Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30895 LG8 42256286 42259804 PREDICTED: protein REVEILLE 6-like isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 42256307 missense_variant p.Pro8Ser
C/T 42256311 missense_variant p.Ser9Leu
C/T 42256332 missense_variant p.Pro16Leu
T/G 42256367 missense_variant p.Ser28Ala
G/T 42256755 downstream_gene_variant
T/C 42256801 downstream_gene_variant
T/A 42256815 downstream_gene_variant
A/G 42256974 downstream_gene_variant
T/C 42257049 downstream_gene_variant
G/A 42257073 downstream_gene_variant
A/C 42257076 downstream_gene_variant
T/A 42257078 downstream_gene_variant
C/T,* 42257198 downstream_gene_variant
T/A 42257630 downstream_gene_variant
T/C 42257815 downstream_gene_variant
C/T 42257905 downstream_gene_variant
G/T 42258033 missense_variant p.Lys102Asn
G/T 42258037 missense_variant p.Gly104Trp
A/T 42258092 missense_variant p.Tyr122Phe
A/T 42258175 downstream_gene_variant
A/C 42258453 downstream_gene_variant
T/C 42258641 downstream_gene_variant
G/C 42258646 downstream_gene_variant
T/A 42258653 downstream_gene_variant
A/G 42258907 downstream_gene_variant
T/C 42259105 downstream_gene_variant
G/A 42259179 missense_variant p.Cys238Tyr
A/G 42259239 splice_region_variant&intron_variant
C/G 42259477 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30895.1
MVSKNSNPSETFYMDPSAMSLPRILHFSATTPADSLEDPAKKTRKPYTITKSRESWTEPEHDKFLEALQLFDRDWKKIEAFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTSEHLPPPRPKRKAAHPYPQKASKNVPVLSQVSGSFQSSSALLEPGYIMKRDSSAMLKTPIINAAASSWSNNSLQKSTNLLHGHKVNNCCSNGGSPRAQLVGEANGQGNNIHPLRILPDFGQVYGFIGSVFDPNVTGHLQKLKRMDPIDVETVLLLMRNLSINLVSPDFEDHRRLLASYEVEPESDNYYINADRNMVEGQLKSVT*


CDS Sequence:
>Vu_30895.1
ATGGTATCTAAAAACTCCAACCCTTCAGAGACTTTTTACATGGACCCTTCTGCTATGTCGCTCCCCAGAATACTCCATTTTTCCGCCACTACCCCTGCCGATTCTCTTGAGGACCCTGCTAAGAAGACTCGCAAACCTTACACTATCACCAAGTCTAGGGAGAGTTGGACCGAACCCGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCAGCTATTTGACCGTGACTGGAAAAAGATTGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACAGTTATCCAGATACGAAGCCATGCTCAGAAATACTTTCTAAAAGTTCAGAAGAATGGGACAAGTGAACATCTTCCTCCACCCAGACCAAAAAGAAAAGCTGCTCATCCATACCCTCAGAAAGCTTCAAAAAATGTTCCAGTGCTCTCACAAGTATCAGGGTCCTTTCAATCATCATCGGCTTTGCTTGAACCAGGGTACATTATGAAGCGTGATTCTTCAGCAATGCTTAAAACTCCTATTATTAACGCTGCAGCGTCTTCCTGGTCAAACAATTCTCTGCAGAAAAGCACCAATTTATTGCATGGCCACAAAGTGAATAATTGTTGCAGTAACGGTGGAAGTCCTAGAGCACAGTTGGTTGGTGAAGCTAATGGTCAAGGGAATAATATCCATCCATTGAGAATTCTTCCAGATTTTGGTCAAGTTTACGGCTTCATTGGTAGTGTATTTGATCCAAATGTAACTGGACATCTGCAGAAACTGAAACGAATGGACCCTATAGATGTTGAGACAGTGCTATTGTTGATGAGAAACCTGTCTATCAATTTAGTAAGCCCAGATTTTGAGGACCATAGAAGGCTGCTTGCATCATATGAAGTGGAACCTGAGTCAGATAACTATTATATCAATGCAGATCGAAACATGGTTGAAGGGCAGTTGAAGAGTGTTACTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_30895::LG8:42254286-42256286(+)
TTTTAATCATTCATTGCATATATATTAGAATGTAACATTTCTTGAAAACTAATCAAGAAAGTTCAACACATTTAAAAGCTCATTAAATACGCACAACAAATTCAGATGCTTTATCCTCCAAAATGTGATGATACTAATAAAAGAAGAAAGTTACCACCTAACAACTTTACAAATGGATAAGATAAAGCATGAGAAAATTAGAAAACTTGTCAGAAAAACTCTTAATTTTTTGTTTTTGATGGAGAGGAGATGAAAAGGAACCCTTTAAATTATAACTGTACGATGTGGATAAGGTAAAAGATTTTATGGGTGGAAAATTTTAAAAATATAATTTTTATGGAGTTACAAAACAGAATTAATTGATTAAGCGTAAAAACAAATAGTTATATTGTTTTCTAGTTTAAATGTTTTTTATTCTCTACATAGGAAGAAAGTGCAACAAACATAGGAAGAGAGACAAAGGAACAGACTGAGCGAGACAAGGGTGAAAGAGACGAAAGGTAAAAGGAAAGAATAGCAAAGACAGCATTGGGTCCTCAGAACGTGAAATCGATATGGGCCCATGATAAAATGACCGGGCCCATCAGAAAATATCTGGTGTGAAATTATGTGGCCTAGCTTTGTGTGTCACTAACTACCTTACAACCAAGTAGGCCTTGTGGGCCATGGGCTTTTTCCCTTAACCCATATTTCCTCGACACGTCACAAATCACTTAATCGCAACCTTTCCTGTCGTTTTTTTCAACATTAATAACTAAAAGACTATGCTTTATGTTCGTCAACGAGTTTTTATCAACTCCGTGTTACTAAATAAAATAAAATAAAATTTAGAATCCACACAACAACAAGAAATCGTTTCAAAATATTAATATTTAATTCGTAAAAGTTTTAAGAAAAAAATTGTTTATTTTAATGAAATCAAATTTAAAATGACATTTTTGGCATTGTTCCTAATCACGTGCAGTTAGGCTACGCGTGAATTCAGGAATATGGAAAAGACATGATTTTGTTGCACTAAAATCTGATTTTGTGTGTGTTTGTACTGTTGGCATATCTAACATTTTGGAAATTAATAGATAAGTGCGAGTACAAATGATAACATTAATCAAAGTCTTGTCAAGAACTAAATTCAAAATCACATAATTATCTGTTTTGTATTATTCCAGAACATTATTGGTGTTTTACTATGAATGTTAAATCATACGTGGCACTTCTCTTTGTAAATAAACCATGCCAACTCAACTTCACAATTGGAGATATTTTGCTCTAAGAAACACTGTCACTGTCTTCAATTCTGTCATAAACTACCAAACTATAATTTGTCTCTAATTAGACTTTCATCTGAGCGACCATATTATTAAACTTCACTTAAGACACGGAATATTATTTTCATTAGGAAACTAAGTCCCATGACAAGAACAAGTGCACAACTGACACATGCTCACAGAAATTAAATGATTCGACAGTTTACAACTATCCATATATCTTATACATAGGCTTTTAGTCTACTCTCTTGAGAAAAAAGAAGAAGAAATAAACCAAGTAAAAGAGAAAAGGAAAAATAAGGTAAAAAATAAATTTAATTAGAAAAAATATAATAAAGATAAAATTGATGAATTTATTCATTATTGGTAGTATTATAGAAAAAATAGATTATGATGTAACTACAGTCAATTTTGTTTTTTCAAAATCTTTGTTATTTTCGACAGTAGTTGGATTTGAAAAAGAATCTAAGAGTAATTAAAGATAAAATTAAAATTTAATACAATAACATAATATAGTGCGTTAAATAAAATAAAAGAAGCTTAATTAAAATAGGTGGTGAGGTGGCAAGGGAGGATTGGCGCTTGCGAAGTAGGAAGAGAAAAAAAAAAACAGAGGAAAGTATCTCTTATAAGTACTCTGTGGTTCTGTTCTGCTCTAACTAACAGCAGCATCTATCTGTTTCTACAAGATACACAAACCTTAAAGCTTGAAACTTACAACCAAAAGGAGGAGCA


Gene Sequence:
>Vu_30895(+)
ATGGTATCTAAAAACTCCAACCCTTCAGAGACTTTTTACATGGACCCTTCTGCTATGTCGCTCCCCAGAATACTCCATTTTTCCGCCACTACCCCTGCCGATTCTCTTGAGGACCCTGCTAAGAAGACTCGCAAACCTTACACTATCACCAAGTCTAGGGAGAGTTGGACCGAACCCGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCTCTTCAGCTGTATGTCAATTTCACGGTTTTTTATAATTGGTTTTGTATTAGAATGTAGTGTGTGGATTTTGAAGCTCAATTGAGACATGGGTTTTAGTGGTATATCATATACGAGGTTTCAAATTGTTGTATATAAGGAGAAATTGATTATAAATGTGAGGGTATAATTGTGGTTACTGTCACTCCAAAACTCTTAATGTTTCAGGGGTATGTGCTTATGATTAGGTATTTCCTATTTTTGACGGGTTTAGTGTTAGGGACAGGGTATGGTTTCTATTACTGTTATTGTTATTTGAAAATGACTCTGGTTTTGACTGTTCTGTATTGCATTGCTCGAGACTCGTCGAAAGAGAGAGAATCAGAAGGGAATTAGGCAGGTTTATTATTCTCTTTGAAGTGTTTTTATTAGAAACTTAGATTTATATGTTGATTCTTTCAAGTATCAAAGCATCATTTTATACTTGTACATGAGCCACTTTGGAGGAGATAGATTTTGATATGTTGATTGGCAAGGATCTTGTACACTGCATGGATAACTTTTTGGTTTAGCTAAAATATGAATTTCTCTGAATACTAGCAATAGTGTGGTAAATATACTGTTTATTCATGATGTAATGCAGAATGACCATAGCTCAAGTTACTGCAAATCCTTCTTACAGAAAATTATTAATTTGTGAATAGAAAAGAAAAGAATGTAATGATTTTCTAGGTACTTCTACATAAATTTACATAATTAAAAAGAAAAGATAGAAATTAATGCTTGGGGACGTTAAGAAGTTCTCCTGACTAGAAAAGAATGAGAAGAAAACAGTGAGCAGTAGCTAGGAAAATGCAACAGAGCTCTTTCAATATTAAATTTTCCTTTAAATAGCTAAGGCACCTAAGATAAACCACAAACACAATTCAACAACAAATTTAAACATAACCTGACAACATTGAAAGTACTGTTGTTTCTCTCCAACCAAGTACACCTGAAAAGTACCAAGTTGTTTAAATTGTAAATTCTGATAATAACTCATCTCATTTTGTTTCTTTGGTTCTGGATGCAGATTTGACCGTGACTGGAAAAAGATTGAAGCATTTGTTGGATCAAAGACAGTTATCCAGGTAATTTCAAATGCAACCTTTGTCTGGAAATTTGCACTAGCTGTTTGGGTTAGCCATAAATGTCCAGGATTGAATAGAGCAGAATGGAGATGTCATGGATTAAAATTTGAGAACACTTAGTCATACGAACATTTATGTCATGTCAGGGAACCAACAACCCCAAAAGTTTAATTTGATAGATATAGGTTTGGGAGTGGCTTTATTGTCTTAACTAGGATAATGTAATTTTTCTTCTGGGATACCATCGGTTGGCTAACGTGAAAAGAAGAAAATCTTTTATGTTGTTAACGGAAAGAGAAACCAAATATTCATCGGTTGAGTGTTTGTAGCTTAAATGGATTTAAATGGACACCTCAAATACCTATGAGAAGGACTGAAAAATTACTACTGATTTTGCAGATACGAAGCCATGCTCAGAAATACTTTCTAAAAGTTCAGAAGAATGGGACAAGTGAACATCTTCCTCCACCCAGACCAAAAAGAAAAGCTGCTCATCCATACCCTCAGAAAGCTTCAAAAAATGGTTTGAATATTCACTATATTTTTTATTTCATTATTTAATATGATTGTATCTAATAATTTATAGTGATATCTGGCAGTTCCAGTGCTCTCACAAGTATCAGGGTCCTTTCAATCATCATCGGCTTTGCTTGAACCAGGGTACATTATGAAGCGTGATTCTTCAGCAATGCTTAAAACTCCTATTATTAACGCTGCAGCGTCTTCCTGGTCAAACAATTCTCTGCAGAAAAGCACCAATTTATTGCATGGTACTAAACGCTGAACTTTCCATACTTCAACTTTGATTACATTATCATTGGAAACAGTTGTGGATGTTATTTAAATATTTTTCTGAAGGTAATAATTATTTATCGAGTTTATCATATCGTATGTTTTAGGCCACAAAGTGAATAATTGTTGCAGTAACGGTGGAAGTCCTAGAGCACAGTTGGTTGGTGAAGCTAATGGTCAAGGGAATAATATCCATCCATTGAGAAGTAAGGGTTTAATGATTTTATTTCTAATTTTTTATGTTCTCGTCTGCAATTATTAGACCACATTCAATGTGTGTACGGCAGCAAGGTTATGAAATGTTGTAGACTGACAATGTGTGTAGATAGAGTATGCCGTATGCTTCAGTGTATACACTCTTTCTCTATTTTATTTTAAATACTAAAAAAAGAACTTGTGGGGTCCAGAGTAACTTTGGACTCTGTTTCCCATCACCTTGGGACATGAATCTTAATTATCATTATCTAAGTCTTGAACAATTTTGCGATTTTAATGTTTAGTCACCATATGGAAACTATAGCGAGTCCTGTTTTTCTTGTTTTGTGAATCATTATCTACAGAAAGCTCTGTTGGCCTGGAAAAACTGATAACTCAACTCCCACAGACTAACCGCTCTGTCATGCGAACATCCTTTTAAAAATTTATCTTTCTTCCAACGAAGTATTGCTGTTTCCCAAATCACATTGGCAGTTTTCTTCTCAATATTTATAATGTTTCATCTTCCTGTTTTTAATGCAGTTCTTCCAGATTTTGGTCAAGTTTACGGCTTCATTGGTAGTGTATTTGATCCAAATGTAACTGGACATCTGCAGAAACTGAAACGAATGGACCCTATAGATGTTGAGACAGTAAGTACTTGTGAACGTGATTTCTTTTTAAAAATGATTCTTTCCGATTATTCTTCACGGCTATTTATTTGTAATTTCCTTTTTAGGTGCTATTGTTGATGAGAAACCTGTCTATCAATTTAGTAAGCCCAGATTTTGAGGACCATGTAAGTATTGTGACAACTATCTTTGTATTACTATTACAATGAATATGTAATTATCAATGCACCGTTTTTTCTTACTTGGGCCTCGCCCTTCTCTTAACCCAACATCAAATTTTGATTATGTTTTCAAATACCTATTTTGGGGATTCTTAGCTTGAAATGATCCCTATATGTTCCTCATCTTTCCAAAACTTTCAAAAAATTGATTGGAATTTTCTTCTTTATAGAAACTTGAATGACTGAAGTTGACATCAAATTGGATGTTCAAGGAGAGAAGAAAAGATGATAAACATCTATATTTATACGCATGTTGTGTTATTCATGCAGAGAAGGCTGCTTGCATCATATGAAGTGGAACCTGAGTCAGATAACTATTATATCAATGCAGATCGAAACATGGTTGAAGGGCAGTTGAAGAGTGTTACTTAG