGCCTATCAATTTTTTTTGTTGCAGAATATTGTTCAATCCAGGCCATCTAGTTTTCCTATATCTTCCCAAGAGTTGTTCAGTATCCTAGATGATTCTAGTGAAAAAACATTTTTGGTCGGATCAGCAGTGTCGATGCAAAGATATGTTTTTGATGGAGAGGCTGGAAAGATTGGTCTTGAACAAAAAAACCTAGTTGCTTGCACAAGTTTCTTGCTAGAGCAGAAACTGGTAACTTTTTTACAAACTTAAGAATCTGTCTGTTTACCTTTAAACTCCTCTTCCTGCCTCTTTCTCATGTGGTTTTTGCTACATTTCCCTTTTTGTTTGTAAAGATTAGTAGATGACACTGATGTCATTTTGTGGGTGTCTAGGCTTGTTTGTTGTTCGATTCATTCAATGACATTAGGAGTGTTGGTTATTATTAAATACATTAGTTTGTTCAAATGCATGCTTCACTTATATCAAAAGTTAACTATGAACAAATCCGTAGTTATGCAATCAGATTTTTGGTATAAAATCAATTCGTGGTTACTCTTCTATTTGGCTTTTTCCCAAGTGAGGTTGTTCCACACGATCCAGATTTTACTGGTGAAAAGGGTCTAAAAAATGGTTTATAATTACGCAATACTTCATGCTTCTATCATTGTTGACAGTTTACATATGTTGACATATACATAAGTGGAAGAGTTTACACGTAACACAACAGTCCATTTTTTCAGTTACACAAAGAGGCGATAGAAGGGTTTAAAAAGATAATTAGTATAAAACAATATTTTGGCATCCTGTGATGCCCCAAAGTCTACAAAGTTTTAATCTTGTCACCTTAAGATTTGACTCAGCACATAGCTTGAGCTATAATGCTTTTGAAAACGAAATGGAAGTGAAACCAAAATTATGGCATATCCTGCATGTACATTCTCTTAAGTCTGACGTGATAGTATAACCTTTCTTTACTATTTCTTAGTTACAGTAATGATGATATGACAATTTATTTCTCAGTTACAGTACTGATGAAATATGAATTTCATTTCACATAGGTGAAGTCTTGGCTTGCGGACAAGGATGCTGAAGCATTGAGATGCCAAAAGTTACTTGTGGAAGAGGAAGAAGCTGCTCAGAAAAGGTACACTTAACCACTTTGTCCTTCAATCAATCTTTCTTGGTATCTTTTCCCCATTCCTTCCCTTGTTCTAGTGTCTTTATTTATATCAGGTCTTGTTGATCTGCATCTTCCCTGAGCTGTTCTTGATTTTTATTTCAATTTTTAGATTCTTAAGGAATGGAAAATATTTCAAGTGTTTGGTTGAGTTTTATTTAAAAGCATGGTCAATCTTCAATTTGTTTGCCTCTATTTAAAATTCTTATTGTCCTCCTTTAAAGGGAAGTCACAATTGGATAAAATTTAATATTTAAAGTGGAGCCCGAGCATTGCTCTGTTTTTAGTAGCTCAGGGAATTTATATAGTCATTAAATCAATGCGTATGAAAAACAGTACGAAAAGAAACCTAACTTGGTTTTAGTGAGAGAAACAATAGGCCCTTGTGTCATGAGAGAAACAATTCCCAACAAGGACCAGGTTCTATGAAAGATACTGGTGTTTATTATATTCACTCAGAGTGAGTTATGTGTAGTTTTAGTGAAACTTTAATAGTCTCACTGCACCGACAGAACATCTTAATGCAACAATTTTTTCTCAGTTTACCCATGGTCTACTCTCTGGCTTTAAGAATATTTCTAGATACTAGAATAGACTTAAAATGGACACGTATATGTAATGACTTATATTTCTCTTTCTTTAGTTGTCTGAATTTTGGAATGACTTCGGCAACTTCTAATGACCTATAATAATAAACAAAATTACATTATTTTAATCATTTAGGTAGTTAATGGTTTGCTCTTTAAGTTGTTTATATAGCGAAGTCAATAATAAGGTACTAGATATGTTATGTACTCTATTATAAACTAGTTATCGTGAAGAGGTTCTTTATTTATTTTTTTATGTCTATTCATAGAAAAGCTGAGATTTTAGAGAGGAAACGGCAGAAAAAGCTCAGACAGAAAGAACACAAGGCAAAGGAGCAACTTGAAAACGACACAGAAACTAAAGGAAACATAAGCAGCGCAGGAGAGGATGTATCACCAGGAGAAGCATCTTTGGGTACATGCGACTTCGATGCACATAATCCAGATATTTTTGCGGATCATTCTCCTCCACCACCACATGTAACTTCTCACTGCCTAGACACTAATGATGTTATAGAAAAGGATACGCTGGCAGGGTATGATGATTGTGACACTGATCAGTATATAGAGCGGCAGACACTACCAGCACATAATCGCCCGGGCACAGTGCCTGCCAGATGGCAAGGGCTACCAAAATCACAATGGGCT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