People Important Links Contact Us
Chickpea portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Menu

Genetic Resources

Genomic Resources

Agronomic Practice

Publications

Nutrition

Social Resources
  • Maps
  • Gene Families
  • Gene Search
  • MARKERs  
    • SSRs
    • SNPs
  • JBrowse
  • Download

Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30740 LG8 40609430 40614100 hypothetical protein BVRB_1g021420
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30740.1
MRSCFETGDALHSLRTNLQDPNNVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNNDNSVIRVDLGNAALSGQLVPQLGQLKNLQYLELYSNNITGPIPSDLGNLTNLVSLDLYLNRFTGPIPDSLGKLSKLRFLRLNNNSLSGPIPMSLTNITALQVLDLSNNHLSGVVPDNGSFSLFTPISFANNLDLCGPVTGHPCPGSPPFSPPPPFVPPPPISAPGGNSATGAIAGGVAAGAALLFAAPAIAFAWWRRRKPQEFFFDVPAEEDPEVHLGQLKRFSLRELQVATDTFSNKNILGRGGFGKVYKGRLADGSLVAVKRLKEERTPGGELQFQTEVEMISMAVHRNLLRLRGFCMTPTERLLVYPYMANGSVASCLRAPEYLSTGKSSEKTDVFGYGIMLLELITGQRAFDLARLANDDDVMLLDWVKGLLKEKKLEMLVDPDLQNNYIEAEVEQLIQVALLCTQGSPMDRPKMSEVVRMLEGDGLAERWDEWQKVEVLRQEVELAPHPNSDWIVDSTENLHAVELSGPR*


