Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30871 LG8 42016236 42017686 PREDICTED: phytosulfokine receptor 1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 42016540 missense_variant p.Gly102Val
T/C 42016562 synonymous_variant p.Phe109Phe
T/A 42016580 synonymous_variant p.Pro115Pro
C/T 42016646 synonymous_variant p.Val137Val
G/C 42016656 missense_variant p.Asp141His
C/G 42016683 missense_variant p.Gln150Glu
A/G 42016746 missense_variant p.Ile171Val
C/T 42016892 synonymous_variant p.Phe219Phe
A/C 42016893 missense_variant p.Asn220His
T/C 42016896 missense_variant p.Phe221Leu
A/T 42016940 synonymous_variant p.Ile235Ile
A/G 42016957 missense_variant p.Lys241Arg
G/C 42016969 missense_variant p.Cys245Ser
A/T 42016988 synonymous_variant p.Ser251Ser
A/G 42017367 missense_variant p.Met378Val
T/A 42017579 downstream_gene_variant
G/C 42017663 missense_variant p.Met447Ile
C/T 42017664 synonymous_variant p.Leu448Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30871.1
MNTLLNFKQGLIDPSGVLSSWFPKLDCCEWTGVKCDDITARVTELYLPCYTNHPQLVPYGDKDDKSHCLSGAFSLTLLELEFLNYLNLSNNDFKCIKYSSIGSRRCDDFSTDNLPYLFGNTTKLRYLDLSYNYDLLVRDLDWISPLTSLQYLNLGGIYIDKDIDWLQSVTILPSLEELHLVSCQLENIYPFLEYANFTSLQVLNLAHNHFVSEFPTWLFNFSSGISLIDLSQNQIHSQLPKTLPCFRSLKSLILSRNYLKGTIPDWFGQLEQLQELDLSHNFLSGSISTSLGNLSSLTILILESNEFNGSLPDDLGKLFNLETLRVATNSLTGIVSERNLLSFKNLRELSLSSPGLNFDFDSEWVPPFQLKHIRLGYMRNKFPAWVFKHSSLKYLAIGDSKTSFEPLDKFWKFATQLEFISLERNTINGDMSNVVLNSKVVWIHFYHAVPKYDK*


CDS Sequence:
>Vu_30871.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30871::LG8:42014236-42016236(+)
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Gene Sequence:
>Vu_30871(+)
ATGAACACACTCCTAAACTTCAAACAAGGACTAATAGATCCTTCAGGTGTTCTCTCCTCATGGTTCCCAAAGTTAGATTGTTGTGAATGGACTGGAGTCAAGTGTGATGATATCACAGCAAGAGTAACAGAACTTTATCTCCCTTGTTATACAAATCATCCCCAACTTGTTCCTTATGGAGACAAAGATGACAAATCACACTGCTTATCAGGTGCATTCTCCCTCACTTTGCTGGAACTTGAATTTTTGAACTACTTGAATTTGAGCAACAATGACTTCAAGTGTATCAAATATAGTTCAATCGGTAGCCGTAGATGTGATGACTTTTCAACGGATAACCTTCCTTATCTGTTTGGAAACACTACCAAGCTTCGCTATCTTGATTTATCATATAACTATGATCTTCTTGTCCGTGATCTGGATTGGATTTCTCCACTGACCTCTTTGCAATATCTCAACCTTGGAGGTATTTATATTGACAAAGACATTGATTGGCTTCAATCAGTAACCATTCTCCCTTCTCTTGAAGAGTTGCACTTGGTGAGTTGTCAACTTGAAAACATCTATCCATTTCTCGAGTACGCTAATTTTACTTCACTTCAGGTTCTAAATCTCGCTCACAATCATTTTGTATCTGAATTTCCTACCTGGTTATTCAATTTTAGTAGTGGCATCTCTCTTATTGACCTTAGCCAAAATCAAATACATAGCCAACTTCCTAAAACATTGCCATGTTTTAGAAGTCTGAAGTCATTGATTTTGTCTCGTAATTATCTCAAAGGAACCATTCCAGATTGGTTTGGACAACTTGAACAACTACAAGAACTTGATCTTTCTCATAATTTTTTATCTGGTTCAATTTCCACAAGTTTGGGAAATCTATCATCCTTGACAATTTTGATACTTGAATCAAATGAGTTCAATGGAAGTCTTCCAGATGATCTTGGGAAACTCTTCAACTTGGAGACCCTTCGAGTTGCAACAAATTCCTTAACTGGAATTGTGTCGGAAAGAAATTTACTTTCCTTTAAAAATCTGAGGGAACTTTCATTGAGTTCACCTGGCTTGAACTTTGATTTTGATTCTGAATGGGTCCCTCCCTTTCAACTTAAACATATTAGATTGGGCTACATGAGAAACAAATTTCCTGCATGGGTATTCAAACACAGTTCTCTGAAATATCTTGCAATTGGAGATTCAAAGACTTCATTCGAACCTCTTGACAAGTTTTGGAAGTTTGCTACTCAACTTGAATTTATCTCCTTAGAAAGAAACACGATCAATGGGGACATGTCAAATGTTGTGCTAAACTCGAAAGTCGTTTGGTTAGTGGGGAATAATTTTGGAGGTGGCGTGCCTCGTATAACACCAGAAGTGGTTGTTTTACACTTACGTAATAACTCTTTGTCAGGATCCATTTCTACCATGCTGTGCCAAAATATGACAAATAA