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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30679 LG8 39907727 39915487 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108325798 isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 39908160 5_prime_UTR_variant
T/C 39908181 5_prime_UTR_variant
A/T 39909378 synonymous_variant p.Pro265Pro
C/T 39909559 missense_variant p.Pro326Ser
C/T 39909566 missense_variant p.Thr328Ile
A/G 39909601 splice_region_variant&intron_variant
G/A 39909810 intron_variant
A/T 39909817 intron_variant
C/T 39909969 intron_variant
A/G 39910054 intron_variant
C/T 39910086 intron_variant
T/G 39910311 intron_variant
C/T 39910881 synonymous_variant p.Thr482Thr
G/A 39911662 downstream_gene_variant
C/T 39911677 downstream_gene_variant
G/T 39911892 downstream_gene_variant
G/T 39912229 downstream_gene_variant
T/A 39912297 downstream_gene_variant
A/G 39912301 downstream_gene_variant
C/T 39912555 missense_variant p.Pro741Leu
A/G 39912592 synonymous_variant p.Ser753Ser
A/T 39912720 missense_variant p.Asn796Ile
G/A 39912997 synonymous_variant p.Leu888Leu
G/A 39913031 missense_variant p.Glu900Lys
T/A 39913300 missense_variant p.Asp989Glu
C/T 39913302 missense_variant p.Ala990Val
G/A 39913383 missense_variant p.Arg1017Gln
G/A 39913398 missense_variant p.Arg1022Lys
T/A 39913504 missense_variant p.Asp1057Glu
G/A 39913706 missense_variant p.Val1125Ile
A/G 39913889 missense_variant p.Thr1186Ala
T/C 39913906 synonymous_variant p.Cys1191Cys
A/T 39913986 missense_variant p.Gln1218Leu
G/T 39914137 missense_variant p.Leu1268Phe
A/T 39914138 missense_variant p.Thr1269Ser
A/T 39914501 stop_gained p.Lys1390*
A/T 39915204 missense_variant p.Lys1624Met
G/T 39915259 missense_variant p.Lys1642Asn
T/A 39915348 3_prime_UTR_variant
G/C 39915466 3_prime_UTR_variant
C/T 39915467 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30679.2
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>Vu_30679.1
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CDS Sequence:
>Vu_30679.2
ATGCCGCCTGAACCATTGCCTTGGGATCGAAAGGACTTCTTCAAGGAGAGGAAGCACGAGAGGTCTGAGTCACTTGGGTCAGTCGCCAGATGGAGGGATTCCTCGCACCACCGCGACTTCAATCGCTGGGGATCCGCCGAGTTTCGCAGACCGCCAGGGCATGGTAAGCAGGGCGGTTGGCACCTGTTTTCTGAGGACTCAGGTCATGGGTATGCAATTTCTCGGTCAAGCAGTGACAAGATCCTTGAGGAAGATAGTAGGCCCTCGATTTCACGAGGTGATGGGAAGTACGGCAGGAGCAGCAGGGAAAATAGAGGACCCTTTGGTCAGAGAGATTGGAGAGGGCATTCGTGGGAACCCTCCAATGGTACCGTGAATTTACCCAGAAGGCCGCAGGATATGAACAATGATCAGAGGGCTGTGGACGACGCCCTAGGATACTCTTCTCATCCACATTCCGATTTCGTGAACTCTTGGGATCAGCATCATCTTAAAGACCAGCATGAGAAGATAGGTAGTGTCAATGGGTTGGGAACTGGCTCCAGAAGTGACAGAGAGAACTCTCTGGGTGACTGGAAGCCGCTTAAATGGACCCGTTCTGGAAGCTTGTCTTCTCGAGGCTCGGGTTTTAGCCACTCAAGTAGCTCAAGGAGCATGGGAGCAGCGGATTCGCATGAAGAGAAGGCTGAGTTGCAACAGAAAAGTGCAGCTGCTAATGAGTCACATTCAGGGGAAGCCGCTGCTTGTGCGACATCTTCTGTGCCATCTGAAGATACGGCTTCTAGAAAAAAGCCAAGGCTGAATTGGGGCGAGGGACTTGCAAAGTATGAGAAGAAAAAAGTCGAGGTGCCTGATGCAAGTGCAAACAAAGATGGTCCTGTCTTGTCTGCTAGTATCACCGAACCTTGTAATTTCCTCAGTACCAGCTTGGTTGACAAAAGTCCAAAAGTTACAGGATTTTCTGAATGTGCATCACCTGCAACTCCATCTTCTGTCGCCTGCAGTTCCTCTCCTGGTATGGATGATAAATTATTCGGAAAGACTACAAATGTAGACAATGATGTTAGTAATTTGACTTGTTCACCCGCTCCTTTGTCTGAAAATAATTTGCAGAGGTTTTCCTTTAACTTAGAGAAATTTGATATGGGCTCCTTGAATAATTTGGGTTCTTCAATTATTGAGCTGGTACAATCTGATGATCCAACTTCTGTAGATTCTGGTCCAATGAGGTCCAATGCAATTAATAAGTTACTGATATGGAAAGCTGACATTTCAAAGGTGTTGGAGAAGACCGAATCTGAAATAGATTTACTTGAAAATGAACTGAAGTCGCTGAAATCTGAATCTGGTGTTACATGTCCATTTGCGGTATCCCTGGGCTCCCAGATGGTAGGTAGTGGTGAAAAATCCTTTGAAGGACATATTGGAGTCTCTGATCAGGTCACCCGGCCGGTACCGTTGAATATTGTTGATGATGCCAATACAGAGAAGGTGCCATTCTCAACTAATTTACATAGTGTTCATGAAAATGTAAAGGAAGAGGATATTGATAGTCCTGGAACAGCTACTTCTAAATTTGTTGAGGCTCCGCCTGTTTCTTGTGGTACTGGAGGAGGATATGTTAATTTCTCCCAGGACTTGGATTCTGTTCCATCTGCAGCTGTGAAATACTTAATTCCCTGTACTGCTAGGAAAGATGTTATTGTACCTTGTGTTGATGGCAAGACTTCTTTGGAGGTAAATGATAGCATGGATATTTTATGTGGTACAATTATTTCTTCCAATAAAGAATCTGCCAACAAAGCTAGTGAGGTGTTTGATAATTTATTGCCCAAAGATTGTTGTAAGATTGGGAGGATGGGAACCAGCAGTGACACATGCAATCAGACCTTGATTAGGGAAAAGTTTGTTGAGAAAAAGCGACTTGCTAGGTTTAAGGAGAGAGTTATTGCACTTAAGTTCAGAGCTTTGCATCACTTGTGGAAAGAAGATATGCGTTTACTTTCTATCAGGAAATGCCGACCAAAATCTCACAAAAAGAATGAACTAAGTGTTCGAACTACCTGTAATGGTAACCAGAAGAACCGATCATCCATTCGATCACGTTTTCCCTTTCCTGGAAATCATCTGAGCTTGGTTCCAACATCAGAGATTATTAATTTTACAAGCAAACTGCTTTCAGAATCTCAAGTTAAAGTGCAGAGGAACACTTTGAAGATGCCGGCATTAATTTTGGATGAAAAAGAGAAGACGATTTCAAAGTTTGTAACTAGTAATGGGCTGGTTGAAGATCCATTGGCTATTGAGAAGGAAAGGTCTTTGATTAATCCTTGGACACCACAAGAGAGAGAAATTTTCTTGGAGAAATTTGCTGTCTTTGGAAAAAATTTTAGGAAAATTGCTTCTTTTCTTGACCACAAGACAACTGCTGACTGTGTTGAATTCTACTACAAAAATCATAAATCTGATTGTTTTGAGAAACTTAAGAAGCAAGATGTTGGTAAGCTGGGGAAGACATTTTCAGCTAAAACTGACTTGGTGGCATCAGGTAAAAAATGGAATCGTGAATTGAATGCTGCTTCCCTTGAAATTTTGAGTGCAGCTTCGCTGATGGCAGGTGGCATTGCAGGTAATAAAAAAATCCGTGCAGGAAGCTCACTTTTGGGTGGATATGGTAAAGTAAAGACGTCGAGGGTTGAAGACTTCATTGAGAAATCAGGCAGTTTTGACATTCTTGGGGATGAAAGAGAGACTGCTGCTGCAGCTGATGTATTGGCAGGTATATGTGGTTCTCTTTCATCCGAGGCTATTGGTTCCTGCATAACAAGTTCTGCCGATGCAGTAGAAGGTAGCAGGGATAGGAAGTTCCTGAAAGTAAACCCTTTATACAAGCTGCCCTTGACACCAGATTTAACTCAGGATGTTGATGATGAGACTTGTTCGGATGAGAGCTGTGGTGAAATGGATGCTACAGACTGGACTGATGATGAGAAGGCTGCCTTTCTTCAGGCTGTATCTTCTTTTGGGAAAGATTTTGCCAAAATAGCTCGATGTGTTGGGTCAAGGTCCCAAGAACAGTGCAAAGTTTTCTTCAGCAAAGGCCGCAAATGTCTTGGATTAGATCTCATGCGCCCAATACCTGAAAATGTTGGATCCCCAGTGAACGATGATGCAAATGGGGGTGAGAGTGACACTGATGATGCATGTGTCGTGGAGACAGGCTCGATGGTTGAAACTGAAAAGTCTGGCACTAAAACAGATGAGGACCTGCCTTTTTATGGAACAAAAACATTCAATGACGATTCCAATCCTGTGCAAGCTAGGAACATGTCTGCAGAATTAAATGAATCAAAGGGGACTGATGGGACTGAAGTAGATATTGAAGATGCAAATGTGGTTTCTGATGCATGTGCAATTGATATTGATTCTAAACTGGGCTGTGATGTTAGTAAATTTGCCTTGTGTGGTTCTGTCAGTGGACAAACAACTGTAATCATGTCGAATAGCACAGAAATTAGAAGAGATAAAGCTAATAAATTGAAATCTGTTCCAGATACAAGTAGTGAACCATGTGAGATTAATTCTTTTGTTGAGGATAGAATGGTGGTTTCCGAGGTGTCTTCGGGAAGACCTGGTAATGAATTGGAGAGGCAGAGAGTGTCTTCACCCCGATGTCTTGATGATAGAGATAGTAAACAAGAAGCTGATTCGGGTGTCATAGTTGATTTGAAAAGCCCTGTGCACATTCTAAGCACTATGGTAAATGCTCCCGTCTCGTCATTTGGAAATTCCTGTTCAGGATTGACTTCTAGTACTGAAAATAAGCACGTACCCATTGGACAGCCTCATACCTCACCGTTGTCTGTGGACGAACATCAAGCATCTTCAAATTCATTTTTACAAAATACTGTTGCTTCTGATATTCAGTGTGAGAAAACAGCTAGCCAAGATAGACTATCTTCTACCTGTGATATTCAGGTTAGCACGGATGAGCAGCCCCCTATTACTGGGATTTCATCAGACCATGTTGATACCGGAAGTATTCTCCAGGGCTATCCCATGCAAGCTCCCATTAAGAAGGAGATGAATGATGATATGAACTGTAGCAGTTCAGCAGCAGAATTGCATCTTTTGTCCCAGAAGATTGAACAGCCTGATGATCAAACCAAAAAATTACAGTCGTTGGATTCAGATAAAACATCCAGAAATGGTGATGTCAAACTTTTTGGGAAGATACTAACCAATCCTTCATCAACACAGAAACCTAATGTGGGTGCTAAAGGTAGTGAAGAAAATGGTACCCACAATCATAAGTTCAGCAAACCTTCTGGTGTGAAATTTACCGGACATAATGCAGATGGGAATTTGAAAATTTTGAAGTTTGACTGTAATGATTATGTTGGCCTTGAAAATGTTCCCATGAGGAGTTATGGTTATTGGGATGGGAACAGAATACAGACTGGACTCTCTTCTTTGCCAGATTCTGCTATCTTGCTAGCAAAGTATCCTGCAGCCTTCAGTAATTATCCCACACCTTCTGCCAAATTGGAGCAACCGTCATTGCAAACATTTTCCAAGAATAATAATGAACAGCTCCTAAATGGCAGTAATGCCGTGATTGATTATCAGATGTTTAGAAGGGATGGTCCGAAAGTGCAGCCATTTATGGTAGATGTGAAGCACTGCCAGGATGTATTCTCTGAGATGCAGAGAAGAAATGGTTTTGAAGCAATCTCAAGTTTACAGCAGCAGAGCAGGGGAGTGATGGGAATGAATGGGGTTGGAAGACCGGGGATTCTTGTGGGAGGATCGTGCAGTGGTGTCTCAGATCCTGTGGCAGCAATCAAAATGCATTATTCCAATTCTGACAAGTATGGTGGTCAGTCTGGGAGTATTGCAAGAGAAGATGAATCATGGGGAGGGAAGGGGGATTGA

>Vu_30679.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30679::LG8:39905727-39907727(+)
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Gene Sequence:
>Vu_30679(+)
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