Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30790 LG8 41076487 41080633 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 41076657 missense_variant p.Gln57His
T/C 41076935 intron_variant
C/A 41077170 intron_variant
C/T 41078338 downstream_gene_variant
T/C 41078630 synonymous_variant p.Arg408Arg
T/A 41078650 missense_variant p.Leu415His
C/G 41078717 downstream_gene_variant
A/T 41078719 downstream_gene_variant
C/T 41079160 synonymous_variant p.Leu432Leu
C/T 41079247 downstream_gene_variant
A/T 41079277 downstream_gene_variant
G/A 41079410 downstream_gene_variant
C/T 41080081 downstream_gene_variant
T/C 41080106 downstream_gene_variant
A/C 41080128 downstream_gene_variant
C/G 41080220 downstream_gene_variant
G/A 41080243 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30790.1
MGCVQAKQLDSEGPDYRGLERLKLDNGYVASSDFVAHRRSTGQRHDPNKDHHHRLHQHQREQPIKNKVESGVAKDGPGHHKGKVVGREGRRFTRLDDKKVTNKCCFEDEMVDGWPRWLVDNVPAQVLAGLVPRSAESYKMIDKVGQGTYSNVYKALDRDTGEIVALKKVRFNTSEPESIKFMAREITILQRLDHPNVVKLKGLATSRMQYSIYLVFEFMQTDLARVIARPEEKLSEPQVKCYMHQLLSGLQHCHDRGILHRDIKGSNLLIDKNGMLQIADFGLANFYGPDYHQPLTSRVVTLWYRAPELLLGDTNYGVGVDLWSAGCLLAEMFKGFPIMPGRNEVEQIHKIFRLCGTPSEEYWRKLKLSTTFRPPKSYRPSLIETFGDLPSSSLGLLCTLLALDPAFRGSASKALKNQFFFTSPLACDLSGLPVLFKEDDEHVQANEQIKYMNSKIRRSRTYLERRKNSASKRPTEHTVSSKEELIRNAKPETYAPTVDMGSTSSTSSSVNPGGAKDQSPFFLSPFGELDRKLSPKTHHHHVNVGEENIKILPPLPKSKPNATKKDDSRYRPDQFFRSASTREFRYLKREERLLLDFDH*


CDS Sequence:
>Vu_30790.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30790::LG8:41074487-41076487(+)
GGTAAATTAAGTACAAACATGTTATGACATGAGTGACTGATAAGCATGTATCTTAAGTTTGTGATCAATCCATGTATATATGGAGGAAAATTTCTTAGAAGTAGTTAGTTAATTTAATGAATCTTAATTTTTCGTTAAATTAAGTTTGAACGTGTTAGCATTGGATGATGTCTCCAAAGCCGAATATTGATAACTTCATAGTTAACCACAAAATTTTGGTGTTTTTTTTTGTTTTATTTTTTGCTTGAATTTCATTGACAATGACATTAGACAAAGATAGTTTAACGGTGGCAAGCATTGATAATTTAATATCAATGGCCTTTTATGCAATGCTGTGAGAGTATTGGCTTGAGTTTATATCAATTTTAGATGGAATGGATTAAAAAATAAAATAATATATGGCAGTTATGAAAGACTGCCTCTGGCTATTTTTATTTTCTAAATGTTCATATACCTTTTGGAGTTATGGTTGCATGGATGTATAAAGGAGATAATAAACTTATTTTCATATCTTTATTCTCTTTTTCTTCTACTGAAGGTTTATTGAGGATTTCATTCAAACAATCCATATATAATTTCTCCTTAAATTGATTACCTCAACCAAAATTGGTACAGTCATTTTGTGAGAAAAATAAATAAATAGATTAAAGAAGAATATTATAGATCTTTGAATAATTATTGAAGGAAAAGTAGGTTTTTCCTTGACAATCTTTTTATCACATTATTGATATGAACAATATTTTAGTTTTGCAATTATTTTTTTATAGAAAAATACACATAGATATAGATTAAAATCCTGACCCATGTGGAATGTGATCTCAACAAGGAAGTGCCTAAATGGATTTTTCGAAAGTATATTTATTTCCTAAAAATTCATTTTCTTTAATTATTTTGTATATTAGAATTAAAAAAAAACTTTCCCGATTTCAATAAATAGTGTATATATTTTTAATGTACCAAAACAATACATTCTTTGTTCCAATTATTTGTTGACTATAATGAACTGTAATCAGTAAATGAAAAATGTAACGTGGAGTTCTTTAGCTCATTTTAAGACTTCGCAATTTAAAAAAAAAAAAGTTAATATATTGCAGAATACGTTTTTCCTTTACAGTTTTTTTGTCGTTGAAAAATTTGAATTGTTATTTTAAAATATCGATGTTTTGTTTTGATAAGGATTGATTAACATAAGAAAAATAAAAATAATTGTGTGAAATTGATTAATTGAAGGAAAAAAAAAGAATTTATCCATACTCATTTGGATAGATAAAACAGAGAATAAAAATATATGAAAAATATTTTATAACAACTAAAATATACTTTTTACTAAAATTAATTTTCTTAACATAAATTATTTACCACTTTAAAAAATATATTATAACTTCTTAAAAATTAAAGCTAAGAAATTAAGAGTGAAGTCATTTTCCTTTTATTTCATGTACTTCTAGTAATAAAATATTTTTGGATAGGTTTCGTAGGAATAAGTTTTCTCTTTTTTATTCCTGTTCTGAGATAGTAAATAGTATAAAAAGTAAATAAACGTGTGATGTGTGATGATGTGTTAGCATGGATATACGAATCTTGGTGGGTGTCCGTATTCTGCAAAGGTTGCCGGCTGTGGGACCCAAACAAAAGAATAAAAGATCTAACATCTCTGCCATACACAGACACGTGCGCCCAACACTCACTCACGCCATTGCCTACTGTCACACTCCATATGTCTTTCCATCTTCAAAGTTTCACCCTTTCCTTTCCACTTTCAAAACTCTCTCTCTCTCTCTCCCATTCTAGTAACTGCGCAGTCATTTTCTCTCTCTGCGGAAAACCCAAAGAGGAAAACACCTCCATTGGTTTTGCCTGTGACTGAGAGTGATTACCCACAACAACATTCCAAATGTGCCGTCCGTGGTCGGCTTCTACCGTTATTCTTTGTCCCTTTCTATATCTCTCTTTTTCTTTTCTTTGGAGCTGCACTCATAGAAGCTGAAGAACACCTGTTA


Gene Sequence:
>Vu_30790(+)
ATGGGCTGTGTTCAGGCCAAGCAATTGGATTCGGAAGGTCCAGACTACCGGGGCCTAGAGAGGTTGAAGTTGGATAATGGGTATGTCGCAAGCTCTGACTTTGTTGCTCATAGGAGATCCACTGGTCAAAGACATGACCCCAATAAGGACCACCATCACAGGCTGCATCAGCATCAGAGAGAACAGCCCATAAAGAATAAAGTTGAGTCCGGTGTTGCCAAGGATGGTCCTGGGCATCATAAGGGCAAGGTGGTTGGAAGGGAGGGGAGGCGATTCACGCGTCTTGATGATAAGAAAGTGACAAACAAGTGTTGCTTTGAGGATGAGATGGTAGATGGGTGGCCAAGGTGGTTGGTTGATAATGTCCCTGCACAAGTGTTGGCTGGCTTGGTTCCCAGGAGTGCTGAATCCTACAAAATGATTGATAAGGTTTTCTATTTCTTGGTTCTGTATGAATTTTGTTTATGATATGGTATGAAGGGTTGTGGGGAACTTTAAGTACAAATGTGTTTTTACAGAGTTTTTCTTGCAAAATTATTTGGTTATTCTGTGCGCAGTGAATATGGTTAGCTGTAGGCTAGAGCTCATCAACAAGCCACATTGTGTTTGAAAAATGATTTCAGATATTTTTTAAGGTGTGGAGTCAGTGTTATGCAATTTATAATTTTCTCTGCTTGAATCTCCTTGAGTTCCAGGTATCTCTACTTGCTCTGGGAATGGGCGATTTGAATTTGGCAATTTATGGAAGCAGACAGTTCAATTGTTTGTGCAATGCACGATTGATTTGAAAGCACTATTAATCTTAATCTCATATGTACTTAGTTTAATCGAGGTTTGATCAGTTATATCATGAAAACTTCAAGCAATTGAGTCGTGATATTGATTTCTATCTAGATTATAGAAATGTTAATCCGGAGCTGTATTCAACTACTTCTTAAGTTTTATTGTTTCCAAACTATTGACAATCCACTGTGCAAGTTTTGTTCAAATGTAGTTCACTTATAACAATCAAAACTGAAGTGTTGTCGTAACTGATAATGGCAGGATGGAGCAGACAAATTGACTTGTGTTATTTACGTTTTGCAGGTTGGACAAGGAACCTACAGCAATGTTTATAAAGCTCTGGATAGAGACACAGGAGAAATTGTGGCCCTGAAGAAGGTTCGCTTCAATACATCAGAGCCCGAAAGCATAAAGTTTATGGCAAGAGAAATTACCATATTACAGAGACTGGATCATCCCAATGTAGTCAAACTTAAAGGATTAGCCACTTCAAGAATGCAGTACAGTATATATCTAGTTTTTGAGTTCATGCAAACAGATTTGGCACGAGTCATTGCTCGTCCTGAAGAGAAACTATCAGAACCACAGGTTAAAAGATTCTCTTTGATGCTTTGGTCATTTTAACATTTGAACCCCTTTATACTCCTTAATGATCTTAAAAAGTTAATGTAGGTCAAGTGCTATATGCATCAATTACTATCAGGTCTGCAGCATTGCCATGATAGGGGAATTCTTCACCGAGATATAAAGGGGTCAAACCTTTTGATTGATAAAAATGGGATGCTTCAGATTGCAGATTTTGGACTTGCCAATTTTTATGGTCCAGATTATCATCAGCCTCTCACTAGCCGGGTTGTGACACTATGGTACAGAGCTCCTGAATTGTTGTTAGGTGACACAAACTATGGAGTTGGTGTTGATCTGTGGAGTGCTGGATGTCTCCTGGCAGAAATGTTCAAAGGATTCCCAATCATGCCTGGCAGAAATGAGGTGATGAAGATAGTGGCTTCGTTTTATGTTCAAGTATCTTTGGCTATTTCTGAAATTCCTTTCTTTTTATACTGTCTTCTATTTCTGTTGTTCTGTATAAGTTTGTGTTATGTTGCCTGCATTTCTTACTGACTTCAATTTTTCTAGATCTGATAAGCATGAACTTTCCCTGCTTCCAGGTTGAGCAAATTCATAAAATTTTCAGGCTATGTGGCACACCATCAGAGGAGTATTGGAGAAAATTGAAACTTTCTACTACTTTTAGACCTCCAAAGTCTTATAGACCCAGCCTTATAGAAACTTTCGGTGATCTCCCTTCTTCTTCTTTAGGTCTTTTATGCACCCTGCTTGCTCTGGATCCTGCATTCCGTGGAAGTGCATCCAAAGCTCTTAAAAATCAGGTTAGAAAAGTGTAAAGATTGAATCTTGAAATCATATTCCTAAGTTATTCTGTCTCCAAACCATTAAACTACGCAATGCACAATACATTTTCTATGAAGATCGAACCTTTTCTCCAGTTGCAATTTGTTGGCTATGACTTTTCAATTTCGCACACCAATTTGCAATTCCAGTTTTCAATACATAGAATATATACTTTATACGAGTAGTTGGGAGTGTGAATGGCTTAGTAACTATGTGCACTTTTTATTTGACGAATCATCTTCAATGAAAATTACATTTTATGGATTTAATGTTCTCGTGATGATTCAGCAGTGGCCCATTGTCTTGTAGAACTTGTAGATGTAGAAAAAATGTGAAATAATATTAAATTCAATATGCAATTCCCAGTGAGCAGCTAGGAAATAATTAAATACCTAAATTACTTCAAATTTCCAACGTACGAGTGTCTTCTGTGTGCAGTTTTTCTTTACAAGCCCATTGGCGTGTGACCTCTCTGGTCTGCCTGTTCTCTTCAAAGAGGATGATGAGCATGTTCAAGCCAACGAACAGATCAAGTAAGTCTTTTTTAGTCATACAGGTTTTTGACAATCGTTTCAGTCATTTTATTACACATACATATCCTTCTTCTGTTACATAAGTCACATGTATATGTGACAGTGATTAATGGCATACCTATTATTTCCATAGTGAGAGTGAACCATATCGGTTATTTTGTTTTCATAATTTAGCAAATTGTTTCATTTAAGCAGTATAAAATGAATCTAGTTACCAGAAAGACCATCTTGTGACGAGCTATTGGATGCCATTATTTATATCCTGTATTGCCATCATTAATGTAATTCTATTTTGAATTTGCTAGAAGTTGAGTGTAAGACAATGCCAAATGCTAGTAAATTATATAAAATCTGTTTTGATTTTTGATGAGAGAAGAGAGATTCTGGGCAACAATGCTGATGAGAGCAACTTCGTATACGAACCCCTTGTCCCAAAATGGATAACTAGATTCACTGTTCATACATAGGTTGCTACATATTGGTATTTGTGATTGGGTTTGATAATCTGACATATGTTTATGCTGAGGAATTTTTGTTCAACATGTGGCATTGAACTATATTTGAACTATATTAATCCAGGTACATTTGTTCAAATGTGGTGATTATATAAAAAATTATTGTCTTAAAGATTTAAATTATTAATTTCAGTACTGGCAGAGAGATCTTAATGTTTTATTAATACTTACAGGTACATGAACTCTAAAATCAGACGTTCTCGTACATATCTGGAGCGTCGTAAGAATTCAGCATCTAAGAGGCCAACAGAGCATACTGTATCTTCTAAAGAGGTATTAATGAAAATTTGAGATTCCCCACTCTCATGCTTGATGGAGTTAGATTCAAATTTTTCTTTTGCCCAATTCCCCGTTAAGTTTTCTTCTGTTTAAGTGTTTTCTTCTGTTTAAGTGTTTGAACCAATAATTTAAAACTACAGATGTTATGTCTTCATTTTTATAGCTTGATCTTTAGCCATACTTTTCTTGTTATCATTTTGGTTATGCAGTCCTACTATTGCAACTCATTTGATGTATGTTTAATTGATGTATTGGTTTCACATGTTCTTTCAGGAATTGATAAGGAATGCTAAACCTGAAACTTATGCTCCAACTGTAGACATGGGTAGCACAAGTAGTACCTCATCTAGTGTAAACCCAGGAGGGGCTAAGGACCAATCACCTTTTTTTCTATCTCCATTTGGGGAATTAGATCGAAAGCTATCTCCAAAAACCCACCACCACCATGTTAATGTTGGTGAAGAAAACATCAAAATTCTTCCTCCATTACCCAAGTCTAAACCAAATGCTACGAAGAAAGATGACAGTAGATACAGACCAGACCAGTTTTTCAGGTCAGCTTCCACCAGAGAATTTAGATACTTGAAAAGGGAAGAACGTTTACTATTGGATTTTGATCATTAG