Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30875 LG8 42046244 42050338 PREDICTED: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 42046694 upstream_gene_variant
G/T 42046732 upstream_gene_variant
G/T 42046835 upstream_gene_variant
A/C 42046836 upstream_gene_variant
G/A 42046878 upstream_gene_variant
A/G 42046989 upstream_gene_variant
A/G 42047310 upstream_gene_variant
C/T 42047344 upstream_gene_variant
A/T 42047841 missense_variant p.Phe485Tyr
G/T 42047863 missense_variant p.Pro478Thr
T/C 42048157 missense_variant p.Ile380Val
T/G 42048163 missense_variant p.Thr378Pro
C/G 42048209 synonymous_variant p.Thr362Thr
A/G 42048555 missense_variant p.Met247Thr
T/G 42048943 missense_variant p.Thr118Pro
G/T 42048983 synonymous_variant p.Thr104Thr
C/T 42049266 upstream_gene_variant
G/T 42049297 upstream_gene_variant
T/A 42049386 upstream_gene_variant
T/C 42049487 upstream_gene_variant
T/G 42049745 upstream_gene_variant
A/T 42049942 upstream_gene_variant
T/A 42050009 upstream_gene_variant
G/A 42050038 upstream_gene_variant
G/T 42050057 upstream_gene_variant
T/C 42050098 missense_variant p.Ile81Val
C/G 42050140 missense_variant p.Val67Leu
A/G 42050291 synonymous_variant p.Leu16Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30875.1
MANAAYSSFSCYCLILALGLSSFSTCISAHVALGSRLLSSKALTWVSENGTFAFGFTPADTDNRLFVLGVWFAQLPGDPTIVWSPNRDSPVSQDATLELDTTGNLVLVDGDITVWTSNTSGAGVQAAVMAESGNFILQNANNHPVWQSFSQPSDTLLPNQLLTVSSELTSSKSSSHGGYYSLKMLQQRTSLSLALTYNLLETYQASDESYTNYSYWKGPDISNVTGEVIAVLDHAGSFGIVYGDSSDGAVYVYKNDGDDAGLPSAVNQSAPSTVLRRLTLEKNGNLRLYRWDEVNGSRQWVPQWAAVSNPCDIAGVCGNGVCNLDRSKTKATCTCLPGTSKVGRDGLCYENSSLVGKCNGKHENLTSQFRISTVQQTNYYFSDISVIANYSDISNESKCGDACLSECDCVASVYGLNEERAYCWVLRSLSYGGFEDTGSTLFVKVRANGSWTPEGQGGSNNSSSGGMGSAKEKAVIIPTVFSMVVLIVLLSLLLYYSVHRKRTLKREMESSLILSGAPMNFTYRDLQIRTCNFSQLLGTGGFGSVYKGSLGDGTLVAVKKLDRVLPHGEKEFITEEMTNGSTIKVADRRLNGAVDEEELTRALKVAFWCIQDEVSMRPTMGEVVRLLEDTVDINMPPMPQTVLELIEEGLDHVYKAMKRENNHSSSFTLTSHLTSRATCSNSTMSPR*


CDS Sequence:
>Vu_30875.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30875::LG8:42050338-42052338(-)