CDS Sequence:
>Vu_30740.1
ATGCGCTCGTGCTTTGAAACAGGAGATGCTTTGCATAGTCTGAGGACTAATTTACAGGACCCTAACAATGTTTTGCAAAGTTGGGATCCTACACTCGTCAATCCATGTACATGGTTTCATGTGACATGCAACAATGATAATAGTGTTATCAGAGTTGATCTGGGGAATGCTGCTTTGTCTGGTCAACTTGTTCCACAGCTTGGTCAGCTCAAGAATTTGCAGTATTTGGAACTGTACAGCAATAACATTACTGGCCCTATCCCAAGTGACCTGGGGAATCTTACTAACCTGGTGAGCTTGGATCTGTACCTAAACCGTTTCACTGGCCCAATCCCAGATTCATTGGGCAAGTTGTCAAAATTGCGTTTCCTCCGGCTTAACAACAACAGCTTGTCAGGTCCTATTCCCATGTCGCTGACTAATATTACTGCTCTCCAAGTTCTGGATTTGTCTAATAATCATCTATCAGGAGTGGTTCCCGATAATGGCTCCTTCTCATTATTCACTCCTATCAGTTTTGCAAATAACTTGGATCTATGTGGACCCGTTACTGGGCACCCCTGTCCTGGCTCTCCTCCATTTTCTCCTCCTCCTCCTTTTGTTCCTCCACCTCCAATTTCTGCCCCAGGAGGTAATAGTGCCACTGGAGCAATAGCTGGAGGAGTTGCTGCTGGTGCTGCTCTATTGTTTGCTGCACCTGCAATTGCATTTGCCTGGTGGCGTAGAAGGAAACCACAAGAATTTTTCTTTGATGTGCCTGCTGAAGAGGATCCTGAAGTTCATCTAGGACAGCTTAAAAGGTTCTCTCTACGAGAACTGCAAGTGGCAACAGATACTTTCAGCAATAAGAACATTCTCGGGAGGGGAGGATTTGGTAAGGTGTACAAAGGACGGTTGGCAGATGGTTCATTAGTGGCTGTGAAACGGTTGAAAGAGGAACGCACACCTGGTGGGGAGCTTCAGTTTCAGACCGAAGTAGAGATGATTAGCATGGCTGTGCATAGAAATCTCCTTCGACTACGTGGGTTTTGTATGACACCAACAGAAAGGCTACTTGTTTATCCCTACATGGCTAACGGAAGTGTTGCCTCATGCTTAAGAGCTCCTGAGTACCTATCCACTGGTAAATCTTCAGAGAAAACCGATGTTTTTGGTTATGGTATCATGCTTCTGGAGCTGATCACTGGACAGAGAGCTTTTGACCTTGCTCGGCTTGCAAATGACGACGATGTTATGCTGCTTGATTGGGTAAAAGGACTCCTGAAGGAGAAAAAGCTTGAAATGTTGGTTGATCCTGATCTACAAAACAATTACATAGAAGCTGAGGTAGAACAATTAATCCAGGTTGCACTGCTCTGCACACAAGGTTCCCCTATGGACCGACCAAAGATGTCAGAAGTGGTGAGAATGCTTGAAGGTGATGGGTTGGCAGAGAGATGGGATGAGTGGCAAAAGGTGGAAGTTCTCCGGCAGGAGGTGGAGCTGGCCCCTCATCCCAATTCTGATTGGATTGTCGACTCGACTGAAAATCTGCATGCAGTTGAGTTATCTGGTCCAAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_30740::LG8:40614100-40616100(-)
