Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30657 LG8 39590094 39592659 PREDICTED: auxin response factor 18-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 39590643 missense_variant p.Val184Met
T/A 39590644 missense_variant p.Val184Glu
A/G 39590652 missense_variant p.Lys187Glu
A/G 39590724 missense_variant p.Arg211Gly
T/C 39590906 synonymous_variant p.Ala271Ala
G/A 39590914 missense_variant p.Gly274Asp
G/T 39590917 missense_variant p.Arg275Met
C/A 39591106 missense_variant p.Pro338His
T/A 39591110 synonymous_variant p.Ile339Ile
T/A 39591211 intron_variant
T/C 39591466 intron_variant
A/G 39591596 intron_variant
T/C 39591608 intron_variant
T/C 39591814 intron_variant
C/A 39591848 intron_variant
T/A 39592543 missense_variant p.Leu562Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30657.1
MERGSERCLDSQLWHACAGAMVQMPPLNTKVFYFPQGHAEHANGKVDFGQTRVPPLVPCRLSAMKYMADPDTDEVYVKMRLIPLREHELDLEDDCFLGNTVEGQEKPPTSFAKTLTQSDANNGGGFSVPRYCAETIFPRLDYSAEPPVQTIIAKDMHGQCWKFRHIYRGTPRRHLLTTGWSNFVNQKRLVAGDSIVFLRAENGDLCVGIRRAKKGIGGGSEFSSGWNPLFGGGSGFLCGSESNLVGGAKGGGDEMVGRVAAESVVEAVACAVNGRPFEVVYYPRASSPEFCVKASVVKAAMQIQWCSGMRFKMPFETEDSSRISWFMGTISSVQVADPIRWPDSPWRLLQVVWDEPDLLQNVKCVNPWLVELVSNMPTFNLSAYSPPRKKQRFLHDPYFQVINQLPMPSFSSNLLNYTNSLCNIENNSSAGIQGARHAQFGLSPSDFPFNKLPTDMLLGGFSRLDHATKPVRPPCGTYKNSTSNTTTKTNVDISCLLTVGNPIPNFKESNATKAPHILLFGKLIHTEQKSSNTSSASTTGNSVSEGNSLKTSNASDGLGSALHQNSPIENNSDGGSPWYKDQHKADLGSDNVNTLCIAL*


CDS Sequence:
>Vu_30657.1
ATGGAGAGGGGTTCAGAAAGGTGCTTAGATTCTCAACTGTGGCATGCCTGTGCTGGTGCCATGGTTCAAATGCCACCTCTTAACACAAAAGTCTTCTACTTTCCCCAGGGCCACGCGGAGCACGCTAATGGGAAAGTAGATTTTGGCCAAACCAGGGTTCCACCACTCGTCCCTTGCAGACTCTCTGCCATGAAATACATGGCAGACCCTGACACAGATGAGGTGTATGTCAAAATGAGGCTGATCCCTTTGAGGGAACATGAATTGGATTTGGAGGATGATTGTTTCTTGGGGAACACTGTGGAGGGTCAAGAGAAACCTCCTACCTCTTTTGCCAAGACACTCACACAATCTGATGCCAACAATGGTGGAGGGTTTTCTGTGCCTCGTTACTGTGCAGAAACCATCTTCCCGAGGTTGGACTATTCAGCCGAGCCTCCAGTTCAGACAATCATCGCCAAGGATATGCATGGACAGTGCTGGAAGTTTAGGCATATCTATAGAGGGACGCCTAGGAGGCATCTTTTGACCACTGGATGGAGCAATTTTGTGAATCAGAAGAGGCTTGTTGCTGGGGACTCCATTGTGTTTCTGAGGGCAGAAAACGGGGATCTTTGTGTTGGGATAAGGAGGGCTAAGAAGGGGATTGGTGGAGGGTCTGAGTTCTCTTCCGGATGGAACCCTCTCTTTGGTGGGGGTTCTGGATTCTTGTGTGGGAGTGAGAGCAACTTGGTGGGTGGTGCAAAAGGCGGTGGTGACGAGATGGTAGGAAGAGTGGCTGCTGAATCTGTTGTTGAGGCCGTAGCTTGTGCTGTTAATGGTAGGCCCTTCGAGGTTGTGTACTATCCAAGAGCTAGTTCCCCTGAGTTTTGTGTCAAGGCTTCTGTTGTGAAGGCTGCAATGCAAATTCAGTGGTGTTCTGGGATGAGATTCAAAATGCCCTTCGAAACTGAGGATTCTTCTAGGATTAGCTGGTTCATGGGCACCATTTCTTCTGTTCAGGTTGCAGATCCCATTCGTTGGCCTGATTCTCCTTGGCGTCTTCTGCAGGTGGTATGGGATGAACCAGATTTACTTCAGAATGTGAAGTGTGTAAACCCTTGGCTGGTTGAACTAGTCTCTAACATGCCCACCTTCAATCTCTCTGCATACTCACCTCCTAGAAAGAAACAACGCTTCCTGCATGACCCATATTTTCAAGTCATCAACCAACTCCCAATGCCATCATTTTCTAGCAATCTTCTGAATTATACCAACTCTCTTTGTAACATTGAAAATAATAGTTCTGCAGGCATACAGGGAGCCAGGCATGCTCAATTTGGACTATCTCCATCTGATTTTCCCTTCAACAAGCTCCCAACAGACATGCTTCTAGGTGGGTTCTCTAGGCTCGACCATGCAACAAAACCTGTTAGGCCTCCTTGCGGAACCTATAAAAACAGCACTTCTAATACTACTACTAAGACCAATGTTGACATATCTTGCCTGTTGACTGTGGGAAATCCCATCCCGAATTTTAAGGAATCGAATGCAACAAAAGCACCCCACATCTTGTTATTTGGAAAACTTATTCACACTGAGCAAAAGAGTTCAAACACCAGCTCTGCAAGTACAACTGGGAATAGTGTGTCTGAGGGGAATTCACTCAAGACATCTAATGCTTCTGATGGCCTAGGTTCTGCTTTGCACCAAAATAGCCCAATTGAGAATAATTCTGATGGAGGGTCTCCCTGGTACAAGGATCAGCACAAGGCTGATCTGGGATCCGACAACGTTAACACGTTATGCATTGCTTTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30657::LG8:39588094-39590094(+)
ATATTTTAATTTAATGGTTAAAAATTGGATTTAAATAAAATATTGACCAAACTCAATGATGCACCAAAAACCTTCGTGCATTTTATTAACGCCTAATTAAAATTCAGAAACTTCTGTAATTTAATAAAAATGGATTAAAACTGTATTGGTAAGGTTTTGTGATTTTATTATTTTTCAAATAGTTGTATAAAATGATTTATCGGTGATGATTAAATTTATAACATATTTCATTTCAAACTTATTCAATATTAGGTTCGATGTAGTTTATATGTTTGATATCTATGGCGTAGATAGTAAATAGAATTGTATTTTGAGTATTTGGCTGGAAAAAAAATTACAAAATTTAAAAACACGAAGGGGGTGTGAGCTTAGAAAGATAGAAGTGTTATTTGGAATATTTATTCTTTTTTAATCATGAAAACGAGTTCAGATTATCAAATTTTTTTATACTGTCTTTTTATTGTACACTTAAAATACATTGATTTAAATATATTAAAAATATTTAATACATTTTAAAACATCCTAAGTGTACTTCAATATATTTTAAAGATAGAATATAAGGACAATATAAAAAATCAACAATAAAATCTAAATTCCAAAATATATTACCTATATTTTCACCTTTTCATCTTCCTTGATTTCCATTCTTCTTTCTCTATAATTTTGCATGTAAGTTTTTAGGGTTTTTTAGGCATTGATAGAAATTAAAGTTTTGAATTAATTACTAAGGGTGTTTAATGTTTAGGACTTGATTTTGAATTGCTTGAGCATTGTTGAGGTGTGTGCTTCGTTTTCTTCAATCCTTAAAGTAATAAAAACTAGTTCATTGGATTTTATTCTATATTTCATATTTAATAATATATATATATATATATATATATTCATAATTAAGCTAACAACTGTTCAAGAATTAAATAACTTCCTTTTCTTGTTATCAATTTATATTAATTTATTATATAAAATATTGATAATATAATTAAGTAAACTTAACAATTTTATACTGTAAGAATAAAAAATGTATGCAACATACAGGCACAAATATATCTCTTTTAATATTTTAAAAAACACACGGATAAGATACACATCTAATACAAATTTATATAAAAATTACAGAGATTAAAATTATTGATTTTAATAAAGAAAATTTAAAACGAAAAGAAGAAAAAGAGAATAAATTTATTAAGAAAGAAAAAGAGTTGGTTTGGTTAAGGAGATTTCATAATTAATGACGGGCCGTTTCTTCATAATTTTTAAATAAAAATAAATCAGTATTAAAAATAATAATCATATGATAAAAATAAGTTAGAAAATAAATTTTTATATGTATGTATTTCAATCAAATAACTATTATATTATTTTCTCTACTAAAGAAAATAAATATATATATTTATATATATAATTTGATAGTGACATAAAAAAATATATTATTATATGGTTTTATCATTTATGAATACGTGAGTTGTAAACTGTAATGTCGATTTTCAATTCATGTTTGTGTTATGGTCGGCAACTGAGAGAACCACATACGCGTGTGACAGTGAGATAGAGATAGAAAGAGAGAGAGAGAGCAGTGTGTGTCTTTATGTACTTCCAACATCGCACTCTCTCTCACTCCCCACTCTTCCTTTCGCTTCTCTTCTCTTCTTCCACATCACACATTCTCTCTCTACTTTTTCTTCATCCACCAATCAGCAACACATTCACCTTTCTCTTTATTTACAACAATCTTCTTCTCCTTCCTTCATCAACCGTCACAATCTAGCCACCTTCTTTTTCTCCATCTCACTAACCATATCACATACTTCATTCAAACAACCCTGTTCTCCTCTTTGCATCTCTATCCTTTCTCCTTCCATATACCTTCATCTGTTATTATTCTTCTTGGCCACAGAAGAACACACACCTTATTTCCTTCAAACCTTTTCTCTGGGTTGTCTTTTCTCGTGAAAAGCGAGGATATTTAATATTTTACATTGAGATGTTCAAGGTTATAGAAAACA


Gene Sequence:
>Vu_30657(+)
ATGGAGAGGGGTTCAGAAAGGTGCTTAGATTCTCAACTGTGGCATGCCTGTGCTGGTGCCATGGTTCAAATGCCACCTCTTAACACAAAAGTCTTCTACTTTCCCCAGGGCCACGCGGAGCACGCTAATGGGAAAGTAGATTTTGGCCAAACCAGGGTTCCACCACTCGTCCCTTGCAGACTCTCTGCCATGAAATACATGGCAGACCCTGACACAGATGAGGTGTATGTCAAAATGAGGCTGATCCCTTTGAGGGAACATGAATTGGATTTGGAGGATGATTGTTTCTTGGGGAACACTGTGGAGGGTCAAGAGAAACCTCCTACCTCTTTTGCCAAGACACTCACACAATCTGATGCCAACAATGGTGGAGGGTTTTCTGTGCCTCGTTACTGTGCAGAAACCATCTTCCCGAGGTTGGACTATTCAGCCGAGCCTCCAGTTCAGACAATCATCGCCAAGGATATGCATGGACAGTGCTGGAAGTTTAGGCATATCTATAGAGGGACGCCTAGGAGGCATCTTTTGACCACTGGATGGAGCAATTTTGTGAATCAGAAGAGGCTTGTTGCTGGGGACTCCATTGTGTTTCTGAGGGCAGAAAACGGGGATCTTTGTGTTGGGATAAGGAGGGCTAAGAAGGGGATTGGTGGAGGGTCTGAGTTCTCTTCCGGATGGAACCCTCTCTTTGGTGGGGGTTCTGGATTCTTGTGTGGGAGTGAGAGCAACTTGGTGGGTGGTGCAAAAGGCGGTGGTGACGAGATGGTAGGAAGAGTGGCTGCTGAATCTGTTGTTGAGGCCGTAGCTTGTGCTGTTAATGGTAGGCCCTTCGAGGTTGTGTACTATCCAAGAGCTAGTTCCCCTGAGTTTTGTGTCAAGGCTTCTGTTGTGAAGGCTGCAATGCAAATTCAGTGGTGTTCTGGGATGAGATTCAAAATGCCCTTCGAAACTGAGGATTCTTCTAGGATTAGCTGGTTCATGGGCACCATTTCTTCTGTTCAGGTTGCAGATCCCATTCGTTGGCCTGATTCTCCTTGGCGTCTTCTGCAGGTACAGTACACCCCATTATGGATTTCCTTTTACTATTGCATTAACATGATAACTTGTTCAGATCCCCTTCCTCAACTTGTCTTTACTCAGAGGCTATACTTTTATTCTCTCAGTGTGGTACTGATTTGACCAACAGTGACACTGCTTCGTCAATGGTGAAACTATTCATTGGATTTCCAGTTTACTCCTTTTCAACCTCATCCTAAAACTGTTCAATGCTTAAAAAAGATGTAGCACAGTTTACACTTTGTCAGACAAGATGATTATTTCCTGATGCAATGTTTTTGTTTATCTTTCTTATTTATGTGTTGTGCGCCTTTCCTATTAAATAGTTGCTGAATCATACTCTGACCTGTGCAAATTGTATGTGCTGTGTTCAGCGGCATTTTTATTTACAATATATTTGTTTTCTATAAATGGATTTTCTGAATGTTCTAGGTCCATTTCAATTAAAAAATAGCGGTTAATAGTAATAACTGTTGAACTACAGTAAAGTAGCAAATCGTTTTTCATCATTTTAAGCGTGTCTGTTCAGTGCTGACAATTCTTTCTAGCAAGTACAAATGGTTGCTTCAATTAGGCACTGTCTCCATAGAGTGCTTTTGATGATTGAGCTTTACTTTTGGAAGTTCGAGTTACCTTTACCTTTTAACAATACTATGGCAGGATGTTTGTCTTCAGTTTTTTTTTTGTTGGTTGGTACTCTTTTGGCTTAAAGTATGGTTAAACATGAAAATAATCTATAATTTGTGATGTCACGTTTCAGGTGGTATGGGATGAACCAGATTTACTTCAGAATGTGAAGTGTGTAAACCCTTGGCTGGTTGAACTAGTCTCTAACATGCCCACCTTCAATCTCTCTGCATACTCACCTCCTAGAAAGAAACAACGCTTCCTGCATGACCCATATTTTCAAGTCATCAACCAACTCCCAATGCCATCATTTTCTAGCAATCTTCTGAATTATACCAACTCTCTTTGTAACATTGAAAATAATAGTTCTGCAGGCATACAGGGAGCCAGGCATGCTCAATTTGGACTATCTCCATCTGATTTTCCCTTCAACAAGCTCCCAACAGACATGCTTCTAGGTGGGTTCTCTAGGCTCGACCATGCAACAAAACCTGTTAGGCCTCCTTGCGGAACCTATAAAAACAGCACTTCTAATACTACTACTAAGACCAATGTTGACATATCTTGCCTGTTGACTGTGGGAAATCCCATCCCGAATTTTAAGGAATCGAATGCAACAAAAGCACCCCACATCTTGTTATTTGGAAAACTTATTCACACTGAGCAAAAGAGTTCAAACACCAGCTCTGCAAGTACAACTGGGAATAGTGTGTCTGAGGGGAATTCACTCAAGACATCTAATGCTTCTGATGGCCTAGGTTCTGCTTTGCACCAAAATAGCCCAATTGAGAATAATTCTGATGGAGGGTCTCCCTGGTACAAGGATCAGCACAAGGCTGATCTGGGATCCGACAACGTTAACACGTTATGCATTGCTTTGTAA