Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30873 LG8 42034243 42036855 LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 42034446 synonymous_variant p.Val68Val
C/T 42034452 synonymous_variant p.Asp70Asp
C/T 42034461 synonymous_variant p.Asp73Asp
T/A 42034693 missense_variant p.Ser151Thr
T/A 42034731 synonymous_variant p.Gly163Gly
T/C 42034950 synonymous_variant p.Asp236Asp
C/A 42034954 missense_variant p.Arg238Ser
A/C 42034983 synonymous_variant p.Pro247Pro
G/A 42035027 missense_variant p.Cys262Tyr
G/A 42035268 synonymous_variant p.Val342Val
A/G 42035301 synonymous_variant p.Leu353Leu
T/C 42035314 synonymous_variant p.Leu358Leu
T/C 42035379 synonymous_variant p.Asn379Asn
T/C 42035420 missense_variant p.Leu393Pro
A/T 42035421 synonymous_variant p.Leu393Leu
C/T 42035712 downstream_gene_variant
A/G 42035977 downstream_gene_variant
A/G 42036003 downstream_gene_variant
G/A 42036151 downstream_gene_variant
C/T 42036289 missense_variant p.Leu465Phe
T/C 42036291 synonymous_variant p.Leu465Leu
C/A 42036388 missense_variant p.Leu498Ile
T/G 42036408 missense_variant p.Asn504Lys
G/T 42036546 synonymous_variant p.Thr550Thr
T/C 42036573 synonymous_variant p.Tyr559Tyr
C/T 42036599 missense_variant p.Pro568Leu
A/C 42036648 missense_variant p.Lys584Asn
G/C 42036659 missense_variant p.Gly588Ala
G/A 42036757 missense_variant p.Val621Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30873.1
MSNPKIHCNKKDMDTLLLFKQGLTDPSGMLSSWISNLDCCQWTGVKCDNITGKVTNLHLPCHTNHPKVVDFLDKDDKSHCLTGTLSLSLLELQSLSYLNLSNNNFKFMQYTSMVTPPIGNLSRLCGNSTNLRYLDLSQNYDLLVDNLHWISHLTSLQYLNLGGVYLHKDIDWLQPVTMLPLLKELHLKCCELENIYPYLQHANFTSLQVLNLADNRFMFELPNWLFNLSCEISRIDLRQNQIHSQLPKTLPNFKSLKSLVLCGNILKGPIPSWLGQLEQLQELDLSHNLFSGPIPTSLGNLSSLIKLMLESNDLNGNLPVELGQLFKLETLRVSNNPLTGIVSEKSLRSLRNLKNFSLSSPFLIFDFDAKWVPPFQLLNVELGYLRDKLPAWLFTQSSLKYLTIRDSTASFEPLDMFWNFTTQLEYISLENNTINGDMSKISCSIQLLIKGNELPYFDVMNAIDLSSNNLSGSVPLGIYMLTGLQSLNLSHNQLIGTLPNEIGNLQQLESIDLSSNNLSGEIPQSMSALHFLGVLNLSFNNFMGKIPAGTQLGSTNLSYIHNPDLCGPPLTKICPPDEYPNNKKSMRGDDSDDDKFQVHSWFDMGLGMGFAAGFWGLLGTVFFNRKCRRAYFKFLNRISDFVIQKINSITEM*


CDS Sequence:
>Vu_30873.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30873::LG8:42032243-42034243(+)
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Gene Sequence:
>Vu_30873(+)
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