GTAATGTTGGGCCCAGAAAACTCACTCGCATTTTGACCAAAAAACGGGGTTTTGCCCCTCCATGTTAGAGTCACGTCACTTTCCACGATCTCGCGCGAGAGCGTTTTTGACTGCGTTAGGGCAGGGGGCAGCACCGTTCGGGCAGCTTCATTTTTCTTTTTCTATCCATCTATTTTACACTCTCACTCCACGCCTCACTCAAAAAAGATAACAATCTTACACTCTCACCAGCTGACAGAGATAGAGAGAGAAAGAGAAACAGTATCTGTGTTTTCCTTTCCAAGATAGCTAGAGCGAAAGTGGAAAAAAAAAAGTTTTTTATTTTTTCATATACTTGAAGAGAAGGGAAAATGTTTTGATTCTTTTAGTTTTTGAGAGCTTGTTTTGTGTTTCTGGGTTTGAGTCTCTGGAGTTGTCGAAAATTGGCGTATTTTGGTGAGATCGGGGTGTGGGTGTAGTGTGGCTGGTGGTAATGGCGGAGATTTGAGAGTTAGGGTTTGAGTTCATTTGAGTTTGTATTTATAGTGGTGGTGGCGGAAGAGTGCTGGGGTGTTTTTGTGATGGTGTATTGGTGTGGGAGGTCTTGTTTGGATCTGAAGTTATTGAGTACATAGGTTGATGGAGAGAAAGTTGATGGATTTGAGTTTCATTTGTTGGATATTGTTGATTCATCCACTATGCCTGATTTCTGCTAACATGGAAGGTTTGTAATGCTTGCATGGAGTCAAATTATTCTTTGTTTGATGATTTATTTATGCCTCGTTAAACAAAACCCGAAAGAGGGAGCTGTTTTCAAGCTTCTTTGGACTTTTGATTCTTGCTTCCTTGATTTTATTTAGTTTGGTAAAGAAGATTCCTTTCTTTTTTTGTTTCCTTCTTGGATATGAAGGGGTTTGTGTATTCATGAAGGAGACTCGTCTTGTTTTGGCACTACTCTCTTTGGGTGTTTAATCCATCTTCATTCCCTTAGCTAAGTGACCCTATGGAATCTTTTTTGTCACTGTTTATTTTTGGTATAACAAATCTTCAAAGATTTTTCTCCTCTTAATTGATGAGTGCCATTTTACGACAATGCCTTCTTGCTGGCCCTCTCTTCCCAATTCAAATTAAGTATTGAATTATTACTTCTATGCGTAGTAACAGTATTTATCACGGAATGTGCCCGACCTTTTTGACCTTTATGATTACGTTCACCTCTCTGGTCAATAAAGTCTTAGTTATAATCTACTAGACAGTTTAGAATATATTCTGTGTTATAATCTACCAAACTGACCGAAACGTGTCTGTGTGTGCTGTCTTATTGCGTTAACTCGTGAACTCCTCAATGTTTTTGAGTAGTGTTTTTTGAGCTTTAAAGTGTTTTGCTCCAATCAATAAGATATGTTTTTGAAGTGTGCTTTTTTGGGCGCTCATGTGCCTGTCGTGTGTTGTATTGATATGTGAATTTCTGTATTTTTTAATCCTGTTTTTGTGCTTGAAATGTATTGCTAAATCTATGTGATATGTTCTTGAAGTGTATTTTTATGCACACTCGAGTGCCTGTTAGGTTGTATTAACTAGTGAATTTCTCTGTATTTTTCAATCCTGATTTTGCGCTTTGAAGTGCATTGCTCCAACTCGAACCTAACGCCTATTGCTCCAATCTGTCTACATGCTATCTTATTGCAATGTAATTCCTATGCGCATGTTTGTGCCTGTCCCGATTGTATTTTTCAATCAGGATTTTTGTGTTTGAAGTGTATTTCTCCAACCTATATGGTATGCTCTTGAAGTGTAATTTTTTGTTTACAGGAGTTTGTCGTGTTGCATTAATTAGTGATTGAAGTGTGTTCAATCCTGTTATTTTTGTGTGCGTGACGTGTATTAGTTCAAACTCTGTGGTATAATATTTTTCTTTTGTGCAAATTTCTAACTACATTATCATGCAACTTTACTACTGGAAAAAATCATCTGTGTGGATTTGACACATGTTTATTTTGAACTTTAAAGTACCTGATTGC


