Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30601 LG8 38898792 38900795 PREDICTED: piriformospora indica-insensitive protein 2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   mitochondrion
Molecular Function   enables   molecular_function
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 38898896 synonymous_variant p.Glu35Glu
T/A 38899008 splice_region_variant&intron_variant
A/T 38899040 intron_variant
T/A 38899081 intron_variant
T/A 38899102 intron_variant
T/A 38899158 intron_variant
A/G 38899159 intron_variant
G/A 38899353 intron_variant
C/T 38899404 intron_variant
G/C 38899405 intron_variant
A/T 38899461 intron_variant
T/A 38899552 intron_variant
G/C 38900035 missense_variant p.Ser225Thr
A/T 38900037 missense_variant p.Asn226Tyr
A/T 38900045 missense_variant p.Leu228Phe
C/T 38900117 synonymous_variant p.Leu252Leu
T/C 38900195 synonymous_variant p.Gly278Gly
A/G 38900207 synonymous_variant p.Leu282Leu
C/T 38900351 synonymous_variant p.Pro330Pro
G/T 38900670 missense_variant p.Asp437Tyr
C/T 38900678 synonymous_variant p.Asn439Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30601.1
MKSIKTVGHAIFVIFILCLSARCCGQEDLDIAPMEKAEQEALYSTIQGFVGNSWNGSDLYPDPCGWTPIQGVSCDLFNGFWYVTVLNIGPVHDNSLSCAQDLEFRPELFSLKHLKSLSFFNCFQSKNSFPATIPARNWEKLASSLETLEFRSNPGLVGNIPSGFGVLKNLRSLVLLENGVTGEIPSSIGNLVKLKKLVLAENYLNGRIPDVFDGMNELLIFDLSSNSLSGSLPSTLGSLTSALKLDVSHNDLEGTLLKEFANLKNLTLMDLRNNKLSGGLTLSLQEMQSLEELVMSNNPLGGDMRALEWENMKNLEILELSNMGLTGEIPESISELKRLRFLGLSNNKLTGNLSPKLENLPCLNALYLSGNNITGEINFSKEFLEKMGRRFGAWRNPNLCYQVGVISTNHVPYGVKPCQREVNLLESNSKTELINGDRNETFHFIASKGFSSSATNGLWWTLMEEIAMMGLVLIILI*


CDS Sequence:
>Vu_30601.1
ATGAAGAGTATCAAGACCGTTGGCCATGCCATATTTGTCATTTTCATCCTCTGCCTGAGTGCAAGATGCTGTGGACAAGAAGACCTTGATATTGCTCCAATGGAGAAAGCAGAGCAAGAAGCTCTGTACTCCACCATTCAAGGCTTTGTTGGTAATTCCTGGAATGGCTCAGATCTCTATCCGGATCCTTGTGGTTGGACTCCAATTCAGGGTGTCTCTTGTGATCTGTTTAATGGGTTTTGGTATGTTACTGTCTTGAACATCGGACCCGTCCATGACAATTCTCTGAGTTGTGCTCAAGATTTGGAGTTTAGGCCAGAGTTATTCTCGCTCAAGCACCTAAAATCTCTATCCTTCTTCAATTGCTTTCAATCAAAAAATAGCTTTCCAGCTACCATTCCCGCTAGAAACTGGGAAAAACTTGCCAGCAGCTTAGAGACACTAGAGTTTAGATCAAATCCAGGTCTCGTTGGAAACATTCCCTCAGGTTTTGGTGTCCTCAAGAACCTCCGATCACTAGTATTACTAGAAAACGGTGTAACAGGTGAAATACCATCAAGCATTGGCAATCTCGTGAAGTTGAAGAAGCTTGTTCTTGCTGAAAACTACCTTAATGGGAGGATCCCAGATGTTTTTGATGGGATGAACGAGTTATTAATCTTTGATTTGAGCAGTAATTCGTTATCGGGGTCTTTGCCTTCAACACTCGGAAGCTTAACTTCAGCATTGAAGCTTGATGTGAGCCACAATGACCTCGAAGGGACTCTTCTAAAGGAGTTTGCTAATCTTAAGAATCTGACCCTTATGGACCTTAGGAATAACAAATTGAGTGGTGGATTGACCTTATCTTTGCAAGAGATGCAGTCATTAGAGGAATTGGTTATGTCCAACAATCCATTAGGTGGAGACATGAGGGCATTAGAGTGGGAAAACATGAAGAACTTGGAAATTTTGGAACTCTCTAACATGGGGTTGACAGGGGAAATTCCCGAGTCTATCTCAGAATTGAAGAGGCTCAGATTTTTGGGACTTAGTAACAACAAGCTCACTGGCAATCTGTCACCAAAGCTGGAAAATCTTCCTTGTCTCAATGCACTTTACCTAAGTGGAAACAATATCACAGGAGAGATTAACTTCTCGAAAGAGTTTTTGGAAAAAATGGGAAGGCGTTTTGGGGCGTGGAGAAACCCCAACCTTTGCTACCAAGTTGGAGTAATTTCAACAAACCATGTTCCATATGGGGTAAAGCCATGCCAGAGAGAGGTCAATTTGTTAGAATCTAATTCAAAAACTGAACTGATCAATGGGGATAGGAACGAGACTTTCCATTTCATAGCCTCTAAGGGATTTTCTAGCTCTGCTACAAATGGACTCTGGTGGACATTGATGGAAGAAATAGCGATGATGGGTTTAGTTCTAATAATTCTTATATAG


Promoter Sequence:
>Vu_30601::LG8:38896792-38898792(+)
GTTATTAAAATAAAAGTTTGAGTTTCGTATTAAATAAAAAATAAACAATAAATAAAAAGAAGATTCACAATTCTATTATTTTAAAAATTATATAAATATCCTCAAAATACGTAAACAGTAATATTAAAGTCCATATATGTTTTTACTCTTATACCATTTTTTATTGTATTAGACACTGATATTTTGACATTATAATTCTTTTTACACATTATTATTTACTCTTTATTTTTAAATATAAATGCTAATTTTTGTTAAAGCTATTTTACTCCTGTAAAAGTTGTCATATGATACTCACATTATGTCAAGTAAACTTTTTCCTTTTTTCTAAATGCTCCTATCATAATAAAACTCTTGCCACACTAATAAATATATTAAAAAATATACCTTTAGCAAATAAACCGGCTAATTTGGTAGCAAATTCAATTACTTGTAAGTAATTGTTGCCTCTAACTGTTTTTCATCACACTTATATGACTAATTATTATTATATATTTATTCCATTCAGAAATTGCAAAAAAGTGGGCCACATTGTCTATTTTATATGAACTTTTATCAAAAATTAGGAATTGAAAATTGGGAGAAACAGTGACATAAATTTTTGACAAAGTTAATACTAAATTGAGAAGAAGGAAGAAAAAATTATTAGCACCGGCAGGGCATCTTCCGATAGTTGATGATAATTACTGTGCAAACCATAAATTCCGCAGTAATATTAATAGACACGAAGGCAATCTAGATAAACTTTATTTTGTTAGAGTGTAAGCAATGAATGGATTCATTGAAGAAGTTCAGAAAAAGAGATTTCCTTTGGGTTTAATTAAATTAGCAAGCATTTAAAAGTGCGTCCACTGATAGTTTTCTTTAGCCAGTTTGAAATGTATGAGGGAAAAAGGTTAAGTTTGGCTAGTTATTTACATTGAAAAAAAAGTTATAGAGATTAGGTAGGTACAAATTTTGAGGAAAAAAGAAACATTGAAGGTACAAGTATGGTCCAACTGTTATATGTAGCAATGTGATTAAGTGGTGTATTGAAATATGAAAAGGTAGCTAGTGAGGTCTCTGTTGTCCTTTTAGTTTCAATGGAGCTGTCAAAAATACACCAGCCAAAAACACTAGACAACGAGGCAACAGCCGGATGAAAACCTTATTTGTATTGCATGTTTTTACATGCACCTCTTCCTTTTGCATGAACATGGTCCCCTGCTACGCAACGCTCTTTCTAGTCTTCAACTAATCCCTCAACCCTATCCCTTTATTGCCTTCAACTACCAATTACACTTTTAAAACACTATCAAACTTGTGACTACTAACACACATAATTTCCATCATACTTATTTCTCGTCTAATAATGGTAATGAATAAGACAATCATATAGGGTGTGCAATTTCCATAGCATAGCTGCATAAAAAGGAAACACTGTTTTTTAACTTTTTTTTGCTTCCATTTTATAGGCTTCTCAGTTGCTTCTGCTCTGATCATATTAATGCCATCGTTATTATGACTTTGAGCTTCGAGAACTGTGATAAGATATCGTGTTCTCTCTTAAAAATTATTTATATATATATATATATATATATACTTCCTTAGTTTTTTCTATAAACACCATAAGAAGGAAGAGGTCGGGCTTCTTGCTCAGCTTTTGTGTTTCCTCCATTCCCACTATCCTACTAAGTCTGAGCATAAATTCAGGATCTTGTTCTTTCTTTCTTCATACTACAACCCGTGTTCTTCCAAAACAACAGTAGTTTTCTGTAAGGTCCCCTGTTCGGGTACCCACTTCATTCTTGAGGTATTCGGCCACCCATTTTAACTTTCACCCTTCTTTGTATCTGTTGTCACTCAGTTGAACATCTTCTTCCTCTTTTTCTTTCTCCATCTCTAAAATGATAAATGCACATGTAACCCATCAACCATAACATGCTTCTTTCTTTTTTATCAATTTTGCTTCATCCATCTTGAATTTCTTTCGTGCTTGGTAATCCTATTTTGACTCAAAATCA