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Gene Sequence:
>Vu_30875(-)
ATGGCCAATGCTGCTTACTCTTCCTTTTCATGTTACTGCCTAATTCTTGCTTTGGGCCTCTCTTCTTTTAGTACCTGCATTTCGGCCCACGTTGCCTTGGGCTCCAGGTTATTGTCTAGCAAGGCCCTAACTTGGGTTTCAGAAAACGGCACATTTGCTTTCGGGTTCACTCCAGCAGATACCGATAATCGATTGTTTGTGCTTGGCGTTTGGTTTGCACAGCTTCCAGGAGATCCAACTATAGTTTGGTCACCCAATAGGTACCATTTTTTCATCTTCCACTTTATAAATGAACTTATTCTATTCAATTCACGTTTCTGAATATAGCAAAAGTATTCCATAAAATGAAATTCATTCAGTGTGTAAATTAAGTTTTTTTTTTCTTTCTGAAATTTATTATACTGAGAACCTTGACTAGATTAAAATTTTATAGTGATCATACGTGAGGGCCAAAATGAAGAACGAGTGAAATGAAAAAAATGAAAAAAATAAATAAAATAGCCTTAAGCCAAATATGATGTAAAAACCAAACGGCACCAATATGTCAAGGGAGCACAGGAAGAAAAGATGTAATATATTTGAAAAACTATAGAAGCAAGGAGAATCAAACAGTCATATAGTCGTAGTTATATAATATTTTTTCAATCTCTTATGTAAATAAATTTGCTTTTTATTTCAATTATAAAATGCATGAACTCACGTTTAGATTGTAGGTATTTTTAAAATAAAATTTAAATTTACGAATTTATTAATTAAAATTATCTACTTTAATCTTCTCAATGAATTAGTTTTTTTTTTTATCATTTGTATCAGAATATCTCTCAATAAATAGTCATTAGTTATTTCTTTTTATAACGTAAAAGTCATTAATATTTAGTTATTTGCTGAAAAATAGTATAAAGGTTAAATTTATTTTGCATACTCTTGTAGTTTGCTACATTTTTATATATAGATCTTAGTTTATAAATTTTTAACATTATCTTTACACTTATCTTTTTAATAAATCTTTACAGATCAATCTTTTAAACAGGTAATATTTCCCTTCGTCTTGAAATAATGAAAGCATTAATTTGTTGGGAAATCAATTTAGTTAATCAAATGTTGGGGGCCAGTTTTCACACAAAACAACAATAGTGTTATATCAGTGTAGTGCAGATTAGATTTAGATGGTTAGTTCTGGTTTTTGACTTAGACAAAGAGGAAGTCATGAATCATATCTCCATCTAGTTTTTAGTGTTTACAAAAGCTTCTGCAGGTTATGAATGCCAACATGTTTCATTTTCTTTGATCTCAATCCAAATAGAGACAGTCCTGTATCCCAAGATGCAACATTGGAGCTTGACACCACTGGCAACCTTGTTCTCGTGGATGGAGACATCACAGTGTGGACCTCAAACACCTCAGGTGCCGGTGTTCAAGCAGCAGTCATGGCAGAATCCGGCAACTTCATCCTCCAGAACGCCAACAACCACCCTGTGTGGCAGAGTTTTTCTCAACCTTCCGACACTCTCCTCCCCAACCAGCTTCTAACAGTGTCTTCAGAACTAACTTCATCTAAGTCTTCTTCTCATGGTGGCTACTATTCTCTCAAAATGCTTCAACAGCGTACTTCCTTAAGCCTTGCTCTCACTTACAATCTCCTTGAGACTTACCAAGCCTCAGATGAATCATACACCAACTATTCCTATTGGAAAGGCCCTGATATCTCCAATGTGACTGGGGAGGTTATAGCAGTTTTAGACCATGCTGGGAGCTTTGGGATTGTGTATGGAGACTCCTCTGATGGTGCAGTGTATGTGTACAAGAATGATGGTGACGATGCAGGCTTGCCTTCTGCAGTTAATCAATCTGCACCATCGACTGTTCTCAGGAGACTAACACTGGAAAAGAATGGCAATCTGCGGTTGTATCGATGGGACGAAGTGAATGGCTCAAGGCAGTGGGTGCCACAGTGGGCTGCAGTTTCAAATCCATGTGACATTGCTGGAGTTTGTGGCAACGGGGTTTGCAATTTGGATAGAAGTAAGACAAAAGCCACTTGCACTTGCTTGCCAGGAACTTCTAAAGTTGGGAGGGATGGTCTGTGCTATGAGAATTCATCTCTAGTGGGAAAATGCAATGGCAAACACGAAAACCTGACATCCCAGTTTAGGATTTCGACGGTGCAGCAAACCAACTATTATTTTTCTGACATTTCAGTTATAGCTAACTACAGTGATATTTCTAATGAGTCAAAATGTGGGGATGCTTGCTTGTCAGAATGTGATTGCGTGGCTTCTGTTTATGGGCTAAATGAGGAGAGAGCATATTGTTGGGTGTTGAGGAGCTTAAGTTATGGTGGTTTTGAAGATACAGGATCAACTTTGTTTGTGAAAGTAAGAGCAAATGGGTCATGGACTCCAGAAGGCCAAGGAGGGTCTAATAATAGCTCTTCTGGTGGAATGGGAAGTGCAAAGGAGAAGGCTGTGATTATTCCCACTGTTTTTAGCATGGTAGTTCTCATTGTTTTGCTGAGTTTATTACTGTATTACAGCGTTCACAGGAAAAGAACTTTGAAAAGGGAGATGGAAAGTTCCTTGATCTTATCAGGTGCTCCAATGAATTTCACATACCGTGATTTGCAGATCAGGACATGCAACTTTTCACAGCTGCTAGGAACAGGTACGTGTGTTTTATATCAATTTTCACTCCAAAAAAGTTACAGTTACATGAAGAGTTTCGACTTTGTGTGAAGTGTTACTAAAGGTACATGTTTTGCAGGTGGGTTTGGCAGTGTATATAAAGGAAGCCTGGGAGACGGTACTCTAGTGGCAGTGAAGAAACTTGACAGGGTTTTGCCCCATGGAGAGAAGGAATTCATCACTGAAGTAAACACTATTGGCTCAATGCATCATATGAATTTGGTTCGCCTATGCGGCTATTGTTCTGAGGGGTCACATAGGTATGCACTCTTTCTTCGCGATCAATTTTATGATTTTTTCCTTCTTACATAAAGAAATATCAAGTCTTTTCACATATTTTCTAGCTTTGGTAATAACTATCTTAAAAATTATCCTAACGATATGGAATGATACATGTTTACTAAACTAAATTTGTAATGGTTTATTGGCTTTGACAAATATTTGTTTGACAGGCTTCTGGTTTATGAGTTCATGAAGAATGGGTCCTTGGATAAGTGGATCTTCACTTCGTATCAAGGGCGAGATAGATTGTTGGATTGGACAACTCGTTTCAATATAGCCATAGCTACTGCACAAGGAATTGCATACTTTCATGAACAATGCAGGGATAGGATAATACACTGTGACATAAAACCGGAGAATATATTGGTGGACGACAACTTTTGTCCTAAAGTATCTGATTTTGGACTGGCGAAATTGATGGGAAGGGAGCACTCTCATGTGGTGACAATGGTGAGAGGCACAAGAGGTTATTTGGCACCAGAATGGGTTAGTAATCGCCCTATAACTGTCAAAGCTGATGTTTACAGCTATGGGATGCTTCTTTTAGAGATCATTGGTGGTAGGAGAAATCTTGACATGTCCTTTGGTCCTGAGGATTTCTTCTATCCTGGTTGGGCTTACAAGGTATATTTTTCAGATTGCACTTATCATTATTAGTATTATGAGAAGAAAAATGTCACTGCACATCATAAAACACATTATACCATCATTCTATCATAATTGTGATGTGTATTAAATTTGTTATCTATGTGGTTGATAAATATAGTGATAGTATAATGTTGGGTTACTGTAGGAGATGACAAATGGGTCAACAATTAAAGTGGCAGATAGAAGATTAAATGGGGCAGTTGATGAAGAAGAGCTAACGAGAGCTCTGAAAGTTGCATTTTGGTGCATCCAAGATGAGGTATCCATGCGACCAACAATGGGGGAAGTGGTGAGACTTCTGGAAGATACGGTGGACATTAATATGCCACCGATGCCACAAACAGTGCTAGAGTTAATTGAGGAAGGCTTAGACCATGTATACAAAGCTATGAAAAGAGAGAATAATCACTCCAGCTCATTCACTCTTACAAGCCATCTCACATCTCGTGCCACATGTAGCAATTCCACAATGTCACCGAGATAG