Gene Sequence:
>Vu_30740(-)
ATGCGCTCGTGCTTTGAAACAGGAGATGCTTTGCATAGTCTGAGGACTAATTTACAGGACCCTAACAATGTTTTGCAAAGTTGGGATCCTACACTCGTCAATCCATGTACATGGTTTCATGTGACATGCAACAATGATAATAGTGTTATCAGAGTGTAAGCTGCTCGTTCCTTGATATCTGTCACATATCTGTCACATATATGTTAATTTTGTCTGAACAGTTTCTGTTAACTGAGGACGACTTCTCTAATGGTTGCTTTTGATCTTTACTTTGTTCTGATGTCAGTGATCTGGGGAATGCTGCTTTGTCTGGTCAACTTGTTCCACAGCTTGGTCAGCTCAAGAATTTGCAGTATTTGTATGTTATCACTTGATTTGATGTTCCAATGATTTTTTATTCTTTTGTAATTTAATTTTGAATGGGCCTTGTTAGTGAAGTGACAACTTTGACTTAACTTTCCTTGTTTAATTTGGACATGTGATTATAAATTATTGAATGTGATTCTCAAGTTGGTTCATGATGTAATGGGGTAGTGGTTATTTGAATCTTCAATATCCAGCTGGATGGTCATGTTGTGTGTTGGCAATAATATGTGGTTTCTGTTCCTTTTCATCTGGTTTTTATAATTCTTTTAGACTGCTAGACTTGGTAATGATGCTTATTTGTGTGCTGCCCCATCCTCACTTAAAATTATCTGTCTTGTTTCAATGGAGTGATTATTCATATGAATATTACTTCGGGGAACATGGTGTTCTAATGTTTAAGTTTGCTATGCAAGTCAACCTAATGGATAGTTTTTTATCTGTTAGGGAAACATGAGAAAACAATAACTTGTTTTACCTTAACTCTATCCTTTACTTATGCAGAATATGGGGTGCTCCTGAATCTAATTATTGAATTTCCACGAAATATTTAGTTTTTTTGACAGATGCTTATTTTACTAATATTGATTTAAGTATTCTTTTATCTTCGTAACTTTTTGATATAAATTGTTTTTCATAATAGGGAACTGTACAGCAATAACATTACTGGCCCTATCCCAAGTGACCTGGGGAATCTTACTAACCTGGTGAGCTTGGATCTGTACCTAAACCGTTTCACTGGCCCAATCCCAGATTCATTGGGCAAGTTGTCAAAATTGCGTTTCCTGTGAGTATAGATTCTGAATTTTTTATTATGTAAACAGCTGTTTTTGTTTTTCTTCTGTTGAAGGGTAAAAGATTGATCTGGTGTTTGCAATCTTGTGGATTTTAATATCCGTATGGTTCTTAATTCTTTTCTCCTGTTATGTCTAAGGATAGCCGGCTTAACAACAACAGCTTGTCAGGTCCTATTCCCATGTCGCTGACTAATATTACTGCTCTCCAAGTTCTGTAAGTGCCACTAATACGCCATGTATTTCTCTCTTTTTTATTTCTATGTGGTGCTTATGTTTTGCCCTCAATTTGTGTCACGTGTAGGGATTTGTCTAATAATCATCTATCAGGAGTGGTTCCCGATAATGGCTCCTTCTCATTATTCACTCCTATCAGGTCTCGTACTGAAAATTGTGTTGTTGTCATATTGGTTTTGATATGTAAGTTTTTTCTGAACGTGCTTCCTGTCTCAGTTTTGCAAATAACTTGGATCTATGTGGACCCGTTACTGGGCACCCCTGTCCTGGCTCTCCTCCATTTTCTCCTCCTCCTCCTTTTGTTCCTCCACCTCCAATTTCTGCCCCAGGTAATCTTCCTTCTGTTGCAATTGATCTTTTAGTTGTAAAGGTGATTTTACAAAACTTATGGTGATGGCTGTTTCAATTTTTTATTATAATAAAGGTGTCTTATATTTGCTGACCATCATACAGACGCACCTGTGTAGATGAATATTTTTAGTCATGCTATGGGACTGAATTTGTTTTTTTCACTTGTGGTGTTTAAGATCTCTTCCAGTTCTCTGGAAAAGATTCTAGCATTTTATGTAAACATGTGGAGTTTTGAAGATTAAATTCTTTATTGGCCCAATTTGGAATTGAAAATCATTGGTCAGTCATATCTTGTAATATCCTCTAGATTTGGTTGTATTGCTGCTCCTACGTGGTTTATATTTATATACTAATGTTTATGTTAAACATAAAGATAGAAGAAACAGTGATGATCCAACCTTCCTCTATATCTAATTTCAGGAGGTAATAGTGCCACTGGAGCAATAGCTGGAGGAGTTGCTGCTGGTGCTGCTCTATTGTTTGCTGCACCTGCAATTGCATTTGCCTGGTGGCGTAGAAGGAAACCACAAGAATTTTTCTTTGATGTGCCTGGTGAGCCATACTTGAACAGTGAGTGTAACAGTTTCTGAACTTGTTTAAAGAATATAATTTGACTTGATTGCGTATGTTTGCAGCTGAAGAGGATCCTGAAGTTCATCTAGGACAGCTTAAAAGGTTCTCTCTACGAGAACTGCAAGTGGCAACAGATACTTTCAGCAATAAGAACATTCTCGGGAGGGGAGGATTTGGTAAGGTGTACAAAGGACGGTTGGCAGATGGTTCATTAGTGGCTGTGAAACGGTTGAAAGAGGAACGCACACCTGGTGGGGAGCTTCAGTTTCAGACCGAAGTAGAGATGATTAGCATGGCTGTGCATAGAAATCTCCTTCGACTACGTGGGTTTTGTATGACACCAACAGAAAGGCTACTTGTTTATCCCTACATGGCTAACGGAAGTGTTGCCTCATGCTTAAGAGGTAGATCTTCTGTTTCATTTTTTTTAGCTGTTGTTCAAGTCCTTGATTCTCTTATTTCTTTCATTCCTTTCTTTGCCCCTCTCCCCCTCCCCATCTTGAATGGAACAGGGTTCTCATTGTCCTATTTACCATTTCCCCGTAGTTCTACTTTAGCATAAACTTATGAAAGTAGTATAGTTGTTGGGTGGTCAAGCCGTGGGATGTTCTATTGGGAATGGTGAAAAAATGGAACAAGTTATGCACTTTTTCTCCGTTAATTTGGTAAAAAATATACATTTACTCCCTGTGGTTTAAAAAGGAACCTGTAGCTGTAAAAGTCCTGAGGACTTCTTCAAGTCTAAAATCTTAACTGGTCTTAGCTATTCTCTTAACTTCTTAATGTCATCTACCCATTTAGAGTCTGGGATGTTGTCCATATTTATTTTATATTGTTTAACCAGGTGTTAGTTGTCATTAACTTAATTATTAAATTTATTATCCTTCAGCTTGGAAAAATATTCTCAATTTTATCATTTTAATAGGCCATTTATTGGGAAAGTTTATTCCTTAATTCCCATGCTCAAAGCAAAAAGAGATTATAGAGTAAAGATATAAAAAAATCTATGCTGTTTTATGGAAATTTTATTTTTTTAGCTTGATTGCCAAACTGGAAGAAATCCCAAGGTGTGCATAGTAGCACGCATTCTGTGCTTAAAGTAAATATCCTTGGCCCACCTTGTATTTTTAATCATTCAAATATTCTTTATTTTAGAGCGTCCTCCACATCAAGAACCCCTGGATTGGCCAACTAGGAAAAGAATAGCTTTGGGATCTGCAAGGGGTCTTTCATATTTGCATGATCACTGTGATCCAAAGATTATTCATCGCGATGTGAAAGCTGCAAACATATTGCTGGATGAAGAGTTTGAGGCTGTTGTAGGGGACTTTGGATTGGCCAAACTCATGGATTACAAGGACACCCATGTGACAACTGCTGTAAGGGGCACAATTGGGCACATAGCTCCTGAGTACCTATCCACTGGTAAATCTTCAGAGAAAACCGATGTTTTTGGTTATGGTATCATGCTTCTGGAGCTGATCACTGGACAGAGAGCTTTTGACCTTGCTCGGCTTGCAAATGACGACGATGTTATGCTGCTTGATTGGGTATGTTTAGCGTGAAAGTATATGTTGTGTTTCTGTTATTATTTATCACGCAGTTACTTTCATGCAGCTCATGAATAGCCGGAGTACCAGTTATTGTTATATTTATTGTTAGGAAGAATGATTGTGTCCATCTATGATGTGCATAAGATATGTGTATTGCATATGATATATATCTGACATGCAAATATGGTTAAAACTTATAAAACAATAAATATATAATACTGCAAATCCAAACTAAGATCACTATTCTTCTTCCAAGCACGATTCAGAATATTGACATTTCTTTATTCGGTAAAGTATGCATCTCAGCTAGGCAAAGGCAAGAATCACAAGTATTCGATTATATTTTGATTTCTGTTGTTACTTGTTTGACTAGTTGAGAATTATCTGCTTATGTATTTTCCAAAACAAGCTTTCTTCCTTGTTTAAAAGTACCCTTTTCTGTAATGTAATGTATGTAAATCTAATACAGCTGAATATTTTCACAGGTAAAAGGACTCCTGAAGGAGAAAAAGCTTGAAATGTTGGTTGATCCTGATCTACAAAACAATTACATAGAAGCTGAGGTAGAACAATTAATCCAGGTTGCACTGCTCTGCACACAAGGTTCCCCTATGGACCGACCAAAGATGTCAGAAGTGGTGAGAATGCTTGAAGGTGATGGGTTGGCAGAGAGATGGGATGAGTGGCAAAAGGTGGAAGTTCTCCGGCAGGAGGTGGAGCTGGCCCCTCATCCCAATTCTGATTGGATTGTCGACTCGACTGAAAATCTGCATGCAGTTGAGTTATCTGGTCCAAGGTGA

NIPGR © 2020

This project is funded by the Department of Biotechnology
Ministry of Science and Technology
Government of India

Visits: 1322431