Gene Sequence:
>Vu_30601(+)
ATGAAGAGTATCAAGACCGTTGGCCATGCCATATTTGTCATTTTCATCCTCTGCCTGAGTGCAAGATGCTGTGGACAAGAAGACCTTGATATTGCTCCAATGGAGAAAGCAGAGCAAGAAGCTCTGTACTCCACCATTCAAGGCTTTGTTGGTAATTCCTGGAATGGCTCAGATCTCTATCCGGATCCTTGTGGTTGGACTCCAATTCAGGTACCTTTAACCAGACACCTAGCTGTGCCATCATCGGTAGTACTACAATACAAGTTGTCTAAGCAACTACTTTATACTGTGCTCGAGATAAGTTTTGGGTTGTGAAAATTTGTTTTTGTTAGGCCACCGTTTCTTGATGAGTGTCAGAAGGAATAGTATAGCTACAACGATATGGTTCCTGTTTGGTTAATGACTTGCACAGACTTTTTCATAATCAAGAGTTAAACTCTGAACACAAACACCCTTACTTTTCTCACTCTTGAAGATTTTTGCTAAATTTTGAAGTCCATATAAATAAAAGGCTTTGCACTCAATTTCATTAATGAACGCTGAAGCTTTTTAATTTCTGGTGGATGCCAAAGGTAAAAGTACAATCCATTGGTTTAATTTTACCGTTTGATCCGTAGTGTATCGATCGTCTTTCAGAAGTTCTCTTCCCTCTCTTTTTTTTTCAGAAAAAGTTCAATTGCCCATTATGTATTTGCATTTCAAACCGGAATTATAAATTAACCAGAACATGGTGATTGATTAGTTGCTTAATTGTGATGTCTGTGTTGTCTTCTTCTGCAGGGTGTCTCTTGTGATCTGTTTAATGGGTTTTGGTATGTTACTGTCTTGAACATCGGACCCGTCCATGACAATTCTCTGAGTTGTGCTCAAGATTTGGAGTTTAGGCCAGAGTTATTCTCGCTCAAGCACCTAAAATCTCTATCCTTCTTCAATTGCTTTCAATCAAAAAATAGCTTTCCAGCTACCATTCCCGCTAGAAACTGGGAAAAACTTGCCAGCAGCTTAGAGACACTAGAGTTTAGATCAAATCCAGGTCTCGTTGGAAACATTCCCTCAGGTTTTGGTGTCCTCAAGAACCTCCGATCACTAGTATTACTAGAAAACGGTGTAACAGGTGAAATACCATCAAGCATTGGCAATCTCGTGAAGTTGAAGAAGCTTGTTCTTGCTGAAAACTACCTTAATGGGAGGATCCCAGATGTTTTTGATGGGATGAACGAGTTATTAATCTTTGATTTGAGCAGTAATTCGTTATCGGGGTCTTTGCCTTCAACACTCGGAAGCTTAACTTCAGCATTGAAGCTTGATGTGAGCCACAATGACCTCGAAGGGACTCTTCTAAAGGAGTTTGCTAATCTTAAGAATCTGACCCTTATGGACCTTAGGAATAACAAATTGAGTGGTGGATTGACCTTATCTTTGCAAGAGATGCAGTCATTAGAGGAATTGGTTATGTCCAACAATCCATTAGGTGGAGACATGAGGGCATTAGAGTGGGAAAACATGAAGAACTTGGAAATTTTGGAACTCTCTAACATGGGGTTGACAGGGGAAATTCCCGAGTCTATCTCAGAATTGAAGAGGCTCAGATTTTTGGGACTTAGTAACAACAAGCTCACTGGCAATCTGTCACCAAAGCTGGAAAATCTTCCTTGTCTCAATGCACTTTACCTAAGTGGAAACAATATCACAGGAGAGATTAACTTCTCGAAAGAGTTTTTGGAAAAAATGGGAAGGCGTTTTGGGGCGTGGAGAAACCCCAACCTTTGCTACCAAGTTGGAGTAATTTCAACAAACCATGTTCCATATGGGGTAAAGCCATGCCAGAGAGAGGTCAATTTGTTAGAATCTAATTCAAAAACTGAACTGATCAATGGGGATAGGAACGAGACTTTCCATTTCATAGCCTCTAAGGGATTTTCTAGCTCTGCTACAAATGGACTCTGGTGGACATTGATGGAAGAAATAGCGATGATGGGTTTAGTTCTAATAATTCTTATATAG